138 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daud_1252 on replicon NC_010424
Organism: Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010424  Daud_1252  heterodisulfide reductase subunit C-like protein  100 
 
 
160 aa  326  9e-89  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4092  heterodisulfide reductase subunit C-like  40 
 
 
148 aa  116  9.999999999999999e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.737599  normal  0.409471 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0975  heterodisulfide reductase subunit C-like protein  44.35 
 
 
133 aa  111  3e-24  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.826747  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0563  putative heterodisulfide reductase, C subunit  50 
 
 
211 aa  99  3e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0394  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  51.14 
 
 
189 aa  94  8e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00274296  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2317  heterodisulfide reductase subunit C  48.35 
 
 
213 aa  93.6  1e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0198  heterodisulfide reductase subunit C  47.25 
 
 
213 aa  92.8  2e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2098  heterodisulfide reductase, C subunit  44.79 
 
 
193 aa  89.7  1e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0031  heterodisulfide reductase subunit  44.21 
 
 
194 aa  89.4  2e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0032  heterodisulfide reductase subunit  44.21 
 
 
194 aa  89  3e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3424  heterodisulfide reductase subunit  37.5 
 
 
216 aa  88.2  4e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1108  heterodisulfide reductase, subunit C/succinate dehydrogenase, subunit C  41.58 
 
 
502 aa  87.8  6e-17  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.785263  normal  0.633567 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0151  heterodisulfide reductase subunit C-like protein  41.05 
 
 
192 aa  87.8  6e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3574  Heterodisulfide reductase subunit C-like protein  40.2 
 
 
202 aa  87.8  6e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3581  heterodisulfide reductase subunit C-like protein  41.05 
 
 
192 aa  87.4  7e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1196  heterodisulfide reductase, C subunit  39.64 
 
 
184 aa  86.7  1e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0322  heterodisulfide reductase, C subunit  49.43 
 
 
186 aa  87  1e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.554815 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0358  putative heterodisulfide reductase, C subunit  45.12 
 
 
187 aa  85.9  2e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1201  CoB--CoM heterodisulfide reductase  41.57 
 
 
508 aa  86.3  2e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0710444  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0826  heterodisulfide reductase, C subunit  48.31 
 
 
186 aa  85.5  3e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.185232  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1028  heterodisulfide reductase, subunit C/succinate dehydrogenase, subunit C  44.32 
 
 
502 aa  85.1  4e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00356665  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0861  heterodisulfide reductase subunit  42.11 
 
 
194 aa  84.7  4e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0092  heterodisulfide reductase subunit  46.34 
 
 
182 aa  84.7  5e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1261  CoB--CoM heterodisulfide reductase  43.02 
 
 
502 aa  83.2  0.000000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1351  heterodisulfide reductase, C subunit  46.99 
 
 
193 aa  83.2  0.000000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.452628 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2344  putative heterodisulfide reductase, C subunit  46.05 
 
 
188 aa  83.2  0.000000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.628999  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1335  heterodisulfide reductase, C subunit  45.68 
 
 
177 aa  83.6  0.000000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1207  heterodisulfide reductase, C subunit  40.57 
 
 
204 aa  82  0.000000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1325  heterodisulfide reductase, C subunit  38.05 
 
 
188 aa  82  0.000000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1307  CoB--CoM heterodisulfide reductase  40.23 
 
 
497 aa  81.3  0.000000000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1700  putative heterodisulfide reductase, C subunit  42.11 
 
 
193 aa  80.5  0.000000000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000309238 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3524  heterodisulfide reductase, C subunit  44.55 
 
 
185 aa  79.7  0.00000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1882  heterodisulfide reductase subunit C  39.6 
 
 
195 aa  80.1  0.00000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1574  putative heterodisulfide reductase, C subunit  43.33 
 
 
174 aa  78.2  0.00000000000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0820  putative heterodisulfide reductase, C subunit  42.11 
 
 
192 aa  78.2  0.00000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.123 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1348  heterodisulfide reductase, C subunit  38.64 
 
 
192 aa  77.8  0.00000000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.511519 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0417  putative heterodisulfide reductase, C subunit  43.24 
 
 
194 aa  77.8  0.00000000000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.344766 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2663  Heterodisulfide reductase subunit C-like protein  33.9 
 
 
129 aa  77.8  0.00000000000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17750  hypothetical protein  39.36 
 
 
204 aa  77.4  0.00000000000007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0809  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  44.32 
 
 
190 aa  77.4  0.00000000000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000061408 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0848  heterodisulfide reductase, C subunit  37.84 
 
 
202 aa  75.5  0.0000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.12259  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0633  putative heterodisulfide reductase, C subunit  37.63 
 
 
200 aa  74.7  0.0000000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1806  heterodisulfide reductase, C subunit  39.76 
 
 
189 aa  73.2  0.000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.577988 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0239  hypothetical protein  32.48 
 
 
194 aa  70.9  0.000000000007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.577493 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0640  CoB--CoM heterodisulfide reductase subunit C  31.67 
 
 
161 aa  68.9  0.00000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0308  CoB--CoM heterodisulfide reductase  30.84 
 
 
184 aa  68.6  0.00000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0539  CoB--CoM heterodisulfide reductase subunit C  30.84 
 
 
184 aa  68.2  0.00000000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.214937  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1604  CoB--CoM heterodisulfide reductase, subunit C  30.84 
 
 
184 aa  68.2  0.00000000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.455044  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3675  putative heterodisulfide reductase, C subunit  47.14 
 
 
195 aa  68.6  0.00000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.141926 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2341  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  35.79 
 
 
439 aa  68.2  0.00000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0377  CoB--CoM heterodisulfide reductase  30.84 
 
 
184 aa  67.8  0.00000000006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1953  heterodisulfide reductase subunit HdrC  35.42 
 
 
236 aa  67.4  0.00000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1516  CoB--CoM heterodisulfide reductase subunit C  33.33 
 
 
164 aa  67.4  0.00000000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000306335  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1161  heterodisulfide reductase subunit C-like protein  40.48 
 
 
203 aa  67  0.00000000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.860285  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0307  CoB--CoM heterodisulfide reductase  37.33 
 
 
196 aa  66.6  0.0000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.802269  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1697  hypothetical protein  37.97 
 
 
246 aa  67  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000729724 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1436  Heterodisulfide reductase subunit C-like protein  30.25 
 
 
533 aa  65.1  0.0000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.695739  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2241  CoB/CoM heterodisulfide reductase, subunit C  34 
 
 
194 aa  65.1  0.0000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0469153  normal  0.0166067 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0771  oxidoreductase, selenocysteine-containing  39.47 
 
 
432 aa  64.7  0.0000000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.457197  normal  0.324635 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1452  hypothetical protein  36.27 
 
 
412 aa  63.2  0.000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.275657 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1543  heterodisulfide reductase subunit C-like protein  36.05 
 
 
230 aa  62.4  0.000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.0154389 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1884  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  40 
 
 
402 aa  62  0.000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.561608  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2103  heterodisulfide reductase subunit C (HdrC-2)  37.18 
 
 
230 aa  61.6  0.000000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.666222  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1446  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  37.21 
 
 
383 aa  61.6  0.000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1517  CoB--CoM heterodisulfide reductase, subunit C  34.67 
 
 
192 aa  61.2  0.000000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.507445  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0414  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  37.14 
 
 
451 aa  61.2  0.000000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.137763 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1646  heterodisulfide reductase subunit C  31.2 
 
 
210 aa  60.8  0.000000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0261138  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2808  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  36.05 
 
 
383 aa  60.8  0.000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3201  heterodisulfide reductase, transmembrane subunit, putative  30.08 
 
 
408 aa  60.8  0.000000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0402  CoB--CoM heterodisulfide reductase  33.33 
 
 
192 aa  60.5  0.000000008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0280446  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0433  CoB--CoM heterodisulfide reductase  32 
 
 
192 aa  60.5  0.000000009  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0474  CoB--CoM heterodisulfide reductase  32.58 
 
 
193 aa  60.5  0.000000009  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.561183  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2085  protein of unknown function DUF224, cysteine-rich region  34.88 
 
 
387 aa  60.5  0.00000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.32982  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1734  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  32.04 
 
 
385 aa  58.9  0.00000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1113  heterodisulfide reductase, transmembrane subunit, putative  34.69 
 
 
384 aa  58.5  0.00000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0397617  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0625  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  31.87 
 
 
193 aa  58.2  0.00000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0765561  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1783  hypothetical protein  32.22 
 
 
386 aa  58.5  0.00000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2146  hypothetical protein  33.33 
 
 
441 aa  58.2  0.00000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0590  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  29.2 
 
 
193 aa  57.8  0.00000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.321199  normal  0.0726 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2099  heterodisulfide reductase, subunit C (HdrC-1)  30.68 
 
 
280 aa  57.8  0.00000007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1836  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  32.98 
 
 
191 aa  57.8  0.00000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.139025  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0911  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  36.36 
 
 
367 aa  56.6  0.0000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1176  hypothetical protein  35.42 
 
 
375 aa  57  0.0000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.390877 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2133  heterodisulfide reductase, transmembrane subunit, putative  29.35 
 
 
384 aa  56.6  0.0000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.411689  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2185  hypothetical protein  32.05 
 
 
228 aa  57  0.0000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.32077  hitchhiker  0.00000000457726 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2555  iron-sulfur cluster-binding protein  32.05 
 
 
228 aa  57  0.0000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.461611  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3961  DNA binding domain-containing protein  24.55 
 
 
314 aa  55.8  0.0000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1547  heterodisulfide reductase subunit C-like protein  29.55 
 
 
280 aa  55.8  0.0000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.0378845 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2896  heterodisulfide reductase, transmembrane subunit, putative  29.35 
 
 
384 aa  55.8  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.217971 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1282  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  32.86 
 
 
416 aa  55.5  0.0000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.438227 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2216  hypothetical protein  39.66 
 
 
230 aa  55.5  0.0000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.278188  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0632  iron-sulfur cluster-binding protein  39.66 
 
 
230 aa  55.5  0.0000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0958053 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2551  iron-sulfur cluster-binding protein  32.08 
 
 
239 aa  55.5  0.0000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.802978  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1963  quinone-interacting membrane-bound oxidoreductase complex subunit C  31.03 
 
 
407 aa  55.1  0.0000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00829701 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1078  heterodisulfide reductase subunit C  30.53 
 
 
253 aa  54.7  0.0000006  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.114051  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1801  hypothetical protein  34.44 
 
 
372 aa  54.3  0.0000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.606792 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0439  heterodisulfide reductase subunit C-like  35.06 
 
 
156 aa  53.9  0.0000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0968  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  29.55 
 
 
437 aa  53.5  0.000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.405818  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1082  hypothetical protein  23.93 
 
 
240 aa  52.8  0.000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.165945  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0142  hypothetical protein  34.29 
 
 
418 aa  51.6  0.000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>