29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_R0031 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_R0031  tRNA-Arg  100 
 
 		 77 bp  153  7e-36  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.745897  normal  0.775503 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_R0065  tRNA-Arg  93.62 
 
 		 74 bp  69.9  0.00000000008  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0025488  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_R0038  tRNA-Arg  88.52 
 
 		 77 bp  65.9  0.000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.495611  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_R0031  tRNA-Arg  86.89 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0048271  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_R0067  tRNA-Arg  90.91 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.74464  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET_tRNA-Arg-3  tRNA-Arg  90.7 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00117786  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_830  tRNA-Arg  90.7 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00000000213386  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_R0026  tRNA-Arg  90.7 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_R0023  tRNA-Arg  88.68 
 
 		 76 bp  50.1  0.00008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.731836  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_R0004  tRNA-Arg  86.54 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.468205  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_R0037  tRNA-Arg  100 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000022611  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_R0021  tRNA-Trp  88.64 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000394935  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_R0021  tRNA-Met  96.43 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.213808  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_R0044  tRNA-Arg  100 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_R0001  tRNA-Arg  86.27 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00000193558  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_R0021  tRNA-Gly  86.44 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.00000000000904393  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_R0021  tRNA-Gly  86.44 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000020571  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_R0034  tRNA-Arg  83.1 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.299722  normal  0.0234425 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_R0038  tRNA-Trp  85.19 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.23193 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_R0036  tRNA-Trp  86.21 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0303875  normal  0.494779 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_R0024  tRNA-Arg  85.19 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000092316  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_R0034  tRNA-Trp  87.04 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_R0024  tRNA-Arg  85.19 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000167821  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_R0007  tRNA-Arg  85.19 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.688543  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_R0033  tRNA-Arg  85.19 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_t0718  tRNA-Arg  85.19 
 
 		 74 bp  44.1  0.005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.953055  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_R0070  tRNA-Arg  100 
 
 		 78 bp  44.1  0.005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.143256  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_AR0051  tRNA-Arg  85.19 
 
 		 74 bp  44.1  0.005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.462941 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_AR0065  tRNA-Arg  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>