204 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A1953 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007355  Mbar_A1953  heterodisulfide reductase subunit HdrC  100 
 
 
236 aa  491  9.999999999999999e-139  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1697  hypothetical protein  28.57 
 
 
246 aa  98.6  8e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000729724 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1082  hypothetical protein  45.78 
 
 
240 aa  89.4  4e-17  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.165945  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2099  heterodisulfide reductase, subunit C (HdrC-1)  27.95 
 
 
280 aa  83.2  0.000000000000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2555  iron-sulfur cluster-binding protein  41.86 
 
 
228 aa  80.5  0.00000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.461611  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2185  hypothetical protein  41.86 
 
 
228 aa  80.5  0.00000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.32077  hitchhiker  0.00000000457726 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2216  hypothetical protein  33.33 
 
 
230 aa  80.1  0.00000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.278188  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0632  iron-sulfur cluster-binding protein  33.33 
 
 
230 aa  80.1  0.00000000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0958053 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0308  CoB--CoM heterodisulfide reductase  42.31 
 
 
184 aa  79.7  0.00000000000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0539  CoB--CoM heterodisulfide reductase subunit C  42.31 
 
 
184 aa  79.7  0.00000000000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.214937  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1604  CoB--CoM heterodisulfide reductase, subunit C  42.31 
 
 
184 aa  79.7  0.00000000000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.455044  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0377  CoB--CoM heterodisulfide reductase  42.31 
 
 
184 aa  79  0.00000000000006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1351  heterodisulfide reductase, C subunit  46.99 
 
 
193 aa  77.8  0.0000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.452628 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0964  hypothetical protein  33.11 
 
 
239 aa  77.8  0.0000000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.570063  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1547  heterodisulfide reductase subunit C-like protein  26.72 
 
 
280 aa  76.3  0.0000000000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.0378845 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0640  CoB--CoM heterodisulfide reductase subunit C  33.61 
 
 
161 aa  75.9  0.0000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1516  CoB--CoM heterodisulfide reductase subunit C  36.73 
 
 
164 aa  75.5  0.0000000000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000306335  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1574  putative heterodisulfide reductase, C subunit  41.67 
 
 
174 aa  74.7  0.000000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3675  putative heterodisulfide reductase, C subunit  39.13 
 
 
195 aa  74.7  0.000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.141926 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1700  putative heterodisulfide reductase, C subunit  38.55 
 
 
193 aa  72.8  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000309238 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0433  CoB--CoM heterodisulfide reductase  26.09 
 
 
192 aa  71.6  0.00000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2241  CoB/CoM heterodisulfide reductase, subunit C  36.67 
 
 
194 aa  70.9  0.00000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0469153  normal  0.0166067 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0417  putative heterodisulfide reductase, C subunit  37.5 
 
 
194 aa  70.9  0.00000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.344766 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0307  CoB--CoM heterodisulfide reductase  35.9 
 
 
196 aa  70.5  0.00000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.802269  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1517  CoB--CoM heterodisulfide reductase, subunit C  26.09 
 
 
192 aa  70.5  0.00000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.507445  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2098  heterodisulfide reductase, C subunit  44.19 
 
 
193 aa  69.7  0.00000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0474  CoB--CoM heterodisulfide reductase  28.44 
 
 
193 aa  69.7  0.00000000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.561183  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0826  heterodisulfide reductase, C subunit  41.67 
 
 
186 aa  68.9  0.00000000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.185232  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0402  CoB--CoM heterodisulfide reductase  33.33 
 
 
192 aa  68.6  0.00000000008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0280446  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0820  putative heterodisulfide reductase, C subunit  33.02 
 
 
192 aa  68.6  0.00000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.123 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0809  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  33.65 
 
 
190 aa  67.8  0.0000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000061408 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0590  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  38.96 
 
 
193 aa  68.2  0.0000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.321199  normal  0.0726 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1801  hypothetical protein  38.75 
 
 
372 aa  67.4  0.0000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.606792 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0563  putative heterodisulfide reductase, C subunit  39.24 
 
 
211 aa  67  0.0000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1252  heterodisulfide reductase subunit C-like protein  35.42 
 
 
160 aa  67.4  0.0000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2344  putative heterodisulfide reductase, C subunit  40.51 
 
 
188 aa  67.4  0.0000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.628999  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0439  heterodisulfide reductase subunit C-like  36.05 
 
 
156 aa  67  0.0000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0394  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  34.34 
 
 
189 aa  67  0.0000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00274296  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0198  heterodisulfide reductase subunit C  43.48 
 
 
213 aa  66.6  0.0000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0239  hypothetical protein  38.96 
 
 
194 aa  66.6  0.0000000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.577493 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0358  putative heterodisulfide reductase, C subunit  38.75 
 
 
187 aa  66.6  0.0000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1028  heterodisulfide reductase, subunit C/succinate dehydrogenase, subunit C  38.96 
 
 
502 aa  66.2  0.0000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00356665  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1836  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  31.03 
 
 
191 aa  66.2  0.0000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.139025  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1261  CoB--CoM heterodisulfide reductase  34.02 
 
 
502 aa  66.2  0.0000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2317  heterodisulfide reductase subunit C  42.39 
 
 
213 aa  65.9  0.0000000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0625  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  37.66 
 
 
193 aa  65.5  0.0000000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0765561  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0911  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  33.05 
 
 
367 aa  65.5  0.0000000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1307  CoB--CoM heterodisulfide reductase  37.35 
 
 
497 aa  65.1  0.0000000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3574  Heterodisulfide reductase subunit C-like protein  31.03 
 
 
202 aa  65.1  0.0000000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1201  CoB--CoM heterodisulfide reductase  38.75 
 
 
508 aa  65.1  0.0000000009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0710444  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0322  heterodisulfide reductase, C subunit  40.48 
 
 
186 aa  65.1  0.000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.554815 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0633  putative heterodisulfide reductase, C subunit  35.06 
 
 
200 aa  64.7  0.000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0031  heterodisulfide reductase subunit  32.94 
 
 
194 aa  63.2  0.000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0848  heterodisulfide reductase, C subunit  39.51 
 
 
202 aa  63.5  0.000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.12259  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1161  heterodisulfide reductase subunit C-like protein  36.99 
 
 
203 aa  62.8  0.000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.860285  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1108  heterodisulfide reductase, subunit C/succinate dehydrogenase, subunit C  32.98 
 
 
502 aa  62.8  0.000000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.785263  normal  0.633567 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0032  heterodisulfide reductase subunit  32.94 
 
 
194 aa  62.8  0.000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3524  heterodisulfide reductase, C subunit  34.04 
 
 
185 aa  62.4  0.000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1196  heterodisulfide reductase, C subunit  37.5 
 
 
184 aa  62.4  0.000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0861  heterodisulfide reductase subunit  29.55 
 
 
194 aa  62  0.000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1207  heterodisulfide reductase, C subunit  37.76 
 
 
204 aa  61.6  0.00000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1882  heterodisulfide reductase subunit C  31.46 
 
 
195 aa  61.6  0.00000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1325  heterodisulfide reductase, C subunit  33.75 
 
 
188 aa  61.2  0.00000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17750  hypothetical protein  35.16 
 
 
204 aa  60.8  0.00000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1285  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  24.47 
 
 
385 aa  60.5  0.00000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.699767  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2663  Heterodisulfide reductase subunit C-like protein  36 
 
 
129 aa  60.1  0.00000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1335  heterodisulfide reductase, C subunit  35 
 
 
177 aa  59.3  0.00000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0151  heterodisulfide reductase subunit C-like protein  28.7 
 
 
192 aa  58.9  0.00000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3581  heterodisulfide reductase subunit C-like protein  27.42 
 
 
192 aa  58.9  0.00000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3424  heterodisulfide reductase subunit  33.73 
 
 
216 aa  58.5  0.00000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1806  heterodisulfide reductase, C subunit  33.77 
 
 
189 aa  58.5  0.00000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.577988 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0092  heterodisulfide reductase subunit  38.03 
 
 
182 aa  57.4  0.0000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1176  hypothetical protein  38.96 
 
 
375 aa  57.4  0.0000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.390877 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3961  DNA binding domain-containing protein  26.9 
 
 
314 aa  57.4  0.0000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0975  heterodisulfide reductase subunit C-like protein  31.51 
 
 
133 aa  57.4  0.0000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.826747  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1078  heterodisulfide reductase subunit C  27.27 
 
 
253 aa  56.6  0.0000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.114051  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4092  heterodisulfide reductase subunit C-like  26.19 
 
 
148 aa  56.2  0.0000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.737599  normal  0.409471 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0968  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  26.73 
 
 
437 aa  55.8  0.0000006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.405818  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1452  hypothetical protein  32.26 
 
 
412 aa  54.7  0.000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.275657 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1029  succinate dehydrogenase/fumarate reductase subunit B  29.13 
 
 
325 aa  54.3  0.000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.77588  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3531  DNA binding domain-containing protein  31.51 
 
 
308 aa  54.3  0.000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.635038  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0747  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  34.44 
 
 
425 aa  53.1  0.000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.556917  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1783  hypothetical protein  32.18 
 
 
386 aa  52.8  0.000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1436  Heterodisulfide reductase subunit C-like protein  32.91 
 
 
533 aa  52.8  0.000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.695739  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2808  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  32.93 
 
 
383 aa  52.8  0.000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0771  oxidoreductase, selenocysteine-containing  35.94 
 
 
432 aa  52.8  0.000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.457197  normal  0.324635 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1446  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  32.93 
 
 
383 aa  52.4  0.000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5222  hypothetical protein  27.43 
 
 
649 aa  51.2  0.00001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00064431  hitchhiker  0.00288183 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2341  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  32.81 
 
 
439 aa  51.6  0.00001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1348  heterodisulfide reductase, C subunit  30.77 
 
 
192 aa  51.2  0.00001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.511519 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2103  heterodisulfide reductase subunit C (HdrC-2)  27.27 
 
 
230 aa  50.4  0.00002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.666222  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0414  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  30.21 
 
 
451 aa  51.2  0.00002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.137763 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1734  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  28.95 
 
 
385 aa  50.1  0.00003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1077  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  31.46 
 
 
382 aa  50.1  0.00003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0184362  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1646  heterodisulfide reductase subunit C  34.33 
 
 
210 aa  50.1  0.00003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0261138  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0676  succinate dehydrogenase iron-sulfur subunit  33.75 
 
 
319 aa  50.1  0.00003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0212132  hitchhiker  0.00094044 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2085  protein of unknown function DUF224, cysteine-rich region  31.71 
 
 
387 aa  49.7  0.00004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.32982  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0636  iron-sulfur cluster-binding protein  30.49 
 
 
238 aa  49.7  0.00004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.126769 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3136  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.41 
 
 
934 aa  49.7  0.00004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.502756 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1543  heterodisulfide reductase subunit C-like protein  30.38 
 
 
230 aa  49.3  0.00005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.0154389 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>