299 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_R0049 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013946  Mrub_R0049  tRNA-Asn  100 
 
 		 76 bp  151  3e-35  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000556498  normal  0.485056 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_R0053  tRNA-Asn  92.96 
 
 		 76 bp  101  2e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_R0052  tRNA-Asn  89.47 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.292372  normal  0.128808 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_R0073  tRNA-Asn  88.89 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_R0078  tRNA-Asn  88.89 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.184642 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_R0031  tRNA-Asn  88.89 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0885898  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_R0076  tRNA-Asn  88.89 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_R0076  tRNA-Asn  88.89 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.509004  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_R0002  tRNA-Asn  88.73 
 
 		 76 bp  77.8  0.0000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.409498 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_R0075  tRNA-Asn  87.5 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_R0067  tRNA-Asn  87.5 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.143044  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_R0056  tRNA-Asn  87.5 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.880886  decreased coverage  0.00985409 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_R0035  tRNA-Asn  87.32 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1392  tRNA-Asn  90.91 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_R0005  tRNA-Asn  95.12 
 
 		 72 bp  65.9  0.000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.404272  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_R0052  tRNA-Asn  95.12 
 
 		 72 bp  65.9  0.000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_R0003  tRNA-Asn  95.12 
 
 		 72 bp  65.9  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.173284  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_tRNAAsnVIMSS1309105  tRNA-Asn  95.12 
 
 		 72 bp  65.9  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.512806  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_tRNAAsnVIMSS1309137  tRNA-Asn  95.12 
 
 		 72 bp  65.9  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.898434  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_tRNAAsnVIMSS1309287  tRNA-Asn  95.12 
 
 		 72 bp  65.9  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.781392 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_tRNAAsnVIMSS1309178  tRNA-Asn  95.12 
 
 		 72 bp  65.9  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_R0017  tRNA-Asn  88.33 
 
 		 75 bp  63.9  0.000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_R0033  tRNA-Asn  88.33 
 
 		 75 bp  63.9  0.000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0102741  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0049  tRNA-Asn  86.11 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  unclonable  0.000000000433504  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0050  tRNA-Asn  86.11 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  unclonable  0.000000000354715  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0051  tRNA-Asn  86.11 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  unclonable  0.000000000442391  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_R0039  tRNA-Asn  86.84 
 
 		 75 bp  63.9  0.000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.268211  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_R0027  tRNA-Asn  86.84 
 
 		 75 bp  63.9  0.000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.103485  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_R0034    88.14 
 
 		 75 bp  61.9  0.00000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.025116  hitchhiker  0.0090759 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_R0028  tRNA-Asn  88.14 
 
 		 75 bp  61.9  0.00000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.246384  normal  0.65431 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_R0045  tRNA-Asn  92.16 
 
 		 72 bp  61.9  0.00000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  unclonable  0.00000031214  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_R0052  tRNA-Lys  87.93 
 
 		 76 bp  60  0.00000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0175495  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2046  tRNA-Lys  87.93 
 
 		 78 bp  60  0.00000008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000370287  hitchhiker  0.00336958 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4248  tRNA-Lys  88.89 
 
 		 71 bp  60  0.00000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000404741  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4239  tRNA-Lys  87.93 
 
 		 78 bp  60  0.00000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00412423  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_R0071  tRNA-Lys  87.93 
 
 		 76 bp  60  0.00000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_R0045  tRNA-Lys  87.93 
 
 		 76 bp  60  0.00000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.315592  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4247  tRNA-Lys  88.89 
 
 		 71 bp  60  0.00000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000042551  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_t43  tRNA-Asn  86.3 
 
 		 72 bp  58  0.0000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.546364  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0023  tRNA-Met  88.52 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00191996  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_R0015  tRNA-Lys  88.46 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.424743  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_R0046  tRNA-Asn  84.72 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000652879 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_AR0031  tRNA-Asn  84.72 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.0000643005  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_R0008  tRNA-Asn  94.44 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_R0020  tRNA-Asn  94.44 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_R0024  tRNA-Asn  84.72 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.0077208  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_R0025  tRNA-Asn  84.72 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_R0023  tRNA-Asn  94.44 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00104311  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_t00017  tRNA-Lys  88.24 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00000192994  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_t00019  tRNA-Lys  88.24 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000148305  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_t00020  tRNA-Lys  88.24 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000893076  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_t00021  tRNA-Lys  88.24 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000923528  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_t00044  tRNA-Lys  88.24 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000150882  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0054  tRNA-Lys  88.24 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000153086  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0055  tRNA-Lys  88.24 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000177997  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0058  tRNA-Lys  88.24 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000188503  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0060  tRNA-Lys  88.24 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  1.42893e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5020  tRNA-Lys  88.24 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000000079938  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2557  tRNA-Lys  88.24 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.0000000000373976  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0770  tRNA-Lys  88.24 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.0000000000739048  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_R0062  tRNA-Lys  88.24 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000000012796  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_R0065  tRNA-Lys  88.24 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000000124878  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_R0063  tRNA-Lys  88.24 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000000000152813  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_R0053  tRNA-Lys  88.24 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000000000619589  hitchhiker  0.0000900565 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_R0068  tRNA-Lys  88.24 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000208772  normal  0.273161 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_R0067  tRNA-Lys  88.24 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000904848  normal  0.171031 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_R0012  tRNA-Asn  94.29 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00142633  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_R0073  tRNA-Lys  88.24 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000000623521  normal  0.270802 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_R0051  tRNA-Lys  88.24 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000000000619589  hitchhiker  0.0000190999 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4660  tRNA-Lys  88.24 
 
 		 78 bp  54  0.000005  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  2.11514e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00467  tRNA-Lys  88.24 
 
 		 73 bp  54  0.000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_R0025  tRNA-Asn  90.2 
 
 		 72 bp  54  0.000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.691429  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_R0080  tRNA-Lys  88.24 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.0000000000294531  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_R0052  tRNA-Lys  88.24 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000000000683016  hitchhiker  0.000091513 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0766  tRNA-Lys  88.24 
 
 		 78 bp  54  0.000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.000000000107183  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_R0071  tRNA-Lys  88.24 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000000577417  normal  0.268649 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0458  tRNA-Lys  88.24 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_R0013  tRNA-Asn  94.29 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_R0036  tRNA-Lys  88.24 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.00000000584737  hitchhiker  0.00132337 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4250  tRNA-Lys  88.24 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000179224  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_R0069  tRNA-Lys  88.24 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000000622929  normal  0.276829 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_R0039  tRNA-Lys  88.24 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000000375421  normal  0.109121 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_t0407  tRNA-Asn  87.27 
 
 		 73 bp  54  0.000005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.000764097  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_t0408  tRNA-Asn  87.27 
 
 		 73 bp  54  0.000005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.000000233964  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_R0018  tRNA-Lys  88.24 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000000646357  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4253  tRNA-Lys  88.24 
 
 		 78 bp  54  0.000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  4.87819e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4252  tRNA-Lys  88.24 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000173353  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00376  tRNA-Lys  88.24 
 
 		 73 bp  54  0.000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4655  tRNA-Lys  88.24 
 
 		 78 bp  54  0.000005  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  8.59319e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0772  tRNA-Lys  88.24 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000000175235  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06830  tRNA-Lys  88.24 
 
 		 73 bp  54  0.000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00251  tRNA-Lys  88.24 
 
 		 73 bp  54  0.000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4659  tRNA-Lys  88.24 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  8.951839999999999e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_R0064  tRNA-Lys  88.24 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000000141775  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4684  tRNA-Lys  88.24 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  2.3682299999999998e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5023  tRNA-Lys  88.24 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000198459  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4661  tRNA-Lys  88.24 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000171362  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4657  tRNA-Lys  88.24 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  9.396889999999999e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_R0049  tRNA-Lys  88.24 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000000000590411  decreased coverage  0.00000280751 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5052  tRNA-Lys  88.24 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.0000000000000715976  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>