31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_3196 on replicon NC_012028
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013158  Huta_1909  hypothetical protein  51.51 
 
 		 1236 aa  1253    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.6802  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3196  hypothetical protein  100 
 
 		 1239 aa  2498    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2494  hypothetical protein  24.18 
 
 		 1185 aa  126  3e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2289  ATPase-like protein  24.63 
 
 		 1192 aa  102  7e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1123  hypothetical protein  22.09 
 
 		 1177 aa  99  4e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.928627  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0557  hypothetical protein  23.99 
 
 		 1193 aa  95.1  7e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2210  hypothetical protein  21.88 
 
 		 1168 aa  93.6  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.802914  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0338  hypothetical protein  24.58 
 
 		 1213 aa  93.2  3e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0121838  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1680  hypothetical protein  23.52 
 
 		 1203 aa  92.8  3e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000160907 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0292  ATPase-like protein  25.62 
 
 		 1203 aa  90.1  2e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02960  hypothetical protein  24.48 
 
 		 1180 aa  86.3  0.000000000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1894  hypothetical protein  21.89 
 
 		 1178 aa  85.1  0.000000000000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0208797  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1298  hypothetical protein  22.41 
 
 		 1183 aa  85.1  0.000000000000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.994763  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5024  ATPase-like protein  25.39 
 
 		 1202 aa  84  0.00000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_261  hypothetical protein  24.59 
 
 		 1228 aa  82.8  0.00000000000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1609  hypothetical protein  21.81 
 
 		 1201 aa  77.4  0.000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.838427  normal  0.0465574 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3081  hypothetical protein  26.33 
 
 		 1208 aa  70.9  0.0000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4844  hypothetical protein  25.89 
 
 		 1186 aa  67.4  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.0000657531  normal  0.281651 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2757  hypothetical protein  21.26 
 
 		 1145 aa  63.2  0.00000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.636677  hitchhiker  0.0057166 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2108  hypothetical protein  23.53 
 
 		 1214 aa  62.8  0.00000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1155  hypothetical protein  25.36 
 
 		 1206 aa  62.4  0.00000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0990  hypothetical protein  22.7 
 
 		 1199 aa  61.6  0.00000009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1911  hypothetical protein  22.68 
 
 		 1280 aa  60.8  0.0000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.281193  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2037  hypothetical protein  23.36 
 
 		 1211 aa  60.1  0.0000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0600  hypothetical protein  25.17 
 
 		 1207 aa  57.8  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1234  hypothetical protein  25.08 
 
 		 1207 aa  56.6  0.000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3194  hypothetical protein  21.69 
 
 		 1270 aa  55.5  0.000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1818  hypothetical protein  22.74 
 
 		 1157 aa  53.5  0.00002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0281308 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3234  hypothetical protein  23.42 
 
 		 1153 aa  52.4  0.00005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.540167  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1327  hypothetical protein  21.57 
 
 		 1142 aa  48.5  0.0009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.372438  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2242  hypothetical protein  21.32 
 
 		 1148 aa  45.4  0.007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.297499 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>