More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9605_0011 on replicon NC_007516
Organism: Synechococcus sp. CC9605



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007513  Syncc9902_0011  cell division transporter substrate-binding protein FtsY  77.27 
 
 
522 aa  681    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.580658  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0011  signal recognition particle-docking protein FtsY  100 
 
 
512 aa  997    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00101  signal recognition particle docking protein FtsY  67.71 
 
 
484 aa  615  1e-175  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00091  signal recognition particle docking protein FtsY  74.27 
 
 
431 aa  525  1e-148  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.945762  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1337  signal recognition particle-docking protein FtsY  73.98 
 
 
431 aa  523  1e-147  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00091  signal recognition particle docking protein FtsY  74.13 
 
 
444 aa  505  9.999999999999999e-143  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000209396 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00091  signal recognition particle docking protein FtsY  63.35 
 
 
439 aa  498  1e-140  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.290056  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00091  signal recognition particle docking protein FtsY  69.91 
 
 
415 aa  490  1e-137  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.532104  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1588  signal recognition particle-docking protein FtsY  50.28 
 
 
518 aa  484  1e-135  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0010  signal recognition particle-docking protein FtsY  63.87 
 
 
430 aa  476  1e-133  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0277  signal recognition particle-docking protein FtsY  49.1 
 
 
546 aa  474  1e-132  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00091  signal recognition particle docking protein FtsY  68.62 
 
 
429 aa  469  1.0000000000000001e-131  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.481946  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2324  signal recognition particle-docking protein FtsY  51.57 
 
 
606 aa  457  1e-127  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0944454  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3808  signal recognition particle-docking protein FtsY  49.43 
 
 
499 aa  447  1.0000000000000001e-124  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3759  signal recognition particle-docking protein FtsY  49.62 
 
 
499 aa  445  1.0000000000000001e-124  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5042  signal recognition particle-docking protein FtsY  49.61 
 
 
461 aa  429  1e-119  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.267605 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2472  signal recognition particle-docking protein FtsY  51.91 
 
 
518 aa  429  1e-119  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000569987 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0738  signal recognition particle-docking protein FtsY  45.55 
 
 
553 aa  418  9.999999999999999e-116  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.193162  normal  0.913053 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0157  signal recognition particle-docking protein FtsY  46.84 
 
 
481 aa  286  8e-76  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1942  signal recognition particle-docking protein FtsY  49.35 
 
 
373 aa  285  2.0000000000000002e-75  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2989  signal recognition particle-docking protein FtsY  48.37 
 
 
501 aa  277  4e-73  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.862274  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4065  signal recognition particle-docking protein FtsY  38.85 
 
 
452 aa  276  8e-73  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1934  cell division transporter substrate-binding protein FtsY  48.87 
 
 
362 aa  273  7e-72  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.249425  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5161  signal recognition particle-docking protein FtsY  37.67 
 
 
510 aa  271  1e-71  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4751  cell division transporter substrate-binding protein FtsY  46.65 
 
 
505 aa  269  8.999999999999999e-71  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.974367  normal  0.0527316 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0427  signal recognition particle-docking protein FtsY  46.65 
 
 
513 aa  268  1e-70  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3877  signal recognition particle-docking protein FtsY  46.13 
 
 
432 aa  269  1e-70  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4984  signal recognition particle-docking protein FtsY  47.59 
 
 
497 aa  268  2e-70  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0354  signal recognition particle-docking protein FtsY  47.59 
 
 
514 aa  267  4e-70  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0093  cell division protein FtsY  45.48 
 
 
471 aa  264  2e-69  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0619  signal recognition particle-docking protein FtsY  45.18 
 
 
347 aa  264  3e-69  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.124261  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0623  signal recognition particle-docking protein FtsY  45.1 
 
 
453 aa  264  3e-69  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1176  signal recognition particle-docking protein FtsY  47.85 
 
 
351 aa  263  4e-69  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.216853  normal  0.740052 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1132  cell division protein FtsY  47.85 
 
 
350 aa  262  1e-68  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1096  signal recognition particle-docking protein FtsY  46.1 
 
 
340 aa  262  1e-68  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0138862  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0099  cell division protein FtsY  45.16 
 
 
495 aa  262  1e-68  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3944  signal recognition particle-docking protein FtsY  43.61 
 
 
485 aa  262  1e-68  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.0000907128  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0133  cytochrome oxidase assembly family protein/cell division protein FtsY  50.99 
 
 
671 aa  261  2e-68  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.167728  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5111  signal recognition particle-docking protein FtsY  41.88 
 
 
494 aa  260  5.0000000000000005e-68  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.489493  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0386  putative cell division protein  46.62 
 
 
328 aa  258  2e-67  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.919397 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03537  signal recognition particle GTPase  43.73 
 
 
541 aa  258  2e-67  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3972  signal recognition particle-docking protein FtsY  44.92 
 
 
562 aa  258  2e-67  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00124798  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4586  cell division protein FtsY  43.07 
 
 
510 aa  257  3e-67  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3746  signal recognition particle-docking protein FtsY  46.71 
 
 
405 aa  257  3e-67  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3847  signal recognition particle-docking protein FtsY  45.25 
 
 
584 aa  257  4e-67  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00993758  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3496  signal recognition particle-docking protein FtsY  48.51 
 
 
342 aa  256  6e-67  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00000989715  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1715  signal recognition particle-docking protein FtsY  47.33 
 
 
319 aa  255  1.0000000000000001e-66  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0121805  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0221  signal recognition particle-docking protein FtsY  45.31 
 
 
535 aa  255  1.0000000000000001e-66  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.359451  normal  0.0478806 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2988  signal recognition particle-docking protein FtsY  46.45 
 
 
329 aa  255  2.0000000000000002e-66  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.289168  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0651  signal recognition particle-docking protein FtsY  44.55 
 
 
320 aa  255  2.0000000000000002e-66  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0777  Signal recognition particle GTPase-like protein  44.16 
 
 
305 aa  254  2.0000000000000002e-66  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.221787  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48100  signal recognition particle-docking protein FtsY  46.95 
 
 
451 aa  254  2.0000000000000002e-66  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0287334  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0746  signal recognition particle-docking protein FtsY  46.15 
 
 
476 aa  254  3e-66  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0576  signal recognition particle-docking protein FtsY  46.15 
 
 
476 aa  254  3e-66  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.353955  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3336  signal recognition particle-docking protein FtsY  45.31 
 
 
320 aa  254  3e-66  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0289  signal recognition particle-docking protein FtsY  45.72 
 
 
482 aa  254  3e-66  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000644129  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3774  signal recognition particle-docking protein FtsY  44.92 
 
 
582 aa  254  3e-66  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00390438  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0281  signal recognition particle-docking protein FtsY  46.56 
 
 
340 aa  253  4.0000000000000004e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.244047  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0275  signal recognition particle-docking protein FtsY  44.44 
 
 
587 aa  253  4.0000000000000004e-66  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.125713  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2460  signal recognition particle-docking protein FtsY  46.08 
 
 
326 aa  254  4.0000000000000004e-66  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1718  signal recognition particle-docking protein FtsY  40.79 
 
 
381 aa  253  6e-66  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000392089  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0733  signal recognition particle-docking protein FtsY  45.86 
 
 
335 aa  253  6e-66  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2659  signal recognition particle-docking protein FtsY  50.16 
 
 
389 aa  253  6e-66  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.319125  hitchhiker  0.000261917 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3747  cell division protein FtsY  44.52 
 
 
512 aa  253  6e-66  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0776  signal recognition particle-docking protein FtsY  47.56 
 
 
314 aa  253  6e-66  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0251  signal recognition particle-docking protein FtsY  44.98 
 
 
497 aa  253  7e-66  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3946  cell division protein FtsY  44.52 
 
 
497 aa  253  7e-66  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0239  cell division protein FtsY  45.95 
 
 
541 aa  253  7e-66  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0752366  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0577  cell division protein  45.95 
 
 
553 aa  253  7e-66  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0105476  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4784  cell division protein FtsY  44.52 
 
 
498 aa  253  7e-66  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3663  cell division protein FtsY  44.52 
 
 
498 aa  253  7e-66  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0252  cell division protein FtsY  44.52 
 
 
498 aa  253  7e-66  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03313  fused Signal Recognition Particle (SRP) receptor: membrane binding protein/conserved protein  44.52 
 
 
498 aa  253  8.000000000000001e-66  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3979  signal recognition particle-docking protein FtsY  45.95 
 
 
523 aa  253  8.000000000000001e-66  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03266  hypothetical protein  44.52 
 
 
498 aa  253  8.000000000000001e-66  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0241  signal recognition particle-docking protein FtsY  45.98 
 
 
394 aa  253  9.000000000000001e-66  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1170  signal recognition particle-docking protein FtsY  45.98 
 
 
301 aa  252  9.000000000000001e-66  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.102852  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2922  signal recognition particle-docking protein FtsY  46.15 
 
 
439 aa  252  1e-65  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1493  signal recognition particle-docking protein FtsY  46.15 
 
 
439 aa  252  1e-65  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0096  signal recognition particle-docking protein FtsY  46.15 
 
 
439 aa  252  1e-65  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.838826  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3858  cell division protein FtsY  44.52 
 
 
497 aa  251  2e-65  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0268  signal recognition particle-docking protein FtsY  45.66 
 
 
398 aa  251  2e-65  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.500943  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5337  signal recognition particle-docking protein FtsY  48.23 
 
 
515 aa  251  2e-65  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.760188 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0578  signal recognition particle-docking protein FtsY  46.82 
 
 
386 aa  251  2e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.13886  hitchhiker  0.00686608 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4175  signal recognition particle-docking protein FtsY  48.87 
 
 
475 aa  251  2e-65  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0143973  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3868  cell division protein FtsY  44.19 
 
 
511 aa  251  3e-65  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.046763  normal  0.12131 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4164  signal recognition particle-docking protein FtsY  44.74 
 
 
611 aa  251  3e-65  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00648424  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3840  cell division protein FtsY  44.19 
 
 
491 aa  250  4e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0466  signal recognition particle-docking protein FtsY  45.83 
 
 
433 aa  250  4e-65  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3883  cell division protein FtsY  44.19 
 
 
491 aa  250  4e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.629527  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4295  signal recognition particle-docking protein FtsY  44.74 
 
 
540 aa  250  5e-65  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00341336  normal  0.0288649 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0561  signal recognition particle-docking protein FtsY  45.83 
 
 
439 aa  250  5e-65  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0316268  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3773  cell division protein FtsY  44.19 
 
 
491 aa  250  5e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4094  signal recognition particle-docking protein FtsY  44.74 
 
 
615 aa  249  6e-65  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000394743  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04900  signal recognition particle receptor FtsY  48.87 
 
 
451 aa  249  7e-65  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.653255  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3767  signal recognition particle-docking protein FtsY  45.9 
 
 
320 aa  249  8e-65  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000377729  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2724  hypothetical protein  45.69 
 
 
355 aa  249  8e-65  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0171  signal recognition particle-docking protein FtsY  44.74 
 
 
621 aa  249  8e-65  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000116132  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0308  signal recognition particle-docking protein FtsY  46.47 
 
 
392 aa  249  8e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.441566  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0801  cell division protein FtsY  42.06 
 
 
408 aa  249  9e-65  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0242269  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>