30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr4_1708 on replicon NC_008321
Organism: Shewanella sp. MR-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007644  Moth_2242  hypothetical protein  40.19 
 
 		 1148 aa  813    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.297499 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3234  hypothetical protein  36.25 
 
 		 1153 aa  677    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.540167  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2757  hypothetical protein  40.61 
 
 		 1145 aa  850    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.636677  hitchhiker  0.0057166 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1327  hypothetical protein  40.29 
 
 		 1142 aa  844    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.372438  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1708  hypothetical protein  100 
 
 		 1157 aa  2373    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0961451 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1818  hypothetical protein  98.1 
 
 		 1157 aa  2330    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0281308 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1083  hypothetical protein  32.13 
 
 		 1166 aa  572  1e-161  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.679898  normal  0.445705 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2494  hypothetical protein  23.1 
 
 		 1185 aa  106  3e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1298  hypothetical protein  24.65 
 
 		 1183 aa  101  7e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.994763  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1894  hypothetical protein  25.38 
 
 		 1178 aa  96.3  3e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0208797  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2210  hypothetical protein  22.09 
 
 		 1168 aa  87.4  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.802914  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0338  hypothetical protein  24.86 
 
 		 1213 aa  85.5  0.000000000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0121838  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2108  hypothetical protein  22.42 
 
 		 1214 aa  84.3  0.00000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0557  hypothetical protein  26.49 
 
 		 1193 aa  82.8  0.00000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1123  hypothetical protein  24.74 
 
 		 1177 aa  77.4  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.928627  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4844  hypothetical protein  22.57 
 
 		 1186 aa  77.8  0.000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.0000657531  normal  0.281651 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5024  ATPase-like protein  26.57 
 
 		 1202 aa  75.9  0.000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1680  hypothetical protein  25.81 
 
 		 1203 aa  74.7  0.000000000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000160907 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2289  ATPase-like protein  25.06 
 
 		 1192 aa  73.9  0.00000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0292  ATPase-like protein  24.79 
 
 		 1203 aa  73.6  0.00000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2037  hypothetical protein  23.74 
 
 		 1211 aa  72.8  0.00000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_261  hypothetical protein  22.73 
 
 		 1228 aa  68.9  0.0000000005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0990  hypothetical protein  22.25 
 
 		 1199 aa  67  0.000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1609  hypothetical protein  23.81 
 
 		 1201 aa  64.7  0.000000009  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.838427  normal  0.0465574 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1155  hypothetical protein  25.25 
 
 		 1206 aa  63.5  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02960  hypothetical protein  22.24 
 
 		 1180 aa  57.4  0.000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0600  hypothetical protein  23.51 
 
 		 1207 aa  55.5  0.000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3081  hypothetical protein  24.94 
 
 		 1208 aa  54.3  0.00001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1234  hypothetical protein  23.31 
 
 		 1207 aa  52.8  0.00004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0709  bacteriophage resistance gene pglY  26.9 
 
 		 1261 aa  46.2  0.004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.907183  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>