153 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_3363 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_3363  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  100 
 
 		 337 aa  697    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1534  N-acetylneuraminate synthase  41.25 
 
 		 332 aa  238  6.999999999999999e-62  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0756  N-acetylneuraminate synthase  32.94 
 
 		 337 aa  192  8e-48  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.556038 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16950  N-acetylneuraminate synthase  32.83 
 
 		 331 aa  191  1e-47  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0385  N-acetylneuraminic acid synthetase  33.23 
 
 		 334 aa  189  7e-47  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1516  N-acetylneuraminic acid synthetase  33.23 
 
 		 334 aa  188  1e-46  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.350916  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1235  flagellin modification protein PtmC, putative N-acetylneuraminic acid synthetase  31.95 
 
 		 334 aa  185  1.0000000000000001e-45  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.000000147783  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0527  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  31.85 
 
 		 335 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.783884  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2641  N-acetylneuraminate synthase  33.33 
 
 		 330 aa  184  2.0000000000000003e-45  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0019  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  35.91 
 
 		 350 aa  183  5.0000000000000004e-45  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0420  N-acetylneuraminate synthase  30.7 
 
 		 349 aa  180  2.9999999999999997e-44  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3980  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  33.23 
 
 		 350 aa  176  4e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2303  general stress protein 14 (GSP14)  30.59 
 
 		 333 aa  174  9.999999999999999e-43  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12451  sialic acid synthase  32.18 
 
 		 337 aa  174  1.9999999999999998e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0694401  hitchhiker  0.00593947 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3405  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  31.93 
 
 		 358 aa  172  5e-42  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08721  ialic acid synthase  31.27 
 
 		 342 aa  172  5e-42  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.938537  hitchhiker  0.00000164183 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1161  N-acetyl neuramic acid synthetase NeuB  31.18 
 
 		 341 aa  172  6.999999999999999e-42  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0506  N-acetylneuraminate synthase  31.33 
 
 		 348 aa  169  5e-41  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2977  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  31.47 
 
 		 334 aa  169  9e-41  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3121  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  31.47 
 
 		 334 aa  169  9e-41  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1586  N-acetylneuraminate synthase  31.31 
 
 		 347 aa  168  1e-40  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2590  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  31.6 
 
 		 338 aa  167  2e-40  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00139935 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0562  N-acetylneuraminate synthase  31.08 
 
 		 333 aa  166  5.9999999999999996e-40  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1845  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  34.04 
 
 		 344 aa  165  1.0000000000000001e-39  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0595  N-acetylneuraminate synthase  29.73 
 
 		 333 aa  164  2.0000000000000002e-39  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1158  sialic acid synthase  32.41 
 
 		 346 aa  163  3e-39  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  decreased coverage  0.00143382  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3256  N-acetylneuraminate synthase  31.14 
 
 		 351 aa  162  5.0000000000000005e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3011  putative sialic acid synthase NeuB  29.88 
 
 		 346 aa  162  6e-39  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.62069  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4942  N-acetylneuraminate synthase  31.18 
 
 		 748 aa  162  6e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3318  Sialic acid synthase-like protein  35.43 
 
 		 672 aa  162  8.000000000000001e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.785348  normal  0.206825 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00670  sialic acid synthase  31.14 
 
 		 333 aa  161  1e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2331  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  31.53 
 
 		 332 aa  160  3e-38  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.206004 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0774  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  30.18 
 
 		 354 aa  159  6e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.453022  normal  0.512992 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0010  n-acetylneuraminate synthase  34.31 
 
 		 303 aa  157  3e-37  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.124512  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1576  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  29.39 
 
 		 350 aa  155  7e-37  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1832  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  32.28 
 
 		 394 aa  154  2e-36  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3232  polysialic acid capsule biosynthesis sialic acid synthase NeuB  29.65 
 
 		 346 aa  154  2e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1456  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  31.76 
 
 		 354 aa  154  2.9999999999999998e-36  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1772  N-acetylneuraminate synthase  30.59 
 
 		 350 aa  153  4e-36  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0254  N-acetylneuraminic acid synthase  28.37 
 
 		 357 aa  152  5.9999999999999996e-36  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0169  N-acetylneuraminic acid synthase  28.37 
 
 		 357 aa  152  5.9999999999999996e-36  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.922982  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2369  N-acetylneuraminate synthase  29.82 
 
 		 348 aa  150  2e-35  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0796873  normal  0.0101527 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2668  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  32.04 
 
 		 749 aa  151  2e-35  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3448  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  32.04 
 
 		 749 aa  151  2e-35  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3113  N-acetylneuraminic acid synthase-like protein  30.77 
 
 		 359 aa  150  3e-35  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0631  N-acetylneuraminate synthase  29.14 
 
 		 359 aa  150  3e-35  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0818  N-acetylneuraminic acid condensing enzyme  27.86 
 
 		 340 aa  149  7e-35  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0843  N-acetylneuraminate synthase  33.99 
 
 		 296 aa  149  7e-35  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2229  N-acetylneuraminate synthase  29.7 
 
 		 350 aa  149  9e-35  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0643  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  30.56 
 
 		 342 aa  149  9e-35  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0789  N-acetylneuraminic acid condensing enzyme  27.51 
 
 		 340 aa  149  1.0000000000000001e-34  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1289  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  29.48 
 
 		 350 aa  147  3e-34  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0049  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  27.81 
 
 		 357 aa  146  4.0000000000000006e-34  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0305  N-acetylneuraminic acid synthase domain-containing protein  32 
 
 		 347 aa  146  5e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.351224  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4334  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  30.93 
 
 		 356 aa  145  9e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.204017  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1512  N-acetylneuraminic acid synthetase  30.3 
 
 		 343 aa  145  1e-33  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14081  sialic acid synthase  27.41 
 
 		 341 aa  145  1e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1329  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  29.82 
 
 		 358 aa  145  1e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3681  N-acetylneuraminate synthase  32.15 
 
 		 344 aa  144  2e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3208  pseudaminic acid synthase  29.94 
 
 		 351 aa  144  3e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1582  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  29.81 
 
 		 359 aa  143  3e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.807685  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0151  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  30.27 
 
 		 349 aa  143  5e-33  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3100  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  27.68 
 
 		 357 aa  143  5e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0412  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  31.27 
 
 		 338 aa  142  8e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.336797 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1391  N-acetylneuraminate synthase  29.88 
 
 		 337 aa  141  9.999999999999999e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0754706 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1458  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  29.04 
 
 		 334 aa  141  1.9999999999999998e-32  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001800  N-acetylneuraminate synthase  27.95 
 
 		 357 aa  141  1.9999999999999998e-32  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2327  N-acetylneuraminate synthase  28.13 
 
 		 350 aa  141  1.9999999999999998e-32  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.463819 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1580  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  27.3 
 
 		 749 aa  139  6e-32  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0797  N-acetylneuraminate synthase  31.42 
 
 		 289 aa  139  7.999999999999999e-32  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02907  NeuB:Antifreeze-like protein  28.31 
 
 		 347 aa  138  1e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.269494  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4086  N-acetylneuraminate synthase  28.69 
 
 		 363 aa  138  1e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3726  N-acetylneuraminic acid synthase domain  31.21 
 
 		 338 aa  137  2e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0647  antifreeze-like protein  30.7 
 
 		 350 aa  137  2e-31  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.318568  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13043  sialic acid synthase  26.35 
 
 		 338 aa  137  2e-31  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.276449  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1196  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  31 
 
 		 350 aa  136  6.0000000000000005e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1894  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  29.71 
 
 		 354 aa  135  9.999999999999999e-31  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1304  N-acetylneuraminate synthase  28.22 
 
 		 350 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.583965  normal  0.823534 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3027  pseudaminic acid synthase  28.05 
 
 		 349 aa  135  9.999999999999999e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1970  polysaccharide biosynthesis protein, putative  30.75 
 
 		 350 aa  134  1.9999999999999998e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.237085  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0440  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  29 
 
 		 342 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1072  sialic acid synthase  30.15 
 
 		 293 aa  134  3e-30  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0131  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  26.45 
 
 		 351 aa  133  3e-30  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    unclonable  0.00000000000000538819 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2425  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  28.36 
 
 		 345 aa  133  5e-30  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.149839  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2097  neuB protein  26.44 
 
 		 352 aa  132  6.999999999999999e-30  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.268336  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2221  N-acetylneuraminate synthase  29.64 
 
 		 761 aa  131  1.0000000000000001e-29  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2635  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  28.99 
 
 		 352 aa  131  1.0000000000000001e-29  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01550  N-acetylneuraminate synthase  29.34 
 
 		 349 aa  131  2.0000000000000002e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0492033 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0565  spore coat polysaccharide biosynthesis protein SpsE  29.76 
 
 		 342 aa  130  3e-29  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1574  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  29.3 
 
 		 289 aa  130  4.0000000000000003e-29  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000030231  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1248  N-acetylneuraminate synthase  27.35 
 
 		 348 aa  129  5.0000000000000004e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.862744  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2213  pseudaminic acid synthase  27.46 
 
 		 345 aa  129  7.000000000000001e-29  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4269  pseudaminic acid synthase  29.71 
 
 		 351 aa  129  7.000000000000001e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.948479 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1334  N-acetylneuraminic acid synthetase  29.91 
 
 		 343 aa  129  7.000000000000001e-29  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1890  N-acetylneuraminate synthase  28.03 
 
 		 356 aa  129  9.000000000000001e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.00000120962  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0346  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  27.46 
 
 		 313 aa  128  1.0000000000000001e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.417711 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0660  N-acetylneuraminate synthase  27.94 
 
 		 349 aa  127  2.0000000000000002e-28  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.297547  normal  0.963703 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0367  N-acetylneuraminate synthase  27.32 
 
 		 360 aa  127  2.0000000000000002e-28  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2758  N-acetylneuraminate synthase  30.29 
 
 		 348 aa  127  3e-28  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0397  N-acetylneuraminic acid synthetase  30 
 
 		 343 aa  127  3e-28  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.397069  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>