84 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_R0067 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009972  Haur_R0067  tRNA-Arg  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.74464  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET_tRNA-Arg-3  tRNA-Arg  91.38 
 
 
76 bp  75.8  0.000000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00117786  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_R0026  tRNA-Arg  91.38 
 
 
76 bp  75.8  0.000000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_830  tRNA-Arg  91.38 
 
 
76 bp  75.8  0.000000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00000000213386  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0045  tRNA-Arg  86.11 
 
 
76 bp  63.9  0.000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PGt08  tRNA-Trp  88.89 
 
 
76 bp  60  0.00000008  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_R0035  tRNA-Trp  86.89 
 
 
76 bp  58  0.0000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.349144  normal  0.230187 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_R0051  tRNA-Arg  86.67 
 
 
76 bp  56  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00230121 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1155  tRNA-Arg  84.72 
 
 
76 bp  56  0.000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.268031  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_R0055  tRNA-Arg  94.44 
 
 
76 bp  56  0.000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.763699  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_R0060  tRNA-Arg  86.67 
 
 
76 bp  56  0.000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000322774  normal  0.330331 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_R0052  tRNA-Arg  94.44 
 
 
75 bp  56  0.000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.108148  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_R0031  tRNA-Arg  90.91 
 
 
77 bp  56  0.000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.745897  normal  0.775503 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_R0019  tRNA-Arg  86.67 
 
 
76 bp  56  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0771272  normal  0.535237 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_R0032  tRNA-Arg  88.33 
 
 
77 bp  56  0.000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_R0022  tRNA-Arg  85.71 
 
 
76 bp  54  0.000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_R0032  tRNA-Trp  86.21 
 
 
76 bp  52  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_R0012  tRNA-Arg  86.89 
 
 
74 bp  50.1  0.00007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.75723  normal  0.670239 
 
 
-
 
NC_006369  lplt32  tRNA-Arg  93.94 
 
 
77 bp  50.1  0.00007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_R0049  tRNA-Arg  96.55 
 
 
77 bp  50.1  0.00007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_6002  tRNA-Trp  85.25 
 
 
76 bp  50.1  0.00007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_R0056  tRNA-Arg  93.94 
 
 
77 bp  50.1  0.00007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000119061  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lppt32  tRNA-Arg  93.94 
 
 
77 bp  50.1  0.00007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_AR0003  tRNA-Arg  84.93 
 
 
77 bp  50.1  0.00007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.972856  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_R0001  tRNA-Arg  86.54 
 
 
76 bp  48.1  0.0003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.510939 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_R0002  tRNA-Arg  86.54 
 
 
76 bp  48.1  0.0003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_R0004  tRNA-Arg  96.43 
 
 
77 bp  48.1  0.0003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.0000109106  hitchhiker  0.000000979615 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14170  tRNA-Val  100 
 
 
74 bp  48.1  0.0003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.688335  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_R0011  tRNA-Trp  85 
 
 
76 bp  48.1  0.0003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_R0001  tRNA-Arg  86.54 
 
 
76 bp  48.1  0.0003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_R0002  tRNA-Arg  86.54 
 
 
76 bp  48.1  0.0003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0353519  normal  0.248157 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_R0034  tRNA-Trp  85 
 
 
76 bp  48.1  0.0003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0220727 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_R0001  tRNA-Arg  86.54 
 
 
76 bp  48.1  0.0003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_R0001  tRNA-Arg  86.54 
 
 
76 bp  48.1  0.0003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_R0024  tRNA-Arg  86.54 
 
 
76 bp  48.1  0.0003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.80866  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_R0002  tRNA-Arg  86.54 
 
 
76 bp  48.1  0.0003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_R0028  tRNA-Met  100 
 
 
77 bp  46.1  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.570656  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_R0002  tRNA-Arg  93.55 
 
 
77 bp  46.1  0.001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.318513  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_R0043  tRNA-Met  100 
 
 
77 bp  46.1  0.001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.931817  normal  0.538604 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_R0024  tRNA-Arg  100 
 
 
77 bp  46.1  0.001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_R0002  tRNA-Arg  93.55 
 
 
77 bp  46.1  0.001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0106589  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_R0014  tRNA-Met  100 
 
 
77 bp  46.1  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.65159  normal  0.954278 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_R0047  tRNA-Arg  100 
 
 
77 bp  46.1  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.67913  normal  0.0842935 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0079  tRNA-Arg  93.55 
 
 
77 bp  46.1  0.001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_R0023  tRNA-Arg  93.55 
 
 
77 bp  46.1  0.001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.45343  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_R0058  tRNA-Met  100 
 
 
77 bp  46.1  0.001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.272265 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09370  tRNA-Val  100 
 
 
77 bp  46.1  0.001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.12642  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1260  tRNA-Arg  93.55 
 
 
77 bp  46.1  0.001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.285329  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_R0023  tRNA-Arg  93.55 
 
 
77 bp  46.1  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_AR0038  tRNA-Met  100 
 
 
77 bp  46.1  0.001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.27748  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_R0025  tRNA-Met  100 
 
 
77 bp  46.1  0.001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0720614  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_R0003  tRNA-Met  100 
 
 
77 bp  46.1  0.001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.124761  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_R0038  tRNA-Met  100 
 
 
77 bp  46.1  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.545151  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_R0004  tRNA-Arg  100 
 
 
77 bp  46.1  0.001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000356411  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_R0032  tRNA-Val  100 
 
 
74 bp  46.1  0.001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.149498  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_R0020  tRNA-Arg  100 
 
 
77 bp  46.1  0.001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.732276  normal  0.397145 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_R0035  tRNA-Arg  100 
 
 
77 bp  46.1  0.001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.111651 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_R0064  tRNA-Arg  100 
 
 
77 bp  46.1  0.001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_R0022  tRNA-Arg  100 
 
 
77 bp  46.1  0.001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.189189 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_R0064  tRNA-Arg  100 
 
 
77 bp  46.1  0.001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00190165  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_R0040  tRNA-Arg  100 
 
 
77 bp  46.1  0.001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_R0048  tRNA-Arg  93.55 
 
 
77 bp  46.1  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.759858 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_R0055  tRNA-Arg  100 
 
 
76 bp  46.1  0.001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_R0031  tRNA-Arg  86.44 
 
 
77 bp  46.1  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0048271  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_R0032  tRNA-Arg  100 
 
 
76 bp  44.1  0.005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.151331  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_R0016  tRNA-Lys  100 
 
 
76 bp  44.1  0.005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0352775  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_R0019  tRNA-Asn  100 
 
 
76 bp  44.1  0.005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.00742294  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_R0009  tRNA-Arg  93.33 
 
 
77 bp  44.1  0.005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24820  tRNA-Arg  100 
 
 
76 bp  44.1  0.005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.173239 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_R0043  tRNA-Arg  100 
 
 
76 bp  44.1  0.005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0685094  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_R0002  tRNA-Arg  100 
 
 
73 bp  44.1  0.005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000177149  normal  0.0400034 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_R0011  tRNA-His  86.21 
 
 
77 bp  44.1  0.005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_R0019  tRNA-Arg  96.15 
 
 
76 bp  44.1  0.005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.414165 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_R0017  tRNA-Thr  100 
 
 
76 bp  44.1  0.005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000527729  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_R0016  tRNA-Arg  100 
 
 
76 bp  44.1  0.005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_R0047  tRNA-Arg  100 
 
 
76 bp  44.1  0.005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.0070675  normal  0.199885 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_R0006  tRNA-Arg  93.33 
 
 
76 bp  44.1  0.005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.214285  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_R0055  tRNA-Arg  93.33 
 
 
76 bp  44.1  0.005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0855859  hitchhiker  0.00187773 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_R0030  tRNA-Arg  100 
 
 
76 bp  44.1  0.005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_R0001  tRNA-Arg  96.15 
 
 
76 bp  44.1  0.005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.285544  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_R0029  tRNA-Arg  100 
 
 
73 bp  44.1  0.005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.403719 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_R0032  tRNA-Arg  100 
 
 
75 bp  44.1  0.005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_R0037  tRNA-Arg  100 
 
 
76 bp  44.1  0.005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE_tRNA-Arg-4  tRNA-Arg  100 
 
 
77 bp  44.1  0.005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000000000104692  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>