154 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sputcn32_2625 on replicon NC_009438
Organism: Shewanella putrefaciens CN-32



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009438  Sputcn32_2625  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  100 
 
 
349 aa  727    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3208  pseudaminic acid synthase  60.4 
 
 
351 aa  446  1.0000000000000001e-124  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0210  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  59.03 
 
 
349 aa  428  1e-119  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.803069  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1523  N-acetylneuraminate synthase  57.88 
 
 
350 aa  422  1e-117  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.242955  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3942  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  57.88 
 
 
349 aa  419  1e-116  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0693356 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4269  pseudaminic acid synthase  58.17 
 
 
351 aa  416  9.999999999999999e-116  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.948479 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1724  pseudaminic acid synthase  56.16 
 
 
349 aa  411  1e-114  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000954999 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3707  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  58.17 
 
 
350 aa  405  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.170147  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0587  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  56.93 
 
 
349 aa  403  1e-111  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.518416  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3008  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  57.59 
 
 
350 aa  402  1e-111  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3098  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  58.09 
 
 
347 aa  393  1e-108  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.298576  normal  0.187894 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2758  N-acetylneuraminate synthase  55.36 
 
 
348 aa  394  1e-108  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3076  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  58.41 
 
 
355 aa  389  1e-107  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3564  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  58.43 
 
 
343 aa  391  1e-107  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3556  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  54.73 
 
 
358 aa  378  1e-104  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.434108 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1772  N-acetylneuraminate synthase  51.62 
 
 
350 aa  368  1e-101  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0774  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  49.13 
 
 
354 aa  358  8e-98  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.453022  normal  0.512992 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3027  pseudaminic acid synthase  51.18 
 
 
349 aa  348  8e-95  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1329  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  51.61 
 
 
358 aa  345  6e-94  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2327  N-acetylneuraminate synthase  50.73 
 
 
350 aa  342  5.999999999999999e-93  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.463819 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3113  N-acetylneuraminic acid synthase-like protein  51.16 
 
 
359 aa  340  2.9999999999999998e-92  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0660  N-acetylneuraminate synthase  47.13 
 
 
349 aa  338  9e-92  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.297547  normal  0.963703 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13043  sialic acid synthase  50 
 
 
338 aa  337  9.999999999999999e-92  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.276449  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1304  N-acetylneuraminate synthase  47.67 
 
 
350 aa  335  5.999999999999999e-91  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.583965  normal  0.823534 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2097  neuB protein  48.56 
 
 
352 aa  334  1e-90  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.268336  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1248  N-acetylneuraminate synthase  48.98 
 
 
348 aa  332  8e-90  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.862744  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01550  N-acetylneuraminate synthase  47.56 
 
 
349 aa  331  1e-89  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.0492033 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1289  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  47.06 
 
 
350 aa  327  1.0000000000000001e-88  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2229  N-acetylneuraminate synthase  46.53 
 
 
350 aa  328  1.0000000000000001e-88  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2213  pseudaminic acid synthase  46.2 
 
 
345 aa  323  2e-87  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0647  antifreeze-like protein  48.97 
 
 
350 aa  319  3.9999999999999996e-86  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.318568  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1969  N-acetylneuraminate synthase  50.59 
 
 
364 aa  319  3.9999999999999996e-86  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0891356  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1196  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  48.97 
 
 
350 aa  314  1.9999999999999998e-84  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02907  NeuB:Antifreeze-like protein  45.09 
 
 
347 aa  312  3.9999999999999997e-84  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.269494  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1204  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  47.79 
 
 
346 aa  311  1e-83  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.6921 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0169  N-acetylneuraminic acid synthetase  45.21 
 
 
344 aa  309  5e-83  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0138828  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0565  spore coat polysaccharide biosynthesis protein SpsE  47.26 
 
 
342 aa  306  3e-82  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2425  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  46.95 
 
 
345 aa  306  4.0000000000000004e-82  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.149839  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1391  N-acetylneuraminate synthase  46.53 
 
 
337 aa  306  4.0000000000000004e-82  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0754706 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4303  N-acetylneuraminate synthase  48.27 
 
 
361 aa  303  3.0000000000000004e-81  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1512  N-acetylneuraminic acid synthetase  44.48 
 
 
343 aa  297  2e-79  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0397  N-acetylneuraminic acid synthetase  44.78 
 
 
343 aa  278  7e-74  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.397069  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1556  sialic acid synthase  45.76 
 
 
340 aa  278  1e-73  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1334  N-acetylneuraminic acid synthetase  44.18 
 
 
343 aa  274  2.0000000000000002e-72  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0643  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  38.18 
 
 
342 aa  233  3e-60  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1586  N-acetylneuraminate synthase  38.12 
 
 
347 aa  231  1e-59  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0420  N-acetylneuraminate synthase  37.24 
 
 
349 aa  227  2e-58  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0756  N-acetylneuraminate synthase  36.9 
 
 
337 aa  225  9e-58  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.556038 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0506  N-acetylneuraminate synthase  38.73 
 
 
348 aa  220  1.9999999999999999e-56  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3405  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  36.12 
 
 
358 aa  207  2e-52  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4942  N-acetylneuraminate synthase  36.47 
 
 
748 aa  202  8e-51  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2641  N-acetylneuraminate synthase  36.2 
 
 
330 aa  199  7e-50  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3980  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  37.39 
 
 
350 aa  193  3e-48  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16950  N-acetylneuraminate synthase  35.71 
 
 
331 aa  192  5e-48  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0818  N-acetylneuraminic acid condensing enzyme  35.5 
 
 
340 aa  192  8e-48  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0527  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  36.34 
 
 
335 aa  191  2e-47  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.783884  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1580  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  34.6 
 
 
749 aa  191  2e-47  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0789  N-acetylneuraminic acid condensing enzyme  35.61 
 
 
340 aa  189  7e-47  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1970  polysaccharide biosynthesis protein, putative  33.62 
 
 
350 aa  187  3e-46  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.237085  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3726  N-acetylneuraminic acid synthase domain  34.42 
 
 
338 aa  186  4e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2369  N-acetylneuraminate synthase  37.71 
 
 
348 aa  186  6e-46  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0796873  normal  0.0101527 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1516  N-acetylneuraminic acid synthetase  33.85 
 
 
334 aa  184  1.0000000000000001e-45  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.350916  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0412  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  32.93 
 
 
338 aa  181  1e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.336797 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0385  N-acetylneuraminic acid synthetase  33.85 
 
 
334 aa  181  1e-44  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0151  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  32.65 
 
 
349 aa  181  2e-44  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12451  sialic acid synthase  35.6 
 
 
337 aa  179  4.999999999999999e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0694401  hitchhiker  0.00593947 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1235  flagellin modification protein PtmC, putative N-acetylneuraminic acid synthetase  33.94 
 
 
334 aa  178  1e-43  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.000000147783  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3011  putative sialic acid synthase NeuB  33.03 
 
 
346 aa  178  1e-43  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.62069  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0131  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  33.82 
 
 
351 aa  177  2e-43  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    unclonable  0.00000000000000538819 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0662  N-acetylneuraminate synthase  47.4 
 
 
194 aa  176  6e-43  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.116223  normal  0.934611 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1832  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  33.64 
 
 
394 aa  176  6e-43  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3448  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  34.41 
 
 
749 aa  175  9.999999999999999e-43  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2668  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  34.41 
 
 
749 aa  175  9.999999999999999e-43  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2303  general stress protein 14 (GSP14)  33.44 
 
 
333 aa  174  1.9999999999999998e-42  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3232  polysialic acid capsule biosynthesis sialic acid synthase NeuB  33.13 
 
 
346 aa  173  2.9999999999999996e-42  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1161  N-acetyl neuramic acid synthetase NeuB  33.64 
 
 
341 aa  173  3.9999999999999995e-42  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1456  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  33.72 
 
 
354 aa  172  5e-42  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2331  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  34.76 
 
 
332 aa  171  2e-41  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.206004 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0019  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  32.46 
 
 
350 aa  171  2e-41  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3256  N-acetylneuraminate synthase  33.82 
 
 
351 aa  170  3e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2977  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  34.35 
 
 
334 aa  170  3e-41  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3121  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  34.35 
 
 
334 aa  170  3e-41  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00670  sialic acid synthase  33.13 
 
 
333 aa  169  9e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0364  N-acetylneuraminic acid synthase domain-containing protein  32.62 
 
 
358 aa  168  1e-40  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.431709  normal  0.842753 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4334  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  31.79 
 
 
356 aa  168  2e-40  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.204017  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0562  N-acetylneuraminate synthase  35.17 
 
 
333 aa  167  2e-40  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08721  ialic acid synthase  30.65 
 
 
342 aa  167  2e-40  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.938537  hitchhiker  0.00000164183 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1845  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  32.74 
 
 
344 aa  165  8e-40  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0595  N-acetylneuraminate synthase  32.21 
 
 
333 aa  166  8e-40  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1576  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  34.72 
 
 
350 aa  165  9e-40  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0843  N-acetylneuraminate synthase  37.74 
 
 
296 aa  164  2.0000000000000002e-39  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0049  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  31.73 
 
 
357 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0010  n-acetylneuraminate synthase  34.72 
 
 
303 aa  164  3e-39  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.124512  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01101  sialic acid synthase  33.93 
 
 
335 aa  161  2e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.252845 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3318  Sialic acid synthase-like protein  34.93 
 
 
672 aa  160  3e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.785348  normal  0.206825 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1974  N-acetylneuraminate synthase  38.52 
 
 
305 aa  160  4e-38  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2635  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  32.34 
 
 
352 aa  159  7e-38  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1894  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  32.05 
 
 
354 aa  158  1e-37  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2590  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  31.4 
 
 
338 aa  158  1e-37  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00139935 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001800  N-acetylneuraminate synthase  31.44 
 
 
357 aa  159  1e-37  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>