153 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_2331 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008700  Sama_2331  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  100 
 
 		 332 aa  681    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.206004 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00670  sialic acid synthase  73.33 
 
 		 333 aa  516  1.0000000000000001e-145  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2977  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  70 
 
 		 334 aa  478  1e-134  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3121  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  70 
 
 		 334 aa  478  1e-134  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2303  general stress protein 14 (GSP14)  59.82 
 
 		 333 aa  396  1e-109  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0595  N-acetylneuraminate synthase  58.51 
 
 		 333 aa  378  1e-104  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16950  N-acetylneuraminate synthase  58.48 
 
 		 331 aa  380  1e-104  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0527  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  56.5 
 
 		 335 aa  367  1e-100  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.783884  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0756  N-acetylneuraminate synthase  56.93 
 
 		 337 aa  362  4e-99  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.556038 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2641  N-acetylneuraminate synthase  55.42 
 
 		 330 aa  362  7.0000000000000005e-99  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0420  N-acetylneuraminate synthase  52.13 
 
 		 349 aa  341  8e-93  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1235  flagellin modification protein PtmC, putative N-acetylneuraminic acid synthetase  52.25 
 
 		 334 aa  341  1e-92  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.000000147783  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2590  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  52.12 
 
 		 338 aa  338  5.9999999999999996e-92  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00139935 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0506  N-acetylneuraminate synthase  55.06 
 
 		 348 aa  336  3.9999999999999995e-91  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1458  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  51.2 
 
 		 334 aa  331  1e-89  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0562  N-acetylneuraminate synthase  51.81 
 
 		 333 aa  327  3e-88  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1516  N-acetylneuraminic acid synthetase  50.45 
 
 		 334 aa  326  4.0000000000000003e-88  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.350916  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0385  N-acetylneuraminic acid synthetase  50.15 
 
 		 334 aa  324  1e-87  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1586  N-acetylneuraminate synthase  51.06 
 
 		 347 aa  310  2e-83  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12451  sialic acid synthase  47.71 
 
 		 337 aa  306  5.0000000000000004e-82  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0694401  hitchhiker  0.00593947 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0631  N-acetylneuraminate synthase  48.33 
 
 		 359 aa  302  4.0000000000000003e-81  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1161  N-acetyl neuramic acid synthetase NeuB  46.81 
 
 		 341 aa  300  2e-80  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001800  N-acetylneuraminate synthase  49.01 
 
 		 357 aa  300  2e-80  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3011  putative sialic acid synthase NeuB  47.02 
 
 		 346 aa  300  3e-80  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.62069  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3232  polysialic acid capsule biosynthesis sialic acid synthase NeuB  44.94 
 
 		 346 aa  296  4e-79  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0169  N-acetylneuraminic acid synthase  48.45 
 
 		 357 aa  295  1e-78  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.922982  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0254  N-acetylneuraminic acid synthase  48.45 
 
 		 357 aa  295  1e-78  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1582  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  47.77 
 
 		 359 aa  293  3e-78  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.807685  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3100  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  47.04 
 
 		 357 aa  292  7e-78  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0049  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  47.04 
 
 		 357 aa  288  9e-77  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0818  N-acetylneuraminic acid condensing enzyme  47.72 
 
 		 340 aa  282  5.000000000000001e-75  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4086  N-acetylneuraminate synthase  46.2 
 
 		 363 aa  278  1e-73  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3405  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  44.98 
 
 		 358 aa  277  2e-73  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0151  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  49.54 
 
 		 349 aa  276  4e-73  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0789  N-acetylneuraminic acid condensing enzyme  47.11 
 
 		 340 aa  276  5e-73  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2396  NeuB, antifreeze-like protein  45.79 
 
 		 371 aa  275  8e-73  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.503393 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1576  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  48.2 
 
 		 350 aa  272  6e-72  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0019  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  47.56 
 
 		 350 aa  268  7e-71  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0643  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  44.41 
 
 		 342 aa  264  1e-69  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3980  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  46.22 
 
 		 350 aa  262  6e-69  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0367  N-acetylneuraminate synthase  45.74 
 
 		 360 aa  262  6.999999999999999e-69  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1456  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  45.29 
 
 		 354 aa  258  1e-67  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14081  sialic acid synthase  43.58 
 
 		 341 aa  258  1e-67  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01101  sialic acid synthase  43.67 
 
 		 335 aa  253  3e-66  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.252845 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1890  N-acetylneuraminate synthase  40.8 
 
 		 356 aa  243  3e-63  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.00000120962  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0412  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  41.69 
 
 		 338 aa  238  8e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.336797 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2635  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  40.55 
 
 		 352 aa  238  8e-62  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1894  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  38.96 
 
 		 354 aa  230  2e-59  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4942  N-acetylneuraminate synthase  40.66 
 
 		 748 aa  229  7e-59  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4853  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  40.95 
 
 		 352 aa  228  9e-59  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.31192  normal  0.276031 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1970  polysaccharide biosynthesis protein, putative  39.76 
 
 		 350 aa  227  2e-58  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.237085  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1912  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  39.77 
 
 		 365 aa  224  2e-57  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000713145 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3726  N-acetylneuraminic acid synthase domain  40.73 
 
 		 338 aa  221  1.9999999999999999e-56  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2668  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  40.24 
 
 		 749 aa  217  2.9999999999999998e-55  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3448  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  40.24 
 
 		 749 aa  217  2.9999999999999998e-55  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1832  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  38.68 
 
 		 394 aa  215  9e-55  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1580  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  39.16 
 
 		 749 aa  212  7e-54  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0131  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  37.72 
 
 		 351 aa  209  8e-53  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    unclonable  0.00000000000000538819 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3256  N-acetylneuraminate synthase  37.73 
 
 		 351 aa  207  2e-52  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08721  ialic acid synthase  36 
 
 		 342 aa  206  5e-52  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.938537  hitchhiker  0.00000164183 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14241  sialic acid synthase  37.35 
 
 		 356 aa  205  7e-52  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.532641  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1845  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  39.44 
 
 		 344 aa  203  4e-51  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3318  Sialic acid synthase-like protein  42.05 
 
 		 672 aa  202  9e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.785348  normal  0.206825 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0010  n-acetylneuraminate synthase  39.15 
 
 		 303 aa  200  3e-50  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.124512  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1772  N-acetylneuraminate synthase  37.5 
 
 		 350 aa  199  5e-50  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0797  N-acetylneuraminate synthase  37.77 
 
 		 289 aa  198  7.999999999999999e-50  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2221  N-acetylneuraminate synthase  37.35 
 
 		 761 aa  196  3e-49  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1534  N-acetylneuraminate synthase  38.24 
 
 		 332 aa  196  6e-49  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0774  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  37 
 
 		 354 aa  196  6e-49  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.453022  normal  0.512992 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0910  N-acetylneuraminate synthase  38.87 
 
 		 289 aa  194  1e-48  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.497689  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0346  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  36.69 
 
 		 313 aa  194  2e-48  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.417711 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4334  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  36 
 
 		 356 aa  194  2e-48  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.204017  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1391  N-acetylneuraminate synthase  35.54 
 
 		 337 aa  193  4e-48  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0754706 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1248  N-acetylneuraminate synthase  36.59 
 
 		 348 aa  191  1e-47  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.862744  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1274  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  35.84 
 
 		 314 aa  189  5.999999999999999e-47  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2369  N-acetylneuraminate synthase  36.45 
 
 		 348 aa  188  1e-46  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0796873  normal  0.0101527 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0458  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  38.51 
 
 		 762 aa  186  6e-46  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.147767  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2229  N-acetylneuraminate synthase  33.33 
 
 		 350 aa  184  1.0000000000000001e-45  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0305  N-acetylneuraminic acid synthase domain-containing protein  35.6 
 
 		 347 aa  185  1.0000000000000001e-45  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.351224  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13043  sialic acid synthase  35.98 
 
 		 338 aa  181  2e-44  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.276449  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3208  pseudaminic acid synthase  34.14 
 
 		 351 aa  181  2e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1556  sialic acid synthase  36.75 
 
 		 340 aa  179  4e-44  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1512  N-acetylneuraminic acid synthetase  34.53 
 
 		 343 aa  177  2e-43  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1574  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  35.84 
 
 		 289 aa  177  2e-43  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000030231  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0084  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  33.13 
 
 		 349 aa  173  2.9999999999999996e-42  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.174225  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1072  sialic acid synthase  34.41 
 
 		 293 aa  173  3.9999999999999995e-42  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1523  N-acetylneuraminate synthase  34.85 
 
 		 350 aa  171  2e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.242955  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2327  N-acetylneuraminate synthase  33.74 
 
 		 350 aa  170  2e-41  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.463819 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01550  N-acetylneuraminate synthase  33.74 
 
 		 349 aa  170  2e-41  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0492033 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1289  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  34.23 
 
 		 350 aa  170  3e-41  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0587  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  34.04 
 
 		 349 aa  170  3e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.518416  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3027  pseudaminic acid synthase  33.75 
 
 		 349 aa  169  9e-41  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1187  N-acetylneuraminate synthase  33.45 
 
 		 289 aa  168  1e-40  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1158  sialic acid synthase  33.43 
 
 		 346 aa  168  1e-40  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  decreased coverage  0.00143382  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3564  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  35.67 
 
 		 343 aa  168  1e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3681  N-acetylneuraminate synthase  33.44 
 
 		 344 aa  167  2e-40  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1724  pseudaminic acid synthase  34.15 
 
 		 349 aa  166  5.9999999999999996e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000954999 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3076  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  34.94 
 
 		 355 aa  166  6.9999999999999995e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0440  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  33.84 
 
 		 342 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1974  N-acetylneuraminate synthase  38.69 
 
 		 305 aa  163  3e-39  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>