More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_0142 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009253  Dred_0142  hypothetical protein  100 
 
 
418 aa  876    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1282  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  56.34 
 
 
416 aa  464  1e-129  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.438227 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1884  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  44.16 
 
 
402 aa  351  1e-95  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.561608  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0093  hypothetical protein  42.29 
 
 
423 aa  348  1e-94  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1452  hypothetical protein  40.35 
 
 
412 aa  316  4e-85  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.275657 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1028  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  32.15 
 
 
451 aa  219  7.999999999999999e-56  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0872  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  33.25 
 
 
461 aa  217  2.9999999999999998e-55  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.301742  normal  0.724229 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2714  hypothetical protein  33.08 
 
 
439 aa  213  3.9999999999999995e-54  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.694136 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2593  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  35.22 
 
 
463 aa  213  5.999999999999999e-54  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0648  hmc operon protein 6  36.21 
 
 
462 aa  209  5e-53  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2410  hypothetical protein  34.48 
 
 
461 aa  209  7e-53  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.688183  normal  0.0784806 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0573  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  33.83 
 
 
460 aa  209  1e-52  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1633  hypothetical protein  31.64 
 
 
459 aa  207  2e-52  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0302  hypothetical protein  32.16 
 
 
444 aa  208  2e-52  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3709  ferredoxin, 4Fe-4S, putative  31.73 
 
 
439 aa  206  9e-52  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0845  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  32.75 
 
 
462 aa  205  1e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.00000335873  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2555  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  31.83 
 
 
445 aa  205  2e-51  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0414  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  34.97 
 
 
451 aa  204  2e-51  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.137763 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2255  hypothetical protein  33.83 
 
 
460 aa  204  3e-51  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0566  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  32.34 
 
 
438 aa  202  9.999999999999999e-51  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.742352  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0771  oxidoreductase, selenocysteine-containing  35.98 
 
 
432 aa  200  3.9999999999999996e-50  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.457197  normal  0.324635 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2146  hypothetical protein  30.4 
 
 
441 aa  189  1e-46  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2341  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  34.1 
 
 
439 aa  181  2e-44  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0076  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  29.31 
 
 
454 aa  177  4e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0100734 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2191  hypothetical protein  29.53 
 
 
461 aa  171  2e-41  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1023  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  29.02 
 
 
436 aa  170  4e-41  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1446  hypothetical protein  31.21 
 
 
542 aa  163  5.0000000000000005e-39  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0574  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  28.5 
 
 
531 aa  161  2e-38  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.158943  normal  0.0218676 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0176  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  31.83 
 
 
534 aa  159  1e-37  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0034  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  27.21 
 
 
466 aa  157  4e-37  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0249  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  26.78 
 
 
537 aa  157  4e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1267  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  29.94 
 
 
453 aa  156  8e-37  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0339  hypothetical protein  31.23 
 
 
534 aa  155  9e-37  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.495442  normal  0.0503197 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1188  protein of unknown function DUF224, cysteine-rich region  27.42 
 
 
457 aa  152  1e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.584674  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1534  hypothetical protein  29.88 
 
 
446 aa  149  8e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3198  hypothetical protein  27.57 
 
 
464 aa  149  1.0000000000000001e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0839  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  27.3 
 
 
533 aa  140  3.9999999999999997e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00734731  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2883  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  26.24 
 
 
453 aa  139  7e-32  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.945638 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3285  iron-sulfur cluster-binding protein  26.24 
 
 
453 aa  139  7e-32  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1333  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  26.81 
 
 
505 aa  135  1.9999999999999998e-30  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00265785 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4179  hypothetical protein  26.68 
 
 
515 aa  134  3.9999999999999996e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0341375 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0899  hypothetical protein  26.3 
 
 
520 aa  132  7.999999999999999e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0038  DsrK protein  27.47 
 
 
549 aa  126  9e-28  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1147  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  27.84 
 
 
539 aa  125  2e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.63071  normal  0.964876 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0704  DsrK protein  27.42 
 
 
549 aa  123  7e-27  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.186975  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2192  reductase, iron-sulfur binding subunit, putative  29.41 
 
 
496 aa  122  9.999999999999999e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.838987  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0236  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  25.06 
 
 
534 aa  122  9.999999999999999e-27  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.942909 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1848  DsrK protein  26.54 
 
 
549 aa  120  3.9999999999999996e-26  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.189216  normal  0.170119 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1376  heterodisulfide reductase  24.85 
 
 
420 aa  119  9.999999999999999e-26  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0673613  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1947  DsrK protein  25.11 
 
 
549 aa  119  9.999999999999999e-26  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.364031  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0137  DsrK protein  26.27 
 
 
549 aa  118  1.9999999999999998e-25  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.258854  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1776  reductase, iron-sulfur binding subunit, putative  26.44 
 
 
536 aa  117  3.9999999999999997e-25  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.279132  normal  0.149931 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3531  DNA binding domain-containing protein  30.33 
 
 
308 aa  116  7.999999999999999e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.635038  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0045  DsrK protein  25.68 
 
 
549 aa  114  2.0000000000000002e-24  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.954015 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2312  DsrK protein  24.09 
 
 
550 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1176  hypothetical protein  25.98 
 
 
375 aa  114  2.0000000000000002e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.390877 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0174  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  24.48 
 
 
471 aa  114  3e-24  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0069  reductase, iron-sulfur binding subunit, putative  25.52 
 
 
536 aa  113  5e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.481368 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0257  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  25.23 
 
 
542 aa  113  7.000000000000001e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1606  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  25.17 
 
 
541 aa  113  7.000000000000001e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0450  reductase, iron-sulfur binding subunit, putative  27.69 
 
 
547 aa  113  8.000000000000001e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.136958  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2478  reductase, iron-sulfur binding subunit, putative  27.84 
 
 
507 aa  111  2.0000000000000002e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0851  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  25.43 
 
 
493 aa  112  2.0000000000000002e-23  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3961  DNA binding domain-containing protein  30.14 
 
 
314 aa  110  5e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2272  reductase, iron-sulfur binding subunit, putative  25.8 
 
 
536 aa  109  8.000000000000001e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0341  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  24.15 
 
 
471 aa  109  8.000000000000001e-23  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  decreased coverage  0.00798095 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0915  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  22.53 
 
 
472 aa  109  9.000000000000001e-23  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0451  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  25.12 
 
 
549 aa  108  1e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.961487  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1958  hypothetical protein  25.93 
 
 
517 aa  105  1e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0050  Fe-S oxidoreductase  25.61 
 
 
500 aa  105  2e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00237763  normal  0.450022 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1801  hypothetical protein  23.43 
 
 
372 aa  103  7e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.606792 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2808  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  25.76 
 
 
383 aa  102  1e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1446  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  25.76 
 
 
383 aa  101  2e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1721  hypothetical protein  25.19 
 
 
549 aa  96.3  9e-19  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.180785 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1660  Fe-S oxidoreductase  25.46 
 
 
515 aa  95.5  1e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3960  hypothetical protein  41.46 
 
 
169 aa  95.5  2e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2145  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  22.96 
 
 
419 aa  95.5  2e-18  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0198  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  23.13 
 
 
431 aa  93.6  6e-18  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.0678003 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1527  hypothetical protein  26.08 
 
 
654 aa  92  2e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.583345 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0545  hypothetical protein  24.94 
 
 
588 aa  92  2e-17  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0271  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  24.47 
 
 
543 aa  92  2e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000185698  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0406  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  22.91 
 
 
431 aa  90.9  3e-17  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.0694601 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1084  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  22.14 
 
 
392 aa  90.5  5e-17  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.683323  normal  0.0188161 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3765  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  24.77 
 
 
712 aa  90.1  7e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0441363  normal  0.184331 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0739  hypothetical protein  25.33 
 
 
639 aa  89.7  9e-17  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.778114  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1734  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  24.53 
 
 
385 aa  88.2  2e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3399  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  22.69 
 
 
629 aa  87.4  4e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.58436  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0999  hypothetical protein  23.3 
 
 
615 aa  86.3  8e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0267446  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1962  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  24.1 
 
 
411 aa  86.7  8e-16  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0142218  hitchhiker  0.00000000000291974 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1502  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  26.29 
 
 
664 aa  86.3  9e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2714  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  26.29 
 
 
664 aa  85.9  0.000000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.793769 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2267  hypothetical protein  24.67 
 
 
692 aa  84  0.000000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00913496  hitchhiker  0.0000724137 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5143  hypothetical protein  27.78 
 
 
703 aa  82.4  0.00000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3532  hypothetical protein  36.67 
 
 
158 aa  82.4  0.00000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.488693  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1219  hypothetical protein  22.54 
 
 
490 aa  82  0.00000000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.158423  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3866  hypothetical protein  26.85 
 
 
703 aa  82  0.00000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00245399  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0051  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  25.49 
 
 
676 aa  82  0.00000000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1348  hypothetical protein  26.79 
 
 
617 aa  82  0.00000000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1439  hypothetical protein  23.6 
 
 
492 aa  82  0.00000000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.174659 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5484  ferredoxin, 4Fe-4S  27.49 
 
 
629 aa  82  0.00000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00120718  hitchhiker  1.1586099999999999e-20 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>