100 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_R0024 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008025  Dgeo_R0024  tRNA-Thr  100 
 
 		 76 bp  151  3e-35  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0700552  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_R0048  tRNA-Thr  92.11 
 
 		 76 bp  103  6e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.000131085  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_R0029  tRNA-Thr  100 
 
 		 76 bp  97.6  4e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.00000138088  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP_tRNA-Thr-3  tRNA-Thr  90.2 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_R0011  tRNA-Thr  92.5 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP_tRNA-Thr-1  tRNA-Thr  88.24 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0000584403  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0023  tRNA-Thr  88.24 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0010  tRNA-Thr  88.24 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.00000000409146  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0045  tRNA-Thr  88.24 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_R0058  tRNA-Thr  88.24 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000775366  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_R0012  tRNA-Thr  90.7 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00458677 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0061  tRNA-Thr  88.24 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0010  tRNA-Thr  88.24 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.0000000231874  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0045  tRNA-Thr  88.24 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0061  tRNA-Thr  88.24 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.269417  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_tRNA-Thr-2  tRNA-Thr  88.24 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0064  tRNA-Thr  87.04 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000119714  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_R0007  tRNA-Thr  94.12 
 
 		 73 bp  52  0.00002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_R0020  tRNA-Thr  86.21 
 
 		 73 bp  52  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0183484  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  tRNA-Thr-3  tRNA-Thr  90.48 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_R0004  tRNA-Thr  90.48 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.177658  hitchhiker  0.000057248 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_R0014  tRNA-Thr  89.13 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0047  tRNA-Lys  87.04 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.361519  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_R0058  tRNA-Thr  90.48 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.341614  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_R0008  tRNA-Thr  87.04 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0142  tRNA-Thr  87.76 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000202791  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0108  tRNA-Thr  87.76 
 
 		 73 bp  50.1  0.00007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00964752  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0124  tRNA-Thr  87.76 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00762261  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0138  tRNA-Thr  87.76 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000302631  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5002  tRNA-Thr  87.76 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4988  tRNA-Thr  87.76 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0019  tRNA-Thr  87.76 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0246771  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0085  tRNA-Thr  87.76 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000677619  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0112  tRNA-Thr  87.76 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00195399  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0793  tRNA-Thr  87.76 
 
 		 78 bp  50.1  0.00007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.44632e-33 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0128  tRNA-Thr  87.76 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.601101  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5804  tRNA-Thr  87.76 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00774483  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0532  tRNA-Thr  87.76 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.7224099999999997e-31 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4770  tRNA-Thr  87.76 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000025693  hitchhiker  6.21743e-16 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4563  tRNA-Thr  87.76 
 
 		 78 bp  50.1  0.00007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000215679  normal  0.0839515 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0227  tRNA-Thr  87.76 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000274573  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0213  tRNA-Thr  87.76 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000000777909  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0096  tRNA-Thr  87.76 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00156576  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0607  tRNA-Thr  87.76 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000101667  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0868  tRNA-Thr  87.76 
 
 		 78 bp  50.1  0.00007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000000717541  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5019  tRNA-Thr  87.76 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00213455  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5033  tRNA-Thr  87.76 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000000556895  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5818  tRNA-Thr  87.76 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000508092  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5634  tRNA-Thr  87.76 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.109335  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5713  tRNA-Thr  87.76 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.0000838851  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5740  tRNA-Thr  87.76 
 
 		 78 bp  50.1  0.00007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00013213  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Thr-1  tRNA-Thr  87.76 
 
 		 79 bp  50.1  0.00007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Thr-5  tRNA-Thr  87.76 
 
 		 79 bp  50.1  0.00007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000616859  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Thr-4  tRNA-Thr  87.76 
 
 		 79 bp  50.1  0.00007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000285821  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Thr-2  tRNA-Thr  87.76 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.181325  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Thr-1  tRNA-Thr  87.76 
 
 		 79 bp  50.1  0.00007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000228312  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Thr-6  tRNA-Thr  87.76 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000599237  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Thr-5  tRNA-Thr  87.76 
 
 		 79 bp  50.1  0.00007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00616299  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Thr-4  tRNA-Thr  87.76 
 
 		 79 bp  50.1  0.00007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0135529  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Thr-2  tRNA-Thr  87.76 
 
 		 79 bp  50.1  0.00007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0019  tRNA-Thr  87.76 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0021023  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Thr-4  tRNA-Thr  87.76 
 
 		 79 bp  50.1  0.00007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000512626  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Thr-3  tRNA-Thr  87.76 
 
 		 79 bp  50.1  0.00007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0015534  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Thr-1  tRNA-Thr  87.76 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0166054  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5731  tRNA-Thr  87.76 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000447208  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5717  tRNA-Thr  87.76 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0497374  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5702  tRNA-Thr  87.76 
 
 		 73 bp  50.1  0.00007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00210319  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5678  tRNA-Thr  87.76 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000591942  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0081  tRNA-Thr  87.76 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.0000000716294  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Thr-2  tRNA-Thr  87.76 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000472522  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Thr-3  tRNA-Thr  87.76 
 
 		 73 bp  50.1  0.00007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000298609  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Thr-4  tRNA-Thr  87.76 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0435847  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0695  tRNA-Thr  87.76 
 
 		 73 bp  50.1  0.00007  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_4297  tRNA-Arg  88.46 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.801361  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_R0005  tRNA-Thr  90 
 
 		 72 bp  48.1  0.0003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.218351  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_R0040  tRNA-Arg  88.46 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31670  tRNA-Thr  90 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_R0016  tRNA-Arg  88.46 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.448611  normal  0.584402 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_AR0033  tRNA-Thr  90 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_R0021  tRNA-Thr  93.55 
 
 		 72 bp  46.1  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_R0010  tRNA-Thr  86.27 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0181986  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_R0022  tRNA-Thr  86.27 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.0000000830353  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0022  tRNA-Thr  86.27 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000272603  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0068  tRNA-Thr  86.27 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00328675 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0034  tRNA-Thr  86.27 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_R0015  tRNA-Thr  86.27 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000034077  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0036  tRNA-Thr  88.1 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.290713  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0065  tRNA-Thr  88.1 
 
 		 73 bp  44.1  0.005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00709117  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0079  tRNA-Thr  88.1 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0289577  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_R0011  tRNA-Thr  85.19 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00000399709  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0038  tRNA-Lys  85.19 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0061  tRNA-Thr  85.19 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.502238  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_R0054  tRNA-Thr  96.15 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0076  tRNA-Thr  88.1 
 
 		 73 bp  44.1  0.005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0086  tRNA-Thr  88.1 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_R0078  tRNA-Asn  88.1 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_R0048  tRNA-Lys  91.18 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00154367  hitchhiker  0.0000000000357409 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0019  tRNA-Thr  96.15 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  tRNA-Thr-1  tRNA-Thr  88.1 
 
 		 73 bp  44.1  0.005  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0478027  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0013  tRNA-Thr  88.1 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  6.71951e-17  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>