153 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewana3_1304 on replicon NC_008577
Organism: Shewanella sp. ANA-3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008577  Shewana3_1304  N-acetylneuraminate synthase  100 
 
 		 350 aa  726    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.583965  normal  0.823534 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2097  neuB protein  63.82 
 
 		 352 aa  481  1e-135  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.268336  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2327  N-acetylneuraminate synthase  64.24 
 
 		 350 aa  483  1e-135  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.463819 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3027  pseudaminic acid synthase  63.48 
 
 		 349 aa  475  1e-133  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1248  N-acetylneuraminate synthase  59.13 
 
 		 348 aa  449  1e-125  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.862744  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0660  N-acetylneuraminate synthase  57.43 
 
 		 349 aa  431  1e-119  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.297547  normal  0.963703 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0647  antifreeze-like protein  57.02 
 
 		 350 aa  411  1e-114  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.318568  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1196  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  57.76 
 
 		 350 aa  406  1.0000000000000001e-112  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1969  N-acetylneuraminate synthase  53.64 
 
 		 364 aa  373  1e-102  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0891356  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4303  N-acetylneuraminate synthase  53.74 
 
 		 361 aa  373  1e-102  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02907  NeuB:Antifreeze-like protein  50.75 
 
 		 347 aa  364  1e-99  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.269494  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3208  pseudaminic acid synthase  48.84 
 
 		 351 aa  363  2e-99  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0774  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  49.71 
 
 		 354 aa  355  7.999999999999999e-97  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.453022  normal  0.512992 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2229  N-acetylneuraminate synthase  49.43 
 
 		 350 aa  354  1e-96  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1329  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  49.57 
 
 		 358 aa  353  2e-96  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0587  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  48.84 
 
 		 349 aa  352  4e-96  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.518416  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13043  sialic acid synthase  50.76 
 
 		 338 aa  353  4e-96  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.276449  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0210  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  51.3 
 
 		 349 aa  350  1e-95  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.803069  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1772  N-acetylneuraminate synthase  49.71 
 
 		 350 aa  351  1e-95  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1289  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  51.6 
 
 		 350 aa  350  2e-95  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1523  N-acetylneuraminate synthase  48.12 
 
 		 350 aa  349  4e-95  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.242955  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3113  N-acetylneuraminic acid synthase-like protein  50 
 
 		 359 aa  348  1e-94  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1724  pseudaminic acid synthase  49.28 
 
 		 349 aa  346  4e-94  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000954999 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3008  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  49.28 
 
 		 350 aa  340  2e-92  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1204  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  48.55 
 
 		 346 aa  338  9.999999999999999e-92  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.6921 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3098  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  49.26 
 
 		 347 aa  335  5e-91  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.298576  normal  0.187894 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3556  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  50.9 
 
 		 358 aa  334  1e-90  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.434108 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01550  N-acetylneuraminate synthase  46.24 
 
 		 349 aa  332  4e-90  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0492033 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2625  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  47.4 
 
 		 349 aa  328  8e-89  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3564  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  48.65 
 
 		 343 aa  326  4.0000000000000003e-88  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3707  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  46.69 
 
 		 350 aa  324  2e-87  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.170147  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3942  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  45.22 
 
 		 349 aa  319  3.9999999999999996e-86  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0693356 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4269  pseudaminic acid synthase  46.55 
 
 		 351 aa  318  1e-85  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.948479 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3076  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  47.38 
 
 		 355 aa  313  2.9999999999999996e-84  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1556  sialic acid synthase  49.25 
 
 		 340 aa  313  2.9999999999999996e-84  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2213  pseudaminic acid synthase  44.41 
 
 		 345 aa  311  9e-84  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2758  N-acetylneuraminate synthase  44.61 
 
 		 348 aa  308  6.999999999999999e-83  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0565  spore coat polysaccharide biosynthesis protein SpsE  46.01 
 
 		 342 aa  303  3.0000000000000004e-81  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1391  N-acetylneuraminate synthase  44.11 
 
 		 337 aa  288  1e-76  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0754706 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1512  N-acetylneuraminic acid synthetase  42.56 
 
 		 343 aa  282  5.000000000000001e-75  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0169  N-acetylneuraminic acid synthetase  41.69 
 
 		 344 aa  280  4e-74  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0138828  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2425  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  40.67 
 
 		 345 aa  278  8e-74  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.149839  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0397  N-acetylneuraminic acid synthetase  41.54 
 
 		 343 aa  267  2e-70  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.397069  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1334  N-acetylneuraminic acid synthetase  42.26 
 
 		 343 aa  261  2e-68  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0662  N-acetylneuraminate synthase  62.15 
 
 		 194 aa  243  3e-63  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.116223  normal  0.934611 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1586  N-acetylneuraminate synthase  37.24 
 
 		 347 aa  238  2e-61  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0643  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  39.04 
 
 		 342 aa  229  6e-59  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0420  N-acetylneuraminate synthase  36.58 
 
 		 349 aa  222  7e-57  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0756  N-acetylneuraminate synthase  33.43 
 
 		 337 aa  218  8.999999999999998e-56  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.556038 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3980  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  37.94 
 
 		 350 aa  218  1e-55  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0506  N-acetylneuraminate synthase  36.05 
 
 		 348 aa  210  3e-53  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3405  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  34.64 
 
 		 358 aa  210  3e-53  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3726  N-acetylneuraminic acid synthase domain  37.35 
 
 		 338 aa  208  9e-53  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1970  polysaccharide biosynthesis protein, putative  34.12 
 
 		 350 aa  208  1e-52  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.237085  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1516  N-acetylneuraminic acid synthetase  36.71 
 
 		 334 aa  208  1e-52  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.350916  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1456  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  37.39 
 
 		 354 aa  207  2e-52  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0385  N-acetylneuraminic acid synthetase  36.71 
 
 		 334 aa  207  3e-52  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2369  N-acetylneuraminate synthase  36.29 
 
 		 348 aa  205  7e-52  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0796873  normal  0.0101527 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0412  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  36.14 
 
 		 338 aa  200  3e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.336797 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0527  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  37.03 
 
 		 335 aa  198  1.0000000000000001e-49  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.783884  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1161  N-acetyl neuramic acid synthetase NeuB  34.43 
 
 		 341 aa  197  3e-49  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3011  putative sialic acid synthase NeuB  35.21 
 
 		 346 aa  196  5.000000000000001e-49  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.62069  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0818  N-acetylneuraminic acid condensing enzyme  32.84 
 
 		 340 aa  195  8.000000000000001e-49  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0151  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  33.24 
 
 		 349 aa  195  1e-48  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12451  sialic acid synthase  36.25 
 
 		 337 aa  193  4e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0694401  hitchhiker  0.00593947 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08721  ialic acid synthase  34.78 
 
 		 342 aa  192  6e-48  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.938537  hitchhiker  0.00000164183 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2641  N-acetylneuraminate synthase  34.06 
 
 		 330 aa  192  1e-47  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2303  general stress protein 14 (GSP14)  35.96 
 
 		 333 aa  191  1e-47  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0789  N-acetylneuraminic acid condensing enzyme  32.54 
 
 		 340 aa  191  2e-47  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3256  N-acetylneuraminate synthase  31.91 
 
 		 351 aa  185  8e-46  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1845  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  32.46 
 
 		 344 aa  185  8e-46  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3232  polysialic acid capsule biosynthesis sialic acid synthase NeuB  34.98 
 
 		 346 aa  185  8e-46  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16950  N-acetylneuraminate synthase  34.08 
 
 		 331 aa  184  1.0000000000000001e-45  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1235  flagellin modification protein PtmC, putative N-acetylneuraminic acid synthetase  33.23 
 
 		 334 aa  183  4.0000000000000006e-45  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.000000147783  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0131  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  32.93 
 
 		 351 aa  181  1e-44  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    unclonable  0.00000000000000538819 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0595  N-acetylneuraminate synthase  32.51 
 
 		 333 aa  181  2e-44  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4334  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  31.9 
 
 		 356 aa  176  7e-43  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.204017  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0019  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  33.33 
 
 		 350 aa  175  9e-43  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1832  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  31.94 
 
 		 394 aa  175  9.999999999999999e-43  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1534  N-acetylneuraminate synthase  31.85 
 
 		 332 aa  171  2e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0562  N-acetylneuraminate synthase  31.71 
 
 		 333 aa  169  5e-41  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14241  sialic acid synthase  33.63 
 
 		 356 aa  169  8e-41  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.532641  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0797  N-acetylneuraminate synthase  37.13 
 
 		 289 aa  168  1e-40  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1458  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  31.15 
 
 		 334 aa  166  4e-40  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1580  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  32.55 
 
 		 749 aa  166  6.9999999999999995e-40  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0305  N-acetylneuraminic acid synthase domain-containing protein  32.76 
 
 		 347 aa  166  6.9999999999999995e-40  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.351224  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1894  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  34.47 
 
 		 354 aa  165  8e-40  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3318  Sialic acid synthase-like protein  33.7 
 
 		 672 aa  164  2.0000000000000002e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.785348  normal  0.206825 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001800  N-acetylneuraminate synthase  32.94 
 
 		 357 aa  164  2.0000000000000002e-39  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0049  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  33.43 
 
 		 357 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1582  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  32 
 
 		 359 aa  164  3e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.807685  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0960  neuB family protein  31.52 
 
 		 379 aa  162  9e-39  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1158  sialic acid synthase  31.62 
 
 		 346 aa  161  2e-38  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  decreased coverage  0.00143382  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0367  N-acetylneuraminate synthase  31.76 
 
 		 360 aa  160  3e-38  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0631  N-acetylneuraminate synthase  30.88 
 
 		 359 aa  160  3e-38  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2635  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  33.33 
 
 		 352 aa  160  3e-38  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14081  sialic acid synthase  30.86 
 
 		 341 aa  159  5e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1890  N-acetylneuraminate synthase  32.46 
 
 		 356 aa  159  7e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.00000120962  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1974  N-acetylneuraminate synthase  35.21 
 
 		 305 aa  158  1e-37  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0364  N-acetylneuraminic acid synthase domain-containing protein  31.45 
 
 		 358 aa  159  1e-37  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.431709  normal  0.842753 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>