153 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_02907 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011138  MADE_02907  NeuB:Antifreeze-like protein  100 
 
 		 347 aa  724    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.269494  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1248  N-acetylneuraminate synthase  53.41 
 
 		 348 aa  390  1e-107  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.862744  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2327  N-acetylneuraminate synthase  51.31 
 
 		 350 aa  373  1e-102  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.463819 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0660  N-acetylneuraminate synthase  51.19 
 
 		 349 aa  368  1e-101  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.297547  normal  0.963703 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1304  N-acetylneuraminate synthase  50.75 
 
 		 350 aa  364  1e-99  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.583965  normal  0.823534 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2097  neuB protein  50 
 
 		 352 aa  362  7.0000000000000005e-99  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.268336  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3027  pseudaminic acid synthase  50.75 
 
 		 349 aa  359  4e-98  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0647  antifreeze-like protein  49.85 
 
 		 350 aa  353  2e-96  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.318568  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1329  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  49.42 
 
 		 358 aa  345  5e-94  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1969  N-acetylneuraminate synthase  49.85 
 
 		 364 aa  343  2e-93  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0891356  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3208  pseudaminic acid synthase  47.37 
 
 		 351 aa  343  2.9999999999999997e-93  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1196  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  49.26 
 
 		 350 aa  342  5e-93  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2229  N-acetylneuraminate synthase  48.21 
 
 		 350 aa  331  1e-89  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3008  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  50.3 
 
 		 350 aa  326  3e-88  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2213  pseudaminic acid synthase  47.51 
 
 		 345 aa  325  8.000000000000001e-88  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0210  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  47.73 
 
 		 349 aa  323  2e-87  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.803069  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4303  N-acetylneuraminate synthase  47.83 
 
 		 361 aa  323  3e-87  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0587  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  47.43 
 
 		 349 aa  322  7e-87  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.518416  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13043  sialic acid synthase  47.09 
 
 		 338 aa  321  9.999999999999999e-87  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.276449  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1523  N-acetylneuraminate synthase  47.04 
 
 		 350 aa  321  9.999999999999999e-87  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.242955  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1204  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  46.78 
 
 		 346 aa  320  3e-86  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.6921 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0774  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  46.59 
 
 		 354 aa  317  2e-85  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.453022  normal  0.512992 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3113  N-acetylneuraminic acid synthase-like protein  47.45 
 
 		 359 aa  313  2.9999999999999996e-84  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01550  N-acetylneuraminate synthase  45.91 
 
 		 349 aa  311  2e-83  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0492033 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1289  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  45.95 
 
 		 350 aa  310  2.9999999999999997e-83  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4269  pseudaminic acid synthase  45.24 
 
 		 351 aa  309  5e-83  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.948479 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0565  spore coat polysaccharide biosynthesis protein SpsE  45.64 
 
 		 342 aa  308  1.0000000000000001e-82  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1772  N-acetylneuraminate synthase  45.19 
 
 		 350 aa  308  1.0000000000000001e-82  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3098  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  45.91 
 
 		 347 aa  306  3e-82  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.298576  normal  0.187894 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2758  N-acetylneuraminate synthase  44.22 
 
 		 348 aa  305  6e-82  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3564  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  47.56 
 
 		 343 aa  303  3.0000000000000004e-81  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1512  N-acetylneuraminic acid synthetase  44.14 
 
 		 343 aa  302  7.000000000000001e-81  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3942  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  44.02 
 
 		 349 aa  300  2e-80  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0693356 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2625  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  45.09 
 
 		 349 aa  300  3e-80  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3707  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  45.43 
 
 		 350 aa  300  3e-80  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.170147  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3556  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  46.71 
 
 		 358 aa  297  2e-79  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.434108 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1724  pseudaminic acid synthase  44.12 
 
 		 349 aa  294  2e-78  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000954999 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3076  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  44.84 
 
 		 355 aa  293  2e-78  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0169  N-acetylneuraminic acid synthetase  44.54 
 
 		 344 aa  289  5.0000000000000004e-77  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0138828  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0397  N-acetylneuraminic acid synthetase  44.14 
 
 		 343 aa  288  1e-76  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.397069  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1556  sialic acid synthase  43.2 
 
 		 340 aa  282  5.000000000000001e-75  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1334  N-acetylneuraminic acid synthetase  43.24 
 
 		 343 aa  278  9e-74  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2425  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  41.28 
 
 		 345 aa  278  1e-73  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.149839  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1391  N-acetylneuraminate synthase  38.99 
 
 		 337 aa  265  1e-69  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0754706 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0420  N-acetylneuraminate synthase  36.71 
 
 		 349 aa  224  2e-57  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1586  N-acetylneuraminate synthase  37.98 
 
 		 347 aa  216  4e-55  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0643  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  36.97 
 
 		 342 aa  211  1e-53  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1970  polysaccharide biosynthesis protein, putative  35.92 
 
 		 350 aa  210  3e-53  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.237085  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0506  N-acetylneuraminate synthase  37.78 
 
 		 348 aa  210  3e-53  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0756  N-acetylneuraminate synthase  33.94 
 
 		 337 aa  201  1.9999999999999998e-50  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.556038 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1516  N-acetylneuraminic acid synthetase  35.54 
 
 		 334 aa  197  2.0000000000000003e-49  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.350916  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0412  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  36.7 
 
 		 338 aa  195  8.000000000000001e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.336797 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0818  N-acetylneuraminic acid condensing enzyme  35.47 
 
 		 340 aa  195  8.000000000000001e-49  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3980  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  35.84 
 
 		 350 aa  194  1e-48  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0527  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  35.33 
 
 		 335 aa  193  3e-48  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.783884  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0385  N-acetylneuraminic acid synthetase  34.74 
 
 		 334 aa  193  3e-48  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0789  N-acetylneuraminic acid condensing enzyme  35.47 
 
 		 340 aa  193  4e-48  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1456  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  35.73 
 
 		 354 aa  192  6e-48  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2303  general stress protein 14 (GSP14)  35.14 
 
 		 333 aa  190  2.9999999999999997e-47  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2369  N-acetylneuraminate synthase  32.87 
 
 		 348 aa  188  1e-46  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0796873  normal  0.0101527 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2641  N-acetylneuraminate synthase  32.42 
 
 		 330 aa  188  1e-46  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3405  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  32.27 
 
 		 358 aa  187  2e-46  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0151  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  32.95 
 
 		 349 aa  186  5e-46  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16950  N-acetylneuraminate synthase  32.62 
 
 		 331 aa  185  9e-46  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1235  flagellin modification protein PtmC, putative N-acetylneuraminic acid synthetase  34.53 
 
 		 334 aa  184  1.0000000000000001e-45  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.000000147783  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1161  N-acetyl neuramic acid synthetase NeuB  34.25 
 
 		 341 aa  184  2.0000000000000003e-45  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3726  N-acetylneuraminic acid synthase domain  34.66 
 
 		 338 aa  182  6e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0131  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  33.63 
 
 		 351 aa  180  4e-44  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    unclonable  0.00000000000000538819 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0595  N-acetylneuraminate synthase  33.84 
 
 		 333 aa  179  9e-44  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08721  ialic acid synthase  34.01 
 
 		 342 aa  176  4e-43  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.938537  hitchhiker  0.00000164183 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3232  polysialic acid capsule biosynthesis sialic acid synthase NeuB  33.83 
 
 		 346 aa  172  5e-42  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4334  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  33.63 
 
 		 356 aa  172  7.999999999999999e-42  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.204017  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12451  sialic acid synthase  36.09 
 
 		 337 aa  171  2e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0694401  hitchhiker  0.00593947 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3011  putative sialic acid synthase NeuB  33.54 
 
 		 346 aa  169  5e-41  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.62069  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0662  N-acetylneuraminate synthase  44.94 
 
 		 194 aa  169  9e-41  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.116223  normal  0.934611 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0364  N-acetylneuraminic acid synthase domain-containing protein  31.6 
 
 		 358 aa  167  2.9999999999999998e-40  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.431709  normal  0.842753 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0562  N-acetylneuraminate synthase  31.46 
 
 		 333 aa  165  1.0000000000000001e-39  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00670  sialic acid synthase  31.83 
 
 		 333 aa  164  3e-39  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2407  N-acetylneuraminate synthase  31.01 
 
 		 500 aa  163  5.0000000000000005e-39  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.378262  normal  0.284066 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1576  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  32.84 
 
 		 350 aa  159  5e-38  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1458  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  30.49 
 
 		 334 aa  158  2e-37  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1534  N-acetylneuraminate synthase  31.46 
 
 		 332 aa  157  2e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1580  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  30.88 
 
 		 749 aa  157  2e-37  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1158  sialic acid synthase  31.36 
 
 		 346 aa  158  2e-37  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  decreased coverage  0.00143382  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14081  sialic acid synthase  30.61 
 
 		 341 aa  158  2e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2590  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  32.33 
 
 		 338 aa  157  3e-37  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00139935 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3318  Sialic acid synthase-like protein  33.79 
 
 		 672 aa  157  4e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.785348  normal  0.206825 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2977  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  29.82 
 
 		 334 aa  156  6e-37  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3121  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  29.82 
 
 		 334 aa  156  6e-37  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1974  N-acetylneuraminate synthase  36.09 
 
 		 305 aa  155  9e-37  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0019  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  30.61 
 
 		 350 aa  154  2e-36  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4853  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  30.61 
 
 		 352 aa  153  4e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.31192  normal  0.276031 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1845  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  30.49 
 
 		 344 aa  152  8.999999999999999e-36  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4086  N-acetylneuraminate synthase  30.23 
 
 		 363 aa  152  8.999999999999999e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0797  N-acetylneuraminate synthase  32.27 
 
 		 289 aa  149  5e-35  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2331  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  29.64 
 
 		 332 aa  149  5e-35  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.206004 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3256  N-acetylneuraminate synthase  31.12 
 
 		 351 aa  149  8e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0010  n-acetylneuraminate synthase  35.11 
 
 		 303 aa  149  1.0000000000000001e-34  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.124512  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1832  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  29.56 
 
 		 394 aa  148  1.0000000000000001e-34  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1664  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  28.07 
 
 		 344 aa  148  1.0000000000000001e-34  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>