153 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_4334 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013757  Gobs_4334  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  100 
 
 
356 aa  727    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.204017  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1845  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  63.5 
 
 
344 aa  449  1e-125  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3256  N-acetylneuraminate synthase  59.35 
 
 
351 aa  432  1e-120  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0305  N-acetylneuraminic acid synthase domain-containing protein  51.32 
 
 
347 aa  372  1e-102  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.351224  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1158  sialic acid synthase  48.48 
 
 
346 aa  337  1.9999999999999998e-91  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  decreased coverage  0.00143382  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08721  ialic acid synthase  42.82 
 
 
342 aa  310  4e-83  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.938537  hitchhiker  0.00000164183 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0527  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  38.07 
 
 
335 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.783884  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0756  N-acetylneuraminate synthase  37.72 
 
 
337 aa  211  2e-53  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.556038 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1516  N-acetylneuraminic acid synthetase  36.06 
 
 
334 aa  206  4e-52  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.350916  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1196  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  35.76 
 
 
350 aa  205  8e-52  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2641  N-acetylneuraminate synthase  37.42 
 
 
330 aa  205  1e-51  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0385  N-acetylneuraminic acid synthetase  36.06 
 
 
334 aa  201  9.999999999999999e-51  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0506  N-acetylneuraminate synthase  36.16 
 
 
348 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0595  N-acetylneuraminate synthase  34.55 
 
 
333 aa  197  3e-49  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0647  antifreeze-like protein  34.59 
 
 
350 aa  195  9e-49  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.318568  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2977  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  36.09 
 
 
334 aa  195  1e-48  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00670  sialic acid synthase  36.31 
 
 
333 aa  194  1e-48  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2303  general stress protein 14 (GSP14)  34.65 
 
 
333 aa  195  1e-48  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3121  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  36.09 
 
 
334 aa  195  1e-48  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2331  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  36 
 
 
332 aa  194  2e-48  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.206004 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0420  N-acetylneuraminate synthase  33.14 
 
 
349 aa  194  3e-48  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1970  polysaccharide biosynthesis protein, putative  36.75 
 
 
350 aa  192  6e-48  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.237085  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0412  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  36.14 
 
 
338 aa  192  7e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.336797 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1235  flagellin modification protein PtmC, putative N-acetylneuraminic acid synthetase  33.83 
 
 
334 aa  192  9e-48  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.000000147783  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1161  N-acetyl neuramic acid synthetase NeuB  35.58 
 
 
341 aa  191  1e-47  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1586  N-acetylneuraminate synthase  33.73 
 
 
347 aa  191  2e-47  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2369  N-acetylneuraminate synthase  37.17 
 
 
348 aa  190  2.9999999999999997e-47  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0796873  normal  0.0101527 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4269  pseudaminic acid synthase  35.53 
 
 
351 aa  190  2.9999999999999997e-47  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.948479 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16950  N-acetylneuraminate synthase  34.64 
 
 
331 aa  190  4e-47  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1329  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  35.31 
 
 
358 aa  186  4e-46  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3208  pseudaminic acid synthase  33.52 
 
 
351 aa  186  5e-46  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1248  N-acetylneuraminate synthase  33.33 
 
 
348 aa  185  1.0000000000000001e-45  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.862744  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2229  N-acetylneuraminate synthase  31.41 
 
 
350 aa  185  1.0000000000000001e-45  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1580  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  31.23 
 
 
749 aa  182  6e-45  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2327  N-acetylneuraminate synthase  35.38 
 
 
350 aa  182  6e-45  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.463819 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1523  N-acetylneuraminate synthase  35.61 
 
 
350 aa  182  8.000000000000001e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.242955  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2590  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  35.03 
 
 
338 aa  181  2e-44  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00139935 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1534  N-acetylneuraminate synthase  35.95 
 
 
332 aa  180  2.9999999999999997e-44  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0562  N-acetylneuraminate synthase  36.78 
 
 
333 aa  179  8e-44  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1456  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  36.05 
 
 
354 aa  178  1e-43  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3011  putative sialic acid synthase NeuB  32.65 
 
 
346 aa  178  1e-43  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.62069  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3027  pseudaminic acid synthase  31.05 
 
 
349 aa  177  2e-43  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3942  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  32.74 
 
 
349 aa  177  3e-43  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0693356 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1304  N-acetylneuraminate synthase  31.9 
 
 
350 aa  176  8e-43  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.583965  normal  0.823534 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2758  N-acetylneuraminate synthase  32.38 
 
 
348 aa  174  1.9999999999999998e-42  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1890  N-acetylneuraminate synthase  34.63 
 
 
356 aa  173  3.9999999999999995e-42  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.00000120962  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12451  sialic acid synthase  33.73 
 
 
337 aa  173  5e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0694401  hitchhiker  0.00593947 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1289  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  31.61 
 
 
350 aa  172  6.999999999999999e-42  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3076  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  33.52 
 
 
355 aa  172  9e-42  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02907  NeuB:Antifreeze-like protein  33.63 
 
 
347 aa  172  9e-42  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.269494  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1772  N-acetylneuraminate synthase  33.24 
 
 
350 aa  171  1e-41  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3980  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  35.73 
 
 
350 aa  171  2e-41  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0151  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  34.85 
 
 
349 aa  171  2e-41  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1458  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  32.42 
 
 
334 aa  170  3e-41  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1969  N-acetylneuraminate synthase  34.58 
 
 
364 aa  170  4e-41  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0891356  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0210  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  33.82 
 
 
349 aa  169  5e-41  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.803069  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2213  pseudaminic acid synthase  35.17 
 
 
345 aa  169  6e-41  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0019  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  32.95 
 
 
350 aa  168  1e-40  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2097  neuB protein  31.21 
 
 
352 aa  168  2e-40  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.268336  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0774  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  31.4 
 
 
354 aa  167  4e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.453022  normal  0.512992 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3232  polysialic acid capsule biosynthesis sialic acid synthase NeuB  31.76 
 
 
346 aa  166  4e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0631  N-acetylneuraminate synthase  35.39 
 
 
359 aa  164  3e-39  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3113  N-acetylneuraminic acid synthase-like protein  32.34 
 
 
359 aa  163  5.0000000000000005e-39  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3405  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  31.87 
 
 
358 aa  160  2e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0660  N-acetylneuraminate synthase  30.72 
 
 
349 aa  161  2e-38  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.297547  normal  0.963703 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0643  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  32.53 
 
 
342 aa  161  2e-38  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4086  N-acetylneuraminate synthase  32.69 
 
 
363 aa  160  3e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3008  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  34.94 
 
 
350 aa  160  3e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3556  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  34.81 
 
 
358 aa  159  5e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.434108 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3100  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  33.33 
 
 
357 aa  159  6e-38  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1724  pseudaminic acid synthase  31.61 
 
 
349 aa  159  7e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000954999 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1894  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  32.64 
 
 
354 aa  159  9e-38  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1391  N-acetylneuraminate synthase  31.04 
 
 
337 aa  159  1e-37  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0754706 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2625  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  31.79 
 
 
349 aa  158  1e-37  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13043  sialic acid synthase  30.84 
 
 
338 aa  157  2e-37  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.276449  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4942  N-acetylneuraminate synthase  31.86 
 
 
748 aa  157  2e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2668  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  31.05 
 
 
749 aa  156  7e-37  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3448  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  31.05 
 
 
749 aa  156  7e-37  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0587  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  32.29 
 
 
349 aa  154  2e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.518416  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1576  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  32.36 
 
 
350 aa  154  2e-36  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01101  sialic acid synthase  30.28 
 
 
335 aa  154  2e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.252845 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3707  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  33.52 
 
 
350 aa  153  5e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.170147  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0818  N-acetylneuraminic acid condensing enzyme  31.44 
 
 
340 aa  152  5.9999999999999996e-36  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0789  N-acetylneuraminic acid condensing enzyme  31.36 
 
 
340 aa  152  8.999999999999999e-36  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4303  N-acetylneuraminate synthase  34.01 
 
 
361 aa  152  1e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1664  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  29.52 
 
 
344 aa  151  2e-35  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3098  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  33.81 
 
 
347 aa  151  2e-35  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.298576  normal  0.187894 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2221  N-acetylneuraminate synthase  31.75 
 
 
761 aa  150  3e-35  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14241  sialic acid synthase  27.81 
 
 
356 aa  149  9e-35  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.532641  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2396  NeuB, antifreeze-like protein  35.21 
 
 
371 aa  148  1.0000000000000001e-34  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.503393 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3726  N-acetylneuraminic acid synthase domain  34.03 
 
 
338 aa  148  1.0000000000000001e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1512  N-acetylneuraminic acid synthetase  30.56 
 
 
343 aa  147  3e-34  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0254  N-acetylneuraminic acid synthase  31.91 
 
 
357 aa  147  3e-34  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3318  Sialic acid synthase-like protein  35.79 
 
 
672 aa  147  3e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.785348  normal  0.206825 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0169  N-acetylneuraminic acid synthase  31.91 
 
 
357 aa  147  3e-34  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.922982  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1832  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  32.18 
 
 
394 aa  147  4.0000000000000006e-34  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2713  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  36.8 
 
 
310 aa  147  4.0000000000000006e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.314547  normal  0.787059 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001800  N-acetylneuraminate synthase  31.34 
 
 
357 aa  146  7.0000000000000006e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2635  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  30.95 
 
 
352 aa  145  1e-33  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1582  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  31.43 
 
 
359 aa  145  1e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.807685  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>