153 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_3261 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_3261  polysaccharide biosynthesis related-protein  100 
 
 		 290 aa  603  9.999999999999999e-173  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1405  N-acetylneuraminic acid synthase domain protein  85.86 
 
 		 290 aa  532  1e-150  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2958  N-acetylneuraminic acid synthase domain-containing protein  84.97 
 
 		 286 aa  520  1e-146  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1140  polysaccharide biosynthesis protein, putative sialic acid synthase  62.77 
 
 		 287 aa  385  1e-106  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0455  N-acetylneuraminate synthase  62.77 
 
 		 286 aa  376  1e-103  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0423  N-acetylneuraminate synthase  59.35 
 
 		 288 aa  356  1.9999999999999998e-97  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0614  N-acetylneuraminic acid synthase domain protein  51.85 
 
 		 332 aa  345  5e-94  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.984154  normal  0.288463 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1329  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  32.85 
 
 		 358 aa  145  5e-34  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0131  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  29.56 
 
 		 351 aa  144  2e-33  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    unclonable  0.00000000000000538819 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0643  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  36.94 
 
 		 342 aa  142  7e-33  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0756  N-acetylneuraminate synthase  38.26 
 
 		 337 aa  139  4.999999999999999e-32  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.556038 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16950  N-acetylneuraminate synthase  32.72 
 
 		 331 aa  130  2.0000000000000002e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1772  N-acetylneuraminate synthase  32.85 
 
 		 350 aa  130  2.0000000000000002e-29  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0506  N-acetylneuraminate synthase  32.72 
 
 		 348 aa  130  3e-29  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1586  N-acetylneuraminate synthase  32.04 
 
 		 347 aa  129  5.0000000000000004e-29  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3208  pseudaminic acid synthase  32.62 
 
 		 351 aa  127  2.0000000000000002e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2097  neuB protein  34.93 
 
 		 352 aa  127  3e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.268336  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13043  sialic acid synthase  31.07 
 
 		 338 aa  124  1e-27  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.276449  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1391  N-acetylneuraminate synthase  32.97 
 
 		 337 aa  125  1e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0754706 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3027  pseudaminic acid synthase  32.03 
 
 		 349 aa  124  2e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0960  neuB family protein  31.84 
 
 		 379 aa  122  6e-27  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2641  N-acetylneuraminate synthase  29.26 
 
 		 330 aa  122  6e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0420  N-acetylneuraminate synthase  30.4 
 
 		 349 aa  122  6e-27  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01550  N-acetylneuraminate synthase  32.13 
 
 		 349 aa  122  9e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0492033 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0647  antifreeze-like protein  31.43 
 
 		 350 aa  120  3e-26  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.318568  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3980  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  32.85 
 
 		 350 aa  120  3e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0774  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  33.07 
 
 		 354 aa  120  3e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.453022  normal  0.512992 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3113  N-acetylneuraminic acid synthase-like protein  30.11 
 
 		 359 aa  119  3.9999999999999996e-26  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1161  N-acetyl neuramic acid synthetase NeuB  31.37 
 
 		 341 aa  119  6e-26  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2229  N-acetylneuraminate synthase  30.25 
 
 		 350 aa  119  7e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1969  N-acetylneuraminate synthase  36.84 
 
 		 364 aa  119  7.999999999999999e-26  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0891356  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0010  n-acetylneuraminate synthase  32.61 
 
 		 303 aa  118  9.999999999999999e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.124512  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3681  N-acetylneuraminate synthase  29.74 
 
 		 344 aa  118  9.999999999999999e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1248  N-acetylneuraminate synthase  33.33 
 
 		 348 aa  117  1.9999999999999998e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.862744  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0527  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  31.27 
 
 		 335 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.783884  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00670  sialic acid synthase  30.82 
 
 		 333 aa  117  1.9999999999999998e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2303  general stress protein 14 (GSP14)  29.93 
 
 		 333 aa  117  1.9999999999999998e-25  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12451  sialic acid synthase  29 
 
 		 337 aa  117  1.9999999999999998e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0694401  hitchhiker  0.00593947 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2977  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  34.03 
 
 		 334 aa  117  3e-25  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3121  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  34.03 
 
 		 334 aa  117  3e-25  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4942  N-acetylneuraminate synthase  33.73 
 
 		 748 aa  116  3.9999999999999997e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02907  NeuB:Antifreeze-like protein  33.33 
 
 		 347 aa  116  5e-25  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.269494  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1304  N-acetylneuraminate synthase  32.62 
 
 		 350 aa  116  6e-25  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.583965  normal  0.823534 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3318  Sialic acid synthase-like protein  32.86 
 
 		 672 aa  114  1.0000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.785348  normal  0.206825 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1534  N-acetylneuraminate synthase  33.71 
 
 		 332 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3564  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  29.08 
 
 		 343 aa  114  2.0000000000000002e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0562  N-acetylneuraminate synthase  31.18 
 
 		 333 aa  114  3e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2331  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  31.43 
 
 		 332 aa  113  3e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.206004 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0565  spore coat polysaccharide biosynthesis protein SpsE  31.68 
 
 		 342 aa  113  3e-24  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1970  polysaccharide biosynthesis protein, putative  31.87 
 
 		 350 aa  113  4.0000000000000004e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.237085  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3011  putative sialic acid synthase NeuB  32.06 
 
 		 346 aa  113  4.0000000000000004e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.62069  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3405  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  32.48 
 
 		 358 aa  112  6e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0151  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  32.97 
 
 		 349 aa  112  6e-24  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1516  N-acetylneuraminic acid synthetase  32 
 
 		 334 aa  112  8.000000000000001e-24  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.350916  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2425  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  29.54 
 
 		 345 aa  112  9e-24  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.149839  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2327  N-acetylneuraminate synthase  30.98 
 
 		 350 aa  110  2.0000000000000002e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.463819 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1845  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  30.83 
 
 		 344 aa  109  4.0000000000000004e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2713  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  33.33 
 
 		 310 aa  110  4.0000000000000004e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.314547  normal  0.787059 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2590  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  31.65 
 
 		 338 aa  109  5e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00139935 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2407  N-acetylneuraminate synthase  33.66 
 
 		 500 aa  109  6e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.378262  normal  0.284066 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1912  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  30.63 
 
 		 365 aa  108  7.000000000000001e-23  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000713145 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1974  N-acetylneuraminate synthase  33.51 
 
 		 305 aa  109  7.000000000000001e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4269  pseudaminic acid synthase  31.07 
 
 		 351 aa  108  1e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.948479 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1580  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  28.52 
 
 		 749 aa  108  1e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0385  N-acetylneuraminic acid synthetase  34.35 
 
 		 334 aa  108  1e-22  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0818  N-acetylneuraminic acid condensing enzyme  32.22 
 
 		 340 aa  107  2e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3098  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  33.17 
 
 		 347 aa  108  2e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.298576  normal  0.187894 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0789  N-acetylneuraminic acid condensing enzyme  31.85 
 
 		 340 aa  106  4e-22  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2213  pseudaminic acid synthase  32.46 
 
 		 345 aa  106  4e-22  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1196  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  30.32 
 
 		 350 aa  106  4e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1289  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  29.09 
 
 		 350 aa  106  5e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0660  N-acetylneuraminate synthase  28.23 
 
 		 349 aa  105  6e-22  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.297547  normal  0.963703 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2668  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  31.03 
 
 		 749 aa  105  6e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3448  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  31.03 
 
 		 749 aa  105  6e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1458  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  29.71 
 
 		 334 aa  105  9e-22  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3942  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  30.43 
 
 		 349 aa  105  9e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0693356 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1235  flagellin modification protein PtmC, putative N-acetylneuraminic acid synthetase  28.62 
 
 		 334 aa  105  9e-22  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.000000147783  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0595  N-acetylneuraminate synthase  30.26 
 
 		 333 aa  105  1e-21  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1556  sialic acid synthase  35.04 
 
 		 340 aa  105  1e-21  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3256  N-acetylneuraminate synthase  31.76 
 
 		 351 aa  104  2e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1576  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  30.14 
 
 		 350 aa  104  2e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14081  sialic acid synthase  28.62 
 
 		 341 aa  104  2e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0631  N-acetylneuraminate synthase  28.33 
 
 		 359 aa  104  2e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2369  N-acetylneuraminate synthase  30.32 
 
 		 348 aa  103  4e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0796873  normal  0.0101527 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1664  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  33.66 
 
 		 344 aa  103  4e-21  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1832  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  32.02 
 
 		 394 aa  102  5e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1512  N-acetylneuraminic acid synthetase  31.2 
 
 		 343 aa  102  7e-21  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0364  N-acetylneuraminic acid synthase domain-containing protein  34.72 
 
 		 358 aa  102  7e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.431709  normal  0.842753 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4086  N-acetylneuraminate synthase  30.77 
 
 		 363 aa  102  8e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3707  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  31.35 
 
 		 350 aa  101  1e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.170147  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2625  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  32.03 
 
 		 349 aa  100  2e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3363  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  32.31 
 
 		 337 aa  101  2e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2841  N-acetylneuraminate synthase  29.7 
 
 		 300 aa  100  3e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.893161  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0019  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  30.22 
 
 		 350 aa  99.8  5e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1724  pseudaminic acid synthase  31.28 
 
 		 349 aa  99  9e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000954999 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1523  N-acetylneuraminate synthase  31.76 
 
 		 350 aa  98.6  1e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.242955  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0587  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  32.03 
 
 		 349 aa  98.2  1e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.518416  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0049  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  26.91 
 
 		 357 aa  98.2  1e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0797  N-acetylneuraminate synthase  31.01 
 
 		 289 aa  97.8  2e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1072  sialic acid synthase  30.25 
 
 		 293 aa  97.1  3e-19  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>