153 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_0797 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010803  Clim_0797  N-acetylneuraminate synthase  100 
 
 
289 aa  601  1.0000000000000001e-171  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1274  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  83.33 
 
 
314 aa  507  1e-143  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1574  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  81.94 
 
 
289 aa  499  1e-140  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000030231  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1072  sialic acid synthase  79.24 
 
 
293 aa  490  9.999999999999999e-139  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1187  N-acetylneuraminate synthase  77.85 
 
 
289 aa  481  1e-135  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0910  N-acetylneuraminate synthase  76.74 
 
 
289 aa  472  1e-132  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.497689  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0346  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  66.9 
 
 
313 aa  402  1e-111  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.417711 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3318  Sialic acid synthase-like protein  60.14 
 
 
672 aa  359  3e-98  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.785348  normal  0.206825 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0010  n-acetylneuraminate synthase  58.89 
 
 
303 aa  353  2e-96  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.124512  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0843  N-acetylneuraminate synthase  57.79 
 
 
296 aa  330  1e-89  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2841  N-acetylneuraminate synthase  55.59 
 
 
300 aa  306  3e-82  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.893161  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2713  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  48.9 
 
 
310 aa  249  5e-65  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.314547  normal  0.787059 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1346  N-acetylneuraminate synthase  44.16 
 
 
289 aa  225  6e-58  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.107531  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0756  N-acetylneuraminate synthase  40.07 
 
 
337 aa  221  9.999999999999999e-57  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.556038 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0420  N-acetylneuraminate synthase  37.29 
 
 
349 aa  212  4.9999999999999996e-54  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0506  N-acetylneuraminate synthase  39.18 
 
 
348 aa  210  3e-53  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1832  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  38.73 
 
 
394 aa  208  9e-53  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2303  general stress protein 14 (GSP14)  38.13 
 
 
333 aa  204  1e-51  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16950  N-acetylneuraminate synthase  39.01 
 
 
331 aa  201  1.9999999999999998e-50  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2331  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  37.77 
 
 
332 aa  198  7e-50  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.206004 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2641  N-acetylneuraminate synthase  37.97 
 
 
330 aa  198  7.999999999999999e-50  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4942  N-acetylneuraminate synthase  39.79 
 
 
748 aa  198  1.0000000000000001e-49  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00670  sialic acid synthase  36.69 
 
 
333 aa  194  2e-48  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1586  N-acetylneuraminate synthase  36.49 
 
 
347 aa  193  3e-48  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1580  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  39.58 
 
 
749 aa  192  6e-48  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2668  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  39.66 
 
 
749 aa  190  2e-47  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0527  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  38.21 
 
 
335 aa  190  2e-47  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.783884  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3448  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  39.66 
 
 
749 aa  190  2e-47  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2977  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  36.07 
 
 
334 aa  188  7e-47  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3121  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  36.07 
 
 
334 aa  188  7e-47  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1970  polysaccharide biosynthesis protein, putative  38.85 
 
 
350 aa  187  1e-46  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.237085  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0643  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  40.15 
 
 
342 aa  187  2e-46  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1235  flagellin modification protein PtmC, putative N-acetylneuraminic acid synthetase  34.64 
 
 
334 aa  187  2e-46  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.000000147783  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0595  N-acetylneuraminate synthase  36.67 
 
 
333 aa  184  1.0000000000000001e-45  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0774  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  37.46 
 
 
354 aa  184  1.0000000000000001e-45  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.453022  normal  0.512992 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1772  N-acetylneuraminate synthase  39.44 
 
 
350 aa  184  1.0000000000000001e-45  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0385  N-acetylneuraminic acid synthetase  35.69 
 
 
334 aa  182  5.0000000000000004e-45  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1516  N-acetylneuraminic acid synthetase  35.32 
 
 
334 aa  182  7e-45  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.350916  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1161  N-acetyl neuramic acid synthetase NeuB  36.96 
 
 
341 aa  181  1e-44  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01550  N-acetylneuraminate synthase  40 
 
 
349 aa  176  5e-43  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.0492033 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1458  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  35.36 
 
 
334 aa  176  5e-43  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3232  polysialic acid capsule biosynthesis sialic acid synthase NeuB  34.51 
 
 
346 aa  176  5e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1248  N-acetylneuraminate synthase  38.06 
 
 
348 aa  175  7e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.862744  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2590  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  33.33 
 
 
338 aa  174  9.999999999999999e-43  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00139935 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2221  N-acetylneuraminate synthase  36.68 
 
 
761 aa  174  1.9999999999999998e-42  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12451  sialic acid synthase  36.69 
 
 
337 aa  173  2.9999999999999996e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0694401  hitchhiker  0.00593947 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0019  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  36.01 
 
 
350 aa  173  2.9999999999999996e-42  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1523  N-acetylneuraminate synthase  39.38 
 
 
350 aa  172  6.999999999999999e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.242955  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3027  pseudaminic acid synthase  37.82 
 
 
349 aa  171  1e-41  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2229  N-acetylneuraminate synthase  34.25 
 
 
350 aa  171  1e-41  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2213  pseudaminic acid synthase  35.91 
 
 
345 aa  169  4e-41  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3208  pseudaminic acid synthase  38.05 
 
 
351 aa  169  5e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0458  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  36.81 
 
 
762 aa  169  7e-41  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.147767  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1304  N-acetylneuraminate synthase  37.13 
 
 
350 aa  168  8e-41  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.583965  normal  0.823534 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1576  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  37.81 
 
 
350 aa  167  2e-40  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1289  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  36.64 
 
 
350 aa  165  8e-40  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0789  N-acetylneuraminic acid condensing enzyme  33.93 
 
 
340 aa  164  1.0000000000000001e-39  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0210  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  40.43 
 
 
349 aa  165  1.0000000000000001e-39  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.803069  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0562  N-acetylneuraminate synthase  34.17 
 
 
333 aa  164  1.0000000000000001e-39  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3980  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  36.18 
 
 
350 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0631  N-acetylneuraminate synthase  34.97 
 
 
359 aa  164  1.0000000000000001e-39  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0818  N-acetylneuraminic acid condensing enzyme  33.81 
 
 
340 aa  164  2.0000000000000002e-39  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2369  N-acetylneuraminate synthase  33.44 
 
 
348 aa  163  4.0000000000000004e-39  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0796873  normal  0.0101527 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0367  N-acetylneuraminate synthase  35.55 
 
 
360 aa  161  1e-38  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4086  N-acetylneuraminate synthase  33.97 
 
 
363 aa  161  1e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13043  sialic acid synthase  33.46 
 
 
338 aa  161  1e-38  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.276449  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2097  neuB protein  35.38 
 
 
352 aa  160  2e-38  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.268336  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3011  putative sialic acid synthase NeuB  32.48 
 
 
346 aa  159  4e-38  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.62069  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0647  antifreeze-like protein  35.96 
 
 
350 aa  159  7e-38  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.318568  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1845  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  35.69 
 
 
344 aa  158  8e-38  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1329  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  32.66 
 
 
358 aa  158  1e-37  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3256  N-acetylneuraminate synthase  34.04 
 
 
351 aa  157  2e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3076  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  36.64 
 
 
355 aa  157  2e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1969  N-acetylneuraminate synthase  37.2 
 
 
364 aa  156  4e-37  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0891356  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1391  N-acetylneuraminate synthase  35.38 
 
 
337 aa  155  1e-36  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0754706 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2327  N-acetylneuraminate synthase  34.93 
 
 
350 aa  154  1e-36  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.463819 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1724  pseudaminic acid synthase  36.58 
 
 
349 aa  154  1e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000954999 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3405  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  30.43 
 
 
358 aa  154  2e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001800  N-acetylneuraminate synthase  31.48 
 
 
357 aa  154  2e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1582  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  31.49 
 
 
359 aa  154  2e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.807685  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1534  N-acetylneuraminate synthase  32.82 
 
 
332 aa  152  5.9999999999999996e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0408  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  34.75 
 
 
292 aa  150  2e-35  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0412  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  34.18 
 
 
338 aa  149  4e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.336797 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0660  N-acetylneuraminate synthase  32 
 
 
349 aa  149  4e-35  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.297547  normal  0.963703 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02907  NeuB:Antifreeze-like protein  32.27 
 
 
347 aa  149  4e-35  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.269494  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1196  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  37.13 
 
 
350 aa  149  5e-35  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1456  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  33.1 
 
 
354 aa  149  5e-35  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0151  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  32.76 
 
 
349 aa  149  5e-35  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3100  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  30.69 
 
 
357 aa  149  5e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0131  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  32.53 
 
 
351 aa  149  6e-35  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    unclonable  0.00000000000000538819 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0254  N-acetylneuraminic acid synthase  31.15 
 
 
357 aa  148  9e-35  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0169  N-acetylneuraminic acid synthase  31.15 
 
 
357 aa  148  9e-35  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.922982  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0049  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  32.46 
 
 
357 aa  148  1.0000000000000001e-34  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1974  N-acetylneuraminate synthase  38.29 
 
 
305 aa  147  3e-34  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01101  sialic acid synthase  32.5 
 
 
335 aa  146  4.0000000000000006e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.252845 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3942  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  36.86 
 
 
349 aa  145  6e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0693356 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4269  pseudaminic acid synthase  36.63 
 
 
351 aa  145  7.0000000000000006e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.948479 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3098  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  38.1 
 
 
347 aa  145  1e-33  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.298576  normal  0.187894 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3008  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  40.07 
 
 
350 aa  144  1e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2758  N-acetylneuraminate synthase  37.16 
 
 
348 aa  144  2e-33  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>