160 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cla_1235 on replicon NC_012039
Organism: Campylobacter lari RM2100



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012039  Cla_1235  flagellin modification protein PtmC, putative N-acetylneuraminic acid synthetase  100 
 
 
334 aa  676    Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.000000147783  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1516  N-acetylneuraminic acid synthetase  69.16 
 
 
334 aa  475  1e-133  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.350916  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0385  N-acetylneuraminic acid synthetase  69.76 
 
 
334 aa  477  1e-133  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0527  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  58.31 
 
 
335 aa  425  1e-118  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.783884  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2303  general stress protein 14 (GSP14)  63.64 
 
 
333 aa  427  1e-118  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0595  N-acetylneuraminate synthase  64.56 
 
 
333 aa  420  1e-116  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16950  N-acetylneuraminate synthase  60.91 
 
 
331 aa  414  9.999999999999999e-116  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2590  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  57.61 
 
 
338 aa  404  1.0000000000000001e-112  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00139935 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2641  N-acetylneuraminate synthase  60.12 
 
 
330 aa  406  1.0000000000000001e-112  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12451  sialic acid synthase  57.66 
 
 
337 aa  392  1e-108  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0694401  hitchhiker  0.00593947 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1458  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  54.88 
 
 
334 aa  379  1e-104  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001800  N-acetylneuraminate synthase  55.06 
 
 
357 aa  368  1e-101  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0562  N-acetylneuraminate synthase  52.57 
 
 
333 aa  368  1e-101  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0049  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  53.65 
 
 
357 aa  361  9e-99  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2977  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  56.8 
 
 
334 aa  359  4e-98  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3121  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  56.8 
 
 
334 aa  359  4e-98  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0169  N-acetylneuraminic acid synthase  53.09 
 
 
357 aa  358  6e-98  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.922982  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0254  N-acetylneuraminic acid synthase  53.09 
 
 
357 aa  358  6e-98  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0756  N-acetylneuraminate synthase  53.09 
 
 
337 aa  358  8e-98  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.556038 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1161  N-acetyl neuramic acid synthetase NeuB  55.49 
 
 
341 aa  357  9.999999999999999e-98  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1582  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  52.66 
 
 
359 aa  356  2.9999999999999997e-97  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.807685  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4086  N-acetylneuraminate synthase  50.99 
 
 
363 aa  353  2.9999999999999997e-96  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00670  sialic acid synthase  53.47 
 
 
333 aa  351  1e-95  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0420  N-acetylneuraminate synthase  54.98 
 
 
349 aa  350  2e-95  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3011  putative sialic acid synthase NeuB  53.57 
 
 
346 aa  349  5e-95  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.62069  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3100  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  51.13 
 
 
357 aa  343  2e-93  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3232  polysialic acid capsule biosynthesis sialic acid synthase NeuB  52.96 
 
 
346 aa  343  4e-93  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2331  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  52.25 
 
 
332 aa  341  1e-92  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.206004 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0631  N-acetylneuraminate synthase  45.1 
 
 
359 aa  323  2e-87  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1586  N-acetylneuraminate synthase  49.7 
 
 
347 aa  320  3e-86  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0818  N-acetylneuraminic acid condensing enzyme  49.37 
 
 
340 aa  318  1e-85  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0789  N-acetylneuraminic acid condensing enzyme  49.68 
 
 
340 aa  315  5e-85  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0506  N-acetylneuraminate synthase  51.25 
 
 
348 aa  311  1e-83  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0367  N-acetylneuraminate synthase  47.71 
 
 
360 aa  300  2e-80  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2396  NeuB, antifreeze-like protein  44.41 
 
 
371 aa  299  4e-80  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.503393 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01101  sialic acid synthase  46.08 
 
 
335 aa  293  2e-78  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.252845 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3405  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  45.57 
 
 
358 aa  290  2e-77  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1576  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  43.5 
 
 
350 aa  279  5e-74  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3980  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  44.24 
 
 
350 aa  278  6e-74  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14081  sialic acid synthase  43.24 
 
 
341 aa  273  2.0000000000000002e-72  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0151  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  42.77 
 
 
349 aa  262  6e-69  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1456  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  43.44 
 
 
354 aa  260  2e-68  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1970  polysaccharide biosynthesis protein, putative  39.16 
 
 
350 aa  259  6e-68  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.237085  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0019  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  42.77 
 
 
350 aa  250  2e-65  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4853  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  38.81 
 
 
352 aa  241  2e-62  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.31192  normal  0.276031 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1580  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  38.41 
 
 
749 aa  238  9e-62  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0643  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  39.46 
 
 
342 aa  236  5.0000000000000005e-61  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2229  N-acetylneuraminate synthase  40.87 
 
 
350 aa  233  3e-60  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0774  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  40.5 
 
 
354 aa  233  3e-60  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.453022  normal  0.512992 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1772  N-acetylneuraminate synthase  38.39 
 
 
350 aa  231  9e-60  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1832  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  35.24 
 
 
394 aa  228  1e-58  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3726  N-acetylneuraminic acid synthase domain  36.86 
 
 
338 aa  223  3e-57  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4942  N-acetylneuraminate synthase  39.27 
 
 
748 aa  222  6e-57  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0010  n-acetylneuraminate synthase  37.99 
 
 
303 aa  222  9e-57  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.124512  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1391  N-acetylneuraminate synthase  37.76 
 
 
337 aa  219  7e-56  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0754706 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3681  N-acetylneuraminate synthase  34.43 
 
 
344 aa  216  5e-55  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1534  N-acetylneuraminate synthase  36.71 
 
 
332 aa  214  1.9999999999999998e-54  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3318  Sialic acid synthase-like protein  37.09 
 
 
672 aa  213  2.9999999999999995e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.785348  normal  0.206825 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01550  N-acetylneuraminate synthase  33.75 
 
 
349 aa  213  3.9999999999999995e-54  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.0492033 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0412  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  36.86 
 
 
338 aa  211  1e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.336797 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1512  N-acetylneuraminic acid synthetase  38.77 
 
 
343 aa  208  8e-53  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3027  pseudaminic acid synthase  36.25 
 
 
349 aa  208  1e-52  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3448  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  38.89 
 
 
749 aa  207  2e-52  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2668  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  38.89 
 
 
749 aa  207  2e-52  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1845  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  34.43 
 
 
344 aa  204  1e-51  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3256  N-acetylneuraminate synthase  36.5 
 
 
351 aa  204  2e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08721  ialic acid synthase  37.46 
 
 
342 aa  204  2e-51  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.938537  hitchhiker  0.00000164183 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1890  N-acetylneuraminate synthase  36.86 
 
 
356 aa  203  3e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.00000120962  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2221  N-acetylneuraminate synthase  36.36 
 
 
761 aa  202  5e-51  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13043  sialic acid synthase  36.2 
 
 
338 aa  202  6e-51  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.276449  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2425  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  34.47 
 
 
345 aa  202  9e-51  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.149839  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1329  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  35.42 
 
 
358 aa  201  9.999999999999999e-51  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2635  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  36.39 
 
 
352 aa  201  1.9999999999999998e-50  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0131  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  36.92 
 
 
351 aa  200  1.9999999999999998e-50  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    unclonable  0.00000000000000538819 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2213  pseudaminic acid synthase  37.89 
 
 
345 aa  200  3e-50  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3208  pseudaminic acid synthase  35.17 
 
 
351 aa  200  3e-50  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2327  N-acetylneuraminate synthase  35.69 
 
 
350 aa  200  3.9999999999999996e-50  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.463819 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2369  N-acetylneuraminate synthase  34.23 
 
 
348 aa  199  6e-50  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0796873  normal  0.0101527 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3076  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  37.61 
 
 
355 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1894  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  35.5 
 
 
354 aa  196  3e-49  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1664  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  37.73 
 
 
344 aa  196  3e-49  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1248  N-acetylneuraminate synthase  32.61 
 
 
348 aa  196  4.0000000000000005e-49  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.862744  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0843  N-acetylneuraminate synthase  38.87 
 
 
296 aa  196  6e-49  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1289  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  38.67 
 
 
350 aa  195  7e-49  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2097  neuB protein  35 
 
 
352 aa  194  2e-48  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.268336  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14241  sialic acid synthase  38.48 
 
 
356 aa  194  2e-48  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.532641  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4334  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  33.83 
 
 
356 aa  192  8e-48  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.204017  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1072  sialic acid synthase  36.43 
 
 
293 aa  191  1e-47  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1974  N-acetylneuraminate synthase  38.97 
 
 
305 aa  191  1e-47  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0458  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  38.41 
 
 
762 aa  188  9e-47  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.147767  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3113  N-acetylneuraminic acid synthase-like protein  35.91 
 
 
359 aa  188  1e-46  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0210  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  35.31 
 
 
349 aa  187  2e-46  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.803069  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1334  N-acetylneuraminic acid synthetase  39.08 
 
 
343 aa  187  2e-46  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0797  N-acetylneuraminate synthase  34.64 
 
 
289 aa  187  2e-46  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1274  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  34.75 
 
 
314 aa  186  4e-46  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0397  N-acetylneuraminic acid synthetase  37.54 
 
 
343 aa  186  6e-46  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.397069  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0910  N-acetylneuraminate synthase  33.33 
 
 
289 aa  185  7e-46  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.497689  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1969  N-acetylneuraminate synthase  32.52 
 
 
364 aa  185  7e-46  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0891356  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1574  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  37.64 
 
 
289 aa  185  1.0000000000000001e-45  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000030231  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1556  sialic acid synthase  36.56 
 
 
340 aa  185  1.0000000000000001e-45  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>