More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TC0521 on replicon NC_002620
Organism: Chlamydia muridarum Nigg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002620  TC0521  chromosomal replication initiation protein  100 
 
 
456 aa  939    Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0001  chromosomal replication initiation protein  37.13 
 
 
478 aa  224  3e-57  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000339822  hitchhiker  0.0000314878 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0001  chromosomal replication initiation protein  34.64 
 
 
472 aa  223  7e-57  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000368077  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  31.33 
 
 
444 aa  221  1.9999999999999999e-56  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  32.89 
 
 
459 aa  221  3e-56  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0161542  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0001  chromosomal replication initiation protein  37.58 
 
 
481 aa  219  7e-56  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.00000056365  unclonable  0.0000112062 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  30.2 
 
 
443 aa  218  2.9999999999999998e-55  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0001  chromosomal replication initiation protein  29.98 
 
 
480 aa  215  9.999999999999999e-55  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.000170377  unclonable  0.000000000650471 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  29.74 
 
 
454 aa  215  1.9999999999999998e-54  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00039195  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0001  chromosomal replication initiation protein  29.78 
 
 
440 aa  211  2e-53  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000118947  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  33.56 
 
 
439 aa  211  2e-53  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.000000109214  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2553  chromosomal replication initiation protein  29.36 
 
 
451 aa  209  7e-53  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000248403  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0001  chromosomal replication initiation protein  29.93 
 
 
450 aa  209  7e-53  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  31.54 
 
 
439 aa  209  7e-53  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00780596  normal  0.982574 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1100  chromosomal replication initiation protein  31.03 
 
 
482 aa  206  5e-52  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.018395 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0001  chromosomal replication initiation protein  29.91 
 
 
453 aa  206  6e-52  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000795473  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0001  chromosomal replication initiation protein  29.91 
 
 
453 aa  206  6e-52  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.101414  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  34.88 
 
 
447 aa  206  8e-52  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  36.02 
 
 
480 aa  204  3e-51  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  35.94 
 
 
528 aa  204  3e-51  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.561876  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0002  chromosomal replication initiation protein  29.6 
 
 
442 aa  203  4e-51  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0135977  hitchhiker  0.0000101386 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0001  chromosomal replication initiation protein  29.33 
 
 
445 aa  203  7e-51  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00343862  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0001  chromosomal replication initiation protein  29.89 
 
 
443 aa  202  8e-51  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00172749  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0001  chromosomal replication initiation protein  29.89 
 
 
446 aa  201  3e-50  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000325337  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0001  chromosomal replication initiation protein  27.97 
 
 
492 aa  201  3e-50  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.943807  normal  0.152297 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0003  chromosomal replication initiation protein  30.68 
 
 
453 aa  201  3e-50  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0001  chromosomal replication initiation protein  29.83 
 
 
470 aa  201  3e-50  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.000177247  normal  0.980205 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0001  chromosomal replication initiation protein  30.68 
 
 
453 aa  200  5e-50  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.755155  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0198  chromosomal replication initiation protein  29.13 
 
 
460 aa  200  5e-50  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00733858  normal  0.0821352 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2371  chromosomal replication initiation protein  29.46 
 
 
443 aa  200  5e-50  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0166544  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0001  chromosomal replication initiation protein  35.36 
 
 
615 aa  199  9e-50  Thermobifida fusca YX  Bacteria  unclonable  0.000000000479277  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00010  chromosomal replication initiator protein DnaA  39.02 
 
 
506 aa  199  1.0000000000000001e-49  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0001  chromosomal replication initiation protein  29.95 
 
 
446 aa  199  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.000585905  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0001  chromosomal replication initiation protein  29.72 
 
 
450 aa  199  1.0000000000000001e-49  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000000447845  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  32.73 
 
 
721 aa  199  1.0000000000000001e-49  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000423182  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  32.32 
 
 
509 aa  198  2.0000000000000003e-49  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5319  chromosomal replication initiation protein  29.95 
 
 
446 aa  198  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.679479  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  30.79 
 
 
476 aa  198  2.0000000000000003e-49  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  unclonable  0.00000000240109  normal  0.165841 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2133  chromosomal replication initiation protein  28.67 
 
 
489 aa  198  2.0000000000000003e-49  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  unclonable  0.00000000845727  normal  0.662665 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0001  chromosomal replication initiation protein  27.7 
 
 
490 aa  198  2.0000000000000003e-49  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1436  chromosomal replication initiation protein  35.95 
 
 
500 aa  197  4.0000000000000005e-49  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.723228  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0001  chromosomal replication initiation protein  32.85 
 
 
457 aa  197  5.000000000000001e-49  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000458864  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0001  chromosomal replication initiation protein  32.85 
 
 
457 aa  196  6e-49  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000597417  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0045  chromosomal replication initiator protein DnaA  32.74 
 
 
539 aa  196  7e-49  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0001  chromosomal replication initiation protein  29.49 
 
 
446 aa  196  9e-49  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000000244098  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0001  chromosomal replication initiation protein  29.49 
 
 
446 aa  196  9e-49  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000163866  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0001  chromosomal replication initiation protein  29.49 
 
 
446 aa  196  9e-49  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000459109  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0001  chromosomal replication initiation protein  29.49 
 
 
446 aa  196  9e-49  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000000425777  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0001  chromosomal replication initiation protein  29.49 
 
 
446 aa  196  9e-49  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0001  chromosomal replication initiation protein  29.4 
 
 
446 aa  195  1e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000594007  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  37.01 
 
 
570 aa  195  1e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.000116219  normal  0.231349 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0001  chromosomal replication initiation protein  29.4 
 
 
446 aa  195  1e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000000184902  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3373  chromosomal replication initiation protein  29 
 
 
460 aa  195  1e-48  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0001  initiation of chromosome replication  29.69 
 
 
436 aa  196  1e-48  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  26.49 
 
 
453 aa  194  2e-48  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000000208022  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0001  chromosomal replication initiation protein  28.15 
 
 
487 aa  194  2e-48  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00605191  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0001  chromosomal replication initiation protein  34.53 
 
 
470 aa  195  2e-48  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0703594  normal  0.628106 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  29.56 
 
 
449 aa  194  2e-48  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000141272  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  34.1 
 
 
652 aa  195  2e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  unclonable  0.00000505913  hitchhiker  0.00770539 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0001  chromosomal replication initiation protein  29.49 
 
 
446 aa  193  5e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.562714  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  33.52 
 
 
473 aa  193  6e-48  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000000000284064 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0001  chromosomal replication initiation protein  31.88 
 
 
469 aa  192  9e-48  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  34.97 
 
 
518 aa  192  1e-47  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.7384  hitchhiker  0.00538334 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  28.41 
 
 
446 aa  192  1e-47  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.00000208181  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  28.51 
 
 
456 aa  192  1e-47  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  33.24 
 
 
474 aa  192  1e-47  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00000398294  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  32.39 
 
 
454 aa  191  2e-47  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000331762  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0136  chromosomal replication initiation protein  29.52 
 
 
452 aa  190  5e-47  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.00000582235  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10001  chromosomal replication initiation protein  33.55 
 
 
507 aa  190  5e-47  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  33.24 
 
 
534 aa  189  5.999999999999999e-47  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0809  chromosomal replication initiation protein  29.29 
 
 
464 aa  190  5.999999999999999e-47  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.54082  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  38.19 
 
 
527 aa  189  5.999999999999999e-47  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0861644  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00010  chromosomal replication initiator protein DnaA  35.13 
 
 
490 aa  189  7e-47  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0001  chromosomal replication initiation protein  28.93 
 
 
456 aa  189  7e-47  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0001  DNA replication initiation ATPase- like protein  34.97 
 
 
582 aa  189  8e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00000523076  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00010  chromosomal replication initiator protein DnaA  27.73 
 
 
463 aa  189  1e-46  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00536902  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0009  chromosomal replication initiation protein  32.9 
 
 
495 aa  187  2e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.166715  normal  0.0809665 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0001  chromosomal replication initiation protein  28.1 
 
 
452 aa  188  2e-46  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.98376e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0001  chromosomal replication initiation protein  30.95 
 
 
524 aa  188  2e-46  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0237228  normal  0.131634 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0001  chromosomal replication initiation protein  32.9 
 
 
495 aa  187  2e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0454037 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0001  chromosomal replication initiation protein  32.9 
 
 
495 aa  187  2e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  32.56 
 
 
453 aa  188  2e-46  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0001  chromosomal replication initiation protein  31.1 
 
 
453 aa  188  2e-46  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0001  chromosomal replication initiation protein  29.2 
 
 
441 aa  187  3e-46  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000247534  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  33.72 
 
 
566 aa  187  3e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.0000150843  normal  0.201816 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0001  chromosomal replication initiation protein  28.25 
 
 
455 aa  187  4e-46  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.632445  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0001  chromosomal replication initiation protein  32.9 
 
 
494 aa  186  5e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.124904  normal  0.26229 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06291  chromosomal replication initiation protein  30.07 
 
 
463 aa  187  5e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0565  chromosomal replication initiation protein  29.35 
 
 
464 aa  186  5e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0001  chromosomal replication initiation protein  26.43 
 
 
492 aa  186  6e-46  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.983579  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1342  chromosomal replication initiation protein  29.45 
 
 
455 aa  186  7e-46  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0011  chromosomal replication initiation protein  29.45 
 
 
455 aa  186  7e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0270  chromosomal replication initiation protein  33.33 
 
 
452 aa  186  8e-46  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.43885  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0001  chromosomal replication initiation protein  29.17 
 
 
460 aa  186  8e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.831436  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0827  chromosomal replication initiation protein  32.57 
 
 
492 aa  186  8e-46  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  33.64 
 
 
458 aa  185  1.0000000000000001e-45  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0002  chromosomal replication initiation protein  29.36 
 
 
461 aa  185  1.0000000000000001e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.020385  hitchhiker  0.000000603983 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0001  chromosomal replication initiation protein  27.51 
 
 
491 aa  186  1.0000000000000001e-45  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  32.66 
 
 
503 aa  186  1.0000000000000001e-45  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0001  chromosomal replication initiation protein  26.22 
 
 
491 aa  184  2.0000000000000003e-45  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.96301  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>