More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE1465 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002967  TDE1465  signal peptidase I, putative  100 
 
 
233 aa  479  1e-134  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0553  signal peptidase IB  28.71 
 
 
191 aa  80.9  0.00000000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0965  signal peptidase I  24.65 
 
 
191 aa  77.8  0.0000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.227628  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0984  signal peptidase I  24.65 
 
 
191 aa  77.8  0.0000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.920415  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1310  thylakoidal processing peptidase  28.44 
 
 
198 aa  75.5  0.0000000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1836  signal peptidase I  24.45 
 
 
215 aa  65.5  0.0000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.387891  normal  0.998113 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4839  signal peptidase I  25 
 
 
209 aa  65.1  0.0000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2878  signal peptidase I  29.11 
 
 
201 aa  64.7  0.000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000523532  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1410  signal peptidase I  24.14 
 
 
173 aa  63.5  0.000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0618865  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2049  signal peptidase I  27.09 
 
 
185 aa  62.8  0.000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000784744  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3289  signal peptidase I  24.55 
 
 
173 aa  62  0.000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000862301  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3104  Signal peptidase I U  25.24 
 
 
183 aa  61.2  0.00000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3677  signal peptidase I  23.83 
 
 
208 aa  61.6  0.00000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.60128 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1211  Signal peptidase I  23.08 
 
 
207 aa  60.8  0.00000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0257047  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0861  signal peptidase I  25.97 
 
 
248 aa  60.8  0.00000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0146841 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1005  signal peptidase I  25.97 
 
 
248 aa  60.8  0.00000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0514766 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3122  Signal peptidase I U  25.24 
 
 
183 aa  59.7  0.00000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000326894  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3123  Signal peptidase I U  25.24 
 
 
183 aa  59.7  0.00000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.028916  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2884  Signal peptidase I U  25.24 
 
 
183 aa  59.7  0.00000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0198691  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2851  signal peptidase I  25.24 
 
 
183 aa  59.7  0.00000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.369909  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2812  signal peptidase I  25.24 
 
 
183 aa  59.7  0.00000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.103734  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1532  signal peptidase I  24.88 
 
 
187 aa  60.1  0.00000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00110114  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3099  Signal peptidase I U  25.24 
 
 
183 aa  59.7  0.00000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0167599  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2000  signal peptidase-related protein  25.42 
 
 
208 aa  59.3  0.00000005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.180668 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1355  signal peptidase I  21.82 
 
 
171 aa  59.3  0.00000005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.58594  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4484  signal peptidase I  25.25 
 
 
200 aa  59.3  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.130088 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4420  signal peptidase I  25.25 
 
 
200 aa  59.3  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2146  Signal peptidase I U  24.76 
 
 
183 aa  58.9  0.00000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1752  peptidase S26A, signal peptidase I  23.65 
 
 
268 aa  58.9  0.00000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0552  signal peptidase IA, inactive  24.53 
 
 
173 aa  57.8  0.0000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1202  signal peptidase I  24.29 
 
 
186 aa  57.8  0.0000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000715638  normal  0.167973 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2420  signal peptidase I  25.7 
 
 
299 aa  58.2  0.0000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.133024  normal  0.287096 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1245  signal peptidase I  26.69 
 
 
274 aa  58.2  0.0000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.181866  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3169  signal peptidase I  24.65 
 
 
200 aa  57  0.0000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.559115  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0764  signal peptidase I  25.99 
 
 
221 aa  56.6  0.0000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000000179643  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2135  signal peptidase I  24.4 
 
 
194 aa  57  0.0000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0591499  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4691  signal peptidase I  26.24 
 
 
214 aa  56.6  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4150  signal peptidase I  23.19 
 
 
187 aa  56.6  0.0000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.432313  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1243  signal peptidase I  23.19 
 
 
187 aa  56.2  0.0000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1039  signal peptidase I  23.19 
 
 
187 aa  56.2  0.0000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1295  signal peptidase I  23.19 
 
 
187 aa  56.2  0.0000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.309036  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0134  signal peptidase I  27.67 
 
 
219 aa  56.2  0.0000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1741  signal peptidase I  26.92 
 
 
207 aa  55.8  0.0000005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2247  signal peptidase I  25.1 
 
 
263 aa  56.2  0.0000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1076  peptidase S26A, signal peptidase I  26.67 
 
 
259 aa  55.8  0.0000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.062274  normal  0.941469 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2890  signal peptidase I  25.84 
 
 
251 aa  55.5  0.0000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.527092  normal  0.396669 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1345  signal peptidase I  25.12 
 
 
257 aa  55.8  0.0000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.150454  normal  0.782452 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1191  signal peptidase I  22.71 
 
 
187 aa  55.5  0.0000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0549747  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2249  signal peptidase I  26.09 
 
 
199 aa  55.5  0.0000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0858  signal peptidase I  23.79 
 
 
188 aa  54.7  0.000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.272078  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0195  signal peptidase I  22.17 
 
 
192 aa  54.7  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.597616  normal  0.0662896 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1090  signal peptidase I  25.11 
 
 
267 aa  55.1  0.000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.21498  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1037  signal peptidase I  22.71 
 
 
187 aa  54.3  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0699  peptidase S26A, signal peptidase I  25.68 
 
 
235 aa  54.3  0.000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0691424  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0200  signal peptidase I  22.17 
 
 
193 aa  54.3  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0669  signal peptidase I  25.37 
 
 
189 aa  54.7  0.000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000423092  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3090  Signal peptidase I U  23.79 
 
 
183 aa  55.1  0.000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0250  signal peptidase I  23.5 
 
 
197 aa  55.1  0.000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.904614  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2491  signal peptidase I  32.2 
 
 
183 aa  54.7  0.000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000161769  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1359  signal peptidase I  31.68 
 
 
252 aa  54.7  0.000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.562371  normal  0.164164 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1465  signal peptidase I  25.55 
 
 
262 aa  53.9  0.000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3025  signal peptidase I  26.47 
 
 
248 aa  54.3  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0226835  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2218  signal peptidase I  23.04 
 
 
225 aa  53.9  0.000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000177112 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1846  Signal peptidase I  24.77 
 
 
231 aa  54.3  0.000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.10731  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2088  signal peptidase I  22.84 
 
 
269 aa  53.9  0.000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0733  peptidase S26A, signal peptidase I  24.89 
 
 
255 aa  53.5  0.000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000686529  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0906  signal peptidase I  23.01 
 
 
288 aa  53.9  0.000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.798817  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0312  signal peptidase I  22.97 
 
 
169 aa  53.9  0.000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.531917  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05771  Signal peptidase I  24.63 
 
 
211 aa  53.9  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1484  signal peptidase I  23.7 
 
 
182 aa  54.3  0.000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1039  signal peptidase I  22.71 
 
 
187 aa  54.3  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.260749  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3881  signal peptidase I S  33.9 
 
 
183 aa  53.5  0.000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000109164  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0009  signal peptidase I  24.77 
 
 
230 aa  53.1  0.000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.407191  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1218  signal peptidase I  22.22 
 
 
187 aa  53.1  0.000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1059  signal peptidase I  22.22 
 
 
187 aa  53.1  0.000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3690  signal peptidase I S  33.9 
 
 
183 aa  53.5  0.000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000137808  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3580  signal peptidase I S  33.9 
 
 
183 aa  53.5  0.000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.71528e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2878  signal peptidase I  23.62 
 
 
183 aa  53.1  0.000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.293282  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3598  signal peptidase I S  33.9 
 
 
183 aa  53.5  0.000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000018281  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3852  signal peptidase I S  33.9 
 
 
183 aa  53.5  0.000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.78284e-62 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1335  peptidase S26A, signal peptidase I  22.97 
 
 
217 aa  53.5  0.000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0446505  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1659  peptidase S26A, signal peptidase I  24.43 
 
 
221 aa  53.1  0.000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1398  signal peptidase I  23.5 
 
 
263 aa  53.1  0.000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1140  signal peptidase I  22.22 
 
 
187 aa  53.1  0.000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3977  signal peptidase I S  33.9 
 
 
183 aa  53.5  0.000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000000843557  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0487  thylakoidal processing peptidase  22.96 
 
 
220 aa  53.5  0.000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.0584817 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1119  signal peptidase I  23.5 
 
 
263 aa  53.1  0.000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2040  signal peptidase I  24.68 
 
 
298 aa  53.1  0.000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0825162  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2186  signal peptidase I  21.65 
 
 
304 aa  53.5  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.100122  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3886  signal peptidase I S  33.9 
 
 
183 aa  53.5  0.000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000194308  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1226  signal peptidase I  20.2 
 
 
190 aa  52.8  0.000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1661  signal peptidase I  24.67 
 
 
220 aa  53.1  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1199  signal peptidase I  23.77 
 
 
290 aa  53.1  0.000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.526786  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2178  thylakoidal processing peptidase  25.22 
 
 
216 aa  53.1  0.000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.338284 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05711  Signal peptidase I  23.97 
 
 
230 aa  52.8  0.000005  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.818825  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1103  Signal peptidase I  24.32 
 
 
189 aa  52.8  0.000005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000489704  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1404  signal peptidase I  28.25 
 
 
254 aa  52.8  0.000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.012571 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02999  signal peptidase I  23.63 
 
 
300 aa  52.4  0.000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.406201  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05701  Signal peptidase I  23.65 
 
 
219 aa  52  0.000007  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0121  thylakoidal processing peptidase  31.9 
 
 
215 aa  52.4  0.000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>