153 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_0527 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011060  Ppha_0527  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  100 
 
 
335 aa  690    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.783884  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2303  general stress protein 14 (GSP14)  63.66 
 
 
333 aa  449  1e-125  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1516  N-acetylneuraminic acid synthetase  59.82 
 
 
334 aa  424  1e-118  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.350916  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1235  flagellin modification protein PtmC, putative N-acetylneuraminic acid synthetase  58.31 
 
 
334 aa  425  1e-118  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.000000147783  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16950  N-acetylneuraminate synthase  60.42 
 
 
331 aa  421  1e-116  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0385  N-acetylneuraminic acid synthetase  59.52 
 
 
334 aa  419  1e-116  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0595  N-acetylneuraminate synthase  61.93 
 
 
333 aa  414  1e-114  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2641  N-acetylneuraminate synthase  59.04 
 
 
330 aa  412  1e-114  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0562  N-acetylneuraminate synthase  60.79 
 
 
333 aa  401  1e-111  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2590  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  59.58 
 
 
338 aa  399  9.999999999999999e-111  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00139935 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0756  N-acetylneuraminate synthase  58.21 
 
 
337 aa  390  1e-107  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.556038 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12451  sialic acid synthase  54.35 
 
 
337 aa  384  1e-105  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0694401  hitchhiker  0.00593947 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2331  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  56.5 
 
 
332 aa  367  1e-100  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.206004 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2977  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  56.59 
 
 
334 aa  366  1e-100  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00670  sialic acid synthase  56.59 
 
 
333 aa  365  1e-100  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3121  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  56.59 
 
 
334 aa  366  1e-100  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1458  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  53.66 
 
 
334 aa  358  6e-98  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0420  N-acetylneuraminate synthase  54.24 
 
 
349 aa  355  3.9999999999999996e-97  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0169  N-acetylneuraminic acid synthase  52.82 
 
 
357 aa  350  2e-95  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.922982  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0254  N-acetylneuraminic acid synthase  52.82 
 
 
357 aa  350  2e-95  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001800  N-acetylneuraminate synthase  52.26 
 
 
357 aa  350  2e-95  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4086  N-acetylneuraminate synthase  50.98 
 
 
363 aa  345  4e-94  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0049  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  51.13 
 
 
357 aa  344  1e-93  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1161  N-acetyl neuramic acid synthetase NeuB  52.44 
 
 
341 aa  342  5e-93  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3100  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  51.13 
 
 
357 aa  342  5e-93  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1582  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  49.3 
 
 
359 aa  332  8e-90  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.807685  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3011  putative sialic acid synthase NeuB  49.55 
 
 
346 aa  329  3e-89  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.62069  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3232  polysialic acid capsule biosynthesis sialic acid synthase NeuB  48.64 
 
 
346 aa  330  3e-89  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1586  N-acetylneuraminate synthase  50 
 
 
347 aa  322  5e-87  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0631  N-acetylneuraminate synthase  47.59 
 
 
359 aa  319  3.9999999999999996e-86  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0506  N-acetylneuraminate synthase  50.47 
 
 
348 aa  316  3e-85  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2396  NeuB, antifreeze-like protein  51.68 
 
 
371 aa  308  8e-83  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.503393 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1576  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  49.85 
 
 
350 aa  299  4e-80  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3405  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  47.26 
 
 
358 aa  298  1e-79  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1456  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  50.3 
 
 
354 aa  296  2e-79  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0818  N-acetylneuraminic acid condensing enzyme  47.32 
 
 
340 aa  290  3e-77  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0367  N-acetylneuraminate synthase  45.48 
 
 
360 aa  289  5.0000000000000004e-77  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0789  N-acetylneuraminic acid condensing enzyme  46.69 
 
 
340 aa  288  1e-76  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3980  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  49.1 
 
 
350 aa  284  2.0000000000000002e-75  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14081  sialic acid synthase  44.14 
 
 
341 aa  283  2.0000000000000002e-75  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0151  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  48.89 
 
 
349 aa  276  2e-73  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01101  sialic acid synthase  42.6 
 
 
335 aa  273  3e-72  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.252845 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4853  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  44.18 
 
 
352 aa  270  2e-71  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.31192  normal  0.276031 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0019  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  46.42 
 
 
350 aa  263  3e-69  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0643  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  43.71 
 
 
342 aa  260  2e-68  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1970  polysaccharide biosynthesis protein, putative  41.57 
 
 
350 aa  252  5.000000000000001e-66  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.237085  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1391  N-acetylneuraminate synthase  39.94 
 
 
337 aa  240  2.9999999999999997e-62  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0754706 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1772  N-acetylneuraminate synthase  41.27 
 
 
350 aa  239  2.9999999999999997e-62  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1289  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  43.12 
 
 
350 aa  238  1e-61  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0774  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  42.33 
 
 
354 aa  237  2e-61  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.453022  normal  0.512992 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1832  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  40.82 
 
 
394 aa  236  4e-61  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0131  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  38.1 
 
 
351 aa  228  9e-59  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    unclonable  0.00000000000000538819 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13043  sialic acid synthase  38.08 
 
 
338 aa  226  5.0000000000000005e-58  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.276449  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3318  Sialic acid synthase-like protein  43.57 
 
 
672 aa  226  6e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.785348  normal  0.206825 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4942  N-acetylneuraminate synthase  39.21 
 
 
748 aa  224  2e-57  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1845  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  40.55 
 
 
344 aa  224  2e-57  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0412  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  38.86 
 
 
338 aa  222  7e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.336797 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1580  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  38.6 
 
 
749 aa  221  9.999999999999999e-57  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1248  N-acetylneuraminate synthase  39.63 
 
 
348 aa  221  1.9999999999999999e-56  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.862744  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2327  N-acetylneuraminate synthase  39.81 
 
 
350 aa  219  5e-56  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.463819 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3256  N-acetylneuraminate synthase  40.62 
 
 
351 aa  219  6e-56  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1912  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  38.89 
 
 
365 aa  219  6e-56  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000713145 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3726  N-acetylneuraminic acid synthase domain  38.86 
 
 
338 aa  218  2e-55  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2229  N-acetylneuraminate synthase  36.88 
 
 
350 aa  217  2e-55  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3027  pseudaminic acid synthase  38.91 
 
 
349 aa  215  9.999999999999999e-55  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0010  n-acetylneuraminate synthase  40.07 
 
 
303 aa  214  1.9999999999999998e-54  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.124512  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4334  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  38.07 
 
 
356 aa  214  1.9999999999999998e-54  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.204017  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2369  N-acetylneuraminate synthase  39.52 
 
 
348 aa  212  7e-54  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0796873  normal  0.0101527 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3448  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  38.48 
 
 
749 aa  211  1e-53  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2668  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  38.48 
 
 
749 aa  211  1e-53  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2635  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  37.72 
 
 
352 aa  211  1e-53  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1534  N-acetylneuraminate synthase  38.44 
 
 
332 aa  210  3e-53  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1512  N-acetylneuraminic acid synthetase  37.54 
 
 
343 aa  209  6e-53  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1556  sialic acid synthase  39.02 
 
 
340 aa  208  9e-53  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1890  N-acetylneuraminate synthase  37.76 
 
 
356 aa  207  2e-52  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.00000120962  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01550  N-acetylneuraminate synthase  38.65 
 
 
349 aa  206  3e-52  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.0492033 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0647  antifreeze-like protein  38.86 
 
 
350 aa  206  5e-52  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.318568  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0565  spore coat polysaccharide biosynthesis protein SpsE  37.39 
 
 
342 aa  204  2e-51  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2097  neuB protein  38.12 
 
 
352 aa  202  8e-51  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.268336  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2221  N-acetylneuraminate synthase  38.68 
 
 
761 aa  202  8e-51  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1196  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  39.09 
 
 
350 aa  201  9.999999999999999e-51  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0910  N-acetylneuraminate synthase  38.79 
 
 
289 aa  201  1.9999999999999998e-50  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.497689  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1894  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  36.72 
 
 
354 aa  200  3e-50  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2213  pseudaminic acid synthase  35.14 
 
 
345 aa  199  5e-50  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1304  N-acetylneuraminate synthase  37.03 
 
 
350 aa  198  9e-50  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.583965  normal  0.823534 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1969  N-acetylneuraminate synthase  38.37 
 
 
364 aa  198  1.0000000000000001e-49  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0891356  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2425  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  35.28 
 
 
345 aa  197  2.0000000000000003e-49  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.149839  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3556  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  38.97 
 
 
358 aa  197  2.0000000000000003e-49  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.434108 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0843  N-acetylneuraminate synthase  41.91 
 
 
296 aa  197  2.0000000000000003e-49  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08721  ialic acid synthase  35.06 
 
 
342 aa  197  2.0000000000000003e-49  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.938537  hitchhiker  0.00000164183 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1274  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  38.3 
 
 
314 aa  196  5.000000000000001e-49  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3076  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  38.04 
 
 
355 aa  196  6e-49  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2407  N-acetylneuraminate synthase  36.6 
 
 
500 aa  195  8.000000000000001e-49  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.378262  normal  0.284066 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1329  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  34.36 
 
 
358 aa  195  8.000000000000001e-49  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0587  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  36.53 
 
 
349 aa  193  3e-48  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.518416  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02907  NeuB:Antifreeze-like protein  35.33 
 
 
347 aa  193  3e-48  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.269494  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0169  N-acetylneuraminic acid synthetase  35.37 
 
 
344 aa  192  7e-48  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0138828  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0660  N-acetylneuraminate synthase  36.08 
 
 
349 aa  192  8e-48  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.297547  normal  0.963703 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1523  N-acetylneuraminate synthase  37.65 
 
 
350 aa  192  9e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.242955  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3942  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  36.7 
 
 
349 aa  192  1e-47  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0693356 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>