156 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cla_0169 on replicon NC_012039
Organism: Campylobacter lari RM2100



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012039  Cla_0169  N-acetylneuraminic acid synthetase  100 
 
 		 344 aa  706    Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0138828  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1512  N-acetylneuraminic acid synthetase  68.42 
 
 		 343 aa  486  1e-136  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1334  N-acetylneuraminic acid synthetase  70.18 
 
 		 343 aa  461  1e-129  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0397  N-acetylneuraminic acid synthetase  69.01 
 
 		 343 aa  458  9.999999999999999e-129  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.397069  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0565  spore coat polysaccharide biosynthesis protein SpsE  62.28 
 
 		 342 aa  432  1e-120  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2213  pseudaminic acid synthase  58.48 
 
 		 345 aa  417  9.999999999999999e-116  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13043  sialic acid synthase  52.76 
 
 		 338 aa  352  8e-96  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.276449  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2229  N-acetylneuraminate synthase  48.47 
 
 		 350 aa  327  2.0000000000000001e-88  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1289  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  50.15 
 
 		 350 aa  321  9.999999999999999e-87  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1329  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  47.4 
 
 		 358 aa  321  9.999999999999999e-87  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1391  N-acetylneuraminate synthase  48.06 
 
 		 337 aa  315  6e-85  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0754706 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1248  N-acetylneuraminate synthase  43.67 
 
 		 348 aa  310  2e-83  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.862744  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3113  N-acetylneuraminic acid synthase-like protein  47.87 
 
 		 359 aa  308  1.0000000000000001e-82  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1772  N-acetylneuraminate synthase  44.57 
 
 		 350 aa  308  1.0000000000000001e-82  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0774  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  46.06 
 
 		 354 aa  305  6e-82  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.453022  normal  0.512992 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1556  sialic acid synthase  48.66 
 
 		 340 aa  305  1.0000000000000001e-81  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2097  neuB protein  48.31 
 
 		 352 aa  303  2.0000000000000002e-81  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.268336  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0647  antifreeze-like protein  46.01 
 
 		 350 aa  303  2.0000000000000002e-81  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.318568  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3027  pseudaminic acid synthase  44.64 
 
 		 349 aa  303  3.0000000000000004e-81  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2327  N-acetylneuraminate synthase  45.76 
 
 		 350 aa  303  3.0000000000000004e-81  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.463819 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2625  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  45.21 
 
 		 349 aa  295  9e-79  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3208  pseudaminic acid synthase  45.02 
 
 		 351 aa  293  2e-78  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1196  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  46.63 
 
 		 350 aa  290  4e-77  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02907  NeuB:Antifreeze-like protein  44.54 
 
 		 347 aa  289  5.0000000000000004e-77  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.269494  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0660  N-acetylneuraminate synthase  43.67 
 
 		 349 aa  286  2.9999999999999996e-76  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.297547  normal  0.963703 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2425  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  42.39 
 
 		 345 aa  281  1e-74  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.149839  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1304  N-acetylneuraminate synthase  41.69 
 
 		 350 aa  280  3e-74  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.583965  normal  0.823534 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3564  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  45.72 
 
 		 343 aa  280  3e-74  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3076  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  46.18 
 
 		 355 aa  277  2e-73  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3942  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  45.32 
 
 		 349 aa  277  2e-73  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0693356 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2758  N-acetylneuraminate synthase  44.35 
 
 		 348 aa  276  5e-73  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0210  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  44.68 
 
 		 349 aa  273  4.0000000000000004e-72  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.803069  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4303  N-acetylneuraminate synthase  43.08 
 
 		 361 aa  273  5.000000000000001e-72  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1523  N-acetylneuraminate synthase  43.73 
 
 		 350 aa  272  6e-72  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.242955  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1724  pseudaminic acid synthase  46.48 
 
 		 349 aa  271  8.000000000000001e-72  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000954999 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1969  N-acetylneuraminate synthase  43.87 
 
 		 364 aa  271  1e-71  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0891356  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0587  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  42.12 
 
 		 349 aa  267  2e-70  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.518416  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3556  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  43.5 
 
 		 358 aa  266  5e-70  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.434108 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4269  pseudaminic acid synthase  43.07 
 
 		 351 aa  264  2e-69  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.948479 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3098  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  44.41 
 
 		 347 aa  262  6e-69  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.298576  normal  0.187894 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01550  N-acetylneuraminate synthase  40.06 
 
 		 349 aa  260  3e-68  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0492033 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3008  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  43.43 
 
 		 350 aa  255  7e-67  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3707  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  42.9 
 
 		 350 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.170147  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1204  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  40.98 
 
 		 346 aa  253  3e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.6921 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0420  N-acetylneuraminate synthase  38.81 
 
 		 349 aa  224  1e-57  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0643  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  35.63 
 
 		 342 aa  217  2e-55  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0756  N-acetylneuraminate synthase  34.65 
 
 		 337 aa  217  2.9999999999999998e-55  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.556038 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0131  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  36.02 
 
 		 351 aa  207  2e-52  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    unclonable  0.00000000000000538819 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1161  N-acetyl neuramic acid synthetase NeuB  36.04 
 
 		 341 aa  200  3.9999999999999996e-50  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3405  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  35.76 
 
 		 358 aa  197  2.0000000000000003e-49  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0506  N-acetylneuraminate synthase  35.61 
 
 		 348 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0527  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  35.37 
 
 		 335 aa  192  7e-48  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.783884  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16950  N-acetylneuraminate synthase  35 
 
 		 331 aa  190  2.9999999999999997e-47  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1586  N-acetylneuraminate synthase  33.54 
 
 		 347 aa  189  5.999999999999999e-47  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3011  putative sialic acid synthase NeuB  35.38 
 
 		 346 aa  189  7e-47  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.62069  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2641  N-acetylneuraminate synthase  35.49 
 
 		 330 aa  186  5e-46  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0818  N-acetylneuraminic acid condensing enzyme  33.83 
 
 		 340 aa  183  3e-45  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3232  polysialic acid capsule biosynthesis sialic acid synthase NeuB  35.47 
 
 		 346 aa  182  1e-44  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1235  flagellin modification protein PtmC, putative N-acetylneuraminic acid synthetase  36.5 
 
 		 334 aa  181  2e-44  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.000000147783  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1458  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  33.23 
 
 		 334 aa  179  4.999999999999999e-44  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1516  N-acetylneuraminic acid synthetase  34.15 
 
 		 334 aa  179  5.999999999999999e-44  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.350916  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0789  N-acetylneuraminic acid condensing enzyme  33.23 
 
 		 340 aa  178  1e-43  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0385  N-acetylneuraminic acid synthetase  34.78 
 
 		 334 aa  178  1e-43  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0019  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  33.82 
 
 		 350 aa  178  2e-43  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2407  N-acetylneuraminate synthase  31.93 
 
 		 500 aa  176  5e-43  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.378262  normal  0.284066 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2303  general stress protein 14 (GSP14)  33.13 
 
 		 333 aa  176  5e-43  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0412  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  32.05 
 
 		 338 aa  175  9.999999999999999e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.336797 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01101  sialic acid synthase  32.76 
 
 		 335 aa  172  5.999999999999999e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.252845 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1970  polysaccharide biosynthesis protein, putative  32.55 
 
 		 350 aa  172  7.999999999999999e-42  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.237085  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12451  sialic acid synthase  35.88 
 
 		 337 aa  171  2e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0694401  hitchhiker  0.00593947 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0595  N-acetylneuraminate synthase  32.82 
 
 		 333 aa  170  3e-41  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1664  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  32.09 
 
 		 344 aa  170  3e-41  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1456  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  32.73 
 
 		 354 aa  165  9e-40  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00670  sialic acid synthase  30.33 
 
 		 333 aa  164  1.0000000000000001e-39  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3980  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  32.84 
 
 		 350 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0151  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  31.14 
 
 		 349 aa  164  2.0000000000000002e-39  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0364  N-acetylneuraminic acid synthase domain-containing protein  30 
 
 		 358 aa  164  2.0000000000000002e-39  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.431709  normal  0.842753 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3256  N-acetylneuraminate synthase  32.64 
 
 		 351 aa  163  3e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3726  N-acetylneuraminic acid synthase domain  33.13 
 
 		 338 aa  161  1e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1580  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  29.25 
 
 		 749 aa  160  2e-38  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0562  N-acetylneuraminate synthase  31.06 
 
 		 333 aa  160  3e-38  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1582  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  32.02 
 
 		 359 aa  159  7e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.807685  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2590  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  31.52 
 
 		 338 aa  159  8e-38  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00139935 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4942  N-acetylneuraminate synthase  31.63 
 
 		 748 aa  158  2e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14081  sialic acid synthase  31.71 
 
 		 341 aa  157  2e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2977  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  32.34 
 
 		 334 aa  157  2e-37  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3121  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  32.34 
 
 		 334 aa  157  2e-37  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1158  sialic acid synthase  34.12 
 
 		 346 aa  157  3e-37  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  decreased coverage  0.00143382  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001800  N-acetylneuraminate synthase  33.43 
 
 		 357 aa  155  1e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4086  N-acetylneuraminate synthase  33.7 
 
 		 363 aa  153  2.9999999999999998e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0049  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  31.82 
 
 		 357 aa  153  2.9999999999999998e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0367  N-acetylneuraminate synthase  32.12 
 
 		 360 aa  152  7e-36  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08721  ialic acid synthase  32.39 
 
 		 342 aa  151  1e-35  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.938537  hitchhiker  0.00000164183 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0631  N-acetylneuraminate synthase  30.57 
 
 		 359 aa  149  9e-35  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1072  sialic acid synthase  34.75 
 
 		 293 aa  147  3e-34  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1534  N-acetylneuraminate synthase  28.83 
 
 		 332 aa  147  4.0000000000000006e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0254  N-acetylneuraminic acid synthase  30.77 
 
 		 357 aa  146  6e-34  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0169  N-acetylneuraminic acid synthase  30.77 
 
 		 357 aa  146  6e-34  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.922982  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2331  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  30 
 
 		 332 aa  145  7.0000000000000006e-34  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.206004 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1974  N-acetylneuraminate synthase  35.29 
 
 		 305 aa  145  1e-33  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>