34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_2494 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011662  Tmz1t_0292  ATPase-like protein  35.33 
 
 		 1203 aa  637    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1894  hypothetical protein  37.26 
 
 		 1178 aa  719    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0208797  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2494  hypothetical protein  100 
 
 		 1185 aa  2420    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2289  ATPase-like protein  38.18 
 
 		 1192 aa  663    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5024  ATPase-like protein  35.22 
 
 		 1202 aa  632  1e-179  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1298  hypothetical protein  36.94 
 
 		 1183 aa  619  1e-175  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.994763  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0338  hypothetical protein  33.15 
 
 		 1213 aa  550  1e-155  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0121838  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1680  hypothetical protein  30.92 
 
 		 1203 aa  483  1e-135  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000160907 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2210  hypothetical protein  30.04 
 
 		 1168 aa  479  1e-134  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.802914  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0557  hypothetical protein  29.32 
 
 		 1193 aa  471  1.0000000000000001e-131  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1609  hypothetical protein  30.39 
 
 		 1201 aa  419  9.999999999999999e-116  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.838427  normal  0.0465574 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02960  hypothetical protein  31.04 
 
 		 1180 aa  365  3e-99  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4844  hypothetical protein  25.55 
 
 		 1186 aa  264  6e-69  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.0000657531  normal  0.281651 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1123  hypothetical protein  25.28 
 
 		 1177 aa  234  6e-60  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.928627  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2108  hypothetical protein  23.73 
 
 		 1214 aa  199  3e-49  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_261  hypothetical protein  26.26 
 
 		 1228 aa  160  9e-38  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1234  hypothetical protein  22.75 
 
 		 1207 aa  148  8.000000000000001e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0600  hypothetical protein  22.5 
 
 		 1207 aa  145  3e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2037  hypothetical protein  23.21 
 
 		 1211 aa  137  9.999999999999999e-31  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1155  hypothetical protein  23.69 
 
 		 1206 aa  125  7e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3196  hypothetical protein  23.83 
 
 		 1239 aa  124  9.999999999999999e-27  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3081  hypothetical protein  23.8 
 
 		 1208 aa  123  1.9999999999999998e-26  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0990  hypothetical protein  23.03 
 
 		 1199 aa  122  3e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2757  hypothetical protein  24.37 
 
 		 1145 aa  121  7.999999999999999e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.636677  hitchhiker  0.0057166 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1327  hypothetical protein  25.29 
 
 		 1142 aa  120  9.999999999999999e-26  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.372438  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1083  hypothetical protein  22.13 
 
 		 1166 aa  115  4.0000000000000004e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.679898  normal  0.445705 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1818  hypothetical protein  23.63 
 
 		 1157 aa  114  9e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0281308 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3234  hypothetical protein  23.31 
 
 		 1153 aa  113  3e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.540167  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1708  hypothetical protein  23.1 
 
 		 1157 aa  106  2e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0961451 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2242  hypothetical protein  23.11 
 
 		 1148 aa  97.1  2e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.297499 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1909  hypothetical protein  24.87 
 
 		 1236 aa  96.3  3e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.6802  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1911  hypothetical protein  23.99 
 
 		 1280 aa  59.7  0.0000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.281193  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3194  hypothetical protein  22.31 
 
 		 1270 aa  55.1  0.000008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1203  hypothetical protein  23.38 
 
 		 1192 aa  55.1  0.000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0694076  hitchhiker  0.00012393 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>