33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_0600 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014148  Plim_3081  hypothetical protein  58.41 
 
 
1208 aa  1398    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1234  hypothetical protein  99.17 
 
 
1207 aa  2383    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0600  hypothetical protein  100 
 
 
1207 aa  2401    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1155  hypothetical protein  51.03 
 
 
1206 aa  1092    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1123  hypothetical protein  27.52 
 
 
1177 aa  275  3e-72  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.928627  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2108  hypothetical protein  25.65 
 
 
1214 aa  229  2e-58  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_261  hypothetical protein  27.8 
 
 
1228 aa  204  6e-51  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2494  hypothetical protein  22.9 
 
 
1185 aa  153  2e-35  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0292  ATPase-like protein  25.05 
 
 
1203 aa  135  3.9999999999999996e-30  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2289  ATPase-like protein  22.46 
 
 
1192 aa  129  4.0000000000000003e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1894  hypothetical protein  23.2 
 
 
1178 aa  128  7e-28  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0208797  normal 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5024  ATPase-like protein  26.65 
 
 
1202 aa  124  8e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1298  hypothetical protein  24.21 
 
 
1183 aa  124  9.999999999999999e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.994763  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02960  hypothetical protein  22.19 
 
 
1180 aa  121  7e-26  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0338  hypothetical protein  23.18 
 
 
1213 aa  116  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0121838  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0990  hypothetical protein  22.37 
 
 
1199 aa  108  5e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0557  hypothetical protein  22.41 
 
 
1193 aa  104  8e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2210  hypothetical protein  19.39 
 
 
1168 aa  99.4  4e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.802914  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1609  hypothetical protein  23.62 
 
 
1201 aa  97.4  1e-18  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.838427  normal  0.0465574 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1680  hypothetical protein  21.48 
 
 
1203 aa  94  2e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000160907 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4844  hypothetical protein  21.86 
 
 
1186 aa  90.1  2e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.0000657531  normal  0.281651 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2757  hypothetical protein  25.6 
 
 
1145 aa  83.2  0.00000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.636677  hitchhiker  0.0057166 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2037  hypothetical protein  23.06 
 
 
1211 aa  79.3  0.0000000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1083  hypothetical protein  23.28 
 
 
1166 aa  71.2  0.0000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.679898  normal  0.445705 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3234  hypothetical protein  24.04 
 
 
1153 aa  70.5  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.540167  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2242  hypothetical protein  23.21 
 
 
1148 aa  66.6  0.000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.297499 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1909  hypothetical protein  26.12 
 
 
1236 aa  62  0.00000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.6802  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1327  hypothetical protein  23.29 
 
 
1142 aa  59.7  0.0000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.372438  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3196  hypothetical protein  25.17 
 
 
1239 aa  57.4  0.000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1818  hypothetical protein  23.51 
 
 
1157 aa  56.6  0.000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0281308 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1708  hypothetical protein  23.51 
 
 
1157 aa  54.7  0.00001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0961451 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1911  hypothetical protein  27.41 
 
 
1280 aa  50.8  0.0002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.281193  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3194  hypothetical protein  23.91 
 
 
1270 aa  49.3  0.0004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>