289 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_1307 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_1307  CoB--CoM heterodisulfide reductase  100 
 
 		 497 aa  1034    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1108  heterodisulfide reductase, subunit C/succinate dehydrogenase, subunit C  71.4 
 
 		 502 aa  746    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.785263  normal  0.633567 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1028  heterodisulfide reductase, subunit C/succinate dehydrogenase, subunit C  77.46 
 
 		 502 aa  827    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00356665  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1261  CoB--CoM heterodisulfide reductase  75.51 
 
 		 502 aa  809    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1201  CoB--CoM heterodisulfide reductase  71.6 
 
 		 508 aa  775    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0710444  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0395  CoB--CoM heterodisulfide reductase  46.07 
 
 		 462 aa  272  1e-71  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.453445  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0564  CoB--CoM heterodisulfide reductase  46.93 
 
 		 283 aa  253  5.000000000000001e-66  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0810  hypothetical protein  41.11 
 
 		 299 aa  241  2e-62  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000756552 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1334  CoB--CoM heterodisulfide reductase  44.04 
 
 		 286 aa  239  1e-61  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1326  hypothetical protein  40.91 
 
 		 281 aa  230  4e-59  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0849  CoB--CoM heterodisulfide reductase  42.26 
 
 		 294 aa  228  2e-58  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0688989  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1352  CoB--CoM heterodisulfide reductase  38.63 
 
 		 285 aa  223  8e-57  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.472371 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0357  CoB--CoM heterodisulfide reductase  38.43 
 
 		 284 aa  217  4e-55  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0827  CoB--CoM heterodisulfide reductase  40.94 
 
 		 334 aa  216  7e-55  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.247627  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17760  heterodisulfide reductase, subunit B  39.86 
 
 		 349 aa  216  9.999999999999999e-55  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0323  CoB--CoM heterodisulfide reductase  40.22 
 
 		 326 aa  213  9e-54  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.557922 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2099  CoB--CoM heterodisulfide reductase  38.97 
 
 		 306 aa  211  2e-53  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0150  CoB--CoM heterodisulfide reductase  39.32 
 
 		 295 aa  211  2e-53  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3582  CoB--CoM heterodisulfide reductase  39.32 
 
 		 295 aa  211  2e-53  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3525  heterodisulfide reductase, B subunit  40.51 
 
 		 308 aa  209  7e-53  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1349  CoB--CoM heterodisulfide reductase  39.37 
 
 		 293 aa  207  3e-52  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.543015 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1208  succinate dehydrogenase subunit C  38.38 
 
 		 299 aa  207  4e-52  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0031  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  39.93 
 
 		 317 aa  203  5e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0091  heterodisulfide reductase subunit  39.73 
 
 		 296 aa  203  6e-51  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1805  hypothetical protein  37.41 
 
 		 281 aa  201  1.9999999999999998e-50  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.852192 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0030  CoB--CoM heterodisulfide reductase  39.59 
 
 		 317 aa  201  3e-50  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3425  protein of unknown function DUF224, cysteine-rich region  38.83 
 
 		 296 aa  200  5e-50  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1701  CoB--CoM heterodisulfide reductase  34.97 
 
 		 288 aa  195  2e-48  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000396629 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0197  CoB--CoM heterodisulfide reductase  37.24 
 
 		 300 aa  193  8e-48  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2316  CoB--CoM heterodisulfide reductase  37.24 
 
 		 300 aa  193  8e-48  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0862  CoB--CoM heterodisulfide reductase  37.97 
 
 		 292 aa  191  2e-47  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1195  hypothetical protein  39.46 
 
 		 290 aa  184  2.0000000000000003e-45  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0416  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  37.89 
 
 		 302 aa  182  1e-44  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.373291 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1160  CoB--CoM heterodisulfide reductase  33.8 
 
 		 295 aa  182  1e-44  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0819  CoB--CoM heterodisulfide reductase  36.1 
 
 		 294 aa  176  9.999999999999999e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.130606 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26920  heterodisulfide reductase, subunit B  32.87 
 
 		 296 aa  174  3.9999999999999995e-42  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3676  CoB--CoM heterodisulfide reductase  33.33 
 
 		 300 aa  174  5e-42  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.153415 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2104  CoB--CoM heterodisulfide reductase  35.54 
 
 		 305 aa  172  1e-41  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1573  CoB--CoM heterodisulfide reductase  35.69 
 
 		 281 aa  170  5e-41  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0675  succinate dehydrogenase subunit C  32.87 
 
 		 290 aa  167  2.9999999999999998e-40  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0161488  hitchhiker  0.000830307 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3573  CoB--CoM heterodisulfide reductase  35.69 
 
 		 294 aa  167  4e-40  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1077  CoB--CoM heterodisulfide reductase  33.75 
 
 		 320 aa  167  4e-40  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0320251  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0634  CoB--CoM heterodisulfide reductase  35.38 
 
 		 290 aa  167  4e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2343  CoB--CoM heterodisulfide reductase  35.97 
 
 		 305 aa  167  5e-40  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.50274  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1542  CoB--CoM heterodisulfide reductase  33.1 
 
 		 306 aa  165  1.0000000000000001e-39  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.0167563 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06200  heterodisulfide reductase, subunit B  33.45 
 
 		 297 aa  164  3e-39  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.860836  hitchhiker  0.00110828 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0637  CoB--CoM heterodisulfide reductase  29.87 
 
 		 303 aa  162  1e-38  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0945961 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0172  CoB--CoM heterodisulfide reductase  32.28 
 
 		 290 aa  161  3e-38  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1645  heterodisulfide reductase, B subunit  35.42 
 
 		 303 aa  159  8e-38  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0422083  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0976  CoB--CoM heterodisulfide reductase  31.21 
 
 		 296 aa  158  2e-37  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.161405  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2211  CoB--CoM heterodisulfide reductase  29.55 
 
 		 303 aa  155  1e-36  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0339635  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2550  succinate dehydrogenase/fumarate reductase, C subunit  30.46 
 
 		 303 aa  152  1e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.187993  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2178  CoB--CoM heterodisulfide reductase  30.46 
 
 		 303 aa  152  1e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000000377327 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0375  CoB--CoM heterodisulfide reductase  30.69 
 
 		 291 aa  146  6e-34  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0394  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  40.23 
 
 		 189 aa  145  1e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00274296  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1881  CoB--CoM heterodisulfide reductase  32.51 
 
 		 295 aa  145  2e-33  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.983489  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1351  heterodisulfide reductase, C subunit  45.45 
 
 		 193 aa  144  4e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.452628 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3648  succinate dehydrogenase subunit C  32.09 
 
 		 301 aa  144  5e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.115665  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0453  succinate dehydrogenase subunit C  30.85 
 
 		 301 aa  143  9e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4093  hypothetical protein  30.29 
 
 		 296 aa  140  4.999999999999999e-32  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.883836  normal  0.415354 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0465  succinate dehydrogenase, C subunit  29.79 
 
 		 285 aa  140  4.999999999999999e-32  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0490  succinate dehydrogenase, C subunit  29.79 
 
 		 285 aa  140  7e-32  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1281  hypothetical protein  29.93 
 
 		 285 aa  140  7e-32  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0286  CoB--CoM heterodisulfide reductase  30.22 
 
 		 282 aa  139  8.999999999999999e-32  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.82153  normal  0.840113 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1251  CoB--CoM heterodisulfide reductase  31.25 
 
 		 282 aa  139  1e-31  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.684126  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2526  CoB--CoM heterodisulfide reductase  32.66 
 
 		 302 aa  138  2e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5286  CoB--CoM heterodisulfide reductase  31.12 
 
 		 304 aa  138  2e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0198  heterodisulfide reductase subunit C  36.08 
 
 		 213 aa  138  2e-31  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2317  heterodisulfide reductase subunit C  36.08 
 
 		 213 aa  138  2e-31  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2715  CoB--CoM heterodisulfide reductase  28.88 
 
 		 282 aa  137  4e-31  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0826  heterodisulfide reductase, C subunit  40.68 
 
 		 186 aa  137  4e-31  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.185232  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2664  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  29.3 
 
 		 276 aa  137  6.0000000000000005e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1632  CoB--CoM heterodisulfide reductase  31.25 
 
 		 301 aa  136  8e-31  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0322  heterodisulfide reductase, C subunit  38.67 
 
 		 186 aa  136  9.999999999999999e-31  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.554815 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0358  putative heterodisulfide reductase, C subunit  38.37 
 
 		 187 aa  135  1.9999999999999998e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4068  CoB--CoM heterodisulfide reductase  30.41 
 
 		 297 aa  135  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0031  heterodisulfide reductase subunit  39.87 
 
 		 194 aa  134  3.9999999999999996e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3151  CoB--CoM heterodisulfide reductase  30.27 
 
 		 297 aa  134  6e-30  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00144336  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0032  heterodisulfide reductase subunit  39.22 
 
 		 194 aa  133  9e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1993  succinate/fumarate oxidoreductase, putative  30.22 
 
 		 282 aa  132  2.0000000000000002e-29  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0129  succinate/fumarate oxidoreductase, putative  28.42 
 
 		 282 aa  131  3e-29  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.394033  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2945  CoB--CoM heterodisulfide reductase  29.25 
 
 		 297 aa  130  5.0000000000000004e-29  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1325  heterodisulfide reductase, C subunit  33.52 
 
 		 188 aa  130  7.000000000000001e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0151  heterodisulfide reductase subunit C-like protein  37.66 
 
 		 192 aa  129  1.0000000000000001e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3424  heterodisulfide reductase subunit  37.5 
 
 		 216 aa  128  2.0000000000000002e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1837  protein of unknown function DUF224, cysteine-rich region  30 
 
 		 296 aa  128  2.0000000000000002e-28  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.213828  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0175  succinate dehydrogenase subunit C  30.22 
 
 		 282 aa  129  2.0000000000000002e-28  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3581  heterodisulfide reductase subunit C-like protein  37.66 
 
 		 192 aa  129  2.0000000000000002e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0563  putative heterodisulfide reductase, C subunit  37.85 
 
 		 211 aa  129  2.0000000000000002e-28  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0861  heterodisulfide reductase subunit  35.95 
 
 		 194 aa  128  3e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0624  CoB--CoM heterodisulfide reductase  30.39 
 
 		 300 aa  127  3e-28  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.022325  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0250  CoB--CoM heterodisulfide reductase  29.24 
 
 		 282 aa  127  3e-28  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.26914  normal  0.65671 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1028  succinate dehydrogenase/fumarate reductase subunit C  29.03 
 
 		 293 aa  126  8.000000000000001e-28  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.288715  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2342  CoB--CoM heterodisulfide reductase  29.08 
 
 		 282 aa  126  8.000000000000001e-28  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0092  heterodisulfide reductase subunit  36.6 
 
 		 182 aa  126  1e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1207  heterodisulfide reductase, C subunit  38.27 
 
 		 204 aa  125  2e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1196  heterodisulfide reductase, C subunit  41.1 
 
 		 184 aa  125  2e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0475  CoB--CoM heterodisulfide reductase  28.47 
 
 		 300 aa  124  3e-27  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.946116  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0310  succinate dehydrogenase subunit C  28.98 
 
 		 282 aa  124  5e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.231375 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0809  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  35.9 
 
 		 190 aa  124  5e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000061408 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>