31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_3081 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014148  Plim_3081  hypothetical protein  100 
 
 
1208 aa  2465    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1155  hypothetical protein  48.1 
 
 
1206 aa  1036    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0600  hypothetical protein  58.41 
 
 
1207 aa  1394    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1234  hypothetical protein  58.49 
 
 
1207 aa  1399    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1123  hypothetical protein  27.01 
 
 
1177 aa  284  6.000000000000001e-75  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.928627  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2108  hypothetical protein  25.65 
 
 
1214 aa  237  1.0000000000000001e-60  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_261  hypothetical protein  25.54 
 
 
1228 aa  153  2e-35  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5024  ATPase-like protein  28.32 
 
 
1202 aa  135  3.9999999999999996e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0292  ATPase-like protein  26.8 
 
 
1203 aa  125  5e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2494  hypothetical protein  23.8 
 
 
1185 aa  123  1.9999999999999998e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1894  hypothetical protein  24.41 
 
 
1178 aa  119  3.9999999999999997e-25  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0208797  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1298  hypothetical protein  24.5 
 
 
1183 aa  117  1.0000000000000001e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.994763  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2289  ATPase-like protein  21.53 
 
 
1192 aa  114  1.0000000000000001e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02960  hypothetical protein  23.26 
 
 
1180 aa  109  3e-22  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0338  hypothetical protein  24.6 
 
 
1213 aa  105  6e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0121838  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4844  hypothetical protein  22.54 
 
 
1186 aa  104  1e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.0000657531  normal  0.281651 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2210  hypothetical protein  23.46 
 
 
1168 aa  95.9  4e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.802914  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0557  hypothetical protein  23.83 
 
 
1193 aa  92.4  5e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1609  hypothetical protein  21.58 
 
 
1201 aa  87  0.000000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.838427  normal  0.0465574 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1680  hypothetical protein  22.7 
 
 
1203 aa  85.9  0.000000000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000160907 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2757  hypothetical protein  23.98 
 
 
1145 aa  84  0.00000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.636677  hitchhiker  0.0057166 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2242  hypothetical protein  22.64 
 
 
1148 aa  84  0.00000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.297499 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2037  hypothetical protein  24.18 
 
 
1211 aa  79  0.0000000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0990  hypothetical protein  22.73 
 
 
1199 aa  79  0.0000000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1909  hypothetical protein  24.41 
 
 
1236 aa  73.9  0.00000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.6802  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1083  hypothetical protein  23.01 
 
 
1166 aa  73.9  0.00000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.679898  normal  0.445705 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3196  hypothetical protein  26.33 
 
 
1239 aa  70.5  0.0000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3234  hypothetical protein  22.47 
 
 
1153 aa  69.3  0.0000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.540167  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1327  hypothetical protein  22.91 
 
 
1142 aa  68.6  0.0000000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.372438  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1818  hypothetical protein  25 
 
 
1157 aa  57.8  0.000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0281308 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1708  hypothetical protein  24.94 
 
 
1157 aa  53.9  0.00002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0961451 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>