More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9902_1654 on replicon NC_007513
Organism: Synechococcus sp. CC9902



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008820  P9303_07561  peptidoglycan synthetase  71.87 
 
 
584 aa  845    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.272548 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1850  putative peptidoglycan synthetase (pbp transpeptidase domain)  57.92 
 
 
598 aa  683    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.570485  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1654  peptidoglycan glycosyltransferase  100 
 
 
608 aa  1229    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0704  peptidoglycan glycosyltransferase  84.97 
 
 
601 aa  999    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05751  peptidoglycan synthetase  58.26 
 
 
598 aa  682    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05201  peptidoglycan synthetase  56.57 
 
 
598 aa  689    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.692786  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0518  putative peptidoglycan synthetase (pbp transpeptidase domain)  51.39 
 
 
583 aa  620  1e-176  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.289725  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05441  peptidoglycan synthetase  51.74 
 
 
583 aa  620  1e-176  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05741  peptidoglycan synthetase  51.47 
 
 
583 aa  615  1e-175  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.712635  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05821  peptidoglycan synthetase  50.87 
 
 
583 aa  614  9.999999999999999e-175  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4620  penicillin-binding protein, transpeptidase  45.87 
 
 
609 aa  504  1e-141  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.408465 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0482  peptidoglycan glycosyltransferase  45.63 
 
 
589 aa  503  1e-141  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.635287  normal  0.182989 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3955  peptidoglycan glycosyltransferase  43.87 
 
 
603 aa  487  1e-136  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.194154  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1172  Peptidoglycan glycosyltransferase  44.15 
 
 
612 aa  478  1e-133  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1853  Peptidoglycan glycosyltransferase  42.93 
 
 
624 aa  476  1e-133  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1199  Peptidoglycan glycosyltransferase  44.15 
 
 
612 aa  478  1e-133  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3749  Peptidoglycan glycosyltransferase  45.23 
 
 
607 aa  446  1.0000000000000001e-124  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.425103  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1840  peptidoglycan glycosyltransferase  42.94 
 
 
628 aa  421  1e-116  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.707167  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1614  Peptidoglycan glycosyltransferase  32.2 
 
 
582 aa  285  2.0000000000000002e-75  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4123  peptidoglycan glycosyltransferase  31.72 
 
 
630 aa  273  8.000000000000001e-72  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3649  peptidoglycan glycosyltransferase  31.72 
 
 
630 aa  273  1e-71  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00810793  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1015  stage V sporulation protein D  32.06 
 
 
646 aa  270  5e-71  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0373  penicillin-binding protein  31.37 
 
 
594 aa  268  2.9999999999999995e-70  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1056  penicillin-binding protein  31.37 
 
 
594 aa  268  2.9999999999999995e-70  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.300075  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1625  penicillin-binding protein  31.37 
 
 
594 aa  268  2.9999999999999995e-70  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.142989  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0044  penicillin-binding protein  31.37 
 
 
594 aa  268  2.9999999999999995e-70  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1212  penicillin-binding protein  31.37 
 
 
594 aa  268  2.9999999999999995e-70  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1712  putative penicillin-binding protein  31.37 
 
 
594 aa  267  4e-70  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0213  penicillin-binding protein  31.2 
 
 
594 aa  267  5e-70  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.885893  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0837  stage V sporulation protein D  31.8 
 
 
711 aa  266  7e-70  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.677302 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2730  Peptidoglycan glycosyltransferase  33.44 
 
 
595 aa  266  7e-70  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1197  penicillin-binding protein  31.52 
 
 
596 aa  265  2e-69  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.113554  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1298  Peptidoglycan glycosyltransferase  31.71 
 
 
704 aa  264  4e-69  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3095  Peptidoglycan glycosyltransferase  33.17 
 
 
595 aa  264  4e-69  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1887  stage V sporulation protein D  32.4 
 
 
644 aa  263  6.999999999999999e-69  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4378  peptidoglycan glycosyltransferase  30.8 
 
 
618 aa  262  1e-68  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2850  penicillin-binding 3 precursor PBP-3 transmembrane protein  32.54 
 
 
595 aa  262  2e-68  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0113  peptidoglycan synthetase FtsI  33.22 
 
 
577 aa  260  4e-68  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.483173  normal  0.0772929 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6002  Peptidoglycan glycosyltransferase  30.72 
 
 
577 aa  258  2e-67  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0358141  normal  0.616486 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2238  peptidoglycan synthetase FtsI  30.52 
 
 
577 aa  257  4e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3290  peptidoglycan glycosyltransferase  30.72 
 
 
632 aa  257  5e-67  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.38808 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4139  peptidoglycan glycosyltransferase  30.72 
 
 
632 aa  257  5e-67  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.261865  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4227  peptidoglycan glycosyltransferase  30.72 
 
 
632 aa  257  5e-67  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.200885 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3504  peptidoglycan synthetase FtsI  31.99 
 
 
582 aa  256  7e-67  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.152932 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1788  peptidoglycan synthetase FtsI  30.73 
 
 
631 aa  256  9e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.399225 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0820  peptidoglycan glycosyltransferase  31.35 
 
 
705 aa  254  3e-66  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3824  peptidoglycan glycosyltransferase  31.37 
 
 
578 aa  253  9.000000000000001e-66  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1570  stage V sporulation protein D  32.18 
 
 
708 aa  253  1e-65  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0597  Peptidoglycan glycosyltransferase  30.09 
 
 
614 aa  249  8e-65  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2985  peptidoglycan synthetase FtsI  31.74 
 
 
600 aa  247  4e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.250181  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0516  peptidoglycan glycosyltransferase  30.96 
 
 
614 aa  245  1.9999999999999999e-63  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.316691 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0352  peptidoglycan synthetase FtsI  29.73 
 
 
599 aa  244  1.9999999999999999e-63  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1004  peptidoglycan glycosyltransferase  31.03 
 
 
638 aa  244  3.9999999999999997e-63  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.855584  normal  0.147704 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2620  peptidoglycan glycosyltransferase  31.3 
 
 
587 aa  244  5e-63  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000000128115 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3134  peptidoglycan synthetase FtsI  30.98 
 
 
605 aa  243  7e-63  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.236928  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3766  sporulation specific penicillin-binding protein  29.29 
 
 
638 aa  242  1e-62  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3657  sporulation specific penicillin-binding protein  29.29 
 
 
638 aa  242  1e-62  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3674  sporulation specific penicillin-binding protein  29.29 
 
 
638 aa  242  1e-62  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4054  sporulation specific penicillin-binding protein  29.29 
 
 
638 aa  242  1e-62  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3961  sporulation specific penicillin-binding protein  29.29 
 
 
638 aa  242  2e-62  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3968  sporulation specific penicillin-binding protein  29.29 
 
 
638 aa  241  2e-62  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.313702  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1036  peptidoglycan glycosyltransferase  30.62 
 
 
675 aa  241  2.9999999999999997e-62  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3930  sporulation specific penicillin-binding protein  29.46 
 
 
638 aa  241  4e-62  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00892193 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2867  peptidoglycan glycosyltransferase  32.06 
 
 
570 aa  241  4e-62  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09030  stage V sporulation protein D  28.26 
 
 
695 aa  241  4e-62  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2565  stage V sporulation protein D  29.48 
 
 
638 aa  240  5e-62  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.18233  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2053  peptidoglycan glycosyltransferase  30.21 
 
 
613 aa  240  5.999999999999999e-62  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.830537  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0456  peptidoglycan synthetase FtsI  30.4 
 
 
607 aa  240  5.999999999999999e-62  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.619421 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1974  peptidoglycan glycosyltransferase  30.21 
 
 
613 aa  240  5.999999999999999e-62  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4069  stage V sporulation protein D  29.1 
 
 
682 aa  240  5.999999999999999e-62  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3742  stage V sporulation protein D  29.11 
 
 
638 aa  240  6.999999999999999e-62  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0676  Peptidoglycan glycosyltransferase  31.05 
 
 
662 aa  240  6.999999999999999e-62  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.832446  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4016  sporulation specific penicillin-binding protein  29.11 
 
 
638 aa  239  8e-62  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.622695  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1225  sporulation specific penicillin-binding protein  29.11 
 
 
638 aa  239  8e-62  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00126151  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0406  penicillin-binding protein, transpeptidase  31.11 
 
 
657 aa  239  1e-61  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0161  peptidoglycan glycosyltransferase  33.02 
 
 
590 aa  239  1e-61  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1272  stage V sporulation protein D  31.26 
 
 
645 aa  238  2e-61  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.144454  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2275  peptidoglycan synthetase FtsI  30.62 
 
 
583 aa  238  2e-61  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.482519 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0502  Peptidoglycan glycosyltransferase  30.05 
 
 
654 aa  237  4e-61  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.734645 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04372  peptidoglycan synthetase FtsI  30.78 
 
 
622 aa  236  6e-61  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0485  penicillin-binding protein transpeptidase  30.71 
 
 
660 aa  236  8e-61  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0815  peptidoglycan synthetase FtsI  29.47 
 
 
581 aa  236  9e-61  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.265307  normal  0.713364 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0979  peptidoglycan glycosyltransferase  28.9 
 
 
723 aa  236  1.0000000000000001e-60  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0175  Peptidoglycan glycosyltransferase  32.51 
 
 
590 aa  235  1.0000000000000001e-60  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2208  peptidoglycan synthetase  30.82 
 
 
656 aa  235  2.0000000000000002e-60  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2986  Peptidoglycan glycosyltransferase  29.76 
 
 
582 aa  234  4.0000000000000004e-60  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3676  peptidoglycan synthetase FtsI  29.76 
 
 
582 aa  234  4.0000000000000004e-60  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.383509  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2679  peptidoglycan glycosyltransferase  29.73 
 
 
624 aa  233  5e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0763  Peptidoglycan glycosyltransferase  30.65 
 
 
570 aa  234  5e-60  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0669  stage V sporulation protein D  29.69 
 
 
713 aa  233  9e-60  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1464  peptidoglycan glycosyltransferase  29.43 
 
 
582 aa  233  9e-60  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.923848  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3431  peptidoglycan glycosyltransferase  29.27 
 
 
580 aa  232  1e-59  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1172  Peptidoglycan glycosyltransferase  28.68 
 
 
656 aa  231  2e-59  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3459  peptidoglycan glycosyltransferase  29.29 
 
 
578 aa  231  4e-59  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0440693 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3295  peptidoglycan glycosyltransferase  28.3 
 
 
657 aa  230  6e-59  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3075  penicillin-binding protein  30.74 
 
 
657 aa  229  8e-59  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.274173  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3531  penicillin-binding protein  29.68 
 
 
614 aa  229  9e-59  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3551  penicillin-binding protein  29.68 
 
 
614 aa  229  1e-58  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.252392  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3226  penicillin-binding protein  29.68 
 
 
614 aa  229  1e-58  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0343  penicillin-binding protein  32 
 
 
570 aa  229  1e-58  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.503077  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>