32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewana3_1818 on replicon NC_008577
Organism: Shewanella sp. ANA-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013173  Dbac_1327  hypothetical protein  40.21 
 
 		 1142 aa  845    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.372438  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2242  hypothetical protein  39.93 
 
 		 1148 aa  805    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.297499 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3234  hypothetical protein  35.57 
 
 		 1153 aa  663    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.540167  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2757  hypothetical protein  40.35 
 
 		 1145 aa  850    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.636677  hitchhiker  0.0057166 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1818  hypothetical protein  100 
 
 		 1157 aa  2373    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0281308 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1708  hypothetical protein  98.1 
 
 		 1157 aa  2330    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0961451 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1083  hypothetical protein  32.22 
 
 		 1166 aa  570  1e-161  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.679898  normal  0.445705 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2494  hypothetical protein  23.63 
 
 		 1185 aa  114  1.0000000000000001e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1298  hypothetical protein  24.71 
 
 		 1183 aa  100  1e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.994763  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2108  hypothetical protein  22.96 
 
 		 1214 aa  94.4  1e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1894  hypothetical protein  25.21 
 
 		 1178 aa  94.4  1e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0208797  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0338  hypothetical protein  25.79 
 
 		 1213 aa  89.7  3e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0121838  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1123  hypothetical protein  26.04 
 
 		 1177 aa  89  5e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.928627  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2210  hypothetical protein  22.67 
 
 		 1168 aa  89  5e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.802914  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0557  hypothetical protein  24.55 
 
 		 1193 aa  85.9  0.000000000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1680  hypothetical protein  25.49 
 
 		 1203 aa  80.5  0.0000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000160907 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4844  hypothetical protein  22.56 
 
 		 1186 aa  79.3  0.0000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.0000657531  normal  0.281651 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5024  ATPase-like protein  25.94 
 
 		 1202 aa  75.9  0.000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0292  ATPase-like protein  23.75 
 
 		 1203 aa  75.1  0.000000000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2289  ATPase-like protein  23.86 
 
 		 1192 aa  73.2  0.00000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1609  hypothetical protein  23.76 
 
 		 1201 aa  72.8  0.00000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.838427  normal  0.0465574 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_261  hypothetical protein  22.73 
 
 		 1228 aa  73.2  0.00000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1155  hypothetical protein  24.69 
 
 		 1206 aa  72  0.00000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2037  hypothetical protein  23.77 
 
 		 1211 aa  69.7  0.0000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0990  hypothetical protein  23.58 
 
 		 1199 aa  66.2  0.000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02960  hypothetical protein  21.96 
 
 		 1180 aa  63.2  0.00000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3081  hypothetical protein  25 
 
 		 1208 aa  58.2  0.0000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0600  hypothetical protein  23.51 
 
 		 1207 aa  57.8  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1909  hypothetical protein  21.86 
 
 		 1236 aa  55.5  0.000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.6802  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1234  hypothetical protein  23.31 
 
 		 1207 aa  54.3  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3196  hypothetical protein  22.44 
 
 		 1239 aa  50.8  0.0001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0709  bacteriophage resistance gene pglY  28.57 
 
 		 1261 aa  46.2  0.004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.907183  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>