200 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssol_2103 on replicon CP001800
Organism: Sulfolobus solfataricus 98/2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001800  Ssol_2103  heterodisulfide reductase subunit C (HdrC-2)  100 
 
 
230 aa  473  1e-132  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.666222  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1543  heterodisulfide reductase subunit C-like protein  83.48 
 
 
230 aa  412  1e-114  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.0154389 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1078  heterodisulfide reductase subunit C  38.08 
 
 
253 aa  154  1e-36  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.114051  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0636  iron-sulfur cluster-binding protein  34.06 
 
 
238 aa  135  6.0000000000000005e-31  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.126769 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2551  iron-sulfur cluster-binding protein  34.84 
 
 
239 aa  131  6.999999999999999e-30  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.802978  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2212  heterodisulfide reductase subunit C  31.67 
 
 
238 aa  128  8.000000000000001e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0191178  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1882  heterodisulfide reductase subunit C  34.56 
 
 
195 aa  92.8  4e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3574  Heterodisulfide reductase subunit C-like protein  30.77 
 
 
202 aa  89  5e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1700  putative heterodisulfide reductase, C subunit  28.02 
 
 
193 aa  86.7  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000309238 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1574  putative heterodisulfide reductase, C subunit  33.33 
 
 
174 aa  85.9  4e-16  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0633  putative heterodisulfide reductase, C subunit  30.41 
 
 
200 aa  86.3  4e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0394  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  30.12 
 
 
189 aa  81.6  0.00000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00274296  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0848  heterodisulfide reductase, C subunit  27.86 
 
 
202 aa  78.6  0.00000000000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.12259  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2317  heterodisulfide reductase subunit C  26.88 
 
 
213 aa  78.2  0.0000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0198  heterodisulfide reductase subunit C  26.34 
 
 
213 aa  77.4  0.0000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3581  heterodisulfide reductase subunit C-like protein  31.28 
 
 
192 aa  77  0.0000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0151  heterodisulfide reductase subunit C-like protein  31.28 
 
 
192 aa  76.6  0.0000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0820  putative heterodisulfide reductase, C subunit  31.53 
 
 
192 aa  75.5  0.0000000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.123 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0563  putative heterodisulfide reductase, C subunit  24.87 
 
 
211 aa  75.1  0.000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0358  putative heterodisulfide reductase, C subunit  28.74 
 
 
187 aa  74.7  0.000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1335  heterodisulfide reductase, C subunit  32.09 
 
 
177 aa  74.7  0.000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0031  heterodisulfide reductase subunit  32 
 
 
194 aa  74.7  0.000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0439  heterodisulfide reductase subunit C-like  38.1 
 
 
156 aa  73.9  0.000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0032  heterodisulfide reductase subunit  31.43 
 
 
194 aa  73.9  0.000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1351  heterodisulfide reductase, C subunit  30.18 
 
 
193 aa  73.2  0.000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.452628 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1261  CoB--CoM heterodisulfide reductase  30.83 
 
 
502 aa  72.4  0.000000000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0861  heterodisulfide reductase subunit  28.82 
 
 
194 aa  72  0.000000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1201  CoB--CoM heterodisulfide reductase  33.05 
 
 
508 aa  72  0.000000000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0710444  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1207  heterodisulfide reductase, C subunit  31.5 
 
 
204 aa  71.2  0.00000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3424  heterodisulfide reductase subunit  28.49 
 
 
216 aa  70.5  0.00000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0809  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  32.46 
 
 
190 aa  70.5  0.00000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000061408 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0092  heterodisulfide reductase subunit  28.25 
 
 
182 aa  69.3  0.00000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1646  heterodisulfide reductase subunit C  25.12 
 
 
210 aa  69.3  0.00000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0261138  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1307  CoB--CoM heterodisulfide reductase  27.89 
 
 
497 aa  68.9  0.00000000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1806  heterodisulfide reductase, C subunit  25.79 
 
 
189 aa  68.9  0.00000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.577988 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3524  heterodisulfide reductase, C subunit  30.49 
 
 
185 aa  68.2  0.00000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1108  heterodisulfide reductase, subunit C/succinate dehydrogenase, subunit C  33.05 
 
 
502 aa  68.2  0.0000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.785263  normal  0.633567 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1028  heterodisulfide reductase, subunit C/succinate dehydrogenase, subunit C  31.82 
 
 
502 aa  67.8  0.0000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00356665  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1348  heterodisulfide reductase, C subunit  27.84 
 
 
192 aa  67.8  0.0000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.511519 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0322  heterodisulfide reductase, C subunit  29.07 
 
 
186 aa  67.4  0.0000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.554815 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0826  heterodisulfide reductase, C subunit  29.07 
 
 
186 aa  67  0.0000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.185232  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1325  heterodisulfide reductase, C subunit  26.09 
 
 
188 aa  66.6  0.0000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3675  putative heterodisulfide reductase, C subunit  31.25 
 
 
195 aa  66.2  0.0000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.141926 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1029  succinate dehydrogenase/fumarate reductase subunit B  28.16 
 
 
325 aa  65.5  0.0000000007  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.77588  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2344  putative heterodisulfide reductase, C subunit  30.66 
 
 
188 aa  65.1  0.0000000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.628999  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1282  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  28.35 
 
 
416 aa  65.1  0.0000000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.438227 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2098  heterodisulfide reductase, C subunit  29.38 
 
 
193 aa  63.9  0.000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0975  heterodisulfide reductase subunit C-like protein  34.02 
 
 
133 aa  62.4  0.000000005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.826747  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1252  heterodisulfide reductase subunit C-like protein  37.18 
 
 
160 aa  61.6  0.00000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1196  heterodisulfide reductase, C subunit  23.84 
 
 
184 aa  61.6  0.00000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4092  heterodisulfide reductase subunit C-like  30 
 
 
148 aa  60.5  0.00000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.737599  normal  0.409471 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0539  CoB--CoM heterodisulfide reductase subunit C  34.44 
 
 
184 aa  59.7  0.00000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.214937  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17750  hypothetical protein  31.36 
 
 
204 aa  60.1  0.00000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0308  CoB--CoM heterodisulfide reductase  34.44 
 
 
184 aa  59.7  0.00000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1604  CoB--CoM heterodisulfide reductase, subunit C  34.44 
 
 
184 aa  59.7  0.00000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.455044  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1697  hypothetical protein  29.36 
 
 
246 aa  59.7  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000729724 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0377  CoB--CoM heterodisulfide reductase  34.44 
 
 
184 aa  59.7  0.00000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1161  heterodisulfide reductase subunit C-like protein  29.41 
 
 
203 aa  59.3  0.00000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.860285  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2099  heterodisulfide reductase, subunit C (HdrC-1)  28.7 
 
 
280 aa  58.9  0.00000006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0376  succinate dehydrogenase and fumarate reductase iron-sulfur protein  28.34 
 
 
348 aa  58.9  0.00000007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1872  succinate dehydrogenase, iron-sulfur protein subunit  29.41 
 
 
321 aa  58.5  0.00000008  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.856441  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0417  putative heterodisulfide reductase, C subunit  25.29 
 
 
194 aa  57.8  0.0000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.344766 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26930  succinate dehydrogenase and fumarate reductase iron-sulfur protein  27.59 
 
 
315 aa  57  0.0000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2241  CoB/CoM heterodisulfide reductase, subunit C  28.37 
 
 
194 aa  55.8  0.0000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0469153  normal  0.0166067 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1884  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  30.95 
 
 
402 aa  55.8  0.0000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.561608  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1452  hypothetical protein  27.18 
 
 
412 aa  55.8  0.0000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.275657 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0489  succinate dehydrogenase, iron-sulfur protein subunit  31.09 
 
 
321 aa  55.5  0.0000007  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0464  succinate dehydrogenase, iron-sulfur protein subunit  31.09 
 
 
321 aa  55.5  0.0000007  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0239  hypothetical protein  28.12 
 
 
194 aa  55.5  0.0000007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.577493 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0142  hypothetical protein  28.92 
 
 
418 aa  55.1  0.0000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1282  O-acetylhomoserine (thiol)-lyase  31.09 
 
 
321 aa  55.1  0.000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0309  succinate dehydrogenase subunit B  22.78 
 
 
344 aa  53.9  0.000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.24045 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1547  heterodisulfide reductase subunit C-like protein  25.93 
 
 
280 aa  53.9  0.000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.0378845 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1836  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  32.69 
 
 
191 aa  53.1  0.000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.139025  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1801  hypothetical protein  29.63 
 
 
372 aa  52.8  0.000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.606792 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0590  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  30.69 
 
 
193 aa  52.8  0.000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.321199  normal  0.0726 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0911  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  32.43 
 
 
367 aa  52  0.000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2663  Heterodisulfide reductase subunit C-like protein  29.67 
 
 
129 aa  52  0.000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0640  CoB--CoM heterodisulfide reductase subunit C  27.91 
 
 
161 aa  51.2  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0128  succinate dehydrogenase/fumarate reductase iron-sulfur protein  21.98 
 
 
345 aa  51.6  0.00001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.579752  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1734  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  26.97 
 
 
385 aa  51.6  0.00001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1285  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  31.58 
 
 
385 aa  51.6  0.00001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.699767  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2555  iron-sulfur cluster-binding protein  27.64 
 
 
228 aa  51.2  0.00001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.461611  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2185  hypothetical protein  27.64 
 
 
228 aa  51.2  0.00001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.32077  hitchhiker  0.00000000457726 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1953  heterodisulfide reductase subunit HdrC  27.27 
 
 
236 aa  50.4  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0013  methyl-viologen-reducing hydrogenase, delta subunit  35.14 
 
 
540 aa  50.4  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.779838 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1783  hypothetical protein  31.52 
 
 
386 aa  50.8  0.00002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0307  CoB--CoM heterodisulfide reductase  32.22 
 
 
196 aa  50.4  0.00002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.802269  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0093  hypothetical protein  30.53 
 
 
423 aa  50.4  0.00002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1516  CoB--CoM heterodisulfide reductase subunit C  27.96 
 
 
164 aa  50.1  0.00003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000306335  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0987  succinate dehydrogenase and fumarate reductase iron-sulfur protein  24.5 
 
 
250 aa  50.1  0.00003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.400874  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0385  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  33.73 
 
 
420 aa  50.1  0.00003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0625  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  26.21 
 
 
193 aa  50.1  0.00003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0765561  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2341  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  28.57 
 
 
439 aa  49.7  0.00004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0632  iron-sulfur cluster-binding protein  27.52 
 
 
230 aa  49.3  0.00005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0958053 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1176  hypothetical protein  28.21 
 
 
375 aa  49.3  0.00005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.390877 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2716  succinate dehydrogenase and fumarate reductase iron-sulfur protein  23.84 
 
 
344 aa  49.3  0.00005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2216  hypothetical protein  27.52 
 
 
230 aa  49.3  0.00005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.278188  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06190  succinate dehydrogenase and fumarate reductase iron-sulfur protein  24.14 
 
 
328 aa  48.5  0.00008  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000260303 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3201  heterodisulfide reductase, transmembrane subunit, putative  34.85 
 
 
408 aa  48.5  0.00008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>