238 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_1543 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009440  Msed_1543  heterodisulfide reductase subunit C-like protein  100 
 
 
230 aa  475  1e-133  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.0154389 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2103  heterodisulfide reductase subunit C (HdrC-2)  83.48 
 
 
230 aa  412  1e-114  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.666222  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1078  heterodisulfide reductase subunit C  40 
 
 
253 aa  161  7e-39  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.114051  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0636  iron-sulfur cluster-binding protein  34.5 
 
 
238 aa  138  7e-32  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.126769 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2212  heterodisulfide reductase subunit C  33.79 
 
 
238 aa  132  3.9999999999999996e-30  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0191178  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2551  iron-sulfur cluster-binding protein  32.58 
 
 
239 aa  125  7e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.802978  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1882  heterodisulfide reductase subunit C  31.08 
 
 
195 aa  88.6  7e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1574  putative heterodisulfide reductase, C subunit  33.14 
 
 
174 aa  83.2  0.000000000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3574  Heterodisulfide reductase subunit C-like protein  28.49 
 
 
202 aa  80.9  0.00000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0394  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  29.52 
 
 
189 aa  80.9  0.00000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00274296  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0633  putative heterodisulfide reductase, C subunit  28.06 
 
 
200 aa  75.9  0.0000000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1646  heterodisulfide reductase subunit C  28.64 
 
 
210 aa  75.1  0.0000000000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0261138  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1700  putative heterodisulfide reductase, C subunit  26.92 
 
 
193 aa  74.7  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000309238 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0358  putative heterodisulfide reductase, C subunit  32.11 
 
 
187 aa  73.6  0.000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1335  heterodisulfide reductase, C subunit  30.3 
 
 
177 aa  72.4  0.000000000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0439  heterodisulfide reductase subunit C-like  36.14 
 
 
156 aa  72  0.000000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0820  putative heterodisulfide reductase, C subunit  29.36 
 
 
192 aa  72  0.000000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.123 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1261  CoB--CoM heterodisulfide reductase  31.06 
 
 
502 aa  71.2  0.00000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3581  heterodisulfide reductase subunit C-like protein  30.86 
 
 
192 aa  70.9  0.00000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0031  heterodisulfide reductase subunit  31.25 
 
 
194 aa  70.5  0.00000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2317  heterodisulfide reductase subunit C  25.44 
 
 
213 aa  70.5  0.00000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0151  heterodisulfide reductase subunit C-like protein  30.86 
 
 
192 aa  70.9  0.00000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0198  heterodisulfide reductase subunit C  24.85 
 
 
213 aa  70.1  0.00000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1351  heterodisulfide reductase, C subunit  32.17 
 
 
193 aa  70.1  0.00000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.452628 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3424  heterodisulfide reductase subunit  27.37 
 
 
216 aa  69.3  0.00000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0032  heterodisulfide reductase subunit  30.68 
 
 
194 aa  69.3  0.00000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1028  heterodisulfide reductase, subunit C/succinate dehydrogenase, subunit C  32.59 
 
 
502 aa  68.9  0.00000000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00356665  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0563  putative heterodisulfide reductase, C subunit  24.3 
 
 
211 aa  68.9  0.00000000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1108  heterodisulfide reductase, subunit C/succinate dehydrogenase, subunit C  32.5 
 
 
502 aa  68.6  0.00000000009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.785263  normal  0.633567 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1201  CoB--CoM heterodisulfide reductase  31.36 
 
 
508 aa  68.2  0.0000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0710444  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0809  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  27.61 
 
 
190 aa  66.6  0.0000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000061408 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0861  heterodisulfide reductase subunit  28.07 
 
 
194 aa  66.6  0.0000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0092  heterodisulfide reductase subunit  26.26 
 
 
182 aa  66.2  0.0000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1207  heterodisulfide reductase, C subunit  31.75 
 
 
204 aa  66.2  0.0000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1029  succinate dehydrogenase/fumarate reductase subunit B  31.53 
 
 
325 aa  65.9  0.0000000005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.77588  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0826  heterodisulfide reductase, C subunit  31.41 
 
 
186 aa  65.5  0.0000000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.185232  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0322  heterodisulfide reductase, C subunit  33.09 
 
 
186 aa  65.5  0.0000000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.554815 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3524  heterodisulfide reductase, C subunit  29.58 
 
 
185 aa  64.7  0.000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0848  heterodisulfide reductase, C subunit  27.98 
 
 
202 aa  65.1  0.000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.12259  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1604  CoB--CoM heterodisulfide reductase, subunit C  36.17 
 
 
184 aa  63.9  0.000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.455044  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0308  CoB--CoM heterodisulfide reductase  36.17 
 
 
184 aa  63.9  0.000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0539  CoB--CoM heterodisulfide reductase subunit C  36.17 
 
 
184 aa  63.9  0.000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.214937  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1307  CoB--CoM heterodisulfide reductase  29.55 
 
 
497 aa  63.2  0.000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1325  heterodisulfide reductase, C subunit  28.8 
 
 
188 aa  63.5  0.000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0377  CoB--CoM heterodisulfide reductase  35.11 
 
 
184 aa  63.2  0.000000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1252  heterodisulfide reductase subunit C-like protein  36.05 
 
 
160 aa  62.4  0.000000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1282  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  30.56 
 
 
416 aa  62.8  0.000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.438227 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3675  putative heterodisulfide reductase, C subunit  31.19 
 
 
195 aa  62  0.000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.141926 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1806  heterodisulfide reductase, C subunit  32.08 
 
 
189 aa  62  0.000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.577988 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2344  putative heterodisulfide reductase, C subunit  29.6 
 
 
188 aa  62  0.000000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.628999  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1348  heterodisulfide reductase, C subunit  27.06 
 
 
192 aa  61.2  0.00000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.511519 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17750  hypothetical protein  27.03 
 
 
204 aa  61.6  0.00000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0975  heterodisulfide reductase subunit C-like protein  31.96 
 
 
133 aa  60.5  0.00000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.826747  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1161  heterodisulfide reductase subunit C-like protein  27.19 
 
 
203 aa  59.7  0.00000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.860285  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1196  heterodisulfide reductase, C subunit  26.96 
 
 
184 aa  59.3  0.00000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2098  heterodisulfide reductase, C subunit  31.9 
 
 
193 aa  59.7  0.00000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1452  hypothetical protein  28.04 
 
 
412 aa  58.9  0.00000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.275657 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1697  hypothetical protein  28.44 
 
 
246 aa  57.8  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000729724 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2241  CoB/CoM heterodisulfide reductase, subunit C  26.43 
 
 
194 aa  55.8  0.0000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0469153  normal  0.0166067 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0309  succinate dehydrogenase subunit B  23.89 
 
 
344 aa  55.8  0.0000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.24045 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0590  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  28.3 
 
 
193 aa  55.5  0.0000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.321199  normal  0.0726 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0128  succinate dehydrogenase/fumarate reductase iron-sulfur protein  23.43 
 
 
345 aa  55.1  0.0000008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.579752  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4092  heterodisulfide reductase subunit C-like  27.27 
 
 
148 aa  55.1  0.000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.737599  normal  0.409471 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1872  succinate dehydrogenase, iron-sulfur protein subunit  27.73 
 
 
321 aa  54.7  0.000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.856441  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2099  heterodisulfide reductase, subunit C (HdrC-1)  26.67 
 
 
280 aa  54.3  0.000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2341  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  29.87 
 
 
439 aa  54.3  0.000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3201  heterodisulfide reductase, transmembrane subunit, putative  35 
 
 
408 aa  53.9  0.000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0968  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  23.26 
 
 
437 aa  53.9  0.000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.405818  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0239  hypothetical protein  27.62 
 
 
194 aa  53.9  0.000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.577493 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0307  CoB--CoM heterodisulfide reductase  31.03 
 
 
196 aa  53.5  0.000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.802269  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0249  succinate dehydrogenase and fumarate reductase iron-sulfur protein  21.82 
 
 
340 aa  53.1  0.000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.237523  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1783  hypothetical protein  33.33 
 
 
386 aa  53.1  0.000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1734  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  28.57 
 
 
385 aa  52.8  0.000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1801  hypothetical protein  27.16 
 
 
372 aa  53.1  0.000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.606792 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0911  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  32.88 
 
 
367 aa  52.4  0.000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1285  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  33.78 
 
 
385 aa  52.8  0.000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.699767  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26930  succinate dehydrogenase and fumarate reductase iron-sulfur protein  26.44 
 
 
315 aa  52.8  0.000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0417  putative heterodisulfide reductase, C subunit  28.07 
 
 
194 aa  52.4  0.000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.344766 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0987  succinate dehydrogenase and fumarate reductase iron-sulfur protein  26.54 
 
 
250 aa  52  0.000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.400874  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0285  succinate dehydrogenase and fumarate reductase iron-sulfur protein  23.53 
 
 
344 aa  52  0.000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.847816 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0489  succinate dehydrogenase, iron-sulfur protein subunit  27.73 
 
 
321 aa  51.6  0.000009  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0464  succinate dehydrogenase, iron-sulfur protein subunit  27.73 
 
 
321 aa  51.6  0.000009  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1834  heterodisulfide reductase, putative  27.78 
 
 
391 aa  51.6  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0759481  normal  0.0501032 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1884  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  30.39 
 
 
402 aa  51.2  0.00001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.561608  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0142  hypothetical protein  28.92 
 
 
418 aa  51.6  0.00001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1836  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  30.49 
 
 
191 aa  50.4  0.00002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.139025  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0474  CoB--CoM heterodisulfide reductase  26.88 
 
 
193 aa  50.8  0.00002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.561183  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1517  CoB--CoM heterodisulfide reductase, subunit C  27.91 
 
 
192 aa  50.4  0.00002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.507445  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0402  CoB--CoM heterodisulfide reductase  29.07 
 
 
192 aa  50.8  0.00002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0280446  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0433  CoB--CoM heterodisulfide reductase  27.91 
 
 
192 aa  50.8  0.00002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0093  hypothetical protein  29.23 
 
 
423 aa  50.1  0.00003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1547  heterodisulfide reductase subunit C-like protein  24.76 
 
 
280 aa  50.1  0.00003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.0378845 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1582  heterodisulfide reductase, putative  35.94 
 
 
392 aa  50.1  0.00003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00374998  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0176  succinate dehydrogenase subunit B  23.18 
 
 
356 aa  50.1  0.00003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1001  heterodisulfide reductase, putative  30.1 
 
 
398 aa  50.1  0.00003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.284636  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06190  succinate dehydrogenase and fumarate reductase iron-sulfur protein  23.56 
 
 
328 aa  50.4  0.00003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000260303 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2716  succinate dehydrogenase and fumarate reductase iron-sulfur protein  22.61 
 
 
344 aa  50.1  0.00003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1963  quinone-interacting membrane-bound oxidoreductase complex subunit C  32.5 
 
 
407 aa  49.7  0.00004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00829701 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4330  pyruvate flavodoxin/ferredoxin oxidoreductase domain-containing protein  29.23 
 
 
1195 aa  49.7  0.00004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.830503  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04820  succinate dehydrogenase subunit B  25.95 
 
 
263 aa  49.7  0.00004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>