153 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_3113 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007954  Sden_3113  N-acetylneuraminic acid synthase-like protein  100 
 
 		 359 aa  741    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1329  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  76.75 
 
 		 358 aa  592  1e-168  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1248  N-acetylneuraminate synthase  53.67 
 
 		 348 aa  382  1e-105  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.862744  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0647  antifreeze-like protein  54.49 
 
 		 350 aa  380  1e-104  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.318568  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2097  neuB protein  51.88 
 
 		 352 aa  375  1e-103  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.268336  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2327  N-acetylneuraminate synthase  53.85 
 
 		 350 aa  378  1e-103  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.463819 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3027  pseudaminic acid synthase  53.29 
 
 		 349 aa  369  1e-101  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1196  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  53.91 
 
 		 350 aa  360  2e-98  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4303  N-acetylneuraminate synthase  53.98 
 
 		 361 aa  355  5e-97  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1772  N-acetylneuraminate synthase  50.3 
 
 		 350 aa  353  2e-96  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1304  N-acetylneuraminate synthase  50 
 
 		 350 aa  353  2.9999999999999997e-96  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.583965  normal  0.823534 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3942  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  49.85 
 
 		 349 aa  353  4e-96  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0693356 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0660  N-acetylneuraminate synthase  49.41 
 
 		 349 aa  350  2e-95  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.297547  normal  0.963703 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1289  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  52.07 
 
 		 350 aa  350  2e-95  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01550  N-acetylneuraminate synthase  51.03 
 
 		 349 aa  347  2e-94  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0492033 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0774  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  49.41 
 
 		 354 aa  347  2e-94  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.453022  normal  0.512992 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1969  N-acetylneuraminate synthase  51.6 
 
 		 364 aa  344  2e-93  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0891356  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2625  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  51.16 
 
 		 349 aa  339  5e-92  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2229  N-acetylneuraminate synthase  47.43 
 
 		 350 aa  338  8e-92  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13043  sialic acid synthase  49.85 
 
 		 338 aa  338  8e-92  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.276449  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1204  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  50 
 
 		 346 aa  338  9.999999999999999e-92  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.6921 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0587  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  48.56 
 
 		 349 aa  335  5e-91  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.518416  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3208  pseudaminic acid synthase  47.69 
 
 		 351 aa  333  2e-90  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4269  pseudaminic acid synthase  48.53 
 
 		 351 aa  329  4e-89  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.948479 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2758  N-acetylneuraminate synthase  49.13 
 
 		 348 aa  326  4.0000000000000003e-88  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0565  spore coat polysaccharide biosynthesis protein SpsE  48.79 
 
 		 342 aa  322  6e-87  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1523  N-acetylneuraminate synthase  47.23 
 
 		 350 aa  320  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.242955  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02907  NeuB:Antifreeze-like protein  47.45 
 
 		 347 aa  319  3.9999999999999996e-86  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.269494  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2213  pseudaminic acid synthase  46.57 
 
 		 345 aa  319  3.9999999999999996e-86  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0169  N-acetylneuraminic acid synthetase  47.87 
 
 		 344 aa  318  1e-85  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0138828  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1724  pseudaminic acid synthase  46.65 
 
 		 349 aa  316  4e-85  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000954999 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3564  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  48.66 
 
 		 343 aa  315  6e-85  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0210  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  48.24 
 
 		 349 aa  315  8e-85  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.803069  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3098  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  48.97 
 
 		 347 aa  314  9.999999999999999e-85  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.298576  normal  0.187894 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3008  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  47.98 
 
 		 350 aa  314  1.9999999999999998e-84  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3556  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  50.6 
 
 		 358 aa  313  3.9999999999999997e-84  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.434108 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1512  N-acetylneuraminic acid synthetase  45.67 
 
 		 343 aa  311  2e-83  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3076  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  47.56 
 
 		 355 aa  308  9e-83  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2425  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  45.35 
 
 		 345 aa  305  8.000000000000001e-82  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.149839  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3707  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  47.11 
 
 		 350 aa  304  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.170147  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1334  N-acetylneuraminic acid synthetase  47.71 
 
 		 343 aa  293  3e-78  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1556  sialic acid synthase  44.41 
 
 		 340 aa  292  7e-78  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0397  N-acetylneuraminic acid synthetase  44.48 
 
 		 343 aa  290  3e-77  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.397069  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1391  N-acetylneuraminate synthase  42.3 
 
 		 337 aa  274  2.0000000000000002e-72  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0754706 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0643  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  38.28 
 
 		 342 aa  221  1.9999999999999999e-56  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0420  N-acetylneuraminate synthase  32.84 
 
 		 349 aa  206  4e-52  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0131  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  37.01 
 
 		 351 aa  206  4e-52  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    unclonable  0.00000000000000538819 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1586  N-acetylneuraminate synthase  36.51 
 
 		 347 aa  206  5e-52  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2303  general stress protein 14 (GSP14)  36.14 
 
 		 333 aa  205  8e-52  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16950  N-acetylneuraminate synthase  35.74 
 
 		 331 aa  203  5e-51  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0506  N-acetylneuraminate synthase  34.95 
 
 		 348 aa  202  9e-51  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0412  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  36.7 
 
 		 338 aa  200  3e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.336797 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0562  N-acetylneuraminate synthase  35.42 
 
 		 333 aa  200  3e-50  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1516  N-acetylneuraminic acid synthetase  34.89 
 
 		 334 aa  198  1.0000000000000001e-49  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.350916  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0756  N-acetylneuraminate synthase  33.23 
 
 		 337 aa  197  3e-49  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.556038 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2641  N-acetylneuraminate synthase  33.33 
 
 		 330 aa  196  4.0000000000000005e-49  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0385  N-acetylneuraminic acid synthetase  34.57 
 
 		 334 aa  196  5.000000000000001e-49  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1235  flagellin modification protein PtmC, putative N-acetylneuraminic acid synthetase  35.91 
 
 		 334 aa  196  7e-49  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.000000147783  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3405  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  36.22 
 
 		 358 aa  196  7e-49  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0527  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  34.58 
 
 		 335 aa  192  7e-48  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.783884  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12451  sialic acid synthase  34.44 
 
 		 337 aa  189  7e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0694401  hitchhiker  0.00593947 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0595  N-acetylneuraminate synthase  34.26 
 
 		 333 aa  187  2e-46  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3011  putative sialic acid synthase NeuB  34.14 
 
 		 346 aa  187  3e-46  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.62069  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1970  polysaccharide biosynthesis protein, putative  32.93 
 
 		 350 aa  186  4e-46  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.237085  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0151  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  33.72 
 
 		 349 aa  185  1.0000000000000001e-45  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2369  N-acetylneuraminate synthase  35.1 
 
 		 348 aa  184  2.0000000000000003e-45  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0796873  normal  0.0101527 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3980  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  33.92 
 
 		 350 aa  183  5.0000000000000004e-45  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3256  N-acetylneuraminate synthase  34.43 
 
 		 351 aa  179  4e-44  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4086  N-acetylneuraminate synthase  33.14 
 
 		 363 aa  180  4e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1161  N-acetyl neuramic acid synthetase NeuB  32.5 
 
 		 341 aa  177  3e-43  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1458  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  32.09 
 
 		 334 aa  176  6e-43  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4942  N-acetylneuraminate synthase  35.01 
 
 		 748 aa  176  7e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3726  N-acetylneuraminic acid synthase domain  33.23 
 
 		 338 aa  175  9.999999999999999e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1664  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  33.64 
 
 		 344 aa  174  1.9999999999999998e-42  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1534  N-acetylneuraminate synthase  34.28 
 
 		 332 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3232  polysialic acid capsule biosynthesis sialic acid synthase NeuB  33.94 
 
 		 346 aa  174  2.9999999999999996e-42  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0818  N-acetylneuraminic acid condensing enzyme  32.14 
 
 		 340 aa  173  5e-42  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0662  N-acetylneuraminate synthase  45.6 
 
 		 194 aa  173  5e-42  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.116223  normal  0.934611 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1456  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  32.95 
 
 		 354 aa  173  5e-42  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4334  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  32.34 
 
 		 356 aa  172  6.999999999999999e-42  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.204017  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1845  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  33.73 
 
 		 344 aa  172  7.999999999999999e-42  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0364  N-acetylneuraminic acid synthase domain-containing protein  31.34 
 
 		 358 aa  171  2e-41  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.431709  normal  0.842753 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0631  N-acetylneuraminate synthase  32.49 
 
 		 359 aa  170  3e-41  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1580  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  31.95 
 
 		 749 aa  170  4e-41  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0789  N-acetylneuraminic acid condensing enzyme  32.44 
 
 		 340 aa  169  6e-41  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0367  N-acetylneuraminate synthase  34.45 
 
 		 360 aa  166  5.9999999999999996e-40  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3318  Sialic acid synthase-like protein  34.51 
 
 		 672 aa  165  1.0000000000000001e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.785348  normal  0.206825 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1582  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  30.7 
 
 		 359 aa  165  1.0000000000000001e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.807685  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1832  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  30.56 
 
 		 394 aa  164  2.0000000000000002e-39  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001800  N-acetylneuraminate synthase  32.73 
 
 		 357 aa  164  2.0000000000000002e-39  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3100  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  31.14 
 
 		 357 aa  164  3e-39  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2407  N-acetylneuraminate synthase  32.93 
 
 		 500 aa  163  4.0000000000000004e-39  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.378262  normal  0.284066 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3448  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  33.14 
 
 		 749 aa  163  5.0000000000000005e-39  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2668  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  33.14 
 
 		 749 aa  163  5.0000000000000005e-39  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2977  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  33.13 
 
 		 334 aa  161  1e-38  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0049  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  31.14 
 
 		 357 aa  162  1e-38  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3121  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  33.13 
 
 		 334 aa  161  1e-38  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1894  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  34.72 
 
 		 354 aa  160  4e-38  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01101  sialic acid synthase  31.1 
 
 		 335 aa  160  4e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.252845 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2635  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  33.53 
 
 		 352 aa  159  5e-38  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>