34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_2289 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011662  Tmz1t_0292  ATPase-like protein  49.59 
 
 
1203 aa  1187    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0338  hypothetical protein  40.11 
 
 
1213 aa  862    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0121838  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5024  ATPase-like protein  49.13 
 
 
1202 aa  1181    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2494  hypothetical protein  35.4 
 
 
1185 aa  683    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2289  ATPase-like protein  100 
 
 
1192 aa  2451    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1894  hypothetical protein  34.36 
 
 
1178 aa  633  1e-180  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0208797  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1298  hypothetical protein  32.73 
 
 
1183 aa  529  1e-148  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.994763  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1680  hypothetical protein  34.41 
 
 
1203 aa  508  9.999999999999999e-143  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000160907 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0557  hypothetical protein  30.72 
 
 
1193 aa  494  9.999999999999999e-139  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2210  hypothetical protein  29.18 
 
 
1168 aa  463  9.999999999999999e-129  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.802914  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1609  hypothetical protein  28.82 
 
 
1201 aa  442  9.999999999999999e-123  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.838427  normal  0.0465574 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02960  hypothetical protein  30.02 
 
 
1180 aa  356  2e-96  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4844  hypothetical protein  26.89 
 
 
1186 aa  266  2e-69  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.0000657531  normal  0.281651 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1123  hypothetical protein  22.48 
 
 
1177 aa  222  3.9999999999999997e-56  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.928627  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2108  hypothetical protein  23 
 
 
1214 aa  177  9.999999999999999e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_261  hypothetical protein  21.57 
 
 
1228 aa  139  5e-31  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2037  hypothetical protein  23.92 
 
 
1211 aa  137  9.999999999999999e-31  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1155  hypothetical protein  23.22 
 
 
1206 aa  135  3e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1234  hypothetical protein  22.46 
 
 
1207 aa  131  8.000000000000001e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0600  hypothetical protein  22.46 
 
 
1207 aa  129  2.0000000000000002e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1327  hypothetical protein  23.16 
 
 
1142 aa  124  9.999999999999999e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.372438  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3081  hypothetical protein  21.53 
 
 
1208 aa  114  1.0000000000000001e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1083  hypothetical protein  23.38 
 
 
1166 aa  114  1.0000000000000001e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.679898  normal  0.445705 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2242  hypothetical protein  24.19 
 
 
1148 aa  108  9e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.297499 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3196  hypothetical protein  24.63 
 
 
1239 aa  102  5e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0990  hypothetical protein  23.52 
 
 
1199 aa  101  8e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2757  hypothetical protein  22.1 
 
 
1145 aa  97.4  1e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.636677  hitchhiker  0.0057166 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1909  hypothetical protein  22.75 
 
 
1236 aa  92  6e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.6802  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3234  hypothetical protein  22.14 
 
 
1153 aa  90.9  1e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.540167  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1708  hypothetical protein  25.06 
 
 
1157 aa  73.9  0.00000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0961451 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1818  hypothetical protein  23.86 
 
 
1157 aa  73.2  0.00000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0281308 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1911  hypothetical protein  22.47 
 
 
1280 aa  63.2  0.00000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.281193  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3194  hypothetical protein  20.77 
 
 
1270 aa  56.6  0.000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3202  putative phage resistance protein  38.36 
 
 
1230 aa  48.1  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.571473  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>