149 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyc_0662 on replicon NC_007204
Organism: Psychrobacter arcticus 273-4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007204  Psyc_0662  N-acetylneuraminate synthase  100 
 
 		 194 aa  400  1e-111  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.116223  normal  0.934611 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2327  N-acetylneuraminate synthase  78.53 
 
 		 350 aa  299  2e-80  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.463819 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3027  pseudaminic acid synthase  70.18 
 
 		 349 aa  267  8.999999999999999e-71  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2097  neuB protein  63.84 
 
 		 352 aa  247  9e-65  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.268336  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1304  N-acetylneuraminate synthase  62.15 
 
 		 350 aa  243  9.999999999999999e-64  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.583965  normal  0.823534 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0660  N-acetylneuraminate synthase  54.34 
 
 		 349 aa  213  1.9999999999999998e-54  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.297547  normal  0.963703 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1248  N-acetylneuraminate synthase  46.33 
 
 		 348 aa  186  2e-46  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.862744  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0587  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  47.51 
 
 		 349 aa  186  2e-46  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.518416  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0210  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  49.71 
 
 		 349 aa  183  1.0000000000000001e-45  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.803069  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0647  antifreeze-like protein  46.89 
 
 		 350 aa  182  2.0000000000000003e-45  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.318568  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3942  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  45.51 
 
 		 349 aa  181  6e-45  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0693356 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1196  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  47.46 
 
 		 350 aa  181  7e-45  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3208  pseudaminic acid synthase  43.96 
 
 		 351 aa  179  2e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0774  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  46.33 
 
 		 354 aa  178  4e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.453022  normal  0.512992 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1969  N-acetylneuraminate synthase  46.15 
 
 		 364 aa  176  2e-43  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0891356  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2625  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  47.4 
 
 		 349 aa  176  2e-43  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1329  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  46.74 
 
 		 358 aa  174  9.999999999999999e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3113  N-acetylneuraminic acid synthase-like protein  45.6 
 
 		 359 aa  172  1.9999999999999998e-42  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1772  N-acetylneuraminate synthase  45.76 
 
 		 350 aa  172  2.9999999999999996e-42  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02907  NeuB:Antifreeze-like protein  44.94 
 
 		 347 aa  169  3e-41  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.269494  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1523  N-acetylneuraminate synthase  42.37 
 
 		 350 aa  167  1e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.242955  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3707  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  45.05 
 
 		 350 aa  167  1e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.170147  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01550  N-acetylneuraminate synthase  44.2 
 
 		 349 aa  166  2e-40  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0492033 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4303  N-acetylneuraminate synthase  52.9 
 
 		 361 aa  166  2e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3008  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  46.33 
 
 		 350 aa  165  2.9999999999999998e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3076  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  44.25 
 
 		 355 aa  165  5e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1724  pseudaminic acid synthase  44.07 
 
 		 349 aa  164  6.9999999999999995e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000954999 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3556  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  42.05 
 
 		 358 aa  164  8e-40  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.434108 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2758  N-acetylneuraminate synthase  45.9 
 
 		 348 aa  161  6e-39  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3098  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  43.5 
 
 		 347 aa  156  2e-37  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.298576  normal  0.187894 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13043  sialic acid synthase  42.31 
 
 		 338 aa  156  2e-37  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.276449  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1556  sialic acid synthase  46.78 
 
 		 340 aa  154  6e-37  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2213  pseudaminic acid synthase  46.15 
 
 		 345 aa  154  9e-37  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2425  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  45.28 
 
 		 345 aa  152  2.9999999999999998e-36  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.149839  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1289  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  43.86 
 
 		 350 aa  149  2e-35  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0565  spore coat polysaccharide biosynthesis protein SpsE  40.12 
 
 		 342 aa  149  2e-35  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2229  N-acetylneuraminate synthase  38.1 
 
 		 350 aa  147  8e-35  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3564  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  46.02 
 
 		 343 aa  147  1.0000000000000001e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1204  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  44.25 
 
 		 346 aa  140  8e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.6921 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4269  pseudaminic acid synthase  40.66 
 
 		 351 aa  140  9.999999999999999e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.948479 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0397  N-acetylneuraminic acid synthetase  43.21 
 
 		 343 aa  135  4e-31  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.397069  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12451  sialic acid synthase  45.62 
 
 		 337 aa  133  9.999999999999999e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0694401  hitchhiker  0.00593947 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1586  N-acetylneuraminate synthase  39.11 
 
 		 347 aa  130  1.0000000000000001e-29  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1512  N-acetylneuraminic acid synthetase  41.98 
 
 		 343 aa  129  4.0000000000000003e-29  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1516  N-acetylneuraminic acid synthetase  36.11 
 
 		 334 aa  127  8.000000000000001e-29  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.350916  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0643  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  37.91 
 
 		 342 aa  127  8.000000000000001e-29  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1334  N-acetylneuraminic acid synthetase  41.36 
 
 		 343 aa  126  2.0000000000000002e-28  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0420  N-acetylneuraminate synthase  39.08 
 
 		 349 aa  123  1e-27  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0385  N-acetylneuraminic acid synthetase  35.96 
 
 		 334 aa  124  1e-27  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2641  N-acetylneuraminate synthase  37.23 
 
 		 330 aa  123  2e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1235  flagellin modification protein PtmC, putative N-acetylneuraminic acid synthetase  37.95 
 
 		 334 aa  122  4e-27  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.000000147783  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0527  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  38.82 
 
 		 335 aa  121  5e-27  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.783884  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2303  general stress protein 14 (GSP14)  39.53 
 
 		 333 aa  120  9.999999999999999e-27  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1391  N-acetylneuraminate synthase  37.25 
 
 		 337 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0754706 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0169  N-acetylneuraminic acid synthetase  37.2 
 
 		 344 aa  119  3e-26  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0138828  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0506  N-acetylneuraminate synthase  40.88 
 
 		 348 aa  118  3.9999999999999996e-26  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14081  sialic acid synthase  37.5 
 
 		 341 aa  118  4.9999999999999996e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3405  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  36.26 
 
 		 358 aa  118  4.9999999999999996e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16950  N-acetylneuraminate synthase  36.78 
 
 		 331 aa  118  6e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0756  N-acetylneuraminate synthase  36.53 
 
 		 337 aa  116  1.9999999999999998e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.556038 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0169  N-acetylneuraminic acid synthase  39.29 
 
 		 357 aa  115  5e-25  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.922982  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0254  N-acetylneuraminic acid synthase  39.29 
 
 		 357 aa  115  5e-25  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2977  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  40.74 
 
 		 334 aa  115  5e-25  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3121  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  40.74 
 
 		 334 aa  115  5e-25  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3011  putative sialic acid synthase NeuB  39.29 
 
 		 346 aa  114  1.0000000000000001e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.62069  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0631  N-acetylneuraminate synthase  38.41 
 
 		 359 aa  114  1.0000000000000001e-24  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0049  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  40.91 
 
 		 357 aa  112  3e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0131  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  36.07 
 
 		 351 aa  112  3e-24  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    unclonable  0.00000000000000538819 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2331  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  40.61 
 
 		 332 aa  111  7.000000000000001e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.206004 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001800  N-acetylneuraminate synthase  42 
 
 		 357 aa  110  9e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3726  N-acetylneuraminic acid synthase domain  34.83 
 
 		 338 aa  109  2.0000000000000002e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4086  N-acetylneuraminate synthase  38.71 
 
 		 363 aa  109  2.0000000000000002e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00670  sialic acid synthase  37.04 
 
 		 333 aa  109  2.0000000000000002e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1970  polysaccharide biosynthesis protein, putative  32.78 
 
 		 350 aa  109  3e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.237085  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3980  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  38.12 
 
 		 350 aa  108  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1582  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  37.5 
 
 		 359 aa  108  4.0000000000000004e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.807685  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1456  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  40.62 
 
 		 354 aa  108  5e-23  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1161  N-acetyl neuramic acid synthetase NeuB  32.61 
 
 		 341 aa  107  8.000000000000001e-23  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0562  N-acetylneuraminate synthase  35.54 
 
 		 333 aa  107  1e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3232  polysialic acid capsule biosynthesis sialic acid synthase NeuB  37.74 
 
 		 346 aa  107  1e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0367  N-acetylneuraminate synthase  35.5 
 
 		 360 aa  105  4e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0595  N-acetylneuraminate synthase  34.3 
 
 		 333 aa  104  6e-22  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0019  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  37.82 
 
 		 350 aa  104  8e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3256  N-acetylneuraminate synthase  36.31 
 
 		 351 aa  103  2e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1580  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  35.16 
 
 		 749 aa  103  2e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0818  N-acetylneuraminic acid condensing enzyme  31.03 
 
 		 340 aa  101  8e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0412  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  35.59 
 
 		 338 aa  100  9e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.336797 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0789  N-acetylneuraminic acid condensing enzyme  31.03 
 
 		 340 aa  100  2e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1832  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  34.32 
 
 		 394 aa  99  3e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08721  ialic acid synthase  35.26 
 
 		 342 aa  99.8  3e-20  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.938537  hitchhiker  0.00000164183 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2407  N-acetylneuraminate synthase  32.58 
 
 		 500 aa  99  4e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.378262  normal  0.284066 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0960  neuB family protein  32.82 
 
 		 379 aa  98.2  6e-20  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2369  N-acetylneuraminate synthase  35.15 
 
 		 348 aa  97.8  9e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0796873  normal  0.0101527 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01101  sialic acid synthase  33.97 
 
 		 335 aa  97.8  9e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.252845 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1458  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  32.4 
 
 		 334 aa  97.1  1e-19  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4853  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  33.33 
 
 		 352 aa  97.4  1e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.31192  normal  0.276031 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1845  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  35.06 
 
 		 344 aa  96.7  2e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14241  sialic acid synthase  34.52 
 
 		 356 aa  96.7  2e-19  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.532641  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0151  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  33.13 
 
 		 349 aa  95.9  3e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3100  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  36.55 
 
 		 357 aa  96.3  3e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>