153 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_3556 on replicon NC_008687
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008687  Pden_3556  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  100 
 
 		 358 aa  730    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.434108 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3208  pseudaminic acid synthase  62.61 
 
 		 351 aa  453  1.0000000000000001e-126  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1523  N-acetylneuraminate synthase  62.21 
 
 		 350 aa  427  1e-118  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.242955  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3942  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  58.04 
 
 		 349 aa  416  9.999999999999999e-116  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0693356 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0587  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  61.13 
 
 		 349 aa  417  9.999999999999999e-116  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.518416  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3098  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  63.96 
 
 		 347 aa  416  9.999999999999999e-116  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.298576  normal  0.187894 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1724  pseudaminic acid synthase  59.16 
 
 		 349 aa  413  1e-114  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000954999 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0210  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  59.59 
 
 		 349 aa  413  1e-114  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.803069  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3707  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  61.08 
 
 		 350 aa  387  1e-106  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.170147  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3008  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  58.29 
 
 		 350 aa  385  1e-106  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01550  N-acetylneuraminate synthase  57.96 
 
 		 349 aa  383  1e-105  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0492033 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3076  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  56.97 
 
 		 355 aa  379  1e-104  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2625  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  54.73 
 
 		 349 aa  381  1e-104  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0660  N-acetylneuraminate synthase  54.49 
 
 		 349 aa  376  1e-103  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.297547  normal  0.963703 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1248  N-acetylneuraminate synthase  56.97 
 
 		 348 aa  376  1e-103  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.862744  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4269  pseudaminic acid synthase  53.89 
 
 		 351 aa  364  1e-99  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.948479 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0774  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  51.76 
 
 		 354 aa  362  5.0000000000000005e-99  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.453022  normal  0.512992 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2758  N-acetylneuraminate synthase  52.38 
 
 		 348 aa  358  9.999999999999999e-98  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2327  N-acetylneuraminate synthase  53.99 
 
 		 350 aa  357  1.9999999999999998e-97  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.463819 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1772  N-acetylneuraminate synthase  51.51 
 
 		 350 aa  354  1e-96  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2229  N-acetylneuraminate synthase  50.3 
 
 		 350 aa  353  2e-96  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3027  pseudaminic acid synthase  51.8 
 
 		 349 aa  351  1e-95  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1204  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  54.95 
 
 		 346 aa  350  2e-95  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.6921 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4303  N-acetylneuraminate synthase  56.46 
 
 		 361 aa  348  6e-95  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1304  N-acetylneuraminate synthase  50.9 
 
 		 350 aa  347  1e-94  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.583965  normal  0.823534 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2097  neuB protein  51.37 
 
 		 352 aa  347  2e-94  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.268336  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3564  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  53.75 
 
 		 343 aa  347  2e-94  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0647  antifreeze-like protein  54.05 
 
 		 350 aa  345  8.999999999999999e-94  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.318568  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1969  N-acetylneuraminate synthase  54.84 
 
 		 364 aa  338  8e-92  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0891356  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1196  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  54.05 
 
 		 350 aa  336  3.9999999999999995e-91  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1329  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  52.12 
 
 		 358 aa  336  3.9999999999999995e-91  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2213  pseudaminic acid synthase  48.49 
 
 		 345 aa  335  1e-90  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13043  sialic acid synthase  48.21 
 
 		 338 aa  331  1e-89  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.276449  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1391  N-acetylneuraminate synthase  49.55 
 
 		 337 aa  328  7e-89  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0754706 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3113  N-acetylneuraminic acid synthase-like protein  50.6 
 
 		 359 aa  320  1.9999999999999998e-86  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02907  NeuB:Antifreeze-like protein  47.27 
 
 		 347 aa  311  1e-83  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.269494  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1289  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  47.26 
 
 		 350 aa  311  1e-83  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2425  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  47.97 
 
 		 345 aa  310  2.9999999999999997e-83  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.149839  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1556  sialic acid synthase  47.77 
 
 		 340 aa  305  8.000000000000001e-82  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0169  N-acetylneuraminic acid synthetase  43.5 
 
 		 344 aa  286  5e-76  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0138828  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0565  spore coat polysaccharide biosynthesis protein SpsE  46.95 
 
 		 342 aa  278  1e-73  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1512  N-acetylneuraminic acid synthetase  43.24 
 
 		 343 aa  276  5e-73  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0397  N-acetylneuraminic acid synthetase  42.64 
 
 		 343 aa  257  2e-67  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.397069  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0643  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  42.01 
 
 		 342 aa  256  4e-67  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1334  N-acetylneuraminic acid synthetase  43.84 
 
 		 343 aa  255  9e-67  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0756  N-acetylneuraminate synthase  39.71 
 
 		 337 aa  246  4e-64  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.556038 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1586  N-acetylneuraminate synthase  38.64 
 
 		 347 aa  225  1e-57  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1970  polysaccharide biosynthesis protein, putative  37.71 
 
 		 350 aa  219  5e-56  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.237085  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0527  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  38.97 
 
 		 335 aa  217  2.9999999999999998e-55  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.783884  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0412  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  37.43 
 
 		 338 aa  210  3e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.336797 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0420  N-acetylneuraminate synthase  35.05 
 
 		 349 aa  210  3e-53  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2303  general stress protein 14 (GSP14)  35.47 
 
 		 333 aa  208  1e-52  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1516  N-acetylneuraminic acid synthetase  36.14 
 
 		 334 aa  207  2e-52  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.350916  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0562  N-acetylneuraminate synthase  38.17 
 
 		 333 aa  203  4e-51  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0506  N-acetylneuraminate synthase  35.45 
 
 		 348 aa  203  5e-51  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0385  N-acetylneuraminic acid synthetase  35.76 
 
 		 334 aa  202  7e-51  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3726  N-acetylneuraminic acid synthase domain  36.34 
 
 		 338 aa  200  1.9999999999999998e-50  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3980  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  40.65 
 
 		 350 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0595  N-acetylneuraminate synthase  35.47 
 
 		 333 aa  198  1.0000000000000001e-49  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16950  N-acetylneuraminate synthase  34.95 
 
 		 331 aa  197  2.0000000000000003e-49  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00670  sialic acid synthase  35.42 
 
 		 333 aa  195  1e-48  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0019  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  37.03 
 
 		 350 aa  195  1e-48  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2641  N-acetylneuraminate synthase  35.67 
 
 		 330 aa  194  2e-48  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3405  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  36.07 
 
 		 358 aa  190  2.9999999999999997e-47  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2590  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  36.25 
 
 		 338 aa  187  2e-46  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00139935 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12451  sialic acid synthase  34.78 
 
 		 337 aa  187  2e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0694401  hitchhiker  0.00593947 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0818  N-acetylneuraminic acid condensing enzyme  34.9 
 
 		 340 aa  187  3e-46  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1456  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  37.8 
 
 		 354 aa  185  1.0000000000000001e-45  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0789  N-acetylneuraminic acid condensing enzyme  34.9 
 
 		 340 aa  184  2.0000000000000003e-45  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3256  N-acetylneuraminate synthase  35.91 
 
 		 351 aa  183  3e-45  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1534  N-acetylneuraminate synthase  33.92 
 
 		 332 aa  183  4.0000000000000006e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1576  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  37.9 
 
 		 350 aa  183  4.0000000000000006e-45  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0631  N-acetylneuraminate synthase  35 
 
 		 359 aa  183  4.0000000000000006e-45  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1235  flagellin modification protein PtmC, putative N-acetylneuraminic acid synthetase  30.98 
 
 		 334 aa  182  6e-45  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.000000147783  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08721  ialic acid synthase  33.33 
 
 		 342 aa  182  6e-45  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.938537  hitchhiker  0.00000164183 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1845  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  33.92 
 
 		 344 aa  178  1e-43  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1458  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  33.44 
 
 		 334 aa  177  2e-43  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2331  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  35.01 
 
 		 332 aa  177  3e-43  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.206004 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0151  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  35.82 
 
 		 349 aa  177  4e-43  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4334  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  34.22 
 
 		 356 aa  174  1.9999999999999998e-42  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.204017  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2977  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  34.42 
 
 		 334 aa  173  3.9999999999999995e-42  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3121  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  34.42 
 
 		 334 aa  173  3.9999999999999995e-42  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1832  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  34.06 
 
 		 394 aa  172  1e-41  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2369  N-acetylneuraminate synthase  36.63 
 
 		 348 aa  171  1e-41  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0796873  normal  0.0101527 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3232  polysialic acid capsule biosynthesis sialic acid synthase NeuB  32.93 
 
 		 346 aa  171  1e-41  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1161  N-acetyl neuramic acid synthetase NeuB  32.72 
 
 		 341 aa  171  2e-41  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3011  putative sialic acid synthase NeuB  32.76 
 
 		 346 aa  170  3e-41  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.62069  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1890  N-acetylneuraminate synthase  34.57 
 
 		 356 aa  170  4e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.00000120962  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2635  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  32.96 
 
 		 352 aa  168  1e-40  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0131  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  31.38 
 
 		 351 aa  168  2e-40  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    unclonable  0.00000000000000538819 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0254  N-acetylneuraminic acid synthase  34.08 
 
 		 357 aa  167  2.9999999999999998e-40  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0169  N-acetylneuraminic acid synthase  34.08 
 
 		 357 aa  167  2.9999999999999998e-40  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.922982  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4942  N-acetylneuraminate synthase  35.37 
 
 		 748 aa  164  2.0000000000000002e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0364  N-acetylneuraminic acid synthase domain-containing protein  34.2 
 
 		 358 aa  164  2.0000000000000002e-39  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.431709  normal  0.842753 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0662  N-acetylneuraminate synthase  42.05 
 
 		 194 aa  164  3e-39  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.116223  normal  0.934611 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4086  N-acetylneuraminate synthase  35.16 
 
 		 363 aa  163  4.0000000000000004e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1580  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  35.45 
 
 		 749 aa  162  7e-39  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0049  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  33.89 
 
 		 357 aa  162  7e-39  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3318  Sialic acid synthase-like protein  38.08 
 
 		 672 aa  162  1e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.785348  normal  0.206825 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01101  sialic acid synthase  32.94 
 
 		 335 aa  161  2e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.252845 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>