176 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_2896 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007519  Dde_1113  heterodisulfide reductase, transmembrane subunit, putative  80.47 
 
 
384 aa  669    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0397617  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2133  heterodisulfide reductase, transmembrane subunit, putative  83.33 
 
 
384 aa  660    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.411689  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2896  heterodisulfide reductase, transmembrane subunit, putative  100 
 
 
384 aa  785    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.217971 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2125  heterodisulfide reductase, transmembrane subunit, putative  66.16 
 
 
393 aa  507  9.999999999999999e-143  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1963  quinone-interacting membrane-bound oxidoreductase complex subunit C  61.22 
 
 
407 aa  489  1e-137  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00829701 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3201  heterodisulfide reductase, transmembrane subunit, putative  59.69 
 
 
408 aa  463  1e-129  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1001  heterodisulfide reductase, putative  40.73 
 
 
398 aa  286  5e-76  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.284636  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0035  heterodisulfide reductase, putative  38.05 
 
 
393 aa  284  2.0000000000000002e-75  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000417872  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1834  heterodisulfide reductase, putative  39.21 
 
 
391 aa  278  8e-74  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0759481  normal  0.0501032 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1582  heterodisulfide reductase, putative  34.88 
 
 
392 aa  256  5e-67  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00374998  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1077  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  27.03 
 
 
382 aa  134  3e-30  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0184362  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1285  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  26.89 
 
 
385 aa  130  3e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.699767  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0911  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  26.68 
 
 
367 aa  117  3e-25  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0625  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  40.66 
 
 
193 aa  85.5  0.000000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0765561  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0239  hypothetical protein  40.45 
 
 
194 aa  81.3  0.00000000000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.577493 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2241  CoB/CoM heterodisulfide reductase, subunit C  35.16 
 
 
194 aa  80.1  0.00000000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0469153  normal  0.0166067 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0590  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  38.2 
 
 
193 aa  79.7  0.00000000000008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.321199  normal  0.0726 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0563  putative heterodisulfide reductase, C subunit  31.21 
 
 
211 aa  79  0.0000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1836  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  36.26 
 
 
191 aa  75.5  0.000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.139025  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0394  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  35.58 
 
 
189 aa  75.5  0.000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00274296  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4092  heterodisulfide reductase subunit C-like  32.73 
 
 
148 aa  75.1  0.000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.737599  normal  0.409471 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2098  heterodisulfide reductase, C subunit  32.71 
 
 
193 aa  74.3  0.000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2663  Heterodisulfide reductase subunit C-like protein  32.98 
 
 
129 aa  71.2  0.00000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1325  heterodisulfide reductase, C subunit  32.58 
 
 
188 aa  70.5  0.00000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1351  heterodisulfide reductase, C subunit  31.52 
 
 
193 aa  70.1  0.00000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.452628 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3424  heterodisulfide reductase subunit  30.77 
 
 
216 aa  68.9  0.0000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1196  heterodisulfide reductase, C subunit  26.55 
 
 
184 aa  69.3  0.0000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0358  putative heterodisulfide reductase, C subunit  32.04 
 
 
187 aa  69.3  0.0000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1452  hypothetical protein  42.5 
 
 
412 aa  68.2  0.0000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.275657 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3675  putative heterodisulfide reductase, C subunit  38.37 
 
 
195 aa  68.6  0.0000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.141926 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0439  heterodisulfide reductase subunit C-like  37.5 
 
 
156 aa  67.8  0.0000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1574  putative heterodisulfide reductase, C subunit  37.21 
 
 
174 aa  67.8  0.0000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1806  heterodisulfide reductase, C subunit  30.48 
 
 
189 aa  68.2  0.0000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.577988 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0151  heterodisulfide reductase subunit C-like protein  29.67 
 
 
192 aa  68.2  0.0000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3581  heterodisulfide reductase subunit C-like protein  29.67 
 
 
192 aa  67.8  0.0000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0032  heterodisulfide reductase subunit  30.77 
 
 
194 aa  67  0.0000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0031  heterodisulfide reductase subunit  31.82 
 
 
194 aa  66.6  0.0000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0092  heterodisulfide reductase subunit  29.67 
 
 
182 aa  65.9  0.000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1517  CoB--CoM heterodisulfide reductase, subunit C  37.97 
 
 
192 aa  65.9  0.000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.507445  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0861  heterodisulfide reductase subunit  29.67 
 
 
194 aa  65.5  0.000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2085  protein of unknown function DUF224, cysteine-rich region  33.65 
 
 
387 aa  65.5  0.000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.32982  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2212  heterodisulfide reductase subunit C  31.37 
 
 
238 aa  65.5  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0191178  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0636  iron-sulfur cluster-binding protein  33.71 
 
 
238 aa  65.1  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.126769 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1700  putative heterodisulfide reductase, C subunit  37.18 
 
 
193 aa  63.9  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000309238 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1446  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  35.87 
 
 
383 aa  63.5  0.000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2808  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  35.87 
 
 
383 aa  63.2  0.000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0539  CoB--CoM heterodisulfide reductase subunit C  38.3 
 
 
184 aa  63.2  0.000000007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.214937  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0308  CoB--CoM heterodisulfide reductase  38.3 
 
 
184 aa  63.5  0.000000007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1604  CoB--CoM heterodisulfide reductase, subunit C  38.3 
 
 
184 aa  63.2  0.000000007  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.455044  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0474  CoB--CoM heterodisulfide reductase  38.75 
 
 
193 aa  63.2  0.000000008  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.561183  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0848  heterodisulfide reductase, C subunit  30.34 
 
 
202 aa  62.8  0.000000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.12259  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3489  citrate utilization protein B  25.07 
 
 
388 aa  62.4  0.00000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.57381  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0402  CoB--CoM heterodisulfide reductase  34.15 
 
 
192 aa  62.4  0.00000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0280446  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0793  CitB domain-containing protein  25.13 
 
 
403 aa  62.4  0.00000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3416  CitB domain protein  23.81 
 
 
408 aa  61.6  0.00000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4071  CitB domain-containing protein  23.66 
 
 
408 aa  61.6  0.00000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0433  CoB--CoM heterodisulfide reductase  34.15 
 
 
192 aa  62  0.00000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0377  CoB--CoM heterodisulfide reductase  40 
 
 
184 aa  61.6  0.00000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0322  heterodisulfide reductase, C subunit  28.57 
 
 
186 aa  60.8  0.00000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.554815 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17750  hypothetical protein  31.82 
 
 
204 aa  60.5  0.00000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2551  iron-sulfur cluster-binding protein  34.21 
 
 
239 aa  60.1  0.00000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.802978  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0826  heterodisulfide reductase, C subunit  30.34 
 
 
186 aa  59.7  0.00000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.185232  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0307  CoB--CoM heterodisulfide reductase  37.33 
 
 
196 aa  59.7  0.00000008  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.802269  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1207  heterodisulfide reductase, C subunit  29.21 
 
 
204 aa  59.3  0.0000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1078  heterodisulfide reductase subunit C  31.96 
 
 
253 aa  59.3  0.0000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.114051  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1335  heterodisulfide reductase, C subunit  28.71 
 
 
177 aa  59.3  0.0000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1882  heterodisulfide reductase subunit C  33.71 
 
 
195 aa  58.5  0.0000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0975  heterodisulfide reductase subunit C-like protein  31.03 
 
 
133 aa  57.8  0.0000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.826747  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3574  Heterodisulfide reductase subunit C-like protein  29.17 
 
 
202 aa  58.2  0.0000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3524  heterodisulfide reductase, C subunit  28.09 
 
 
185 aa  57.4  0.0000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2503  putative ferredoxin  24.12 
 
 
404 aa  57  0.0000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.232616 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4211  Citrate utilization protein B  22.39 
 
 
390 aa  55.8  0.000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0633  putative heterodisulfide reductase, C subunit  28.87 
 
 
200 aa  56.2  0.000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0198  heterodisulfide reductase subunit C  26.97 
 
 
213 aa  55.8  0.000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2344  putative heterodisulfide reductase, C subunit  32.29 
 
 
188 aa  55.8  0.000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.628999  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1252  heterodisulfide reductase subunit C-like protein  29.35 
 
 
160 aa  55.8  0.000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1108  heterodisulfide reductase, subunit C/succinate dehydrogenase, subunit C  25.6 
 
 
502 aa  55.5  0.000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.785263  normal  0.633567 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2317  heterodisulfide reductase subunit C  26.97 
 
 
213 aa  55.5  0.000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5625  CitB domain protein  23.87 
 
 
404 aa  55.5  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1783  hypothetical protein  32.97 
 
 
386 aa  54.7  0.000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1028  heterodisulfide reductase, subunit C/succinate dehydrogenase, subunit C  30 
 
 
502 aa  54.3  0.000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00356665  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0968  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  32 
 
 
437 aa  54.7  0.000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.405818  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0093  hypothetical protein  42.62 
 
 
423 aa  53.9  0.000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1161  heterodisulfide reductase subunit C-like protein  27.36 
 
 
203 aa  53.5  0.000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.860285  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0809  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  31.03 
 
 
190 aa  53.1  0.000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000061408 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0820  putative heterodisulfide reductase, C subunit  29.27 
 
 
192 aa  53.1  0.000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.123 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1176  hypothetical protein  33.75 
 
 
375 aa  52.8  0.000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.390877 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1348  heterodisulfide reductase, C subunit  25 
 
 
192 aa  52.4  0.00001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.511519 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0395  sn-glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit C  31.11 
 
 
424 aa  51.6  0.00002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3531  DNA binding domain-containing protein  33.8 
 
 
308 aa  51.6  0.00003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.635038  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1125  sn-glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit C  25.21 
 
 
499 aa  51.2  0.00003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3814  CitB domain-containing protein  24.02 
 
 
394 aa  51.6  0.00003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.986403 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6302  CitB domain-containing protein  24.94 
 
 
400 aa  51.2  0.00003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0514  sn-glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit C  33.73 
 
 
423 aa  50.8  0.00004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0688  sn-glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit C  27.36 
 
 
413 aa  50.8  0.00004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3552  CitB domain-containing protein  24.34 
 
 
370 aa  50.8  0.00004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0749  citrate utilization protein B  25.57 
 
 
379 aa  50.4  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.762495 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0737  citrate utilization protein B  25.57 
 
 
379 aa  50.1  0.00006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.580161  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1774  hypothetical protein  30.85 
 
 
356 aa  50.1  0.00006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2341  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  35.62 
 
 
439 aa  50.4  0.00006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>