153 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE0960 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002967  TDE0960  neuB family protein  100 
 
 
379 aa  765    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0756  N-acetylneuraminate synthase  33.71 
 
 
337 aa  179  5.999999999999999e-44  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.556038 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0420  N-acetylneuraminate synthase  33.89 
 
 
349 aa  175  9.999999999999999e-43  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0151  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  33.9 
 
 
349 aa  170  3e-41  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0527  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  32 
 
 
335 aa  168  2e-40  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.783884  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1456  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  30.22 
 
 
354 aa  168  2e-40  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1391  N-acetylneuraminate synthase  32.51 
 
 
337 aa  167  2.9999999999999998e-40  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0754706 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0131  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  29.78 
 
 
351 aa  167  2.9999999999999998e-40  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    unclonable  0.00000000000000538819 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0643  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  33.9 
 
 
342 aa  167  2.9999999999999998e-40  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0506  N-acetylneuraminate synthase  32.45 
 
 
348 aa  166  6.9999999999999995e-40  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3027  pseudaminic acid synthase  31.98 
 
 
349 aa  164  3e-39  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2303  general stress protein 14 (GSP14)  33.99 
 
 
333 aa  163  4.0000000000000004e-39  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12451  sialic acid synthase  32.68 
 
 
337 aa  163  5.0000000000000005e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0694401  hitchhiker  0.00593947 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1304  N-acetylneuraminate synthase  31.52 
 
 
350 aa  162  1e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.583965  normal  0.823534 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1576  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  30.11 
 
 
350 aa  161  2e-38  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16950  N-acetylneuraminate synthase  32.1 
 
 
331 aa  160  2e-38  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1248  N-acetylneuraminate synthase  32.07 
 
 
348 aa  160  3e-38  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.862744  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2641  N-acetylneuraminate synthase  32.84 
 
 
330 aa  160  5e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14081  sialic acid synthase  32.58 
 
 
341 aa  158  2e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0595  N-acetylneuraminate synthase  31.82 
 
 
333 aa  157  4e-37  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0789  N-acetylneuraminic acid condensing enzyme  31.28 
 
 
340 aa  156  5.0000000000000005e-37  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1289  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  32.18 
 
 
350 aa  156  6e-37  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2229  N-acetylneuraminate synthase  31.8 
 
 
350 aa  155  1e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0818  N-acetylneuraminic acid condensing enzyme  30.73 
 
 
340 aa  154  4e-36  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1586  N-acetylneuraminate synthase  31.75 
 
 
347 aa  153  4e-36  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2327  N-acetylneuraminate synthase  30.9 
 
 
350 aa  152  1e-35  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.463819 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2407  N-acetylneuraminate synthase  30.87 
 
 
500 aa  150  3e-35  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.378262  normal  0.284066 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01550  N-acetylneuraminate synthase  28.73 
 
 
349 aa  150  3e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.0492033 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2977  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  32.45 
 
 
334 aa  150  4e-35  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3121  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  32.45 
 
 
334 aa  150  4e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1970  polysaccharide biosynthesis protein, putative  30.93 
 
 
350 aa  149  9e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.237085  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3942  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  31.58 
 
 
349 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0693356 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0019  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  33.43 
 
 
350 aa  147  3e-34  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1516  N-acetylneuraminic acid synthetase  28.29 
 
 
334 aa  144  2e-33  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.350916  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0647  antifreeze-like protein  31.32 
 
 
350 aa  144  3e-33  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.318568  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0385  N-acetylneuraminic acid synthetase  28.29 
 
 
334 aa  143  4e-33  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0455  N-acetylneuraminate synthase  35.22 
 
 
286 aa  143  5e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1140  polysaccharide biosynthesis protein, putative sialic acid synthase  34.35 
 
 
287 aa  141  9.999999999999999e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1458  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  29.75 
 
 
334 aa  142  9.999999999999999e-33  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1329  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  31.14 
 
 
358 aa  142  9.999999999999999e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1832  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  28.53 
 
 
394 aa  141  1.9999999999999998e-32  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01101  sialic acid synthase  30.23 
 
 
335 aa  140  3.9999999999999997e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.252845 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1161  N-acetyl neuramic acid synthetase NeuB  31.71 
 
 
341 aa  139  6e-32  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00670  sialic acid synthase  30.42 
 
 
333 aa  139  8.999999999999999e-32  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13043  sialic acid synthase  33.45 
 
 
338 aa  139  1e-31  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.276449  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2425  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  29.25 
 
 
345 aa  137  2e-31  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.149839  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2213  pseudaminic acid synthase  28.18 
 
 
345 aa  137  3.0000000000000003e-31  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1969  N-acetylneuraminate synthase  30.48 
 
 
364 aa  137  3.0000000000000003e-31  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0891356  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1235  flagellin modification protein PtmC, putative N-acetylneuraminic acid synthetase  29.66 
 
 
334 aa  137  4e-31  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.000000147783  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4086  N-acetylneuraminate synthase  31.73 
 
 
363 aa  135  8e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1196  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  32.77 
 
 
350 aa  135  9.999999999999999e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3318  Sialic acid synthase-like protein  31.95 
 
 
672 aa  135  9.999999999999999e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.785348  normal  0.206825 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2331  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  30.99 
 
 
332 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.206004 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0565  spore coat polysaccharide biosynthesis protein SpsE  30.08 
 
 
342 aa  134  1.9999999999999998e-30  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0423  N-acetylneuraminate synthase  34.96 
 
 
288 aa  134  3e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1580  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  28.61 
 
 
749 aa  133  5e-30  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02907  NeuB:Antifreeze-like protein  28.65 
 
 
347 aa  133  6e-30  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.269494  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0169  N-acetylneuraminic acid synthetase  28 
 
 
344 aa  132  7.999999999999999e-30  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0138828  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0660  N-acetylneuraminate synthase  27.45 
 
 
349 aa  132  9e-30  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.297547  normal  0.963703 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3232  polysialic acid capsule biosynthesis sialic acid synthase NeuB  29.73 
 
 
346 aa  132  9e-30  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2097  neuB protein  27.98 
 
 
352 aa  132  1.0000000000000001e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.268336  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3113  N-acetylneuraminic acid synthase-like protein  29.43 
 
 
359 aa  132  1.0000000000000001e-29  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2590  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  32.42 
 
 
338 aa  130  3e-29  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00139935 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1405  N-acetylneuraminic acid synthase domain protein  32.61 
 
 
290 aa  130  4.0000000000000003e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1556  sialic acid synthase  30.35 
 
 
340 aa  130  4.0000000000000003e-29  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08721  ialic acid synthase  27.3 
 
 
342 aa  130  4.0000000000000003e-29  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.938537  hitchhiker  0.00000164183 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2958  N-acetylneuraminic acid synthase domain-containing protein  32.61 
 
 
286 aa  130  4.0000000000000003e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1534  N-acetylneuraminate synthase  32.81 
 
 
332 aa  129  8.000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3405  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  29.89 
 
 
358 aa  128  2.0000000000000002e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2758  N-acetylneuraminate synthase  30.85 
 
 
348 aa  128  2.0000000000000002e-28  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3980  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  30.17 
 
 
350 aa  128  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2713  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  31.68 
 
 
310 aa  127  4.0000000000000003e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.314547  normal  0.787059 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3256  N-acetylneuraminate synthase  27.27 
 
 
351 aa  126  6e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1512  N-acetylneuraminic acid synthetase  27.45 
 
 
343 aa  125  1e-27  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3208  pseudaminic acid synthase  27.25 
 
 
351 aa  125  1e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1772  N-acetylneuraminate synthase  30.3 
 
 
350 aa  125  1e-27  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1582  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  28.72 
 
 
359 aa  125  1e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.807685  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4269  pseudaminic acid synthase  27.25 
 
 
351 aa  125  1e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.948479 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0010  n-acetylneuraminate synthase  32.44 
 
 
303 aa  124  2e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.124512  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0367  N-acetylneuraminate synthase  29.2 
 
 
360 aa  125  2e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4334  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  27.18 
 
 
356 aa  124  3e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.204017  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1845  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  27.42 
 
 
344 aa  124  4e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0774  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  28.05 
 
 
354 aa  122  7e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.453022  normal  0.512992 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0562  N-acetylneuraminate synthase  28.86 
 
 
333 aa  122  8e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3261  polysaccharide biosynthesis related-protein  31.84 
 
 
290 aa  122  9e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1664  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  27.66 
 
 
344 aa  122  9e-27  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1346  N-acetylneuraminate synthase  32.93 
 
 
289 aa  122  9.999999999999999e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.107531  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1204  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  27.57 
 
 
346 aa  120  3.9999999999999996e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.6921 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1274  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  29.87 
 
 
314 aa  119  7e-26  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0210  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  29.16 
 
 
349 aa  119  7e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.803069  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0797  N-acetylneuraminate synthase  28.94 
 
 
289 aa  118  9.999999999999999e-26  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0346  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  29.57 
 
 
313 aa  119  9.999999999999999e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.417711 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0614  N-acetylneuraminic acid synthase domain protein  30.08 
 
 
332 aa  118  1.9999999999999998e-25  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.984154  normal  0.288463 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4942  N-acetylneuraminate synthase  28.76 
 
 
748 aa  118  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3448  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  29.89 
 
 
749 aa  117  3e-25  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2668  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  29.89 
 
 
749 aa  117  3e-25  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0364  N-acetylneuraminic acid synthase domain-containing protein  26.9 
 
 
358 aa  117  3.9999999999999997e-25  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.431709  normal  0.842753 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07305  N-acetylneuraminic acid phosphate synthase  32.46 
 
 
291 aa  117  3.9999999999999997e-25  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0305  N-acetylneuraminic acid synthase domain-containing protein  29.26 
 
 
347 aa  117  3.9999999999999997e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.351224  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3564  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  27.27 
 
 
343 aa  117  3.9999999999999997e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>