More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_1775 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014165  Tbis_1775  aminotransferase class-III  100 
 
 		 468 aa  960    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.256908  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1814  aminotransferase class-III  34.76 
 
 		 470 aa  286  5.999999999999999e-76  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2968  aminotransferase class-III  32.48 
 
 		 471 aa  245  9.999999999999999e-64  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0799  aminotransferase, class III  33.69 
 
 		 484 aa  239  5e-62  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0851  aminotransferase, class III  33.69 
 
 		 484 aa  239  1e-61  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.83306  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2058  aminotransferase class-III  34.51 
 
 		 475 aa  230  5e-59  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0166657  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0819  aminotransferase class-III  35.13 
 
 		 475 aa  226  6e-58  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.149442  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1785  aminotransferase  37.03 
 
 		 463 aa  225  1e-57  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0653  aminotransferase class-III  34.43 
 
 		 467 aa  219  7e-56  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0978357  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1419  aminotransferase class-III  34.29 
 
 		 460 aa  214  3.9999999999999995e-54  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.39856  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17220  ornithine aminotransferase  31.93 
 
 		 462 aa  199  1.0000000000000001e-49  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0106  aminotransferase  29.91 
 
 		 460 aa  189  1e-46  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0539911  hitchhiker  0.0000000000015302 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1277  putrescine--2-oxoglutarate aminotransferase  31.71 
 
 		 457 aa  182  2e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0468315  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1194  aminotransferase class-III  31.02 
 
 		 468 aa  178  2e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.120122  normal  0.0636258 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2083  ornithine/acetylornithine aminotransferase  28.44 
 
 		 458 aa  175  1.9999999999999998e-42  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.128445  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3528  putrescine--2-oxoglutarate aminotransferase  30.29 
 
 		 459 aa  174  3.9999999999999995e-42  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.31743 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1580  aminotransferase class-III  30.63 
 
 		 411 aa  172  1e-41  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.118025  normal  0.128058 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1416  putrescine--2-oxoglutarate aminotransferase  30.36 
 
 		 477 aa  168  2e-40  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0628  putrescine aminotransferase  29.84 
 
 		 429 aa  168  2e-40  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1304  putrescine--2-oxoglutarate aminotransferase  30.6 
 
 		 472 aa  168  2e-40  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.0000448411  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3367  putrescine--2-oxoglutarate aminotransferase  29.84 
 
 		 429 aa  168  2e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02892  hypothetical protein  29.84 
 
 		 459 aa  168  2e-40  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02942  putrescine:2-oxoglutaric acid aminotransferase, PLP-dependent  29.84 
 
 		 468 aa  167  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4387  putrescine--2-oxoglutarate aminotransferase  29.84 
 
 		 459 aa  167  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3540  putrescine--2-oxoglutarate aminotransferase  29.84 
 
 		 429 aa  167  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0627  putrescine--2-oxoglutarate aminotransferase  29.84 
 
 		 429 aa  167  4e-40  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3255  putrescine--2-oxoglutarate aminotransferase  29.62 
 
 		 429 aa  166  6.9999999999999995e-40  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2699  putrescine--2-oxoglutarate aminotransferase  30.56 
 
 		 472 aa  166  8e-40  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1819  putrescine--2-oxoglutarate aminotransferase  30.44 
 
 		 477 aa  162  1e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0809  acetylornithine aminotransferase, putative  27.59 
 
 		 462 aa  161  2e-38  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1430  hypothetical protein  30.84 
 
 		 448 aa  161  3e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.360398  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6399  hypothetical protein  30.84 
 
 		 448 aa  161  3e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.755332  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3479  putrescine--2-oxoglutarate aminotransferase  31.08 
 
 		 459 aa  160  6e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3409  putrescine--2-oxoglutarate aminotransferase  31.08 
 
 		 459 aa  160  6e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3405  putrescine--2-oxoglutarate aminotransferase  31.08 
 
 		 459 aa  160  6e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3575  putrescine--2-oxoglutarate aminotransferase  31.08 
 
 		 459 aa  159  9e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.328531 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3513  putrescine--2-oxoglutarate aminotransferase  30.81 
 
 		 459 aa  158  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000252781 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2220  aminotransferase class-III  28.67 
 
 		 411 aa  157  4e-37  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0761  aminotransferase class-III  28.15 
 
 		 469 aa  153  8e-36  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS04713  putative aminotransferase protein  30.32 
 
 		 845 aa  152  1e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.924872 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2975  aminotransferase  29.21 
 
 		 453 aa  151  2e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.854958  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1731  aminotransferase class-III  28.25 
 
 		 463 aa  150  3e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0385469 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1728  aminotransferase class-III  27.69 
 
 		 463 aa  151  3e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00289082 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0226  acetylornithine aminotransferase  32.21 
 
 		 396 aa  150  4e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4253  aminotransferase class-III  28.24 
 
 		 463 aa  149  9e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0637  acetylornithine aminotransferase  28.34 
 
 		 418 aa  149  9e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00130856  normal  0.274942 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7208  aminotransferase class-III  28.8 
 
 		 457 aa  149  9e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.796358 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3141  acetylornithine transaminase protein  32.94 
 
 		 397 aa  148  2.0000000000000003e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.759672  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3568  aminotransferase class-III  27.92 
 
 		 463 aa  148  2.0000000000000003e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0230  aminotransferase  28.97 
 
 		 457 aa  149  2.0000000000000003e-34  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.603227 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1842  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  28.74 
 
 		 399 aa  147  3e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.716815  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3173  acetylornithine aminotransferase  29.95 
 
 		 398 aa  147  6e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.324258  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02850  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  33.43 
 
 		 399 aa  146  7.0000000000000006e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.0000577952  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0481  acetylornithine transaminase protein  30.24 
 
 		 402 aa  145  1e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1291  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  28.61 
 
 		 393 aa  145  1e-33  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0338748 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1409  acetylornithine transaminase protein  30.22 
 
 		 396 aa  145  2e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.111439  normal  0.291313 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1566  acetylornithine aminotransferase  27.45 
 
 		 395 aa  145  2e-33  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0150  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  30.54 
 
 		 405 aa  144  2e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0566  4-aminobutyrate aminotransferase  29.95 
 
 		 428 aa  145  2e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3150  acetylornithine aminotransferase  28.31 
 
 		 399 aa  144  3e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2601  aminotransferase class-III  26.98 
 
 		 451 aa  144  3e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.456108  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2204  acetylornithine aminotransferase  28.07 
 
 		 390 aa  144  3e-33  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2872  acetylornithine aminotransferase  29.2 
 
 		 397 aa  144  4e-33  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0570  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  33.14 
 
 		 388 aa  144  4e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1359  acetylornithine transaminase protein  31.82 
 
 		 395 aa  144  4e-33  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.592193  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0406  acetylornithine aminotransferase  33.14 
 
 		 388 aa  144  4e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2288  acetylornithine and succinylornithine aminotransferases  31.34 
 
 		 396 aa  144  4e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.37355  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0513  acetylornithine transaminase protein  32.73 
 
 		 403 aa  143  5e-33  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.508573 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2263  aminotransferase class-III  27.69 
 
 		 463 aa  144  5e-33  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0996567 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0353  acetylornithine aminotransferase  28.5 
 
 		 395 aa  144  5e-33  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00220895 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1024  acetylornithine transaminase protein  33.33 
 
 		 395 aa  143  7e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.433962  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2692  acetylornithine aminotransferase  32.29 
 
 		 401 aa  143  8e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3636  acetylornithine aminotransferase  31.18 
 
 		 397 aa  142  9e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0982  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  33.43 
 
 		 410 aa  141  1.9999999999999998e-32  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0871  acetylornithine aminotransferase  27.68 
 
 		 403 aa  142  1.9999999999999998e-32  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0832  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  30.84 
 
 		 400 aa  142  1.9999999999999998e-32  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0150295 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0626  acetylornithine aminotransferase  30.56 
 
 		 426 aa  141  1.9999999999999998e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.882273  normal  0.369402 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1219  aminotransferase class-III  35.15 
 
 		 492 aa  142  1.9999999999999998e-32  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0656786  normal  0.678095 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0842  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  31.67 
 
 		 399 aa  141  3e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0215856 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2400  4-aminobutyrate aminotransferase  31.91 
 
 		 430 aa  141  3e-32  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.681516  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1218  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  31.44 
 
 		 402 aa  140  3e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.525687  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2287  acetylornithine aminotransferase  31.93 
 
 		 402 aa  141  3e-32  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.194315 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3741  acetylornithine aminotransferase  30.9 
 
 		 397 aa  141  3e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1907  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  30.42 
 
 		 387 aa  140  3.9999999999999997e-32  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0119007  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0426  acetylornithine aminotransferase  27.01 
 
 		 396 aa  140  3.9999999999999997e-32  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0269327  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2903  4-aminobutyrate aminotransferase  34.93 
 
 		 438 aa  140  3.9999999999999997e-32  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0048698  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1040  acetylornithine aminotransferase  31.12 
 
 		 385 aa  140  4.999999999999999e-32  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000111021  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0029  ornithine aminotransferase  27.95 
 
 		 402 aa  140  7e-32  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.628841  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1072  acetylornithine aminotransferase  31.42 
 
 		 385 aa  140  7e-32  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0280572  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0869  aminotransferase class-III  27.79 
 
 		 395 aa  139  7.999999999999999e-32  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0039218 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0640  acetylornithine aminotransferase  28.01 
 
 		 403 aa  139  7.999999999999999e-32  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.41902  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0151  acetylornithine aminotransferase  31.56 
 
 		 399 aa  139  1e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0301  acetylornithine transaminase protein  27.44 
 
 		 403 aa  139  1e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.171719  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2414  acetylornithine aminotransferase  29.17 
 
 		 396 aa  139  1e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2006  putrescine--2-oxoglutarate aminotransferase  29.1 
 
 		 450 aa  139  1e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3316  ornithine aminotransferase  29.95 
 
 		 396 aa  139  1e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.271295  normal  0.0695851 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0314  acetylornithine transaminase protein  27.44 
 
 		 403 aa  139  1e-31  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0483  acetylornithine aminotransferase  28.74 
 
 		 395 aa  138  2e-31  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2493  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  28.09 
 
 		 397 aa  138  2e-31  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3708  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  34.14 
 
 		 412 aa  138  2e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.339324  normal  0.0114471 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>