152 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_1582 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_1582  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  100 
 
 		 359 aa  740    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.807685  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3100  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  79.49 
 
 		 357 aa  590  1e-167  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001800  N-acetylneuraminate synthase  68.82 
 
 		 357 aa  509  1e-143  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0169  N-acetylneuraminic acid synthase  66.85 
 
 		 357 aa  494  1e-139  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.922982  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0254  N-acetylneuraminic acid synthase  66.85 
 
 		 357 aa  494  1e-139  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0049  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  65.45 
 
 		 357 aa  492  9.999999999999999e-139  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0631  N-acetylneuraminate synthase  60.72 
 
 		 359 aa  444  1.0000000000000001e-124  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4086  N-acetylneuraminate synthase  58.87 
 
 		 363 aa  419  1e-116  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1235  flagellin modification protein PtmC, putative N-acetylneuraminic acid synthetase  52.66 
 
 		 334 aa  356  2.9999999999999997e-97  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.000000147783  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1516  N-acetylneuraminic acid synthetase  51.82 
 
 		 334 aa  352  4e-96  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.350916  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0385  N-acetylneuraminic acid synthetase  51.26 
 
 		 334 aa  348  1e-94  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2641  N-acetylneuraminate synthase  50.14 
 
 		 330 aa  345  1e-93  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2303  general stress protein 14 (GSP14)  50 
 
 		 333 aa  343  2e-93  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0595  N-acetylneuraminate synthase  50.28 
 
 		 333 aa  339  5e-92  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16950  N-acetylneuraminate synthase  49.01 
 
 		 331 aa  333  4e-90  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0527  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  49.3 
 
 		 335 aa  332  9e-90  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.783884  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2396  NeuB, antifreeze-like protein  50.42 
 
 		 371 aa  330  2e-89  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.503393 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2590  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  49.01 
 
 		 338 aa  328  1.0000000000000001e-88  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00139935 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0367  N-acetylneuraminate synthase  49.58 
 
 		 360 aa  325  9e-88  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0756  N-acetylneuraminate synthase  47.49 
 
 		 337 aa  320  3e-86  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.556038 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12451  sialic acid synthase  48.46 
 
 		 337 aa  315  7e-85  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0694401  hitchhiker  0.00593947 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0562  N-acetylneuraminate synthase  48.86 
 
 		 333 aa  311  9e-84  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2977  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  49.02 
 
 		 334 aa  307  2.0000000000000002e-82  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3121  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  49.02 
 
 		 334 aa  307  2.0000000000000002e-82  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1161  N-acetyl neuramic acid synthetase NeuB  46.07 
 
 		 341 aa  306  4.0000000000000004e-82  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00670  sialic acid synthase  47.49 
 
 		 333 aa  306  4.0000000000000004e-82  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1458  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  47.18 
 
 		 334 aa  301  8.000000000000001e-81  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0420  N-acetylneuraminate synthase  44.92 
 
 		 349 aa  294  2e-78  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2331  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  47.77 
 
 		 332 aa  293  4e-78  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.206004 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1586  N-acetylneuraminate synthase  46.9 
 
 		 347 aa  288  9e-77  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3011  putative sialic acid synthase NeuB  42.38 
 
 		 346 aa  281  1e-74  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.62069  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01101  sialic acid synthase  44.1 
 
 		 335 aa  281  1e-74  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.252845 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0506  N-acetylneuraminate synthase  46.09 
 
 		 348 aa  280  4e-74  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3232  polysialic acid capsule biosynthesis sialic acid synthase NeuB  41 
 
 		 346 aa  279  5e-74  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0818  N-acetylneuraminic acid condensing enzyme  42.13 
 
 		 340 aa  278  7e-74  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0789  N-acetylneuraminic acid condensing enzyme  44.31 
 
 		 340 aa  275  1.0000000000000001e-72  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14081  sialic acid synthase  40.28 
 
 		 341 aa  273  2.0000000000000002e-72  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1576  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  44.35 
 
 		 350 aa  261  2e-68  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3405  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  41.91 
 
 		 358 aa  256  3e-67  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3980  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  43.26 
 
 		 350 aa  247  2e-64  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1580  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  40.22 
 
 		 749 aa  239  6.999999999999999e-62  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1456  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  40.34 
 
 		 354 aa  234  3e-60  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4853  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  38.14 
 
 		 352 aa  233  4.0000000000000004e-60  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.31192  normal  0.276031 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0151  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  40.79 
 
 		 349 aa  230  3e-59  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0019  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  39.04 
 
 		 350 aa  223  6e-57  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1391  N-acetylneuraminate synthase  37.82 
 
 		 337 aa  213  3.9999999999999995e-54  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0754706 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0643  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  39.29 
 
 		 342 aa  210  2e-53  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0774  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  37.15 
 
 		 354 aa  211  2e-53  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.453022  normal  0.512992 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1970  polysaccharide biosynthesis protein, putative  37.57 
 
 		 350 aa  209  6e-53  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.237085  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4942  N-acetylneuraminate synthase  37.71 
 
 		 748 aa  207  2e-52  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1772  N-acetylneuraminate synthase  37.11 
 
 		 350 aa  205  1e-51  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1832  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  36.98 
 
 		 394 aa  204  2e-51  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2229  N-acetylneuraminate synthase  34.94 
 
 		 350 aa  192  6e-48  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3448  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  36.87 
 
 		 749 aa  192  9e-48  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2668  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  36.87 
 
 		 749 aa  192  9e-48  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0131  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  34.41 
 
 		 351 aa  190  2.9999999999999997e-47  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    unclonable  0.00000000000000538819 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01550  N-acetylneuraminate synthase  34.93 
 
 		 349 aa  187  2e-46  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0492033 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0412  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  34.93 
 
 		 338 aa  187  2e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.336797 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2425  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  34.26 
 
 		 345 aa  185  1.0000000000000001e-45  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.149839  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1248  N-acetylneuraminate synthase  34.38 
 
 		 348 aa  181  2e-44  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.862744  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2221  N-acetylneuraminate synthase  34.64 
 
 		 761 aa  178  2e-43  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13043  sialic acid synthase  32.21 
 
 		 338 aa  176  4e-43  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.276449  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3256  N-acetylneuraminate synthase  35.76 
 
 		 351 aa  176  8e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1512  N-acetylneuraminic acid synthetase  33.43 
 
 		 343 aa  175  9.999999999999999e-43  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0458  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  36.8 
 
 		 762 aa  174  9.999999999999999e-43  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.147767  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1289  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  34.08 
 
 		 350 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0010  n-acetylneuraminate synthase  37.02 
 
 		 303 aa  174  2.9999999999999996e-42  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.124512  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3681  N-acetylneuraminate synthase  33.52 
 
 		 344 aa  174  2.9999999999999996e-42  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2407  N-acetylneuraminate synthase  34.07 
 
 		 500 aa  173  5e-42  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.378262  normal  0.284066 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3726  N-acetylneuraminic acid synthase domain  34.84 
 
 		 338 aa  172  5.999999999999999e-42  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2327  N-acetylneuraminate synthase  34.29 
 
 		 350 aa  172  6.999999999999999e-42  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.463819 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3318  Sialic acid synthase-like protein  37.5 
 
 		 672 aa  171  1e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.785348  normal  0.206825 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1845  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  34.33 
 
 		 344 aa  170  3e-41  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2369  N-acetylneuraminate synthase  34.54 
 
 		 348 aa  167  2e-40  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0796873  normal  0.0101527 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3208  pseudaminic acid synthase  32.68 
 
 		 351 aa  166  4e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0565  spore coat polysaccharide biosynthesis protein SpsE  33.99 
 
 		 342 aa  166  5e-40  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14241  sialic acid synthase  33.8 
 
 		 356 aa  166  8e-40  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.532641  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0910  N-acetylneuraminate synthase  34.13 
 
 		 289 aa  164  2.0000000000000002e-39  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.497689  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1304  N-acetylneuraminate synthase  32 
 
 		 350 aa  164  3e-39  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.583965  normal  0.823534 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0647  antifreeze-like protein  33.62 
 
 		 350 aa  163  4.0000000000000004e-39  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.318568  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2635  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  33.06 
 
 		 352 aa  163  4.0000000000000004e-39  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1974  N-acetylneuraminate synthase  37.58 
 
 		 305 aa  162  6e-39  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2097  neuB protein  33.63 
 
 		 352 aa  161  1e-38  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.268336  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3942  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  32.69 
 
 		 349 aa  160  3e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0693356 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1534  N-acetylneuraminate synthase  30.64 
 
 		 332 aa  160  4e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1556  sialic acid synthase  33.61 
 
 		 340 aa  159  5e-38  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1890  N-acetylneuraminate synthase  33.15 
 
 		 356 aa  159  6e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.00000120962  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0169  N-acetylneuraminic acid synthetase  32.02 
 
 		 344 aa  159  8e-38  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0138828  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3027  pseudaminic acid synthase  32.28 
 
 		 349 aa  158  1e-37  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1329  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  32.02 
 
 		 358 aa  157  2e-37  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1912  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  32.68 
 
 		 365 aa  157  2e-37  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000713145 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2213  pseudaminic acid synthase  31.64 
 
 		 345 aa  156  4e-37  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3113  N-acetylneuraminic acid synthase-like protein  30.7 
 
 		 359 aa  156  5.0000000000000005e-37  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1724  pseudaminic acid synthase  32.86 
 
 		 349 aa  156  6e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000954999 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1664  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  31.16 
 
 		 344 aa  155  1e-36  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1894  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  31.78 
 
 		 354 aa  155  2e-36  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2841  N-acetylneuraminate synthase  35.18 
 
 		 300 aa  154  2e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.893161  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0797  N-acetylneuraminate synthase  31.49 
 
 		 289 aa  154  2.9999999999999998e-36  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0843  N-acetylneuraminate synthase  34.32 
 
 		 296 aa  153  5e-36  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0397  N-acetylneuraminic acid synthetase  33.99 
 
 		 343 aa  153  5e-36  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.397069  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>