187 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_0632 on replicon NC_013889
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013889  TK90_0632  iron-sulfur cluster-binding protein  100 
 
 
230 aa  480  1e-135  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0958053 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2216  hypothetical protein  98.7 
 
 
230 aa  476  1e-133  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.278188  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2185  hypothetical protein  92.98 
 
 
228 aa  452  1.0000000000000001e-126  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.32077  hitchhiker  0.00000000457726 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2555  iron-sulfur cluster-binding protein  92.98 
 
 
228 aa  452  1.0000000000000001e-126  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.461611  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1082  hypothetical protein  55 
 
 
240 aa  270  2e-71  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.165945  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2099  heterodisulfide reductase, subunit C (HdrC-1)  47.25 
 
 
280 aa  240  1e-62  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1547  heterodisulfide reductase subunit C-like protein  44.95 
 
 
280 aa  225  4e-58  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.0378845 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0964  hypothetical protein  44.44 
 
 
239 aa  196  3e-49  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.570063  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1697  hypothetical protein  30.71 
 
 
246 aa  126  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000729724 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1953  heterodisulfide reductase subunit HdrC  46.15 
 
 
236 aa  80.1  0.00000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1261  CoB--CoM heterodisulfide reductase  31.53 
 
 
502 aa  64.3  0.000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0394  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  38.27 
 
 
189 aa  63.5  0.000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00274296  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1307  CoB--CoM heterodisulfide reductase  32.14 
 
 
497 aa  63.5  0.000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1574  putative heterodisulfide reductase, C subunit  27.42 
 
 
174 aa  63.2  0.000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1028  heterodisulfide reductase, subunit C/succinate dehydrogenase, subunit C  34.52 
 
 
502 aa  62.8  0.000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00356665  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1108  heterodisulfide reductase, subunit C/succinate dehydrogenase, subunit C  30.63 
 
 
502 aa  62  0.000000007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.785263  normal  0.633567 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0032  heterodisulfide reductase subunit  30.3 
 
 
194 aa  60.8  0.00000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1201  CoB--CoM heterodisulfide reductase  32.14 
 
 
508 aa  60.1  0.00000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0710444  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0809  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  34.09 
 
 
190 aa  59.7  0.00000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000061408 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0861  heterodisulfide reductase subunit  30.3 
 
 
194 aa  60.1  0.00000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0358  putative heterodisulfide reductase, C subunit  29.2 
 
 
187 aa  59.3  0.00000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0151  heterodisulfide reductase subunit C-like protein  36.49 
 
 
192 aa  59.3  0.00000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3581  heterodisulfide reductase subunit C-like protein  31.31 
 
 
192 aa  59.3  0.00000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1335  heterodisulfide reductase, C subunit  29.7 
 
 
177 aa  58.5  0.00000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0848  heterodisulfide reductase, C subunit  34.52 
 
 
202 aa  58.9  0.00000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.12259  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2344  putative heterodisulfide reductase, C subunit  27.45 
 
 
188 aa  58.5  0.00000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.628999  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0031  heterodisulfide reductase subunit  33.78 
 
 
194 aa  58.5  0.00000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0092  heterodisulfide reductase subunit  29.29 
 
 
182 aa  57.4  0.0000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3574  Heterodisulfide reductase subunit C-like protein  36.21 
 
 
202 aa  57.8  0.0000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0563  putative heterodisulfide reductase, C subunit  32.58 
 
 
211 aa  57.4  0.0000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17750  hypothetical protein  38.71 
 
 
204 aa  57  0.0000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3675  putative heterodisulfide reductase, C subunit  35.48 
 
 
195 aa  57.4  0.0000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.141926 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1700  putative heterodisulfide reductase, C subunit  28.4 
 
 
193 aa  56.6  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000309238 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3424  heterodisulfide reductase subunit  33.78 
 
 
216 aa  57  0.0000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0417  putative heterodisulfide reductase, C subunit  28.85 
 
 
194 aa  56.6  0.0000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.344766 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1351  heterodisulfide reductase, C subunit  34.09 
 
 
193 aa  56.6  0.0000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.452628 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0633  putative heterodisulfide reductase, C subunit  34.65 
 
 
200 aa  56.6  0.0000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2663  Heterodisulfide reductase subunit C-like protein  27.91 
 
 
129 aa  55.8  0.0000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2085  protein of unknown function DUF224, cysteine-rich region  25.87 
 
 
387 aa  55.8  0.0000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.32982  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1252  heterodisulfide reductase subunit C-like protein  39.66 
 
 
160 aa  55.8  0.0000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0975  heterodisulfide reductase subunit C-like protein  31.17 
 
 
133 aa  55.5  0.0000006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.826747  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0911  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  32.47 
 
 
367 aa  54.7  0.000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2905  FAD linked oxidase domain-containing protein  35.59 
 
 
934 aa  54.7  0.000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.520733  normal  0.168522 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1836  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  34.94 
 
 
191 aa  53.5  0.000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.139025  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1882  heterodisulfide reductase subunit C  31.33 
 
 
195 aa  53.9  0.000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2098  heterodisulfide reductase, C subunit  27.36 
 
 
193 aa  53.9  0.000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2241  CoB/CoM heterodisulfide reductase, subunit C  29.52 
 
 
194 aa  53.5  0.000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0469153  normal  0.0166067 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2735  FAD linked oxidase domain-containing protein  34.75 
 
 
934 aa  53.1  0.000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2808  FAD linked oxidase domain-containing protein  34.75 
 
 
934 aa  53.5  0.000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0322  heterodisulfide reductase, C subunit  29.13 
 
 
186 aa  52.8  0.000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.554815 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2808  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  27.1 
 
 
383 aa  52.4  0.000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0820  putative heterodisulfide reductase, C subunit  25.47 
 
 
192 aa  52.8  0.000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.123 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1604  CoB--CoM heterodisulfide reductase, subunit C  30 
 
 
184 aa  52.4  0.000006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.455044  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0539  CoB--CoM heterodisulfide reductase subunit C  30 
 
 
184 aa  52.4  0.000006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.214937  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0308  CoB--CoM heterodisulfide reductase  30 
 
 
184 aa  52.4  0.000006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0826  heterodisulfide reductase, C subunit  29.03 
 
 
186 aa  52.4  0.000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.185232  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1446  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  33.33 
 
 
383 aa  52  0.000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1207  heterodisulfide reductase, C subunit  26.67 
 
 
204 aa  52  0.000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0590  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  31.25 
 
 
193 aa  52  0.000008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.321199  normal  0.0726 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1452  hypothetical protein  26.61 
 
 
412 aa  51.6  0.00001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.275657 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1078  heterodisulfide reductase subunit C  29.89 
 
 
253 aa  51.6  0.00001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.114051  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1353  FAD linked oxidase domain-containing protein  28.21 
 
 
934 aa  51.2  0.00001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3008  FAD linked oxidase domain protein  28.21 
 
 
934 aa  51.2  0.00001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000527922 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1339  FAD linked oxidase domain-containing protein  28.21 
 
 
934 aa  51.2  0.00001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2995  FAD linked oxidase domain-containing protein  33.05 
 
 
939 aa  50.4  0.00002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0198  heterodisulfide reductase subunit C  27.06 
 
 
213 aa  50.4  0.00002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0640  CoB--CoM heterodisulfide reductase subunit C  29.63 
 
 
161 aa  50.4  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0841  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  32.26 
 
 
405 aa  50.8  0.00002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.936764  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0439  heterodisulfide reductase subunit C-like  30.61 
 
 
156 aa  50.4  0.00002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2794  FAD linked oxidase domain-containing protein  32.2 
 
 
934 aa  50.8  0.00002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1325  heterodisulfide reductase, C subunit  22.22 
 
 
188 aa  50.8  0.00002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1271  FAD linked oxidase domain-containing protein  32.2 
 
 
934 aa  50.4  0.00002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0752852  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1376  FAD linked oxidase domain-containing protein  28.21 
 
 
934 aa  50.4  0.00002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.915749 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0377  CoB--CoM heterodisulfide reductase  32.5 
 
 
184 aa  50.4  0.00002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0908  FAD linked oxidase domain-containing protein  28.99 
 
 
942 aa  50.4  0.00002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000203424 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2516  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  29.46 
 
 
408 aa  50.4  0.00003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0531711  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3980  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  27.45 
 
 
408 aa  50.1  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.280221 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2440  iron-sulfur cluster-binding protein  29.66 
 
 
935 aa  50.1  0.00003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2317  heterodisulfide reductase subunit C  27.06 
 
 
213 aa  50.1  0.00003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3524  heterodisulfide reductase, C subunit  31.46 
 
 
185 aa  49.7  0.00004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1801  hypothetical protein  29.23 
 
 
372 aa  49.7  0.00004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.606792 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2103  heterodisulfide reductase subunit C (HdrC-2)  27.52 
 
 
230 aa  49.3  0.00005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.666222  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0625  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  30.38 
 
 
193 aa  49.3  0.00005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0765561  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1521  iron-sulfur cluster-binding protein  33.9 
 
 
914 aa  49.3  0.00006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1806  heterodisulfide reductase, C subunit  29.63 
 
 
189 aa  48.9  0.00006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.577988 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1285  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  33.33 
 
 
385 aa  48.9  0.00007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.699767  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1196  heterodisulfide reductase, C subunit  26.8 
 
 
184 aa  47.8  0.0001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0648  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  30.71 
 
 
408 aa  48.1  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3961  DNA binding domain-containing protein  25.96 
 
 
314 aa  48.1  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2133  heterodisulfide reductase, transmembrane subunit, putative  32.18 
 
 
384 aa  48.1  0.0001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.411689  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0718  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  28.68 
 
 
408 aa  48.1  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1543  heterodisulfide reductase subunit C-like protein  29.49 
 
 
230 aa  47.8  0.0001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.0154389 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1001  heterodisulfide reductase, putative  30.86 
 
 
398 aa  47.4  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.284636  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0622  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  32.54 
 
 
408 aa  47.4  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0494165  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0771  oxidoreductase, selenocysteine-containing  33.33 
 
 
432 aa  47.4  0.0002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.457197  normal  0.324635 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0220  succinate dehydrogenase/fumarate reductase iron-sulfur subunit  23.81 
 
 
487 aa  47.4  0.0002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.804076  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4473  hypothetical protein  27.94 
 
 
435 aa  47  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000823038 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0307  CoB--CoM heterodisulfide reductase  32 
 
 
196 aa  47.8  0.0002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.802269  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1289  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  28.8 
 
 
408 aa  46.6  0.0003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1176  hypothetical protein  33.9 
 
 
375 aa  46.6  0.0003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.390877 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>