163 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_1834 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007514  Cag_1582  heterodisulfide reductase, putative  76.08 
 
 
392 aa  641    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00374998  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1834  heterodisulfide reductase, putative  100 
 
 
391 aa  808    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0759481  normal  0.0501032 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0035  heterodisulfide reductase, putative  77.35 
 
 
393 aa  655    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000417872  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1001  heterodisulfide reductase, putative  39 
 
 
398 aa  297  2e-79  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.284636  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1113  heterodisulfide reductase, transmembrane subunit, putative  40.59 
 
 
384 aa  291  1e-77  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0397617  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2896  heterodisulfide reductase, transmembrane subunit, putative  39.21 
 
 
384 aa  278  9e-74  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.217971 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2133  heterodisulfide reductase, transmembrane subunit, putative  41.09 
 
 
384 aa  278  2e-73  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.411689  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1963  quinone-interacting membrane-bound oxidoreductase complex subunit C  38.08 
 
 
407 aa  271  2e-71  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00829701 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3201  heterodisulfide reductase, transmembrane subunit, putative  36.7 
 
 
408 aa  264  2e-69  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2125  heterodisulfide reductase, transmembrane subunit, putative  36.8 
 
 
393 aa  256  4e-67  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0911  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  28.34 
 
 
367 aa  155  8e-37  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1077  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  24.87 
 
 
382 aa  150  6e-35  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0184362  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1285  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  27.42 
 
 
385 aa  146  6e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.699767  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5625  CitB domain protein  25.13 
 
 
404 aa  84.3  0.000000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3416  CitB domain protein  23.43 
 
 
408 aa  80.9  0.00000000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4071  CitB domain-containing protein  24.56 
 
 
408 aa  79.3  0.0000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3675  putative heterodisulfide reductase, C subunit  37.5 
 
 
195 aa  78.2  0.0000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.141926 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0793  CitB domain-containing protein  25.15 
 
 
403 aa  77.4  0.0000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4092  heterodisulfide reductase subunit C-like  31.71 
 
 
148 aa  75.1  0.000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.737599  normal  0.409471 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1325  heterodisulfide reductase, C subunit  34.02 
 
 
188 aa  75.1  0.000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6302  CitB domain-containing protein  23.53 
 
 
400 aa  74.3  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5879  CitB domain-containing protein  24.42 
 
 
404 aa  73.6  0.000000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.237858  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2663  Heterodisulfide reductase subunit C-like protein  34.48 
 
 
129 aa  73.6  0.000000000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1452  hypothetical protein  27.91 
 
 
412 aa  72.8  0.000000000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.275657 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2241  CoB/CoM heterodisulfide reductase, subunit C  23.96 
 
 
194 aa  72.4  0.00000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0469153  normal  0.0166067 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0625  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  31.19 
 
 
193 aa  71.6  0.00000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0765561  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2275  CitB domain-containing protein  23.59 
 
 
365 aa  71.2  0.00000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.363441 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2503  putative ferredoxin  23.59 
 
 
404 aa  70.9  0.00000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.232616 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0394  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  30.85 
 
 
189 aa  70.1  0.00000000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00274296  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1351  heterodisulfide reductase, C subunit  31.52 
 
 
193 aa  69.7  0.00000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.452628 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1078  heterodisulfide reductase subunit C  33.33 
 
 
253 aa  67.8  0.0000000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.114051  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0358  putative heterodisulfide reductase, C subunit  32.65 
 
 
187 aa  67.8  0.0000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6133  CitB domain-containing protein  23.51 
 
 
368 aa  67.8  0.0000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0563  putative heterodisulfide reductase, C subunit  30.3 
 
 
211 aa  67.8  0.0000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4212  putative citrate utilization protein B (citB)  22.76 
 
 
372 aa  67.4  0.0000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.762767  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2085  protein of unknown function DUF224, cysteine-rich region  30.48 
 
 
387 aa  67  0.0000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.32982  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1700  putative heterodisulfide reductase, C subunit  35.63 
 
 
193 aa  67  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000309238 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1517  CoB--CoM heterodisulfide reductase, subunit C  34.69 
 
 
192 aa  67  0.0000000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.507445  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0590  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  33.33 
 
 
193 aa  67  0.0000000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.321199  normal  0.0726 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6016  CitB domain-containing protein  24.75 
 
 
404 aa  66.6  0.0000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.66746 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0636  iron-sulfur cluster-binding protein  34.69 
 
 
238 aa  65.9  0.000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.126769 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0239  hypothetical protein  32.65 
 
 
194 aa  65.5  0.000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.577493 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3134  CitB domain protein  22.89 
 
 
408 aa  65.1  0.000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.870392  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0433  CoB--CoM heterodisulfide reductase  34.02 
 
 
192 aa  64.3  0.000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3857  CitB domain-containing protein  24.08 
 
 
377 aa  64.7  0.000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000315554 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2212  heterodisulfide reductase subunit C  30.61 
 
 
238 aa  63.9  0.000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0191178  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1836  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  30.28 
 
 
191 aa  63.9  0.000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.139025  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1806  heterodisulfide reductase, C subunit  27.27 
 
 
189 aa  63.5  0.000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.577988 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1882  heterodisulfide reductase subunit C  40 
 
 
195 aa  62.8  0.000000009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3524  heterodisulfide reductase, C subunit  27.72 
 
 
185 aa  62.8  0.00000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3489  citrate utilization protein B  21.65 
 
 
388 aa  62  0.00000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.57381  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3814  CitB domain-containing protein  21.94 
 
 
394 aa  62  0.00000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.986403 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0474  CoB--CoM heterodisulfide reductase  33.65 
 
 
193 aa  61.6  0.00000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.561183  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0402  CoB--CoM heterodisulfide reductase  32.32 
 
 
192 aa  61.2  0.00000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0280446  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0439  heterodisulfide reductase subunit C-like  37.35 
 
 
156 aa  60.8  0.00000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2551  iron-sulfur cluster-binding protein  30.43 
 
 
239 aa  60.8  0.00000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.802978  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1207  heterodisulfide reductase, C subunit  30.11 
 
 
204 aa  60.5  0.00000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2723  CitB domain-containing protein  22.94 
 
 
372 aa  60.5  0.00000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1446  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  29.52 
 
 
383 aa  60.1  0.00000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0848  heterodisulfide reductase, C subunit  32.89 
 
 
202 aa  60.1  0.00000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.12259  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3574  Heterodisulfide reductase subunit C-like protein  33.33 
 
 
202 aa  60.1  0.00000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3552  CitB domain-containing protein  22.65 
 
 
370 aa  60.5  0.00000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0151  heterodisulfide reductase subunit C-like protein  27.78 
 
 
192 aa  60.1  0.00000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0749  citrate utilization protein B  26.29 
 
 
379 aa  60.1  0.00000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.762495 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3581  heterodisulfide reductase subunit C-like protein  27.78 
 
 
192 aa  59.7  0.00000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5147  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  23.65 
 
 
403 aa  59.7  0.00000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.276301  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0846  citrate utilization protein B  25.13 
 
 
379 aa  59.7  0.00000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1196  heterodisulfide reductase, C subunit  28.3 
 
 
184 aa  58.9  0.0000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4211  Citrate utilization protein B  21.85 
 
 
390 aa  58.9  0.0000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0797  citrate utilization protein B  25.13 
 
 
379 aa  59.3  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0737  citrate utilization protein B  25.13 
 
 
379 aa  59.3  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.580161  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0810  citrate utilization protein B  25.13 
 
 
379 aa  59.3  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.972731  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2098  heterodisulfide reductase, C subunit  30.11 
 
 
193 aa  59.3  0.0000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2317  heterodisulfide reductase subunit C  30.85 
 
 
213 aa  59.3  0.0000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17750  hypothetical protein  38.46 
 
 
204 aa  58.9  0.0000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2808  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  29.29 
 
 
383 aa  58.9  0.0000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0633  putative heterodisulfide reductase, C subunit  29.7 
 
 
200 aa  58.2  0.0000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0198  heterodisulfide reductase subunit C  29.79 
 
 
213 aa  58.9  0.0000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1574  putative heterodisulfide reductase, C subunit  34.07 
 
 
174 aa  57.8  0.0000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0539  CoB--CoM heterodisulfide reductase subunit C  34.78 
 
 
184 aa  57.4  0.0000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.214937  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0308  CoB--CoM heterodisulfide reductase  34.78 
 
 
184 aa  57.4  0.0000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1604  CoB--CoM heterodisulfide reductase, subunit C  34.78 
 
 
184 aa  57.4  0.0000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.455044  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0032  heterodisulfide reductase subunit  26.67 
 
 
194 aa  57  0.0000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0861  heterodisulfide reductase subunit  27.78 
 
 
194 aa  57  0.0000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2382  CitB domain protein  22.37 
 
 
378 aa  57  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0031  heterodisulfide reductase subunit  26.67 
 
 
194 aa  56.6  0.0000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0826  heterodisulfide reductase, C subunit  29.03 
 
 
186 aa  55.8  0.000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.185232  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0322  heterodisulfide reductase, C subunit  30.11 
 
 
186 aa  55.8  0.000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.554815 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0307  CoB--CoM heterodisulfide reductase  31.78 
 
 
196 aa  55.8  0.000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.802269  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0092  heterodisulfide reductase subunit  26.14 
 
 
182 aa  55.1  0.000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3424  heterodisulfide reductase subunit  24.73 
 
 
216 aa  55.5  0.000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1697  hypothetical protein  34.88 
 
 
246 aa  55.1  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000729724 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2344  putative heterodisulfide reductase, C subunit  30.77 
 
 
188 aa  55.1  0.000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.628999  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1436  Heterodisulfide reductase subunit C-like protein  32.53 
 
 
533 aa  54.7  0.000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.695739  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0377  CoB--CoM heterodisulfide reductase  34.18 
 
 
184 aa  54.7  0.000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0747  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  28.97 
 
 
425 aa  54.3  0.000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.556917  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1335  heterodisulfide reductase, C subunit  27.55 
 
 
177 aa  54.3  0.000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8555  CitB domain protein  23.28 
 
 
398 aa  53.9  0.000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.388597  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0968  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  27.59 
 
 
437 aa  54.3  0.000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.405818  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0809  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  33.78 
 
 
190 aa  53.9  0.000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000061408 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>