32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcHS_A0338 on replicon NC_009800
Organism: Escherichia coli HS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007949  Bpro_5024  ATPase-like protein  40.44 
 
 		 1202 aa  840    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0292  ATPase-like protein  40.67 
 
 		 1203 aa  840    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2289  ATPase-like protein  40.11 
 
 		 1192 aa  858    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0338  hypothetical protein  100 
 
 		 1213 aa  2499    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0121838  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1894  hypothetical protein  33.52 
 
 		 1178 aa  579  1.0000000000000001e-163  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0208797  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2494  hypothetical protein  33.15 
 
 		 1185 aa  562  1e-158  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2210  hypothetical protein  32.82 
 
 		 1168 aa  496  1e-139  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.802914  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0557  hypothetical protein  30.81 
 
 		 1193 aa  471  1.0000000000000001e-131  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1680  hypothetical protein  31.94 
 
 		 1203 aa  466  9.999999999999999e-131  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000160907 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1298  hypothetical protein  39.19 
 
 		 1183 aa  444  1e-123  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.994763  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1609  hypothetical protein  32.16 
 
 		 1201 aa  445  1e-123  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.838427  normal  0.0465574 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02960  hypothetical protein  28.76 
 
 		 1180 aa  331  5.0000000000000004e-89  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1123  hypothetical protein  25.87 
 
 		 1177 aa  212  4e-53  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.928627  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4844  hypothetical protein  27.76 
 
 		 1186 aa  203  9.999999999999999e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.0000657531  normal  0.281651 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2108  hypothetical protein  26.07 
 
 		 1214 aa  197  9e-49  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1327  hypothetical protein  25.18 
 
 		 1142 aa  132  5.0000000000000004e-29  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.372438  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_261  hypothetical protein  22.46 
 
 		 1228 aa  131  8.000000000000001e-29  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2037  hypothetical protein  23.76 
 
 		 1211 aa  120  1.9999999999999998e-25  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0600  hypothetical protein  23.08 
 
 		 1207 aa  118  6e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1234  hypothetical protein  23.12 
 
 		 1207 aa  118  7.999999999999999e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1155  hypothetical protein  25.06 
 
 		 1206 aa  116  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2757  hypothetical protein  22.34 
 
 		 1145 aa  113  2.0000000000000002e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.636677  hitchhiker  0.0057166 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3081  hypothetical protein  24.6 
 
 		 1208 aa  105  5e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2242  hypothetical protein  22.74 
 
 		 1148 aa  103  3e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.297499 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3234  hypothetical protein  23.79 
 
 		 1153 aa  102  4e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.540167  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1083  hypothetical protein  21.47 
 
 		 1166 aa  101  8e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.679898  normal  0.445705 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3196  hypothetical protein  23.13 
 
 		 1239 aa  99  5e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1909  hypothetical protein  26.02 
 
 		 1236 aa  91.7  9e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.6802  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1818  hypothetical protein  25.27 
 
 		 1157 aa  90.1  2e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0281308 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0990  hypothetical protein  22.79 
 
 		 1199 aa  90.1  3e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1708  hypothetical protein  24.38 
 
 		 1157 aa  85.5  0.000000000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0961451 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3194  hypothetical protein  22.04 
 
 		 1270 aa  57.4  0.000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>