153 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pecwa_3027 on replicon NC_013421
Organism: Pectobacterium wasabiae WPP163



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013421  Pecwa_3027  pseudaminic acid synthase  100 
 
 
349 aa  729    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2327  N-acetylneuraminate synthase  74.85 
 
 
350 aa  538  9.999999999999999e-153  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.463819 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2097  neuB protein  69.7 
 
 
352 aa  490  1e-137  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.268336  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1304  N-acetylneuraminate synthase  63.48 
 
 
350 aa  475  1e-133  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.583965  normal  0.823534 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1248  N-acetylneuraminate synthase  57.19 
 
 
348 aa  412  1e-114  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.862744  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0660  N-acetylneuraminate synthase  55.2 
 
 
349 aa  410  1e-113  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.297547  normal  0.963703 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0647  antifreeze-like protein  56.52 
 
 
350 aa  392  1e-108  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.318568  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1196  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  55.81 
 
 
350 aa  381  1e-104  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1329  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  55.82 
 
 
358 aa  380  1e-104  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1969  N-acetylneuraminate synthase  56.89 
 
 
364 aa  378  1e-103  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0891356  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3208  pseudaminic acid synthase  51.18 
 
 
351 aa  369  1e-101  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3113  N-acetylneuraminic acid synthase-like protein  53.29 
 
 
359 aa  361  1e-98  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1772  N-acetylneuraminate synthase  50 
 
 
350 aa  360  2e-98  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02907  NeuB:Antifreeze-like protein  50.75 
 
 
347 aa  359  4e-98  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.269494  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1523  N-acetylneuraminate synthase  50.86 
 
 
350 aa  359  4e-98  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.242955  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0587  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  50.6 
 
 
349 aa  358  7e-98  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.518416  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3942  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  50.14 
 
 
349 aa  358  9.999999999999999e-98  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0693356 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4303  N-acetylneuraminate synthase  55.66 
 
 
361 aa  356  2.9999999999999997e-97  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01550  N-acetylneuraminate synthase  51.04 
 
 
349 aa  353  2.9999999999999997e-96  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.0492033 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0774  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  50.72 
 
 
354 aa  352  5e-96  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.453022  normal  0.512992 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0210  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  53.29 
 
 
349 aa  350  2e-95  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.803069  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1289  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  51.64 
 
 
350 aa  350  3e-95  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3008  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  51.71 
 
 
350 aa  346  4e-94  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3098  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  50.58 
 
 
347 aa  345  6e-94  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.298576  normal  0.187894 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13043  sialic acid synthase  50.45 
 
 
338 aa  342  5.999999999999999e-93  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.276449  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1204  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  52.6 
 
 
346 aa  342  5.999999999999999e-93  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.6921 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1724  pseudaminic acid synthase  49.28 
 
 
349 aa  340  2.9999999999999998e-92  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000954999 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2625  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  51.18 
 
 
349 aa  337  9.999999999999999e-92  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2758  N-acetylneuraminate synthase  51.79 
 
 
348 aa  335  9e-91  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2213  pseudaminic acid synthase  49.52 
 
 
345 aa  334  1e-90  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3707  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  50.75 
 
 
350 aa  334  1e-90  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.170147  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3556  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  51.8 
 
 
358 aa  332  6e-90  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.434108 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2229  N-acetylneuraminate synthase  48.05 
 
 
350 aa  331  1e-89  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3076  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  47.84 
 
 
355 aa  324  1e-87  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4269  pseudaminic acid synthase  49.71 
 
 
351 aa  324  2e-87  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.948479 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3564  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  49.84 
 
 
343 aa  318  6e-86  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1556  sialic acid synthase  50.46 
 
 
340 aa  313  2.9999999999999996e-84  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0565  spore coat polysaccharide biosynthesis protein SpsE  49.22 
 
 
342 aa  313  2.9999999999999996e-84  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0169  N-acetylneuraminic acid synthetase  44.64 
 
 
344 aa  303  3.0000000000000004e-81  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0138828  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2425  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  46.46 
 
 
345 aa  302  5.000000000000001e-81  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.149839  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1512  N-acetylneuraminic acid synthetase  43.26 
 
 
343 aa  281  1e-74  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1391  N-acetylneuraminate synthase  43.48 
 
 
337 aa  273  2.0000000000000002e-72  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0754706 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0662  N-acetylneuraminate synthase  70.18 
 
 
194 aa  267  2e-70  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.116223  normal  0.934611 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0397  N-acetylneuraminic acid synthetase  43.89 
 
 
343 aa  263  3e-69  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.397069  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1334  N-acetylneuraminic acid synthetase  43.89 
 
 
343 aa  255  6e-67  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0420  N-acetylneuraminate synthase  40 
 
 
349 aa  243  3.9999999999999997e-63  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1586  N-acetylneuraminate synthase  39.59 
 
 
347 aa  240  2.9999999999999997e-62  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0643  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  40.35 
 
 
342 aa  236  3e-61  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0506  N-acetylneuraminate synthase  38.3 
 
 
348 aa  225  1e-57  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0756  N-acetylneuraminate synthase  35.14 
 
 
337 aa  222  6e-57  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.556038 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2641  N-acetylneuraminate synthase  35.62 
 
 
330 aa  219  7e-56  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1970  polysaccharide biosynthesis protein, putative  35.5 
 
 
350 aa  217  2.9999999999999998e-55  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.237085  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0527  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  38.91 
 
 
335 aa  215  9.999999999999999e-55  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.783884  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3011  putative sialic acid synthase NeuB  38.32 
 
 
346 aa  215  9.999999999999999e-55  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.62069  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2369  N-acetylneuraminate synthase  35.88 
 
 
348 aa  213  2.9999999999999995e-54  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0796873  normal  0.0101527 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3405  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  35.83 
 
 
358 aa  211  1e-53  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1516  N-acetylneuraminic acid synthetase  36.91 
 
 
334 aa  210  3e-53  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.350916  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0385  N-acetylneuraminic acid synthetase  36.28 
 
 
334 aa  208  9e-53  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1235  flagellin modification protein PtmC, putative N-acetylneuraminic acid synthetase  36.25 
 
 
334 aa  208  1e-52  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.000000147783  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0412  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  35.29 
 
 
338 aa  207  2e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.336797 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2303  general stress protein 14 (GSP14)  36.91 
 
 
333 aa  207  2e-52  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1456  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  39.88 
 
 
354 aa  206  3e-52  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3980  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  37.04 
 
 
350 aa  206  4e-52  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0595  N-acetylneuraminate synthase  36.39 
 
 
333 aa  206  5e-52  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1845  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  34.45 
 
 
344 aa  206  6e-52  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16950  N-acetylneuraminate synthase  35.67 
 
 
331 aa  205  8e-52  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1161  N-acetyl neuramic acid synthetase NeuB  35.51 
 
 
341 aa  200  1.9999999999999998e-50  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12451  sialic acid synthase  36.28 
 
 
337 aa  201  1.9999999999999998e-50  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0694401  hitchhiker  0.00593947 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3232  polysialic acid capsule biosynthesis sialic acid synthase NeuB  34.64 
 
 
346 aa  196  5.000000000000001e-49  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0151  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  36.01 
 
 
349 aa  191  1e-47  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0562  N-acetylneuraminate synthase  35.2 
 
 
333 aa  190  2e-47  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3726  N-acetylneuraminic acid synthase domain  33.44 
 
 
338 aa  189  5e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3256  N-acetylneuraminate synthase  33.93 
 
 
351 aa  189  8e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0019  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  34.85 
 
 
350 aa  188  1e-46  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0818  N-acetylneuraminic acid condensing enzyme  33.84 
 
 
340 aa  187  2e-46  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1534  N-acetylneuraminate synthase  35 
 
 
332 aa  187  2e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0131  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  35.05 
 
 
351 aa  187  2e-46  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    unclonable  0.00000000000000538819 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0789  N-acetylneuraminic acid condensing enzyme  33.13 
 
 
340 aa  186  4e-46  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2590  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  34.47 
 
 
338 aa  186  4e-46  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00139935 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1458  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  34.06 
 
 
334 aa  186  6e-46  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0364  N-acetylneuraminic acid synthase domain-containing protein  34.88 
 
 
358 aa  184  2.0000000000000003e-45  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.431709  normal  0.842753 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1664  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  33.04 
 
 
344 aa  182  1e-44  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4942  N-acetylneuraminate synthase  36.14 
 
 
748 aa  180  2.9999999999999997e-44  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08721  ialic acid synthase  33.82 
 
 
342 aa  180  2.9999999999999997e-44  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.938537  hitchhiker  0.00000164183 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1576  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  36.5 
 
 
350 aa  179  4.999999999999999e-44  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2977  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  33.75 
 
 
334 aa  179  8e-44  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3121  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  33.75 
 
 
334 aa  179  8e-44  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4334  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  31.05 
 
 
356 aa  177  2e-43  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.204017  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1158  sialic acid synthase  30.66 
 
 
346 aa  176  8e-43  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  decreased coverage  0.00143382  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00670  sialic acid synthase  32.81 
 
 
333 aa  175  9.999999999999999e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14081  sialic acid synthase  32.08 
 
 
341 aa  173  3.9999999999999995e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1580  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  32.54 
 
 
749 aa  172  5.999999999999999e-42  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0049  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  33.63 
 
 
357 aa  171  1e-41  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1832  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  31.82 
 
 
394 aa  171  2e-41  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0797  N-acetylneuraminate synthase  37.82 
 
 
289 aa  171  2e-41  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3318  Sialic acid synthase-like protein  34.83 
 
 
672 aa  170  4e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.785348  normal  0.206825 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1072  sialic acid synthase  37.82 
 
 
293 aa  168  1e-40  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2331  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  33.75 
 
 
332 aa  169  1e-40  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.206004 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01101  sialic acid synthase  31.56 
 
 
335 aa  168  1e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.252845 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4086  N-acetylneuraminate synthase  32.46 
 
 
363 aa  167  2e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>