124 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HY04AAS1_1082 on replicon NC_011126
Organism: Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011126  HY04AAS1_1082  hypothetical protein  100 
 
 
240 aa  504  9.999999999999999e-143  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.165945  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2185  hypothetical protein  54.17 
 
 
228 aa  265  2.9999999999999995e-70  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.32077  hitchhiker  0.00000000457726 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2555  iron-sulfur cluster-binding protein  54.17 
 
 
228 aa  265  2.9999999999999995e-70  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.461611  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0632  iron-sulfur cluster-binding protein  54.67 
 
 
230 aa  265  5.999999999999999e-70  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0958053 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2216  hypothetical protein  54.67 
 
 
230 aa  265  5.999999999999999e-70  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.278188  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2099  heterodisulfide reductase, subunit C (HdrC-1)  46.12 
 
 
280 aa  239  2.9999999999999997e-62  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1547  heterodisulfide reductase subunit C-like protein  44.29 
 
 
280 aa  229  4e-59  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.0378845 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0964  hypothetical protein  48.24 
 
 
239 aa  207  1e-52  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.570063  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1697  hypothetical protein  26.29 
 
 
246 aa  104  1e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000729724 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1953  heterodisulfide reductase subunit HdrC  45.78 
 
 
236 aa  89.4  4e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0975  heterodisulfide reductase subunit C-like protein  34.12 
 
 
133 aa  65.1  0.000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.826747  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0640  CoB--CoM heterodisulfide reductase subunit C  28.38 
 
 
161 aa  64.3  0.000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2344  putative heterodisulfide reductase, C subunit  27.72 
 
 
188 aa  62.4  0.000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.628999  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1574  putative heterodisulfide reductase, C subunit  27.03 
 
 
174 aa  61.6  0.00000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0539  CoB--CoM heterodisulfide reductase subunit C  30.19 
 
 
184 aa  60.5  0.00000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.214937  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0308  CoB--CoM heterodisulfide reductase  30.19 
 
 
184 aa  60.5  0.00000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1604  CoB--CoM heterodisulfide reductase, subunit C  30.19 
 
 
184 aa  60.5  0.00000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.455044  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0377  CoB--CoM heterodisulfide reductase  29.91 
 
 
184 aa  59.7  0.00000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2085  protein of unknown function DUF224, cysteine-rich region  28.48 
 
 
387 aa  58.9  0.00000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.32982  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1176  hypothetical protein  36.36 
 
 
375 aa  58.5  0.00000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.390877 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0417  putative heterodisulfide reductase, C subunit  29.63 
 
 
194 aa  58.2  0.0000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.344766 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0433  CoB--CoM heterodisulfide reductase  26.89 
 
 
192 aa  57.4  0.0000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0307  CoB--CoM heterodisulfide reductase  30.28 
 
 
196 aa  57.8  0.0000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.802269  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3574  Heterodisulfide reductase subunit C-like protein  32.18 
 
 
202 aa  57  0.0000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0402  CoB--CoM heterodisulfide reductase  26.05 
 
 
192 aa  56.6  0.0000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0280446  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1517  CoB--CoM heterodisulfide reductase, subunit C  26.05 
 
 
192 aa  56.2  0.0000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.507445  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1516  CoB--CoM heterodisulfide reductase subunit C  39.34 
 
 
164 aa  55.8  0.0000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000306335  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1801  hypothetical protein  42.19 
 
 
372 aa  55.8  0.0000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.606792 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1446  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  26.17 
 
 
383 aa  55.1  0.000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0848  heterodisulfide reductase, C subunit  30.91 
 
 
202 aa  54.3  0.000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.12259  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0358  putative heterodisulfide reductase, C subunit  30.83 
 
 
187 aa  53.9  0.000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2808  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  26.71 
 
 
383 aa  54.3  0.000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1108  heterodisulfide reductase, subunit C/succinate dehydrogenase, subunit C  30.43 
 
 
502 aa  53.5  0.000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.785263  normal  0.633567 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2241  CoB/CoM heterodisulfide reductase, subunit C  36.36 
 
 
194 aa  53.5  0.000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0469153  normal  0.0166067 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1452  hypothetical protein  27.89 
 
 
412 aa  53.1  0.000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.275657 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3675  putative heterodisulfide reductase, C subunit  35.94 
 
 
195 aa  53.1  0.000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.141926 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1700  putative heterodisulfide reductase, C subunit  26.51 
 
 
193 aa  53.1  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000309238 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0809  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  32.91 
 
 
190 aa  52.8  0.000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000061408 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1351  heterodisulfide reductase, C subunit  29.36 
 
 
193 aa  52.8  0.000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.452628 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0474  CoB--CoM heterodisulfide reductase  24.53 
 
 
193 aa  52.8  0.000005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.561183  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1252  heterodisulfide reductase subunit C-like protein  23.93 
 
 
160 aa  52.8  0.000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1882  heterodisulfide reductase subunit C  33.33 
 
 
195 aa  52.8  0.000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1028  heterodisulfide reductase, subunit C/succinate dehydrogenase, subunit C  29.63 
 
 
502 aa  52  0.000008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00356665  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0394  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  32.91 
 
 
189 aa  52  0.000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00274296  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1201  CoB--CoM heterodisulfide reductase  29.9 
 
 
508 aa  52  0.000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0710444  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0032  heterodisulfide reductase subunit  33.33 
 
 
194 aa  52  0.000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3424  heterodisulfide reductase subunit  40 
 
 
216 aa  51.2  0.00001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1261  CoB--CoM heterodisulfide reductase  31.58 
 
 
502 aa  51.2  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0625  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  35.06 
 
 
193 aa  51.2  0.00001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0765561  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0092  heterodisulfide reductase subunit  40 
 
 
182 aa  50.8  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1335  heterodisulfide reductase, C subunit  31.68 
 
 
177 aa  50.8  0.00002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0820  putative heterodisulfide reductase, C subunit  34.85 
 
 
192 aa  51.2  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.123 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0239  hypothetical protein  32.91 
 
 
194 aa  50.8  0.00002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.577493 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0590  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  36 
 
 
193 aa  51.2  0.00002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.321199  normal  0.0726 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2098  heterodisulfide reductase, C subunit  35.06 
 
 
193 aa  50.8  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0031  heterodisulfide reductase subunit  39.44 
 
 
194 aa  50.8  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0633  putative heterodisulfide reductase, C subunit  32.93 
 
 
200 aa  49.7  0.00004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0151  heterodisulfide reductase subunit C-like protein  37.14 
 
 
192 aa  50.1  0.00004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3581  heterodisulfide reductase subunit C-like protein  37.14 
 
 
192 aa  49.7  0.00004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1307  CoB--CoM heterodisulfide reductase  37.93 
 
 
497 aa  50.1  0.00004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1836  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  29.66 
 
 
191 aa  49.3  0.00005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.139025  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0563  putative heterodisulfide reductase, C subunit  32.1 
 
 
211 aa  49.3  0.00005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0861  heterodisulfide reductase subunit  30.39 
 
 
194 aa  49.3  0.00006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1646  heterodisulfide reductase subunit C  26.32 
 
 
210 aa  48.9  0.00008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0261138  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17750  hypothetical protein  34.48 
 
 
204 aa  47.8  0.0001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1207  heterodisulfide reductase, C subunit  27.91 
 
 
204 aa  48.1  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0198  heterodisulfide reductase subunit C  26.61 
 
 
213 aa  48.1  0.0001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2317  heterodisulfide reductase subunit C  26.61 
 
 
213 aa  47.8  0.0001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11073  iron-sulfur protein  27.52 
 
 
443 aa  47.8  0.0002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1806  heterodisulfide reductase, C subunit  25.2 
 
 
189 aa  47.4  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.577988 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1161  heterodisulfide reductase subunit C-like protein  25.49 
 
 
203 aa  47.4  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.860285  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2663  Heterodisulfide reductase subunit C-like protein  28.26 
 
 
129 aa  47.4  0.0002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1282  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  31.36 
 
 
416 aa  47  0.0003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.438227 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0439  heterodisulfide reductase subunit C-like  28.4 
 
 
156 aa  46.2  0.0004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2808  FAD linked oxidase domain-containing protein  24.14 
 
 
934 aa  46.2  0.0004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2103  heterodisulfide reductase subunit C (HdrC-2)  33.87 
 
 
230 aa  45.8  0.0005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.666222  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2735  FAD linked oxidase domain-containing protein  24.14 
 
 
934 aa  46.2  0.0005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1126  succinate dehydrogenase and fumarate reductase iron-sulfur protein  33.33 
 
 
219 aa  45.8  0.0005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.435427  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4017  oxidoreductase, Fe-S subunit  29.79 
 
 
447 aa  45.8  0.0005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.610189  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0322  heterodisulfide reductase, C subunit  24.79 
 
 
186 aa  45.8  0.0005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.554815 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1348  heterodisulfide reductase, C subunit  28.05 
 
 
192 aa  45.8  0.0006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.511519 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2905  FAD linked oxidase domain-containing protein  24.58 
 
 
934 aa  45.8  0.0006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.520733  normal  0.168522 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0525  hypothetical protein  28.68 
 
 
428 aa  45.8  0.0006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.00000000837043  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0826  heterodisulfide reductase, C subunit  25 
 
 
186 aa  45.8  0.0006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.185232  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0403  succinate dehydrogenase/fumarate reductase iron-sulfur subunit  21.47 
 
 
490 aa  45.8  0.0006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.864832 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3524  heterodisulfide reductase, C subunit  28.43 
 
 
185 aa  44.7  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2794  FAD linked oxidase domain-containing protein  23.28 
 
 
934 aa  45.1  0.001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3531  DNA binding domain-containing protein  25.2 
 
 
308 aa  45.1  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.635038  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0771  oxidoreductase, selenocysteine-containing  34.72 
 
 
432 aa  44.7  0.001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.457197  normal  0.324635 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0747  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  31.11 
 
 
425 aa  44.7  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.556917  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4583  Fe-S oxidoreductase-like protein  29.9 
 
 
443 aa  44.7  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3228  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  26.06 
 
 
978 aa  44.7  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.130904  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1196  heterodisulfide reductase, C subunit  34.43 
 
 
184 aa  44.3  0.002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0142  hypothetical protein  35.62 
 
 
418 aa  44.3  0.002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0911  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  28.95 
 
 
367 aa  44.3  0.002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0649  hypothetical protein  29.05 
 
 
421 aa  44.3  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0908  FAD linked oxidase domain-containing protein  23.62 
 
 
942 aa  44.3  0.002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000203424 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1660  Fe-S oxidoreductase  26.45 
 
 
515 aa  43.5  0.003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1783  hypothetical protein  29.49 
 
 
386 aa  43.5  0.003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1543  heterodisulfide reductase subunit C-like protein  36.67 
 
 
230 aa  43.9  0.003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.0154389 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>