182 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_2133 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011769  DvMF_2896  heterodisulfide reductase, transmembrane subunit, putative  83.33 
 
 
384 aa  680    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.217971 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1113  heterodisulfide reductase, transmembrane subunit, putative  82.55 
 
 
384 aa  681    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0397617  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2133  heterodisulfide reductase, transmembrane subunit, putative  100 
 
 
384 aa  783    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.411689  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2125  heterodisulfide reductase, transmembrane subunit, putative  64.38 
 
 
393 aa  499  1e-140  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1963  quinone-interacting membrane-bound oxidoreductase complex subunit C  60.71 
 
 
407 aa  479  1e-134  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00829701 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3201  heterodisulfide reductase, transmembrane subunit, putative  60.46 
 
 
408 aa  462  1e-129  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1834  heterodisulfide reductase, putative  41.09 
 
 
391 aa  291  2e-77  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0759481  normal  0.0501032 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0035  heterodisulfide reductase, putative  39.66 
 
 
393 aa  288  1e-76  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000417872  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1001  heterodisulfide reductase, putative  40 
 
 
398 aa  276  3e-73  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.284636  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1582  heterodisulfide reductase, putative  37.05 
 
 
392 aa  264  2e-69  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00374998  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1285  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  27.97 
 
 
385 aa  133  5e-30  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.699767  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1077  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  25.26 
 
 
382 aa  131  3e-29  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0184362  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0911  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  26.86 
 
 
367 aa  123  4e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0625  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  43.96 
 
 
193 aa  92  2e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0765561  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0239  hypothetical protein  43.01 
 
 
194 aa  90.1  6e-17  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.577493 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2241  CoB/CoM heterodisulfide reductase, subunit C  38.46 
 
 
194 aa  87  4e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0469153  normal  0.0166067 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0590  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  38.46 
 
 
193 aa  86.7  7e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.321199  normal  0.0726 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1836  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  39.56 
 
 
191 aa  82.4  0.00000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.139025  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0563  putative heterodisulfide reductase, C subunit  36.67 
 
 
211 aa  80.1  0.00000000000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2098  heterodisulfide reductase, C subunit  33.64 
 
 
193 aa  77.4  0.0000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0394  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  36.54 
 
 
189 aa  75.9  0.000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00274296  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1806  heterodisulfide reductase, C subunit  30.07 
 
 
189 aa  73.6  0.000000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.577988 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2663  Heterodisulfide reductase subunit C-like protein  34.04 
 
 
129 aa  73.9  0.000000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4092  heterodisulfide reductase subunit C-like  35.29 
 
 
148 aa  73.6  0.000000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.737599  normal  0.409471 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1325  heterodisulfide reductase, C subunit  31.63 
 
 
188 aa  73.2  0.000000000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3675  putative heterodisulfide reductase, C subunit  34.86 
 
 
195 aa  72.8  0.00000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.141926 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0358  putative heterodisulfide reductase, C subunit  35.79 
 
 
187 aa  72.4  0.00000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1351  heterodisulfide reductase, C subunit  31.25 
 
 
193 aa  72  0.00000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.452628 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0439  heterodisulfide reductase subunit C-like  38.75 
 
 
156 aa  69.7  0.00000000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3424  heterodisulfide reductase subunit  32.22 
 
 
216 aa  68.6  0.0000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0151  heterodisulfide reductase subunit C-like protein  30.77 
 
 
192 aa  68.2  0.0000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1517  CoB--CoM heterodisulfide reductase, subunit C  33.64 
 
 
192 aa  68.6  0.0000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.507445  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1196  heterodisulfide reductase, C subunit  31 
 
 
184 aa  67.8  0.0000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3581  heterodisulfide reductase subunit C-like protein  30.77 
 
 
192 aa  67.8  0.0000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0539  CoB--CoM heterodisulfide reductase subunit C  37.76 
 
 
184 aa  67.4  0.0000000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.214937  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0377  CoB--CoM heterodisulfide reductase  40.51 
 
 
184 aa  67.4  0.0000000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0308  CoB--CoM heterodisulfide reductase  37.76 
 
 
184 aa  67.4  0.0000000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1604  CoB--CoM heterodisulfide reductase, subunit C  37.76 
 
 
184 aa  67.4  0.0000000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.455044  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2085  protein of unknown function DUF224, cysteine-rich region  32.69 
 
 
387 aa  66.6  0.0000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.32982  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1700  putative heterodisulfide reductase, C subunit  35.71 
 
 
193 aa  67  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000309238 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0032  heterodisulfide reductase subunit  31.87 
 
 
194 aa  66.6  0.0000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1574  putative heterodisulfide reductase, C subunit  34.83 
 
 
174 aa  66.6  0.0000000007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0031  heterodisulfide reductase subunit  31.87 
 
 
194 aa  66.6  0.0000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1452  hypothetical protein  37.23 
 
 
412 aa  66.6  0.0000000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.275657 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0474  CoB--CoM heterodisulfide reductase  38.1 
 
 
193 aa  65.9  0.000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.561183  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0848  heterodisulfide reductase, C subunit  31.52 
 
 
202 aa  66.2  0.000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.12259  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0322  heterodisulfide reductase, C subunit  30.36 
 
 
186 aa  65.9  0.000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.554815 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0092  heterodisulfide reductase subunit  30.77 
 
 
182 aa  65.5  0.000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1446  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  33.65 
 
 
383 aa  65.5  0.000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2808  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  34.74 
 
 
383 aa  65.1  0.000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0433  CoB--CoM heterodisulfide reductase  31.78 
 
 
192 aa  64.7  0.000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0861  heterodisulfide reductase subunit  30.77 
 
 
194 aa  65.5  0.000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0402  CoB--CoM heterodisulfide reductase  34.15 
 
 
192 aa  64.3  0.000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0280446  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0826  heterodisulfide reductase, C subunit  31.52 
 
 
186 aa  63.9  0.000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.185232  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0636  iron-sulfur cluster-binding protein  32.58 
 
 
238 aa  63.2  0.000000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.126769 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2212  heterodisulfide reductase subunit C  31.46 
 
 
238 aa  63.2  0.000000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0191178  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0307  CoB--CoM heterodisulfide reductase  38.46 
 
 
196 aa  62.8  0.000000009  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.802269  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3524  heterodisulfide reductase, C subunit  30.43 
 
 
185 aa  61.6  0.00000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3574  Heterodisulfide reductase subunit C-like protein  30.85 
 
 
202 aa  61.6  0.00000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2344  putative heterodisulfide reductase, C subunit  34.38 
 
 
188 aa  60.8  0.00000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.628999  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0975  heterodisulfide reductase subunit C-like protein  30.77 
 
 
133 aa  60.5  0.00000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.826747  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1207  heterodisulfide reductase, C subunit  29.35 
 
 
204 aa  60.5  0.00000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3489  citrate utilization protein B  26.15 
 
 
388 aa  59.7  0.00000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.57381  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1108  heterodisulfide reductase, subunit C/succinate dehydrogenase, subunit C  26.4 
 
 
502 aa  59.7  0.00000009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.785263  normal  0.633567 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17750  hypothetical protein  30.68 
 
 
204 aa  58.9  0.0000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2503  putative ferredoxin  25.47 
 
 
404 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.232616 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3416  CitB domain protein  24.67 
 
 
408 aa  58.9  0.0000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1335  heterodisulfide reductase, C subunit  29.17 
 
 
177 aa  59.3  0.0000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2551  iron-sulfur cluster-binding protein  28.97 
 
 
239 aa  58.9  0.0000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.802978  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0793  CitB domain-containing protein  26.85 
 
 
403 aa  58.9  0.0000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1078  heterodisulfide reductase subunit C  30.93 
 
 
253 aa  58.5  0.0000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.114051  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0633  putative heterodisulfide reductase, C subunit  29 
 
 
200 aa  58.5  0.0000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1161  heterodisulfide reductase subunit C-like protein  27.72 
 
 
203 aa  58.5  0.0000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.860285  n/a   
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3552  CitB domain-containing protein  26.43 
 
 
370 aa  57.8  0.0000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1882  heterodisulfide reductase subunit C  32.58 
 
 
195 aa  57.4  0.0000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0198  heterodisulfide reductase subunit C  27.78 
 
 
213 aa  57  0.0000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2317  heterodisulfide reductase subunit C  27.78 
 
 
213 aa  56.6  0.0000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1252  heterodisulfide reductase subunit C-like protein  29.35 
 
 
160 aa  56.6  0.0000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1028  heterodisulfide reductase, subunit C/succinate dehydrogenase, subunit C  26.83 
 
 
502 aa  55.8  0.000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00356665  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1884  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  34.29 
 
 
402 aa  55.8  0.000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.561608  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4071  CitB domain-containing protein  24.4 
 
 
408 aa  55.5  0.000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0093  hypothetical protein  44.26 
 
 
423 aa  55.5  0.000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0809  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  32.18 
 
 
190 aa  55.1  0.000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000061408 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2341  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  34.38 
 
 
439 aa  54.7  0.000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1176  hypothetical protein  35 
 
 
375 aa  54.3  0.000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.390877 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1348  heterodisulfide reductase, C subunit  26.37 
 
 
192 aa  53.9  0.000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.511519 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4528  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  28.66 
 
 
694 aa  53.5  0.000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1783  hypothetical protein  30 
 
 
386 aa  53.5  0.000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5879  CitB domain-containing protein  23.87 
 
 
404 aa  53.1  0.000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.237858  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0820  putative heterodisulfide reductase, C subunit  30.49 
 
 
192 aa  53.1  0.000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.123 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0688  sn-glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit C  28.45 
 
 
413 aa  52.8  0.000009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4211  Citrate utilization protein B  22.22 
 
 
390 aa  52.8  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0968  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  31.31 
 
 
437 aa  52.8  0.00001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.405818  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0417  putative heterodisulfide reductase, C subunit  33.77 
 
 
194 aa  51.2  0.00003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.344766 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5625  CitB domain protein  23.67 
 
 
404 aa  51.6  0.00003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0395  sn-glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit C  31.87 
 
 
424 aa  51.2  0.00003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1436  Heterodisulfide reductase subunit C-like protein  31.11 
 
 
533 aa  50.8  0.00004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.695739  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6302  CitB domain-containing protein  25.25 
 
 
400 aa  50.4  0.00005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2860  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  25.93 
 
 
699 aa  50.1  0.00007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1261  CoB--CoM heterodisulfide reductase  25.69 
 
 
502 aa  49.7  0.00008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>