153 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_3256 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007519  Dde_3256  N-acetylneuraminate synthase  100 
 
 
351 aa  724    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1845  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  71.22 
 
 
344 aa  522  1e-147  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4334  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  59.35 
 
 
356 aa  432  1e-120  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.204017  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0305  N-acetylneuraminic acid synthase domain-containing protein  54.73 
 
 
347 aa  375  1e-103  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.351224  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1158  sialic acid synthase  50.72 
 
 
346 aa  356  3.9999999999999996e-97  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  decreased coverage  0.00143382  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08721  ialic acid synthase  48.38 
 
 
342 aa  348  1e-94  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.938537  hitchhiker  0.00000164183 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0756  N-acetylneuraminate synthase  40.24 
 
 
337 aa  223  3e-57  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.556038 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0527  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  40.62 
 
 
335 aa  219  6e-56  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.783884  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2229  N-acetylneuraminate synthase  34.88 
 
 
350 aa  213  4.9999999999999996e-54  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0647  antifreeze-like protein  37.1 
 
 
350 aa  211  1e-53  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.318568  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2977  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  39.69 
 
 
334 aa  211  1e-53  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3121  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  39.69 
 
 
334 aa  211  1e-53  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1516  N-acetylneuraminic acid synthetase  36.96 
 
 
334 aa  210  2e-53  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.350916  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2641  N-acetylneuraminate synthase  39.2 
 
 
330 aa  210  3e-53  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0420  N-acetylneuraminate synthase  34.84 
 
 
349 aa  208  9e-53  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2331  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  37.73 
 
 
332 aa  207  2e-52  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.206004 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0385  N-acetylneuraminic acid synthetase  36.89 
 
 
334 aa  207  2e-52  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00670  sialic acid synthase  37.8 
 
 
333 aa  207  3e-52  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3208  pseudaminic acid synthase  35.69 
 
 
351 aa  206  5e-52  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0506  N-acetylneuraminate synthase  35.63 
 
 
348 aa  206  6e-52  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1248  N-acetylneuraminate synthase  34.58 
 
 
348 aa  206  7e-52  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.862744  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1969  N-acetylneuraminate synthase  38.78 
 
 
364 aa  204  1e-51  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0891356  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1196  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  37.57 
 
 
350 aa  204  2e-51  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1235  flagellin modification protein PtmC, putative N-acetylneuraminic acid synthetase  36.5 
 
 
334 aa  204  2e-51  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.000000147783  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2303  general stress protein 14 (GSP14)  36.39 
 
 
333 aa  204  2e-51  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2097  neuB protein  34.69 
 
 
352 aa  201  9.999999999999999e-51  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.268336  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16950  N-acetylneuraminate synthase  36.14 
 
 
331 aa  199  3.9999999999999996e-50  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1458  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  34.86 
 
 
334 aa  197  2.0000000000000003e-49  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1580  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  36.01 
 
 
749 aa  197  2.0000000000000003e-49  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1391  N-acetylneuraminate synthase  37.43 
 
 
337 aa  196  3e-49  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0754706 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2590  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  37.69 
 
 
338 aa  197  3e-49  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00139935 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1161  N-acetyl neuramic acid synthetase NeuB  39.76 
 
 
341 aa  196  4.0000000000000005e-49  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3011  putative sialic acid synthase NeuB  35.1 
 
 
346 aa  196  4.0000000000000005e-49  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.62069  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0412  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  37.5 
 
 
338 aa  196  6e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.336797 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12451  sialic acid synthase  36.78 
 
 
337 aa  195  1e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0694401  hitchhiker  0.00593947 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1523  N-acetylneuraminate synthase  38.33 
 
 
350 aa  194  3e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.242955  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1534  N-acetylneuraminate synthase  37.27 
 
 
332 aa  194  3e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1586  N-acetylneuraminate synthase  33.04 
 
 
347 aa  194  3e-48  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0660  N-acetylneuraminate synthase  33.52 
 
 
349 aa  192  5e-48  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.297547  normal  0.963703 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0595  N-acetylneuraminate synthase  34.76 
 
 
333 aa  192  6e-48  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0774  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  35.24 
 
 
354 aa  192  1e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.453022  normal  0.512992 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0151  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  36.89 
 
 
349 aa  191  2e-47  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1724  pseudaminic acid synthase  36.72 
 
 
349 aa  190  2.9999999999999997e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000954999 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0562  N-acetylneuraminate synthase  37.35 
 
 
333 aa  190  2.9999999999999997e-47  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1772  N-acetylneuraminate synthase  33.72 
 
 
350 aa  190  2.9999999999999997e-47  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3232  polysialic acid capsule biosynthesis sialic acid synthase NeuB  35.78 
 
 
346 aa  190  2.9999999999999997e-47  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0631  N-acetylneuraminate synthase  37.14 
 
 
359 aa  189  5.999999999999999e-47  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3076  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  37.18 
 
 
355 aa  189  5.999999999999999e-47  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2327  N-acetylneuraminate synthase  35.48 
 
 
350 aa  189  8e-47  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.463819 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3027  pseudaminic acid synthase  33.93 
 
 
349 aa  189  8e-47  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3942  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  33.81 
 
 
349 aa  188  1e-46  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0693356 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1329  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  36.23 
 
 
358 aa  187  2e-46  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0818  N-acetylneuraminic acid condensing enzyme  35.4 
 
 
340 aa  186  4e-46  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4303  N-acetylneuraminate synthase  36.23 
 
 
361 aa  186  4e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1970  polysaccharide biosynthesis protein, putative  35.51 
 
 
350 aa  185  8e-46  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.237085  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1304  N-acetylneuraminate synthase  31.91 
 
 
350 aa  185  8e-46  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.583965  normal  0.823534 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01550  N-acetylneuraminate synthase  37.32 
 
 
349 aa  184  2.0000000000000003e-45  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.0492033 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0587  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  35.47 
 
 
349 aa  181  1e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.518416  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0789  N-acetylneuraminic acid condensing enzyme  34.51 
 
 
340 aa  181  2e-44  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1456  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  36.12 
 
 
354 aa  181  2e-44  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1576  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  38.42 
 
 
350 aa  181  2e-44  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2369  N-acetylneuraminate synthase  35.54 
 
 
348 aa  181  2e-44  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0796873  normal  0.0101527 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0019  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  35.69 
 
 
350 aa  181  2e-44  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3707  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  37.64 
 
 
350 aa  179  5.999999999999999e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.170147  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3098  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  38.3 
 
 
347 aa  179  7e-44  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.298576  normal  0.187894 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1289  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  32.38 
 
 
350 aa  177  3e-43  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01101  sialic acid synthase  34.44 
 
 
335 aa  176  4e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.252845 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3100  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  35.29 
 
 
357 aa  176  4e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2425  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  35.33 
 
 
345 aa  176  7e-43  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.149839  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1582  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  35.76 
 
 
359 aa  176  8e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.807685  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4942  N-acetylneuraminate synthase  33.53 
 
 
748 aa  174  9.999999999999999e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0254  N-acetylneuraminic acid synthase  35.15 
 
 
357 aa  174  1.9999999999999998e-42  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0169  N-acetylneuraminic acid synthase  35.15 
 
 
357 aa  174  1.9999999999999998e-42  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.922982  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1890  N-acetylneuraminate synthase  33.63 
 
 
356 aa  174  1.9999999999999998e-42  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.00000120962  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2396  NeuB, antifreeze-like protein  35.69 
 
 
371 aa  174  2.9999999999999996e-42  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.503393 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3980  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  35.47 
 
 
350 aa  174  2.9999999999999996e-42  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0210  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  34.19 
 
 
349 aa  173  2.9999999999999996e-42  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.803069  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4086  N-acetylneuraminate synthase  36.44 
 
 
363 aa  173  2.9999999999999996e-42  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3405  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  34.35 
 
 
358 aa  173  3.9999999999999995e-42  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1832  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  32.65 
 
 
394 aa  172  1e-41  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1556  sialic acid synthase  33.73 
 
 
340 aa  171  2e-41  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001800  N-acetylneuraminate synthase  34.85 
 
 
357 aa  170  3e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4269  pseudaminic acid synthase  34.28 
 
 
351 aa  170  4e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.948479 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0010  n-acetylneuraminate synthase  36.55 
 
 
303 aa  169  5e-41  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.124512  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0643  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  33.23 
 
 
342 aa  169  5e-41  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3008  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  36.34 
 
 
350 aa  169  6e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1512  N-acetylneuraminic acid synthetase  33.23 
 
 
343 aa  167  2.9999999999999998e-40  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3556  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  35.91 
 
 
358 aa  167  4e-40  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.434108 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14081  sialic acid synthase  33.85 
 
 
341 aa  166  4e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0131  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  34.52 
 
 
351 aa  166  4e-40  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    unclonable  0.00000000000000538819 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14241  sialic acid synthase  31.27 
 
 
356 aa  166  5e-40  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.532641  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3113  N-acetylneuraminic acid synthase-like protein  34.43 
 
 
359 aa  166  5.9999999999999996e-40  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3726  N-acetylneuraminic acid synthase domain  36.04 
 
 
338 aa  166  6.9999999999999995e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2213  pseudaminic acid synthase  33.63 
 
 
345 aa  163  3e-39  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0169  N-acetylneuraminic acid synthetase  32.64 
 
 
344 aa  163  4.0000000000000004e-39  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0138828  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0049  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  34 
 
 
357 aa  163  4.0000000000000004e-39  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2758  N-acetylneuraminate synthase  33.72 
 
 
348 aa  162  9e-39  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1204  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  35.73 
 
 
346 aa  162  1e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.6921 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2635  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  34.14 
 
 
352 aa  161  2e-38  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0565  spore coat polysaccharide biosynthesis protein SpsE  35.19 
 
 
342 aa  161  2e-38  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>