154 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_1140 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007498  Pcar_1140  polysaccharide biosynthesis protein, putative sialic acid synthase  100 
 
 
287 aa  595  1e-169  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0455  N-acetylneuraminate synthase  68.09 
 
 
286 aa  417  9.999999999999999e-116  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2958  N-acetylneuraminic acid synthase domain-containing protein  62.99 
 
 
286 aa  388  1e-107  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1405  N-acetylneuraminic acid synthase domain protein  62.41 
 
 
290 aa  389  1e-107  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3261  polysaccharide biosynthesis related-protein  62.77 
 
 
290 aa  385  1e-106  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0423  N-acetylneuraminate synthase  59.57 
 
 
288 aa  363  2e-99  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0614  N-acetylneuraminic acid synthase domain protein  53.23 
 
 
332 aa  348  4e-95  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.984154  normal  0.288463 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0756  N-acetylneuraminate synthase  38.13 
 
 
337 aa  157  2e-37  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.556038 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0643  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  36.4 
 
 
342 aa  155  8e-37  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1576  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  37.76 
 
 
350 aa  152  5e-36  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2641  N-acetylneuraminate synthase  33.83 
 
 
330 aa  145  7.0000000000000006e-34  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1586  N-acetylneuraminate synthase  34.53 
 
 
347 aa  145  9e-34  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1329  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  32.97 
 
 
358 aa  143  4e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0960  neuB family protein  34.35 
 
 
379 aa  141  9.999999999999999e-33  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16950  N-acetylneuraminate synthase  32.73 
 
 
331 aa  140  1.9999999999999998e-32  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0420  N-acetylneuraminate synthase  32.25 
 
 
349 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0506  N-acetylneuraminate synthase  33.09 
 
 
348 aa  135  5e-31  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1970  polysaccharide biosynthesis protein, putative  33.58 
 
 
350 aa  135  9.999999999999999e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.237085  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2097  neuB protein  35.78 
 
 
352 aa  134  9.999999999999999e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.268336  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01550  N-acetylneuraminate synthase  38.6 
 
 
349 aa  135  9.999999999999999e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.0492033 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0527  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  35.36 
 
 
335 aa  134  9.999999999999999e-31  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.783884  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1974  N-acetylneuraminate synthase  35.66 
 
 
305 aa  134  9.999999999999999e-31  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1235  flagellin modification protein PtmC, putative N-acetylneuraminic acid synthetase  33.22 
 
 
334 aa  131  1.0000000000000001e-29  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.000000147783  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12451  sialic acid synthase  33.21 
 
 
337 aa  131  1.0000000000000001e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0694401  hitchhiker  0.00593947 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1304  N-acetylneuraminate synthase  35.53 
 
 
350 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.583965  normal  0.823534 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3980  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  34.42 
 
 
350 aa  130  3e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1248  N-acetylneuraminate synthase  36.89 
 
 
348 aa  130  3e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.862744  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3208  pseudaminic acid synthase  31 
 
 
351 aa  129  5.0000000000000004e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2713  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  33.33 
 
 
310 aa  129  5.0000000000000004e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.314547  normal  0.787059 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4269  pseudaminic acid synthase  35.12 
 
 
351 aa  128  8.000000000000001e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.948479 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0660  N-acetylneuraminate synthase  33.63 
 
 
349 aa  128  1.0000000000000001e-28  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.297547  normal  0.963703 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0151  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  32.73 
 
 
349 aa  128  1.0000000000000001e-28  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0647  antifreeze-like protein  32 
 
 
350 aa  127  2.0000000000000002e-28  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.318568  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3318  Sialic acid synthase-like protein  35.79 
 
 
672 aa  127  2.0000000000000002e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.785348  normal  0.206825 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0562  N-acetylneuraminate synthase  33.33 
 
 
333 aa  127  3e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0131  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  30.6 
 
 
351 aa  126  3e-28  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    unclonable  0.00000000000000538819 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02907  NeuB:Antifreeze-like protein  34.36 
 
 
347 aa  126  4.0000000000000003e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.269494  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1456  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  34.44 
 
 
354 aa  126  5e-28  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3027  pseudaminic acid synthase  34.5 
 
 
349 aa  126  5e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2590  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  32.97 
 
 
338 aa  126  5e-28  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00139935 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2327  N-acetylneuraminate synthase  33.21 
 
 
350 aa  125  6e-28  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.463819 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4853  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  32.97 
 
 
352 aa  125  1e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.31192  normal  0.276031 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2977  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  33.22 
 
 
334 aa  124  2e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3121  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  33.22 
 
 
334 aa  124  2e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00670  sialic acid synthase  33.57 
 
 
333 aa  123  3e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1516  N-acetylneuraminic acid synthetase  33.94 
 
 
334 aa  122  7e-27  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.350916  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3098  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  35.78 
 
 
347 aa  122  7e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.298576  normal  0.187894 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2303  general stress protein 14 (GSP14)  32.12 
 
 
333 aa  122  7e-27  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0210  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  32.37 
 
 
349 aa  122  9e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.803069  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3405  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  33.09 
 
 
358 aa  121  9.999999999999999e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1391  N-acetylneuraminate synthase  35.19 
 
 
337 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0754706 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1458  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  34.18 
 
 
334 aa  119  4.9999999999999996e-26  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2331  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  31.69 
 
 
332 aa  119  4.9999999999999996e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.206004 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3113  N-acetylneuraminic acid synthase-like protein  30.22 
 
 
359 aa  119  6e-26  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1196  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  31.64 
 
 
350 aa  119  6e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1161  N-acetyl neuramic acid synthetase NeuB  33.48 
 
 
341 aa  118  9e-26  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13043  sialic acid synthase  32.6 
 
 
338 aa  118  9e-26  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.276449  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0818  N-acetylneuraminic acid condensing enzyme  33.33 
 
 
340 aa  118  9.999999999999999e-26  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0595  N-acetylneuraminate synthase  32.16 
 
 
333 aa  118  9.999999999999999e-26  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3008  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  32.2 
 
 
350 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4942  N-acetylneuraminate synthase  33.09 
 
 
748 aa  118  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2229  N-acetylneuraminate synthase  32.14 
 
 
350 aa  118  9.999999999999999e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0385  N-acetylneuraminic acid synthetase  33.58 
 
 
334 aa  118  9.999999999999999e-26  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3707  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  31.41 
 
 
350 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.170147  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3076  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  30.69 
 
 
355 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1969  N-acetylneuraminate synthase  34.38 
 
 
364 aa  117  1.9999999999999998e-25  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0891356  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0254  N-acetylneuraminic acid synthase  29.53 
 
 
357 aa  117  1.9999999999999998e-25  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4086  N-acetylneuraminate synthase  34.56 
 
 
363 aa  117  1.9999999999999998e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1204  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  30 
 
 
346 aa  117  1.9999999999999998e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.6921 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0169  N-acetylneuraminic acid synthase  29.53 
 
 
357 aa  117  1.9999999999999998e-25  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.922982  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3942  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  31.03 
 
 
349 aa  117  3e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0693356 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0774  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  34.07 
 
 
354 aa  117  3e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.453022  normal  0.512992 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1772  N-acetylneuraminate synthase  34.65 
 
 
350 aa  116  3.9999999999999997e-25  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1523  N-acetylneuraminate synthase  31.54 
 
 
350 aa  115  7.999999999999999e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.242955  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1724  pseudaminic acid synthase  33.04 
 
 
349 aa  115  7.999999999999999e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000954999 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0789  N-acetylneuraminic acid condensing enzyme  31.41 
 
 
340 aa  114  2.0000000000000002e-24  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0631  N-acetylneuraminate synthase  31.13 
 
 
359 aa  114  2.0000000000000002e-24  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2407  N-acetylneuraminate synthase  31.75 
 
 
500 aa  114  2.0000000000000002e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.378262  normal  0.284066 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001800  N-acetylneuraminate synthase  30.77 
 
 
357 aa  113  3e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1289  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  33.19 
 
 
350 aa  113  3e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2625  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  31.91 
 
 
349 aa  114  3e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0587  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  33.77 
 
 
349 aa  112  7.000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.518416  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3556  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  37.02 
 
 
358 aa  112  7.000000000000001e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.434108 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3564  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  32.93 
 
 
343 aa  112  7.000000000000001e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2758  N-acetylneuraminate synthase  30.65 
 
 
348 aa  111  2.0000000000000002e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1556  sialic acid synthase  33.77 
 
 
340 aa  111  2.0000000000000002e-23  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3448  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  32.25 
 
 
749 aa  110  3e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2668  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  32.25 
 
 
749 aa  110  3e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0010  n-acetylneuraminate synthase  32.21 
 
 
303 aa  110  4.0000000000000004e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.124512  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0049  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  29.8 
 
 
357 aa  108  1e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3726  N-acetylneuraminic acid synthase domain  29.2 
 
 
338 aa  107  3e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1582  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  30.29 
 
 
359 aa  105  9e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.807685  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1845  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  35.87 
 
 
344 aa  105  1e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3681  N-acetylneuraminate synthase  29.52 
 
 
344 aa  105  1e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0412  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  30.18 
 
 
338 aa  104  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.336797 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3256  N-acetylneuraminate synthase  34.39 
 
 
351 aa  103  2e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4334  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  35.14 
 
 
356 aa  103  3e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.204017  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14081  sialic acid synthase  30.33 
 
 
341 aa  103  3e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1664  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  29.48 
 
 
344 aa  103  3e-21  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3011  putative sialic acid synthase NeuB  30.07 
 
 
346 aa  102  5e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.62069  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>