154 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_3076 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008228  Patl_3076  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  100 
 
 
355 aa  736    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1523  N-acetylneuraminate synthase  61.78 
 
 
350 aa  445  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.242955  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3208  pseudaminic acid synthase  58.02 
 
 
351 aa  436  1e-121  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1724  pseudaminic acid synthase  59.71 
 
 
349 aa  432  1e-120  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000954999 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0587  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  58.43 
 
 
349 aa  423  1e-117  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.518416  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0210  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  57.82 
 
 
349 aa  412  1e-114  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.803069  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3942  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  56.56 
 
 
349 aa  409  1e-113  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0693356 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3707  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  59.82 
 
 
350 aa  405  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.170147  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3008  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  59.77 
 
 
350 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3098  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  57.77 
 
 
347 aa  401  1e-111  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.298576  normal  0.187894 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2625  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  58.41 
 
 
349 aa  396  1e-109  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3556  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  56.97 
 
 
358 aa  382  1e-105  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.434108 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2758  N-acetylneuraminate synthase  53.62 
 
 
348 aa  377  1e-103  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3564  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  58.18 
 
 
343 aa  375  1e-103  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01550  N-acetylneuraminate synthase  51.88 
 
 
349 aa  371  1e-101  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.0492033 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4269  pseudaminic acid synthase  53.18 
 
 
351 aa  366  1e-100  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.948479 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1196  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  55.52 
 
 
350 aa  359  5e-98  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0647  antifreeze-like protein  53.78 
 
 
350 aa  358  8e-98  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.318568  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1772  N-acetylneuraminate synthase  50 
 
 
350 aa  356  2.9999999999999997e-97  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2327  N-acetylneuraminate synthase  49.71 
 
 
350 aa  352  5e-96  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.463819 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2229  N-acetylneuraminate synthase  49.42 
 
 
350 aa  352  5.9999999999999994e-96  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2097  neuB protein  48.7 
 
 
352 aa  348  7e-95  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.268336  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1248  N-acetylneuraminate synthase  49.27 
 
 
348 aa  347  1e-94  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.862744  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3027  pseudaminic acid synthase  47.84 
 
 
349 aa  343  2e-93  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1204  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  49.85 
 
 
346 aa  344  2e-93  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.6921 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0774  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  48.4 
 
 
354 aa  343  2e-93  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.453022  normal  0.512992 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0660  N-acetylneuraminate synthase  46.96 
 
 
349 aa  341  9e-93  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.297547  normal  0.963703 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1969  N-acetylneuraminate synthase  50.29 
 
 
364 aa  336  3.9999999999999995e-91  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0891356  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1329  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  48.84 
 
 
358 aa  332  8e-90  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1304  N-acetylneuraminate synthase  47.38 
 
 
350 aa  330  3e-89  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.583965  normal  0.823534 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4303  N-acetylneuraminate synthase  51.16 
 
 
361 aa  329  4e-89  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13043  sialic acid synthase  49.09 
 
 
338 aa  328  7e-89  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.276449  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2213  pseudaminic acid synthase  48.63 
 
 
345 aa  325  7e-88  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3113  N-acetylneuraminic acid synthase-like protein  47.56 
 
 
359 aa  312  4.999999999999999e-84  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02907  NeuB:Antifreeze-like protein  44.84 
 
 
347 aa  312  6.999999999999999e-84  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.269494  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1391  N-acetylneuraminate synthase  47.42 
 
 
337 aa  311  1e-83  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0754706 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1289  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  46.75 
 
 
350 aa  308  6.999999999999999e-83  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2425  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  48.01 
 
 
345 aa  308  1.0000000000000001e-82  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.149839  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0565  spore coat polysaccharide biosynthesis protein SpsE  49.07 
 
 
342 aa  296  3e-79  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0169  N-acetylneuraminic acid synthetase  46.18 
 
 
344 aa  293  3e-78  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0138828  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1512  N-acetylneuraminic acid synthetase  46.48 
 
 
343 aa  289  5.0000000000000004e-77  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1556  sialic acid synthase  45.1 
 
 
340 aa  289  5.0000000000000004e-77  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0397  N-acetylneuraminic acid synthetase  45.57 
 
 
343 aa  267  2e-70  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.397069  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1334  N-acetylneuraminic acid synthetase  45.95 
 
 
343 aa  266  2.9999999999999995e-70  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0643  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  40.48 
 
 
342 aa  236  5.0000000000000005e-61  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0756  N-acetylneuraminate synthase  38.32 
 
 
337 aa  233  4.0000000000000004e-60  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.556038 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1586  N-acetylneuraminate synthase  39 
 
 
347 aa  230  3e-59  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16950  N-acetylneuraminate synthase  39.08 
 
 
331 aa  228  1e-58  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0506  N-acetylneuraminate synthase  38.55 
 
 
348 aa  223  4e-57  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1516  N-acetylneuraminic acid synthetase  39.51 
 
 
334 aa  221  9.999999999999999e-57  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.350916  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0385  N-acetylneuraminic acid synthetase  38.27 
 
 
334 aa  217  2e-55  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0420  N-acetylneuraminate synthase  36.2 
 
 
349 aa  217  2.9999999999999998e-55  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0527  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  38.04 
 
 
335 aa  213  3.9999999999999995e-54  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.783884  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12451  sialic acid synthase  37.92 
 
 
337 aa  213  3.9999999999999995e-54  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0694401  hitchhiker  0.00593947 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1970  polysaccharide biosynthesis protein, putative  34.47 
 
 
350 aa  211  2e-53  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.237085  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2641  N-acetylneuraminate synthase  36.65 
 
 
330 aa  211  2e-53  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1235  flagellin modification protein PtmC, putative N-acetylneuraminic acid synthetase  37.31 
 
 
334 aa  209  5e-53  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.000000147783  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2303  general stress protein 14 (GSP14)  36.11 
 
 
333 aa  207  2e-52  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3256  N-acetylneuraminate synthase  36.96 
 
 
351 aa  206  6e-52  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3980  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  36.42 
 
 
350 aa  198  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0631  N-acetylneuraminate synthase  37.18 
 
 
359 aa  198  1.0000000000000001e-49  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0818  N-acetylneuraminic acid condensing enzyme  35.5 
 
 
340 aa  197  2.0000000000000003e-49  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1845  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  34.97 
 
 
344 aa  196  4.0000000000000005e-49  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3405  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  36.45 
 
 
358 aa  196  6e-49  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3011  putative sialic acid synthase NeuB  35.87 
 
 
346 aa  194  2e-48  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.62069  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0151  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  34.99 
 
 
349 aa  194  2e-48  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0789  N-acetylneuraminic acid condensing enzyme  35.1 
 
 
340 aa  193  4e-48  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0562  N-acetylneuraminate synthase  37.15 
 
 
333 aa  192  8e-48  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08721  ialic acid synthase  34.58 
 
 
342 aa  191  1e-47  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.938537  hitchhiker  0.00000164183 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0019  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  34.8 
 
 
350 aa  191  1e-47  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2369  N-acetylneuraminate synthase  35.55 
 
 
348 aa  191  2e-47  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0796873  normal  0.0101527 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1161  N-acetyl neuramic acid synthetase NeuB  35.29 
 
 
341 aa  190  2.9999999999999997e-47  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1580  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  34.83 
 
 
749 aa  189  5e-47  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0595  N-acetylneuraminate synthase  34.98 
 
 
333 aa  187  2e-46  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3232  polysialic acid capsule biosynthesis sialic acid synthase NeuB  34.55 
 
 
346 aa  186  5e-46  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4334  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  33.52 
 
 
356 aa  186  6e-46  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.204017  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0412  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  34.43 
 
 
338 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.336797 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0049  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  34.92 
 
 
357 aa  182  8.000000000000001e-45  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001800  N-acetylneuraminate synthase  35.55 
 
 
357 aa  181  2.9999999999999997e-44  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2331  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  34.94 
 
 
332 aa  180  4e-44  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.206004 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2590  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  32.83 
 
 
338 aa  179  5.999999999999999e-44  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00139935 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4086  N-acetylneuraminate synthase  36.36 
 
 
363 aa  179  9e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0254  N-acetylneuraminic acid synthase  34.55 
 
 
357 aa  177  3e-43  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1456  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  34.76 
 
 
354 aa  177  3e-43  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0169  N-acetylneuraminic acid synthase  34.55 
 
 
357 aa  177  3e-43  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.922982  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3726  N-acetylneuraminic acid synthase domain  33.33 
 
 
338 aa  175  9.999999999999999e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2977  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  35.15 
 
 
334 aa  175  9.999999999999999e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3121  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  35.15 
 
 
334 aa  175  9.999999999999999e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1832  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  30.84 
 
 
394 aa  173  2.9999999999999996e-42  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0131  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  32.46 
 
 
351 aa  174  2.9999999999999996e-42  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    unclonable  0.00000000000000538819 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4942  N-acetylneuraminate synthase  32.29 
 
 
748 aa  173  3.9999999999999995e-42  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01101  sialic acid synthase  32.27 
 
 
335 aa  172  5.999999999999999e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.252845 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0010  n-acetylneuraminate synthase  34.33 
 
 
303 aa  171  2e-41  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.124512  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0797  N-acetylneuraminate synthase  36.99 
 
 
289 aa  171  2e-41  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00670  sialic acid synthase  33.74 
 
 
333 aa  170  3e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1534  N-acetylneuraminate synthase  32.19 
 
 
332 aa  168  1e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1582  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  33.33 
 
 
359 aa  168  1e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.807685  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1274  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  34.81 
 
 
314 aa  167  2e-40  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1576  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  36.5 
 
 
350 aa  168  2e-40  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3100  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  31.92 
 
 
357 aa  166  4e-40  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>