45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_3552 on replicon NC_009469
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009469  Acry_3552  CitB domain-containing protein  100 
 
 		 370 aa  748    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5625  CitB domain protein  42.62 
 
 		 404 aa  300  2e-80  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4212  putative citrate utilization protein B (citB)  43.05 
 
 		 372 aa  296  4e-79  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.762767  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6133  CitB domain-containing protein  41.71 
 
 		 368 aa  287  2e-76  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8555  CitB domain protein  41.89 
 
 		 398 aa  286  5.999999999999999e-76  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.388597  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5879  CitB domain-containing protein  41.85 
 
 		 404 aa  281  1e-74  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.237858  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6302  CitB domain-containing protein  42.12 
 
 		 400 aa  279  5e-74  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2322  citrate utilization protein B  42.54 
 
 		 376 aa  278  7e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.224163  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2503  putative ferredoxin  43.37 
 
 		 404 aa  278  1e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.232616 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2275  CitB domain-containing protein  43.41 
 
 		 365 aa  273  3e-72  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.363441 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4211  Citrate utilization protein B  41.62 
 
 		 390 aa  269  5.9999999999999995e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0846  citrate utilization protein B  43.21 
 
 		 379 aa  266  2.9999999999999995e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1892  citrate utilization protein B  46.05 
 
 		 372 aa  266  5e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.494216  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0810  citrate utilization protein B  42.38 
 
 		 379 aa  264  1e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.972731  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0737  citrate utilization protein B  42.94 
 
 		 379 aa  265  1e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.580161  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0797  citrate utilization protein B  42.94 
 
 		 379 aa  265  1e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5147  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  42.55 
 
 		 403 aa  265  1e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.276301  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0749  citrate utilization protein B  42.66 
 
 		 379 aa  264  2e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.762495 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3134  CitB domain protein  41 
 
 		 408 aa  260  3e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.870392  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6016  CitB domain-containing protein  42.08 
 
 		 404 aa  259  5.0000000000000005e-68  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.66746 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4071  CitB domain-containing protein  39.67 
 
 		 408 aa  256  4e-67  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2382  CitB domain protein  39.19 
 
 		 378 aa  256  6e-67  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3416  CitB domain protein  39.4 
 
 		 408 aa  255  9e-67  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2987  hypothetical protein  44.97 
 
 		 389 aa  254  2.0000000000000002e-66  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.244128  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3857  CitB domain-containing protein  40.17 
 
 		 377 aa  248  1e-64  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000315554 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0793  CitB domain-containing protein  40.33 
 
 		 403 aa  244  9.999999999999999e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3176  citrate utilization protein B  44.99 
 
 		 379 aa  242  7e-63  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2723  CitB domain-containing protein  40.68 
 
 		 372 aa  237  2e-61  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2087  CitB domain-containing protein  38.44 
 
 		 389 aa  237  3e-61  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0934488  normal  0.0884631 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3814  CitB domain-containing protein  38.19 
 
 		 394 aa  234  2.0000000000000002e-60  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.986403 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3489  citrate utilization protein B  38.8 
 
 		 388 aa  224  1e-57  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.57381  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0640  citrate utilization protein B  39.67 
 
 		 395 aa  221  9.999999999999999e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0620  citrate utilization protein B  35.18 
 
 		 388 aa  189  8e-47  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0911  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  25.73 
 
 		 367 aa  70.9  0.00000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0035  heterodisulfide reductase, putative  22.73 
 
 		 393 aa  69.7  0.00000000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000417872  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1834  heterodisulfide reductase, putative  22.65 
 
 		 391 aa  67.4  0.0000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0759481  normal  0.0501032 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2896  heterodisulfide reductase, transmembrane subunit, putative  24.34 
 
 		 384 aa  65.5  0.000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.217971 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2133  heterodisulfide reductase, transmembrane subunit, putative  26.12 
 
 		 384 aa  63.9  0.000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.411689  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1113  heterodisulfide reductase, transmembrane subunit, putative  24.6 
 
 		 384 aa  63.5  0.000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0397617  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1582  heterodisulfide reductase, putative  21.86 
 
 		 392 aa  60.1  0.00000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00374998  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1963  quinone-interacting membrane-bound oxidoreductase complex subunit C  22.31 
 
 		 407 aa  60.1  0.00000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00829701 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3201  heterodisulfide reductase, transmembrane subunit, putative  23.08 
 
 		 408 aa  50.8  0.00004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2125  heterodisulfide reductase, transmembrane subunit, putative  24.69 
 
 		 393 aa  48.1  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0454  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  33.33 
 
 		 395 aa  42.7  0.01  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0295  hypothetical protein  36.62 
 
 		 399 aa  42.7  0.01  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.630234 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>