21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_3194 on replicon NC_012028
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013158  Huta_1911  hypothetical protein  53.16 
 
 		 1280 aa  1292    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.281193  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3194  hypothetical protein  100 
 
 		 1270 aa  2548    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1909  hypothetical protein  25.04 
 
 		 1236 aa  80.9  0.0000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.6802  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1894  hypothetical protein  21.24 
 
 		 1178 aa  74.3  0.00000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0208797  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1123  hypothetical protein  22.45 
 
 		 1177 aa  66.6  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.928627  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02960  hypothetical protein  21.74 
 
 		 1180 aa  62.4  0.00000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3234  hypothetical protein  23.01 
 
 		 1153 aa  61.6  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.540167  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0338  hypothetical protein  22.41 
 
 		 1213 aa  60.5  0.0000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0121838  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2494  hypothetical protein  21.74 
 
 		 1185 aa  60.1  0.0000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2289  ATPase-like protein  20.77 
 
 		 1192 aa  59.3  0.0000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0557  hypothetical protein  20.95 
 
 		 1193 aa  59.3  0.0000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2242  hypothetical protein  23.31 
 
 		 1148 aa  59.3  0.0000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.297499 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1914  hypothetical protein  34.82 
 
 		 125 aa  56.6  0.000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1234  hypothetical protein  24.09 
 
 		 1207 aa  56.6  0.000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4844  hypothetical protein  21.73 
 
 		 1186 aa  55.8  0.000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.0000657531  normal  0.281651 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1298  hypothetical protein  21.52 
 
 		 1183 aa  54.7  0.00001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.994763  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2210  hypothetical protein  21.73 
 
 		 1168 aa  55.1  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.802914  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0600  hypothetical protein  23.3 
 
 		 1207 aa  54.7  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5024  ATPase-like protein  22.09 
 
 		 1202 aa  53.5  0.00002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3196  hypothetical protein  22.43 
 
 		 1239 aa  52  0.00008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1680  hypothetical protein  21.59 
 
 		 1203 aa  51.6  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000160907 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>